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基于机器学习与细胞形态学对癌细胞分类
被引量:
3
1
作者
臧启元
黄钢
+1 位作者
徐磊
熊
征
斯
《软件》
2019年第9期81-83,共3页
对在细胞实验室培养的三种癌细胞(肺癌PC-9,乳腺癌MDA-MB-231,膀胱癌5637)进行连续4天的图像采集,并进行图像处理,通过ImageJ软件进行图像预处理,包括细胞图像分割,边缘检测,提取细胞形态特征,并通过python编写四种经典机器学习算法,通...
对在细胞实验室培养的三种癌细胞(肺癌PC-9,乳腺癌MDA-MB-231,膀胱癌5637)进行连续4天的图像采集,并进行图像处理,通过ImageJ软件进行图像预处理,包括细胞图像分割,边缘检测,提取细胞形态特征,并通过python编写四种经典机器学习算法,通过对细胞形态特征进行训练,不同模型得到的癌细胞分类结果,对应四种模型在本文数据集上表现进行评价。随机森林分类,逻辑分类,使用线性核函数的SVM分类,朴素贝叶斯分类的准确率分别为:0.725,0.788,0.796,0.813。
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关键词
癌细胞
图像处理
形态特征提取
机器学习
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职称材料
基于NDIR二氧化碳传感器对肿瘤细胞糖代谢速率的研究
被引量:
2
2
作者
徐磊
黄钢
+1 位作者
熊
征
斯
臧启元
《软件》
2018年第8期14-17,共4页
介绍了一种非分光红外(NDIR)CO_2传感器,进行红外检测理论分析、CO_2传感器系统设计及外围电路设计;应用NDIR传感器对HepG2贴壁细胞代谢产生的CO_2浓度进行实时检测,通过相邻时刻的CO_2浓度求差并除以时间差,得到CO_2浓度变化速率。利用...
介绍了一种非分光红外(NDIR)CO_2传感器,进行红外检测理论分析、CO_2传感器系统设计及外围电路设计;应用NDIR传感器对HepG2贴壁细胞代谢产生的CO_2浓度进行实时检测,通过相邻时刻的CO_2浓度求差并除以时间差,得到CO_2浓度变化速率。利用MATLAB软件对CO_2速率散点图拟合,并求拟合曲线导数值为零的点,取该点纵坐标作为该细胞代谢参考速率,最终得到肿瘤细胞糖代谢速率模型。结论:检测四皿细胞浓度比值为1:2:3:4的HepG2细胞,得出其代谢参考速率比值趋同于细胞浓度比值。
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关键词
NDIR红外传感器
二氧化碳检测
糖代谢
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职称材料
基于机器学习的肝癌无创检测
被引量:
1
3
作者
熊
征
斯
黄钢
+1 位作者
郝丽俊
许飞
《北京生物医学工程》
2020年第1期74-79,共6页
目的根据肝癌临床诊断的需求,建立肝癌诊断预测模型,以达到无创检测肝癌的目的。方法利用德国企业产ILD3000型电子鼻设备采集正常受试者和肝癌患者的呼气数据,对呼气所得时间序列数据进行特征提取,包括序列数据的最大值、最小值、均值...
目的根据肝癌临床诊断的需求,建立肝癌诊断预测模型,以达到无创检测肝癌的目的。方法利用德国企业产ILD3000型电子鼻设备采集正常受试者和肝癌患者的呼气数据,对呼气所得时间序列数据进行特征提取,包括序列数据的最大值、最小值、均值、标准差、序列数据总和等统计学特征。结合特征降维算法和机器学习分类模型对呼气特征数据进行正常受试者和原发性肝癌患者的二分类实验。结果通过模型选择和参数调整,在线性核函数支持向量机上对呼气数据取得92.3%的最优二分类结果。结论以正常受试者和肝癌患者的呼气数据为样本,利用机器学习建模的方法可以对肝癌做出诊断预测,且在此数据上,线性核函数支持向量机算法具有最好的分类效果。
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关键词
诊断
电子鼻
原发性肝癌
特征提取
机器学习
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职称材料
题名
基于机器学习与细胞形态学对癌细胞分类
被引量:
3
1
作者
臧启元
黄钢
徐磊
熊
征
斯
机构
上海理工大学
上海健康医学院
出处
《软件》
2019年第9期81-83,共3页
基金
国家自然科学基金项目(批准号:81830052)
文摘
对在细胞实验室培养的三种癌细胞(肺癌PC-9,乳腺癌MDA-MB-231,膀胱癌5637)进行连续4天的图像采集,并进行图像处理,通过ImageJ软件进行图像预处理,包括细胞图像分割,边缘检测,提取细胞形态特征,并通过python编写四种经典机器学习算法,通过对细胞形态特征进行训练,不同模型得到的癌细胞分类结果,对应四种模型在本文数据集上表现进行评价。随机森林分类,逻辑分类,使用线性核函数的SVM分类,朴素贝叶斯分类的准确率分别为:0.725,0.788,0.796,0.813。
关键词
癌细胞
图像处理
形态特征提取
机器学习
Keywords
Cancer cell
Image processing
Morphological feature extraction
Machine learning
分类号
TP391.41 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
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职称材料
题名
基于NDIR二氧化碳传感器对肿瘤细胞糖代谢速率的研究
被引量:
2
2
作者
徐磊
黄钢
熊
征
斯
臧启元
机构
上海理工大学医疗器械与食品学院
上海健康医学院
出处
《软件》
2018年第8期14-17,共4页
基金
国家自然科学基金:NO.81601520
文摘
介绍了一种非分光红外(NDIR)CO_2传感器,进行红外检测理论分析、CO_2传感器系统设计及外围电路设计;应用NDIR传感器对HepG2贴壁细胞代谢产生的CO_2浓度进行实时检测,通过相邻时刻的CO_2浓度求差并除以时间差,得到CO_2浓度变化速率。利用MATLAB软件对CO_2速率散点图拟合,并求拟合曲线导数值为零的点,取该点纵坐标作为该细胞代谢参考速率,最终得到肿瘤细胞糖代谢速率模型。结论:检测四皿细胞浓度比值为1:2:3:4的HepG2细胞,得出其代谢参考速率比值趋同于细胞浓度比值。
关键词
NDIR红外传感器
二氧化碳检测
糖代谢
Keywords
NDIR infrared sensor
Carbon dioxide detection
Glucose metabolism
分类号
TP732.2 [自动化与计算机技术—检测技术与自动化装置]
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职称材料
题名
基于机器学习的肝癌无创检测
被引量:
1
3
作者
熊
征
斯
黄钢
郝丽俊
许飞
机构
上海理工大学医疗器械与食品学院
上海健康医学院
上海交通大学医学院
出处
《北京生物医学工程》
2020年第1期74-79,共6页
文摘
目的根据肝癌临床诊断的需求,建立肝癌诊断预测模型,以达到无创检测肝癌的目的。方法利用德国企业产ILD3000型电子鼻设备采集正常受试者和肝癌患者的呼气数据,对呼气所得时间序列数据进行特征提取,包括序列数据的最大值、最小值、均值、标准差、序列数据总和等统计学特征。结合特征降维算法和机器学习分类模型对呼气特征数据进行正常受试者和原发性肝癌患者的二分类实验。结果通过模型选择和参数调整,在线性核函数支持向量机上对呼气数据取得92.3%的最优二分类结果。结论以正常受试者和肝癌患者的呼气数据为样本,利用机器学习建模的方法可以对肝癌做出诊断预测,且在此数据上,线性核函数支持向量机算法具有最好的分类效果。
关键词
诊断
电子鼻
原发性肝癌
特征提取
机器学习
Keywords
diagnosis
electronic nose
primary liver cancer
feature extraction
machine learning
分类号
R318.04 [医药卫生—生物医学工程]
R735.7 [医药卫生—基础医学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于机器学习与细胞形态学对癌细胞分类
臧启元
黄钢
徐磊
熊
征
斯
《软件》
2019
3
下载PDF
职称材料
2
基于NDIR二氧化碳传感器对肿瘤细胞糖代谢速率的研究
徐磊
黄钢
熊
征
斯
臧启元
《软件》
2018
2
下载PDF
职称材料
3
基于机器学习的肝癌无创检测
熊
征
斯
黄钢
郝丽俊
许飞
《北京生物医学工程》
2020
1
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职称材料
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