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铜绿假单胞菌PA0861突变菌株表达谱检测分析
被引量:
6
1
作者
李九龙
郭嘉义
+3 位作者
张燕
陈一帆
满
耕
孝
黄卫东
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第6期495-499,504,共6页
目的分析铜绿假单胞菌野生型菌株PAO1及PA0861突变菌株基因表达谱,探讨铜绿假单胞菌中GGDEFEAL基因PA0861的生物学功能。方法以野生型铜绿假单胞菌PAO1及PA0861基因转座子插入失活的突变体菌株为材料,利用结晶紫染色方法进行细菌生物膜...
目的分析铜绿假单胞菌野生型菌株PAO1及PA0861突变菌株基因表达谱,探讨铜绿假单胞菌中GGDEFEAL基因PA0861的生物学功能。方法以野生型铜绿假单胞菌PAO1及PA0861基因转座子插入失活的突变体菌株为材料,利用结晶紫染色方法进行细菌生物膜的表型分析;利用Microarray技术分析其基因表达谱的变化;采用半定量RT-PCR验证Microarray结果。结果 PA0861突变株生物膜的合成量在4、8、12h均高于PAO1(P<0.05),在12h时增加了近1倍;利用Microarray技术筛选出差异表达基因517个,其中319个上调,198个下调。生物分子功能注释和Pathway分类显示这些差异表达基因除涉及代谢过程中基本的物质变化和能量转换外,突变体PA0861中涉及铁载体生物合成基因的表达增高。半定量RT-PCR验结果一致。结论铜绿假单胞菌突株PA0861基因表达谱发生改变,其中铁载体生物合成基因高表达,提示c-di-GMP可能通过对铁载体的调控影响细菌生物膜的形成。
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关键词
铜绿假单胞菌
C-DI-GMP
MICROARRAY
生物膜
铁载体
原文传递
铜绿假单胞菌PAO1中4个具有GGDEF-EAL结构域基因的研究
被引量:
1
2
作者
满
耕
孝
陈一帆
+2 位作者
张燕
黄婷
黄卫东
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2016年第3期215-219,224,共6页
目的对铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)野生型PAO1中与环鸟苷二磷酸(C-di-GMP)代谢相关的4个具有GGDEF-EAL结构域基因(PA0285、PA0575、PA5295、PA5442)进行初步研究。方法分析4个基因的转座子突变菌株进行生物膜(Biofilm)及...
目的对铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)野生型PAO1中与环鸟苷二磷酸(C-di-GMP)代谢相关的4个具有GGDEF-EAL结构域基因(PA0285、PA0575、PA5295、PA5442)进行初步研究。方法分析4个基因的转座子突变菌株进行生物膜(Biofilm)及泳动性(Motility);利用PCR对4个基因的催化结构域进行克隆并构建原核表达载体,经IPTG诱导后检测重组蛋白的表达情况。结果生物膜分析显示,PA0285、PA0575、PA5442的转座子突变体较野生型PAO1间生物膜合成发生变化,其A值差异有统计学意义(P=0.000,P<0.05);PA5295转座子突变体与PAO1间生物膜合成差异无统计学意义(P=0.232,P>0.05);泳动性分析显示,PA0285、PA0575、PA5442的转座子突变体菌落直径与PAO1比较差异有统计学意义(P=0.000,P<0.05),PA5295的转座子突变体与PAO1间比较差异无统计学意义(P=0.083,P>0.05)。4个基因的催化结构域原核表达载体构建成功,并在大肠埃希菌中表达目的蛋白。结论初步分析表明PA0285、PA0575、PA5442均影响细菌的生物膜合成及运动性,为4基因的功能研究奠定了基础。
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关键词
铜绿假单胞菌
C-DI-GMP
GGDEF-EAL
基因研究
原文传递
应用Bac-to-Bac系统高效表达人类错配修复基因hMLH1及其错义突变体
3
作者
郭嘉义
张燕
+2 位作者
满
耕
孝
朱明星
黄卫东
《宁夏医科大学学报》
2017年第10期1151-1154,共4页
目的利用Bac-to-Bac杆状病毒表达系统在Sf9昆虫细胞中实现人类错配修复基因h MLH1及其错义突变体的高效表达。方法分别用Bam HI和Not I双酶切构建于pc DNA载体中的全长野生型h MLH1基因及T117M和V384D错义突变型DNA片段,回收后定向克隆...
目的利用Bac-to-Bac杆状病毒表达系统在Sf9昆虫细胞中实现人类错配修复基因h MLH1及其错义突变体的高效表达。方法分别用Bam HI和Not I双酶切构建于pc DNA载体中的全长野生型h MLH1基因及T117M和V384D错义突变型DNA片段,回收后定向克隆至p Fast Bac1转座载体中,经酶切鉴定后转化DH10Bac感受态细胞,PCR方法筛选阳性菌落,提取重组Bacmid,反复感染Sf9昆虫细胞,用SDS-PAGE和Western blot方法鉴定目的蛋白的表达。结果提取转染72h后的Sf9细胞总蛋白,用7%的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,可见分子量为85k Da清晰的蛋白条带,经Western blot方法证实该条带为h MLH1基因的表达产物。结论利用Bac-to-Bac杆状病毒表达系统在Sf9昆虫细胞中大量表达出h MLH1野生型和T117M及V384D错义突变体蛋白,为进一步开展体外错配修复实验奠定了良好的基础。
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关键词
HMLH1基因
T117M错义突变
V384D错义突变
Bac-to-Bac杆状病毒表达系统
Sf9昆虫细胞
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职称材料
题名
铜绿假单胞菌PA0861突变菌株表达谱检测分析
被引量:
6
1
作者
李九龙
郭嘉义
张燕
陈一帆
满
耕
孝
黄卫东
机构
宁夏医科大学基础医学院
宁夏医科大学医学科学技术研究中心
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第6期495-499,504,共6页
基金
国家自然科学基金项目(No.81260243)
文摘
目的分析铜绿假单胞菌野生型菌株PAO1及PA0861突变菌株基因表达谱,探讨铜绿假单胞菌中GGDEFEAL基因PA0861的生物学功能。方法以野生型铜绿假单胞菌PAO1及PA0861基因转座子插入失活的突变体菌株为材料,利用结晶紫染色方法进行细菌生物膜的表型分析;利用Microarray技术分析其基因表达谱的变化;采用半定量RT-PCR验证Microarray结果。结果 PA0861突变株生物膜的合成量在4、8、12h均高于PAO1(P<0.05),在12h时增加了近1倍;利用Microarray技术筛选出差异表达基因517个,其中319个上调,198个下调。生物分子功能注释和Pathway分类显示这些差异表达基因除涉及代谢过程中基本的物质变化和能量转换外,突变体PA0861中涉及铁载体生物合成基因的表达增高。半定量RT-PCR验结果一致。结论铜绿假单胞菌突株PA0861基因表达谱发生改变,其中铁载体生物合成基因高表达,提示c-di-GMP可能通过对铁载体的调控影响细菌生物膜的形成。
关键词
铜绿假单胞菌
C-DI-GMP
MICROARRAY
生物膜
铁载体
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
c-di-GMP
microarray
biofilm
siderophore
分类号
R378.99 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
铜绿假单胞菌PAO1中4个具有GGDEF-EAL结构域基因的研究
被引量:
1
2
作者
满
耕
孝
陈一帆
张燕
黄婷
黄卫东
机构
宁夏医科大学基础学院
宁夏医科大学临床医学院
宁夏医科大学生物化学与分子生物学教研室
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2016年第3期215-219,224,共6页
基金
国家自然科学基金项目(No.81060126
81260243)
宁夏医科大学2014年"大学生创新创业训练计划"项目(No.S2014004)
文摘
目的对铜绿假单胞菌(Pseudomonas aeruginosa,PA)野生型PAO1中与环鸟苷二磷酸(C-di-GMP)代谢相关的4个具有GGDEF-EAL结构域基因(PA0285、PA0575、PA5295、PA5442)进行初步研究。方法分析4个基因的转座子突变菌株进行生物膜(Biofilm)及泳动性(Motility);利用PCR对4个基因的催化结构域进行克隆并构建原核表达载体,经IPTG诱导后检测重组蛋白的表达情况。结果生物膜分析显示,PA0285、PA0575、PA5442的转座子突变体较野生型PAO1间生物膜合成发生变化,其A值差异有统计学意义(P=0.000,P<0.05);PA5295转座子突变体与PAO1间生物膜合成差异无统计学意义(P=0.232,P>0.05);泳动性分析显示,PA0285、PA0575、PA5442的转座子突变体菌落直径与PAO1比较差异有统计学意义(P=0.000,P<0.05),PA5295的转座子突变体与PAO1间比较差异无统计学意义(P=0.083,P>0.05)。4个基因的催化结构域原核表达载体构建成功,并在大肠埃希菌中表达目的蛋白。结论初步分析表明PA0285、PA0575、PA5442均影响细菌的生物膜合成及运动性,为4基因的功能研究奠定了基础。
关键词
铜绿假单胞菌
C-DI-GMP
GGDEF-EAL
基因研究
Keywords
Pseudomonas aeruginosa
C-di-GMP
GGDEF-EAL
gene study
分类号
R378.991 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
应用Bac-to-Bac系统高效表达人类错配修复基因hMLH1及其错义突变体
3
作者
郭嘉义
张燕
满
耕
孝
朱明星
黄卫东
机构
宁夏医学科学研究所
宁夏医科大学基础医学院
出处
《宁夏医科大学学报》
2017年第10期1151-1154,共4页
基金
宁夏自然基金项目(NZ11210)
文摘
目的利用Bac-to-Bac杆状病毒表达系统在Sf9昆虫细胞中实现人类错配修复基因h MLH1及其错义突变体的高效表达。方法分别用Bam HI和Not I双酶切构建于pc DNA载体中的全长野生型h MLH1基因及T117M和V384D错义突变型DNA片段,回收后定向克隆至p Fast Bac1转座载体中,经酶切鉴定后转化DH10Bac感受态细胞,PCR方法筛选阳性菌落,提取重组Bacmid,反复感染Sf9昆虫细胞,用SDS-PAGE和Western blot方法鉴定目的蛋白的表达。结果提取转染72h后的Sf9细胞总蛋白,用7%的SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳,可见分子量为85k Da清晰的蛋白条带,经Western blot方法证实该条带为h MLH1基因的表达产物。结论利用Bac-to-Bac杆状病毒表达系统在Sf9昆虫细胞中大量表达出h MLH1野生型和T117M及V384D错义突变体蛋白,为进一步开展体外错配修复实验奠定了良好的基础。
关键词
HMLH1基因
T117M错义突变
V384D错义突变
Bac-to-Bac杆状病毒表达系统
Sf9昆虫细胞
Keywords
hMLH1 gene
T117M missense mutation
V384D missense mutation
Bac-to-Bac baculovirusexpression system
Sf9 insect cells
分类号
R346 [医药卫生—基础医学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
铜绿假单胞菌PA0861突变菌株表达谱检测分析
李九龙
郭嘉义
张燕
陈一帆
满
耕
孝
黄卫东
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017
6
原文传递
2
铜绿假单胞菌PAO1中4个具有GGDEF-EAL结构域基因的研究
满
耕
孝
陈一帆
张燕
黄婷
黄卫东
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2016
1
原文传递
3
应用Bac-to-Bac系统高效表达人类错配修复基因hMLH1及其错义突变体
郭嘉义
张燕
满
耕
孝
朱明星
黄卫东
《宁夏医科大学学报》
2017
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