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谷子穗发育期转录组与叶酸代谢谱联合分析 被引量：7
1
作者 马贵芳 满夏夏 +5 位作者 张益娟 高豪 孙朝霞 李红英 韩渊怀 侯思宇 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第5期837-846,共10页
植物叶酸(Folate,FA)参与细胞内一碳单位转移反应,是能量代谢、氨基酸和核酸合成的重要供体。前期我们发现,谷子籽粒叶酸含量高于其他禾谷类作物,但叶酸代谢组分特征目前尚不清楚。本研究以‘晋谷21’为试验材料,对3个穗发育期小穗进行... 植物叶酸(Folate,FA)参与细胞内一碳单位转移反应,是能量代谢、氨基酸和核酸合成的重要供体。前期我们发现,谷子籽粒叶酸含量高于其他禾谷类作物,但叶酸代谢组分特征目前尚不清楚。本研究以‘晋谷21’为试验材料,对3个穗发育期小穗进行叶酸代谢组分析;通过RNA-seq分析穗发育期差异表达基因及叶酸合成途径相关代谢通路,探究叶酸组分与叶酸代谢途径基因表达模式及其与可变剪切的相关性,同时预测分析叶酸合成途径基因的蛋白互作网络。结果表明,总叶酸含量随穗发育阶段呈下降趋势;5-甲基四氢叶酸(5-methyltetrahydrofolate,5-M-THF)和10-甲酰叶酸(10-formylfolicacid,10-F-FA)是穗发育期的主要组分。17个叶酸合成关键基因表达模式可划分为2个不同类群。转录起始区域(transcription start site,TSS)和转录终止区域(transcription terminal site,TTS)可变剪切是叶酸合成关键基因在穗发育3个时期均发生的可变剪切类型,外显子跳跃型(exonskipping,ES)、内含子滞留型(intron retention,IR)和可变5'或3'端剪切(alternative exon ends,AE)是特有类型。同时发现叶酸合成、一碳代谢和激素信号传导途径关键基因与叶酸组分差异具有相关性,初步推测谷子穗发育过程叶酸合成途径及偶联途径相关基因的表达一定程度影响叶酸含量变化,其中ADCS、DHFR2和GGH基因的差异表达可能为影响谷穗叶酸含量的主要原因,可作为利用遗传工程提高谷子叶酸含量及生物强化分子育种的关键靶基因。 展开更多
关键词 谷子 叶酸 转录组 代谢组
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高效液相色谱测定小米中叶酸含量方法优化 被引量：7
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作者 满夏夏 高豪 +4 位作者 闫陆飞 张益娟 孙朝霞 韩渊怀 侯思宇 《中国农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第12期111-121,共11页
针对目前小米中叶酸提取及测定方法研究较少,尤其是对适用于规模化提取、测定叶酸含量的研究不够深入的问题,采用高效液相色谱法对小米中叶酸含量进行测定。对影响叶酸提取及测定效果的三酶法和高效液相色谱法进行单因素试验和响应面优... 针对目前小米中叶酸提取及测定方法研究较少,尤其是对适用于规模化提取、测定叶酸含量的研究不够深入的问题,采用高效液相色谱法对小米中叶酸含量进行测定。对影响叶酸提取及测定效果的三酶法和高效液相色谱法进行单因素试验和响应面优化。结果表明:小米中叶酸提取的最佳条件为,提取液添加量1 mL,淀粉酶20μL,蛋白酶150μL,大鼠血清25μL;最佳测定条件为,流速1mL/min,流动相pH=7,检测波长280nm、色谱柱柱温30℃。使用优化后的三酶法和高效液相色谱法对小米中叶酸进行提取并测定,测定过程中重复性的相对标准偏差(RSD)为0.50%。综上,三酶法和高效液相色谱法是一种可用于大规模高效提取并精确定量小米中叶酸含量的方法。 展开更多
关键词 叶酸 小米 三酶法 高效液相色谱法 响应面优化
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谷子MRP蛋白家族序列特征、分子进化及表达模式分析 被引量：1
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作者 高豪 满夏夏 +4 位作者 孙朝霞 韩渊怀 李红英 侯思宇 郭数进 《农学学报》 2021年第5期74-82,共9页
本研究旨在深入了解谷子叶酸转运家族成员的基因结构和表达模式,为谷子体内叶酸转运分子机制的研究奠定基础。使用Phytozome、Clustal X、MEGA7.0等在线工具和软件,对谷子MRP家族成员进行生物信息学分析;基于谷子谷穗有参转录组测序数据... 本研究旨在深入了解谷子叶酸转运家族成员的基因结构和表达模式,为谷子体内叶酸转运分子机制的研究奠定基础。使用Phytozome、Clustal X、MEGA7.0等在线工具和软件,对谷子MRP家族成员进行生物信息学分析;基于谷子谷穗有参转录组测序数据,分析谷子MRP家族成员表达模式。结果显示,谷子MRP蛋白家族成员共21个,在7号染色体分布最多,有8个基因;17个谷子MRP蛋白偏碱性和4个偏酸性,根据疏水值判断其均为亲水性蛋白;成员SiMRP7、SiMRP12基因的表达量与谷子组织中的总叶酸含量表现出协同降低的趋势,推测这两个蛋白可能对谷子叶酸的积累起到调控作用。本研究有助于进一步鉴定叶酸转运相关蛋白,为后续研究叶酸代谢途径及谷子基因挖掘提供了理论基础。 展开更多
关键词 谷子 MRP蛋白家族 谷子叶酸 生物信息学分析 表达模式
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