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走近医学研究领域中的基因芯片技术 被引量:15
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作者 马文丽 《分子诊断与治疗杂志》 2014年第6期361-365,共5页
生物芯片是高密度固定在固相支持介质上的生物信息分子(如寡核苷酸,基因片段,cDNA片段或多肽、蛋白质)的微阵列。基因芯片是生物芯片的一种。随着人类基因组计划的提前完成。基因芯片技术在生命科学研究领域中有着广泛的应用,其具有高... 生物芯片是高密度固定在固相支持介质上的生物信息分子(如寡核苷酸,基因片段,cDNA片段或多肽、蛋白质)的微阵列。基因芯片是生物芯片的一种。随着人类基因组计划的提前完成。基因芯片技术在生命科学研究领域中有着广泛的应用,其具有高通量、多样化、自动化、反应微型化等突出特点。基因芯片技术已在基因功能表达、基因调控网络、疾病病理、临床诊断、药物开发及筛选等研究方面取得重大进展。本文简要介绍基因芯片技术的基本原理和种类,论述基因芯片技术在医学领域中的应用。 展开更多
关键词 基因 基因芯片技术 医学研究
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miR-335在肿瘤组织中的表达及其预测靶基因的生物信息学分析 被引量:5
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作者 陈利娜 +2 位作者 卢严方 郑文岭 马文丽 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期23-30,共8页
目的:分析miR-335在多种肿瘤组织与癌旁组织中的表达,预测其靶基因并进行相关生物信息学分析,为进一步研究miR-335在肿瘤中的调控机制提供理论基础。方法:分析miR-335的保守性及在多个肿瘤组织中的表达;预测miR-335靶基因,并使用DAIVID... 目的:分析miR-335在多种肿瘤组织与癌旁组织中的表达,预测其靶基因并进行相关生物信息学分析,为进一步研究miR-335在肿瘤中的调控机制提供理论基础。方法:分析miR-335的保守性及在多个肿瘤组织中的表达;预测miR-335靶基因,并使用DAIVID对miR-335靶基因进行生物信息学分析。结果:miR-335序列高度保守,在肝癌、肺癌、乳腺癌、肝内胆管癌、脂肪肉瘤中表达下调(P<0.05)。预测miR-335靶基因共34个,靶基因集合功能富集于细胞迁移、凋亡、转录调控,以及蛋白质分子连接、细胞骨架组成等生物学过程和分子功能(P<0.05);主要参与了轴突向导和黏着斑信号通路、黑素瘤疾病信号通路及TGF-β信号通路(P<0.05)。结论:miR-335在多种肿瘤中表达异常,且涉及多个生物学过程和信号转导通路,与肿瘤的发生发展密切相关。 展开更多
关键词 miR-335 肿瘤 靶基因 生物信息学
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妊娠期乳腺癌相关基因的生物信息学分析 被引量:2
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作者 陈利娜 +1 位作者 卢严方 马文丽 《解剖学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期348-352,共5页
目的通过生物信息分析途径对妊娠期乳腺癌患者与正常人群的差异基因进行分析,从分子水平探讨妊娠期乳腺癌的发病机制。方法从公共数据库基因表达数据库(GEO)中下载妊娠期乳腺癌相关数据集,采用Qlucore Omics Explore(QOE)筛选差异表达基... 目的通过生物信息分析途径对妊娠期乳腺癌患者与正常人群的差异基因进行分析,从分子水平探讨妊娠期乳腺癌的发病机制。方法从公共数据库基因表达数据库(GEO)中下载妊娠期乳腺癌相关数据集,采用Qlucore Omics Explore(QOE)筛选差异表达基因,用DAIVID、STRING等在线分析工具对差异表达基因进行功能富集分析,信号转导通路分析以及预测蛋白质之间的关系。结果共筛选出148个差异表达基因,其中表达上调24个,下调124个,对其进行生物信息学分析发现,TAGLN、ACTG2、TPM2、TPM3、MYLK、ACTA2、MTH11等基因以及MAPK信号通路、黏着斑信号通路、血管平滑肌细胞收缩信号通路等在妊娠期乳腺癌的发生发展中可能起着重要作用。通过STRING分析发现,20个基因处于核心节点位置。结论利用生物信息学的方法能有效分析基因芯片数据并获取生物内在信息。 展开更多
关键词 妊娠期乳腺癌 基因芯片 差异表达基因 生物信息学
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FBXW7过表达可抑制乳腺癌MCF-7细胞增殖和迁移并促进细胞凋亡 被引量:2
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作者 陈利娜 马文丽 《肿瘤》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期388-395,共8页
目的:探讨F框/WD-40域蛋白7(F-box and WD-40 domain protein 7,FBXW 7)基因过表达对乳腺癌MCF-7细胞增殖、迁移、周期和凋亡的影响。方法:构建FBXW 7过表达的重组载体pEZ-M02-FBXW7质粒,并将其转染乳腺癌MCF-7细胞,应用实时荧光定量PC... 目的:探讨F框/WD-40域蛋白7(F-box and WD-40 domain protein 7,FBXW 7)基因过表达对乳腺癌MCF-7细胞增殖、迁移、周期和凋亡的影响。方法:构建FBXW 7过表达的重组载体pEZ-M02-FBXW7质粒,并将其转染乳腺癌MCF-7细胞,应用实时荧光定量PCR和蛋白质印迹法检测pEZ-M02-FBXW7转染后MCF-7细胞中FBXW7 mRNA和蛋白的表达,CCK-8和Transwell法检测细胞增殖、迁移和侵袭情况,FCM法检测细胞周期和细胞凋亡情况。结果:pEZ-M02-FBXW7转染后,乳腺癌MCF-7细胞中FBXW7 mRNA和蛋白的表达水平高于阴性对照组(将空载体pEZ-M02质粒转染至MCF-7细胞)和空白对照组(未进行转染的MCF-7细胞)(P值均<0.01),MCF-7细胞的增殖、迁移和侵袭能力均明显下降(P值均<0.05),MCF-7细胞被阻滞于G0/G1期(P<0.05),且细胞凋亡率明显升高(P<0.05)。结论:FBXW7高表达可抑制乳腺癌MCF-7细胞的增殖、侵袭和迁移,并可促进细胞凋亡。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 细胞增殖 细胞运动 细胞凋亡 FBXW7基因
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