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转录组测序技术研究进展
被引量:
10
1
作者
洪
奇
阳
毕行建
+4 位作者
王大宁
李子真
俞海
夏宁邵
李少伟
《中国生化药物杂志》
CAS
2017年第6期443-448,共6页
伴随高通量测序技术的快速发展,转录组测序(RNA-Seq)技术在各个研究领域已经得到广泛的运用.RNA-Seq通过分析不同细胞或者组织转录组的表达情况来揭示细胞的基因表达情况,结构特点和调控规律.近年来基于高通量测序技术的RNA-Seq分析...
伴随高通量测序技术的快速发展,转录组测序(RNA-Seq)技术在各个研究领域已经得到广泛的运用.RNA-Seq通过分析不同细胞或者组织转录组的表达情况来揭示细胞的基因表达情况,结构特点和调控规律.近年来基于高通量测序技术的RNA-Seq分析方法发展迅速,涌现出一大批相关的分析方法和工具,如何根据实际需求选择合适的工具和分析流程,成为广大科研人员面临的问题.本文参照近几年在RNA-seq技术研究领域发表的文献,综述了RNA-Seq应用实际过程中涉及的分析方法、软件工具及其选用标准,为相关的研究和应用提供信息和参考.
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关键词
转录组
高通量测序
数据处理与分析
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职称材料
福建省莆田市115 455例女性HPV感染及宫颈病变流行病学分析
2
作者
林堃
黄洁香
+3 位作者
洪
奇
阳
胡雅静
黄敏君
陈明桥
《福建医科大学学报》
2024年第2期135-142,共8页
目的分析福建省莆田市35~64岁女性人乳头瘤病毒(HPV)的感染特征及HPV相关宫颈病变的流行病学特点。方法回顾性分析2018年1月—2022年12月莆田市115455例女性的HPV分型及宫颈细胞学检查结果。分析HPV亚型和宫颈病变的流行病学特征,探讨...
目的分析福建省莆田市35~64岁女性人乳头瘤病毒(HPV)的感染特征及HPV相关宫颈病变的流行病学特点。方法回顾性分析2018年1月—2022年12月莆田市115455例女性的HPV分型及宫颈细胞学检查结果。分析HPV亚型和宫颈病变的流行病学特征,探讨单一感染和多重感染对宫颈病变的影响,评估年龄对感染和患病风险的影响,并采用χ^(2)检验进行组间率的比较。结果HPV感染总阳性率为8.41%,主要流行亚型有HPV 52、58、16、39、18型;浸润性宫颈癌(ICC)患者最常见的感染亚型有HPV 16、33、18型。宫颈细胞学检查正常者97632例(84.56%),宫颈炎症865例(0.75%),意义不明确的不典型鳞状细胞(ASC-US)985例(0.85%),不能排除高度鳞状上皮内瘤变的不典型鳞状细胞(ASC-H)348例(0.30%),低级别鳞状上皮内病变(LSIL)668例(0.58%),高级别鳞状上皮内病变(HSIL)313例(0.27%),ICC 37例(0.03%)。1597例(16.46%)女性存在多重HPV感染,最常见的合并感染亚型为52、58、16型。多重HPV感染在宫颈炎症中最常见,占比25.15%。随着年龄增长,HPV感染的阳性率呈上升趋势。40~44岁和50~54岁的ICC患者感染HPV33的阳性率最高。结论HPV 16、33、18是ICC患者的主要感染亚型;对HPV33感染应采取更加积极的防治措施。
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关键词
人乳头瘤病毒
宫颈病变
宫颈癌筛查
流行病学特征
莆田市
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职称材料
计算机模拟预测治疗性抗体聚集倾向性的进展及应用
3
作者
毕行建
洪
奇
阳
+2 位作者
俞海
李少伟
夏宁邵
《中国医药工业杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期795-801,共7页
由于具有靶向性高、不良反应少等优势,治疗性抗体已成为生物技术产业的重要研究领域。诸多重大疾病如肿瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、糖尿病、老年性痴呆等都有望用抗体药物进行治疗,以抗体为基础的分子设计和靶向治疗也是近年生物...
由于具有靶向性高、不良反应少等优势,治疗性抗体已成为生物技术产业的重要研究领域。诸多重大疾病如肿瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、糖尿病、老年性痴呆等都有望用抗体药物进行治疗,以抗体为基础的分子设计和靶向治疗也是近年生物医药产业的最大增长点。但目前在抗体药物的研发和生产过程中仍然存在一些问题亟待解决。其中,抗体分子聚集是影响药物成药性的关键因素之一,筛选和设计稳定高效的抗体药物是药物研发早期阶段的重要目标。相较于传统筛选方法,应用计算机模拟技术预测蛋白质的聚集倾向为抗体药物的稳定性和高度可溶性提供了重要参考信息,将有效地提高药物的研发效率。本文重点介绍了已成功应用于治疗性抗体领域的聚集预测方法,并对这些方法的原理与应用前景进行总结,为基于计算机模拟的抗体研究提供参考。
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关键词
治疗性抗体
聚集倾向性
成药性
计算机模拟
药物研发
DNA重组技术
生物信息学
原文传递
题名
转录组测序技术研究进展
被引量:
10
1
作者
洪
奇
阳
毕行建
王大宁
李子真
俞海
夏宁邵
李少伟
机构
厦门大学国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心生命科学学院
厦门大学分子疫苗学与分子诊断学国家重点实验室公共卫生学院
出处
《中国生化药物杂志》
CAS
2017年第6期443-448,共6页
基金
国家自然科学基金(81571996)
文摘
伴随高通量测序技术的快速发展,转录组测序(RNA-Seq)技术在各个研究领域已经得到广泛的运用.RNA-Seq通过分析不同细胞或者组织转录组的表达情况来揭示细胞的基因表达情况,结构特点和调控规律.近年来基于高通量测序技术的RNA-Seq分析方法发展迅速,涌现出一大批相关的分析方法和工具,如何根据实际需求选择合适的工具和分析流程,成为广大科研人员面临的问题.本文参照近几年在RNA-seq技术研究领域发表的文献,综述了RNA-Seq应用实际过程中涉及的分析方法、软件工具及其选用标准,为相关的研究和应用提供信息和参考.
关键词
转录组
高通量测序
数据处理与分析
Keywords
transcriptome
high throughput sequencing
data processing and analysis
分类号
S813 [农业科学—畜牧学]
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职称材料
题名
福建省莆田市115 455例女性HPV感染及宫颈病变流行病学分析
2
作者
林堃
黄洁香
洪
奇
阳
胡雅静
黄敏君
陈明桥
机构
莆田学院附属医院产前诊断中心
莆田市妇幼保健院妇女保健科
出处
《福建医科大学学报》
2024年第2期135-142,共8页
基金
福建省卫生健康科技计划重大科研专项(2021ZD01002)。
文摘
目的分析福建省莆田市35~64岁女性人乳头瘤病毒(HPV)的感染特征及HPV相关宫颈病变的流行病学特点。方法回顾性分析2018年1月—2022年12月莆田市115455例女性的HPV分型及宫颈细胞学检查结果。分析HPV亚型和宫颈病变的流行病学特征,探讨单一感染和多重感染对宫颈病变的影响,评估年龄对感染和患病风险的影响,并采用χ^(2)检验进行组间率的比较。结果HPV感染总阳性率为8.41%,主要流行亚型有HPV 52、58、16、39、18型;浸润性宫颈癌(ICC)患者最常见的感染亚型有HPV 16、33、18型。宫颈细胞学检查正常者97632例(84.56%),宫颈炎症865例(0.75%),意义不明确的不典型鳞状细胞(ASC-US)985例(0.85%),不能排除高度鳞状上皮内瘤变的不典型鳞状细胞(ASC-H)348例(0.30%),低级别鳞状上皮内病变(LSIL)668例(0.58%),高级别鳞状上皮内病变(HSIL)313例(0.27%),ICC 37例(0.03%)。1597例(16.46%)女性存在多重HPV感染,最常见的合并感染亚型为52、58、16型。多重HPV感染在宫颈炎症中最常见,占比25.15%。随着年龄增长,HPV感染的阳性率呈上升趋势。40~44岁和50~54岁的ICC患者感染HPV33的阳性率最高。结论HPV 16、33、18是ICC患者的主要感染亚型;对HPV33感染应采取更加积极的防治措施。
关键词
人乳头瘤病毒
宫颈病变
宫颈癌筛查
流行病学特征
莆田市
Keywords
human papillomavirus
cervical pathology
cervical cancer screening
epidemiological features
Putian City
分类号
R711 [医药卫生—妇产科学]
R181.3 [医药卫生—临床医学]
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职称材料
题名
计算机模拟预测治疗性抗体聚集倾向性的进展及应用
3
作者
毕行建
洪
奇
阳
俞海
李少伟
夏宁邵
机构
厦门大学公共卫生学院分子疫苗学和分子诊断学国家重点实验室
厦门大学生命科学学院国家传染病诊断试剂与疫苗工程技术研究中心
出处
《中国医药工业杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第6期795-801,共7页
基金
国家自然科学基金(81571996)
福建省自然基金(2013J05053)
文摘
由于具有靶向性高、不良反应少等优势,治疗性抗体已成为生物技术产业的重要研究领域。诸多重大疾病如肿瘤、自身免疫性疾病、心血管疾病、糖尿病、老年性痴呆等都有望用抗体药物进行治疗,以抗体为基础的分子设计和靶向治疗也是近年生物医药产业的最大增长点。但目前在抗体药物的研发和生产过程中仍然存在一些问题亟待解决。其中,抗体分子聚集是影响药物成药性的关键因素之一,筛选和设计稳定高效的抗体药物是药物研发早期阶段的重要目标。相较于传统筛选方法,应用计算机模拟技术预测蛋白质的聚集倾向为抗体药物的稳定性和高度可溶性提供了重要参考信息,将有效地提高药物的研发效率。本文重点介绍了已成功应用于治疗性抗体领域的聚集预测方法,并对这些方法的原理与应用前景进行总结,为基于计算机模拟的抗体研究提供参考。
关键词
治疗性抗体
聚集倾向性
成药性
计算机模拟
药物研发
DNA重组技术
生物信息学
Keywords
therapeutic antibody aggregation propensity druggability simulation in silico drug research and development DNA recombination technology bioinformatics
分类号
Q81 [生物学—生物工程]
TP399 [自动化与计算机技术—计算机应用技术]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
转录组测序技术研究进展
洪
奇
阳
毕行建
王大宁
李子真
俞海
夏宁邵
李少伟
《中国生化药物杂志》
CAS
2017
10
下载PDF
职称材料
2
福建省莆田市115 455例女性HPV感染及宫颈病变流行病学分析
林堃
黄洁香
洪
奇
阳
胡雅静
黄敏君
陈明桥
《福建医科大学学报》
2024
0
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职称材料
3
计算机模拟预测治疗性抗体聚集倾向性的进展及应用
毕行建
洪
奇
阳
俞海
李少伟
夏宁邵
《中国医药工业杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2017
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