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中药毒性预测研究进展与思考 被引量：5
1
作者 沈磐 孙德志 +1 位作者 周维 高月 《中国药物警戒》 2023年第4期473-479,共7页
目的了解中药毒性预测研究现状,为全面深入认识中药毒性提供参考。方法基于文献检索和阅读,对近年来有关中药毒性预测思路和方法进行梳理、归纳和总结。结果根据不同的预测理念,中药毒性预测方法大致可分为3类:基于定量结构-活性关系、... 目的了解中药毒性预测研究现状,为全面深入认识中药毒性提供参考。方法基于文献检索和阅读,对近年来有关中药毒性预测思路和方法进行梳理、归纳和总结。结果根据不同的预测理念,中药毒性预测方法大致可分为3类:基于定量结构-活性关系、网络毒理学及传统中药药性理论的中药毒性预测方法,对中药毒性预测的发展及其在临床用药的指导作用提出了展望,提出“基于多元层面的中药全成分组复合毒性效应网络”的中药毒性预测理念,期望实现一体化中药毒性完整预测,有助于中药毒性的系统性研究和应用,为进一步认识中药毒性预测提供了思路。结论现有的中药毒性预测方法能够为“有毒”中药无毒用药方案的制定提供理论依据,对临床上的中药配伍减毒具有一定的参考。 展开更多
关键词 中药毒性预测 定量结构-活性关系 网络毒理学 中药药性理论
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表型药物筛选技术助力基于中药的创新药物发现
2
作者 杨茜茹 孙德志 +4 位作者 沈磐 黄从书 李永芳 高月 周维 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期3125-3131,共7页
我国中草药资源丰富,对复杂疾病具有良好的治疗作用,具有巨大的开发潜力。但其成分复杂,药效物质及其作用机制不明,且缺乏科学的临床安全性和有效性的评价方法,极大地限制了基于中药的创新药物研发。随着人工智能、仿生生物学等前沿学... 我国中草药资源丰富,对复杂疾病具有良好的治疗作用,具有巨大的开发潜力。但其成分复杂,药效物质及其作用机制不明,且缺乏科学的临床安全性和有效性的评价方法,极大地限制了基于中药的创新药物研发。随着人工智能、仿生生物学等前沿学科的发展,特别是细胞画像、器官芯片等技术和产品的涌现,有望实现基于模型宏、微观性状或特征变化的中药及其组分功效的高通量鉴别,为中药的研发和应用提供更加精准的指导。因此,作为全新药物发现的主要手段之一,表型药物筛选在基于中药的创新药物研发过程中越来越受到关注。近年来,表型药物筛选技术不断发展更新,显著提升了新药早期发现率及后期研发成功率,逐渐成为全新药物研究的重要工具。该文通过探讨中药创新药物发现的潜力及挑战,结合表型药物筛选在新药发现中的优势,详细阐述了在细胞画像、深度学习和器官芯片等前沿技术的支持下,表型药物筛选技术的应用如何推动传统中医药进入新的发展阶段。 展开更多
关键词 中药 创新药物 表型药物筛选 高内涵筛选 细胞画像 器官芯片
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雷公藤红素抑制前体脂肪细胞成脂分化的作用及机制研究
3
作者 岳兰昕 沈磐 +3 位作者 周磊 黄从书 周维 高月 《中国药物警戒》 2024年第1期65-73,共9页
目的研究雷公藤红素(celastrol,Cela)对前体脂肪细胞(3T3-L1)成脂分化的抑制作用及其具体机制。方法采用CCK-8法确定雷公藤红素处理3T3-L1细胞的最佳浓度;油红O染色及免疫荧光法(脂肪细胞标志蛋白Perilipin1,Adiponectin)检测雷公藤红素... 目的研究雷公藤红素(celastrol,Cela)对前体脂肪细胞(3T3-L1)成脂分化的抑制作用及其具体机制。方法采用CCK-8法确定雷公藤红素处理3T3-L1细胞的最佳浓度;油红O染色及免疫荧光法(脂肪细胞标志蛋白Perilipin1,Adiponectin)检测雷公藤红素对3T3-L1成脂分化不同时期的抑制作用;Western Blot(WB)检测不同浓度雷公藤红素处理后3T3-L1细胞中调控脂代谢以及分化相关蛋白的表达;对未分化(Con)、分化第1天(MDI)、分化第1天同时给药250 nmol·L^(-1)雷公藤红素(MCT)的3T3-L1细胞进行WB检测以及microRNA(miRNA)测序,qPCR验证筛选得到的miRNA,进行KEGG与GO富集分析;过表达mmu-miR-5121 mimics和inhibitor,WB检测相关蛋白的变化,油红O染色检测分化结果。结果Cela处理3T3-L1细胞的最佳浓度为250 nmol·L^(-1)和500 nmol·L^(-1);油红O染色及免疫荧光结果表明250 nmol·L^(-1)与500 nmol·L^(-1)Cela对3T3-L1成脂分化均有显著抑制作用,250 nmol·L^(-1)在3T3-L1成脂分化早期(第1天)便能显著抑制3T3-L1成脂分化;250 nmol·L^(-1)Cela处理3T3-L124 h后,能显著抑制3T3-L1中DFCP1、FAS、ACC、PPARγ等蛋白的表达;分化第1天FAS与ACC表达升高,采用250 nmol·L^(-1)Cela处理后,ACC、FAS蛋白表达显著降低;miRNA测序筛选后q PCR验证结果表明mmumiR-5121在分化第1天减少,但Cela处理后含量增加。转染5121 inhibitor提高了FAS与ACC的含量,5121 mimics则呈现相反作用。单独转染5121 inhibitor可使得3T3-L1分化成熟,而分化同时添加5121 mimics可以有效抑制分化。并且250nmol·L^(-1)Cela可以抑制5121 inhibitor引起的分化。结论250 nmol·L^(-1)雷公藤红素作用于3T3-L1成脂分化早期可显著抑制3T3-L1分化,其可能通过上调mmu-miR-5121的含量,抑制FAS与ACC的表达发挥作用。 展开更多
关键词 雷公藤红素 前体脂肪细胞 成脂分化 脂代谢 油红O染色 mmu-miR-5121
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基于临床用药特点的补骨脂斑马鱼肝毒性确证与机制探讨
4
作者 敖婷 王宁宁 +5 位作者 周磊 邓慧芳 杨兴鑫 周维 沈磐 高月 《中国药物警戒》 2024年第6期611-616,共6页
目的遵循补骨脂临床用药特点,基于蛋白质组学探究其对于斑马鱼肝脏影响及其潜在肝毒性机制。方法以低、中、高浓度补骨脂水煎液(0.025、0.050、0.100 mg·mL-1)连续对成年斑马鱼给药21 d,比较斑马鱼体重变化、肝脏病理切片及酶联免... 目的遵循补骨脂临床用药特点,基于蛋白质组学探究其对于斑马鱼肝脏影响及其潜在肝毒性机制。方法以低、中、高浓度补骨脂水煎液(0.025、0.050、0.100 mg·mL-1)连续对成年斑马鱼给药21 d,比较斑马鱼体重变化、肝脏病理切片及酶联免疫吸附试验(ELISA)测定血清中谷丙转氨酶(ALT)、谷草转氨酶(AST)的含量变化;基于鉴定的肝脏蛋白质组学,通过聚类分析和通路富集分析研究潜在肝毒性机制,并结合分子对接探究补骨脂主要肝毒性成分的潜在毒性靶点。结果补骨脂水煎液给药组斑马鱼与空白组相比,给药组斑马鱼体重明显下降,且随着给药浓度的增加体重下降更加明显。补骨脂给药组的ALT、AST含量升高,差异具有统计学意义(P<0.05),且具有明显的剂量依赖性。苏木精一伊红(HE)染色结果显示,补骨脂给药组的肝脏组织与对照组相比肝细胞排列混乱、间隙增加,伴有脂肪变性、免疫细胞侵润等现象,且病变程度随着给药剂量的升高肝脏病变越发严重。基于蛋白质组学的聚类和功能富集分析表明,补骨脂影响斑马鱼肝脏中脂质和能量代谢相关的蛋白质乙酰辅酶A乙酰转移酶1(acat1)、3-羟基酰基辅酶A脱氢酶(ehhadh)、琥珀酸脱氢酶(sdha与sdhb)的表达,且分子对接发现补骨脂中主要肝毒性成分具有与此类蛋白结合的潜能。结论长时间补骨脂给药造成肝脏脂质代谢紊乱,最终产生以脂肪变性为代表的肝毒性,其潜在毒性机制为补骨脂主要肝毒性成分介导的脂质和能量代谢相关蛋白的表达异常。 展开更多
关键词 补骨脂 肝毒性 脂肪变性 蛋白质组学 脂质 能量 代谢 分子对接 斑马鱼
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C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列预测方法的研究进展 被引量：4
5
作者 沈磐 杨冬 贺福初 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2017年第7期573-579,共7页
C2H2型锌指蛋白是哺乳动物中数量最多的一类转录调控因子.C2H2型锌指蛋白中含有的C2H2型锌指基序多是不相同的,表明它们很可能结合不同的DNA序列,从而调控不同的基因,行使多样化的调控功能.然而,目前大多数C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列... C2H2型锌指蛋白是哺乳动物中数量最多的一类转录调控因子.C2H2型锌指蛋白中含有的C2H2型锌指基序多是不相同的,表明它们很可能结合不同的DNA序列,从而调控不同的基因,行使多样化的调控功能.然而,目前大多数C2H2型锌指蛋白结合的DNA序列仍不明确,这阻碍了C2H2型锌指蛋白的功能研究.目前,针对C2H2型锌指蛋白的靶序列预测已有一些初步的研究.本文介绍了C2H2型锌指基序与DNA结合的经典模式,并对C2H2型锌指蛋白靶序列预测方法中所用到的算法、训练集、金标准数据集及相应工具进行了全面系统的总结归纳,旨在丰富对C2H2型锌指蛋白靶序列预测原理和工具的认识,为C2H2型锌指蛋白靶序列的精确预测和更深入的功能研究打下基础. 展开更多
关键词 转录因子 C2H2型锌指蛋白 靶序列预测
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基于单细胞转录组数据解析大鼠背根神经节在出生后发育中非神经元细胞变化特征 被引量：1
6
作者 张佳琪 刘俊华 +3 位作者 马洁 沈磐 朱云平 杨冬 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期3772-3786,共15页
背根神经节(dorsal root ganglia,DRG)是重要的外周神经系统组成部分,是外周感觉传入中枢的枢纽。背根神经节在发育过程中神经元细胞及其基因表达的动态变化已有研究进行过单细胞转录组的解析,而关于非神经元细胞的动态变化尚无系统研... 背根神经节(dorsal root ganglia,DRG)是重要的外周神经系统组成部分,是外周感觉传入中枢的枢纽。背根神经节在发育过程中神经元细胞及其基因表达的动态变化已有研究进行过单细胞转录组的解析,而关于非神经元细胞的动态变化尚无系统研究。为了探究出生后不同发育时间点大鼠DRG内非神经元细胞的变化,本研究选取10只7日龄(7 day,7D)大鼠的DRG和3只3月龄(3 month,3M)大鼠的DRG,制备单细胞悬液,使用10×Genomics平台进行测序,从单细胞水平解析了出生后发育中DRG非神经元细胞的转录图谱。结果表明,7D和3M各类非神经元细胞在细胞数目的分布比例上存在显著差异性。对拥有4个亚型的施旺细胞整体进行拟时分析,Ⅱ型施旺细胞是最早出现的施旺细胞亚型,Ⅲ型和Ⅳ型施旺细胞出现较晚。进一步对2个不同发育时间点细胞占比数差异显著的Ⅳ型施旺细胞进行了基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encylopaedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析。从7D到3M的差异基因的GO分析结果表明,Ⅳ型施旺细胞的状态逐渐趋于稳定。KEGG分析结果发现酪氨酸代谢通路的显著上调影响了细胞内的信号转导,进而影响了细胞稳态的维持。从7D到3M,基因Col3a1、Col4a1显著下调,且与细胞外基质的构建密切相关,这表明Ⅳ型施旺细胞的细胞基质环境随着发育过程趋于稳定。上述结果提示Ⅳ型施旺细胞是一类趋于成熟且维持施旺细胞稳态的细胞。本研究关于DRG在发育过程中细胞类型和基因表达差异的分析结果为躯体感觉在发育过程中成熟机制的研究提供了重要参考信息。 展开更多
关键词 背根神经节 发育 单细胞转录组测序 非神经元细胞 施旺细胞
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杜氏高生熊虫实验室培养体系的建立 被引量：2
7
作者 陈俊 李磊 +5 位作者 郭燕 毕瑞 沈磐 王立志 杨冬 张令强 《军事医学》 CAS 北大核心 2020年第2期137-141,共5页
目的建立国内首个纯种水熊虫——杜氏高生熊虫(Hypsibius dujardini)的实验室培养体系。方法于河南省伏牛山老界岭地区采集野生苔藓样品,从中分离、收集混合种属水熊虫及其卵;以土生绿球藻为食物,在琼脂糖板上分离纯化混合种属水熊虫,... 目的建立国内首个纯种水熊虫——杜氏高生熊虫(Hypsibius dujardini)的实验室培养体系。方法于河南省伏牛山老界岭地区采集野生苔藓样品,从中分离、收集混合种属水熊虫及其卵;以土生绿球藻为食物,在琼脂糖板上分离纯化混合种属水熊虫,并使用悬浮培养法进一步扩繁纯种水熊虫;使用形态分类学方法鉴定水熊虫种属。结果野生苔藓中分离得到混合种水熊虫;分离同窝卵后孵化得到纯种水熊虫,进一步扩繁得到单一种属实验室培养体系;以形态分类学方法初步鉴定该物种为杜氏高生熊虫。结论在国内首次建立了杜氏高生熊虫的实验室培养体系,为极端环境耐受机制研究提供了动物模型。 展开更多
关键词 水熊虫 缓步动物门 杜氏高生熊虫 培养体系 隐生
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教育是什么?
8
作者 沈磐 《基础教育》 2005年第3期40-41,共2页
读本科时。友人陈氏指教室之课桌。告诉我，“教育是桌子”。我愕然。不知其所云为何。
关键词 教师 教书育人 学生观 教育理念
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水熊虫耐干燥机制的关键分子筛选
9
作者 郑坤 沈磐 +3 位作者 侯雨杉 王斐 王虎强 杨冬 《中国科学：生命科学》 CSCD 北大核心 2024年第5期936-950,共15页
水熊虫,学名缓步动物,是一种能耐受多种极端环境的微小水陆两栖动物,但其耐干燥的具体分子机制仍不明.本研究收集3种水熊虫和其他11种后生动物的基因组数据,使用OrthoFinder判定得到4个基因家族在水熊虫中特异扩张;接着用eggNOG-Mapper... 水熊虫,学名缓步动物,是一种能耐受多种极端环境的微小水陆两栖动物,但其耐干燥的具体分子机制仍不明.本研究收集3种水熊虫和其他11种后生动物的基因组数据,使用OrthoFinder判定得到4个基因家族在水熊虫中特异扩张;接着用eggNOG-Mapper注释变形拉式熊虫的基因的功能信息,并分析其在正常、低湿隐生、补水80 min、补水3 h四种状态的基因表达谱,筛选出5032个差异基因,用Fuzzy C-Means算法分为9类,对干燥状态下高表达的基因做功能富集分析,得到耐干燥关键分子尿苷二磷酸糖基转移酶UGT72E1(UDP-glycosyltransferase72E1).此外,UGT72E1在典型高生熊虫低湿隐生状态同样存在高表达,推测其通过调节苯丙烷代谢增强水熊虫耐干燥能力. 展开更多
关键词 水熊虫 缓步动物 耐干燥 低湿隐生 尿苷二磷酸糖基转移酶 苯丙烷代谢
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热板式再流炉的研帛
10
作者 沈惠磐 翁志德 《通信与广播电视》 1990年第1期95-98,105,共5页
关键词 再流炉 SMT 焊接 电子元件
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