新型冠状病毒肺炎流行病学特征的最新认识 被引量：665

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作者 中华预防医学会新型冠状病毒肺炎防控专家组 李立明 +19 位作者 梁晓峰 姜庆五 汪华 王波 杨维中 王充 刘霞 吴凡 张志杰 陈峰 赵杨 魏永越 沈思鹏 郝元涛 杜志成 唐金陵 任军 毕振强 邓瑛 王岚 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第2期139-144,共6页

中华预防医学会新型冠状病毒肺炎防控专家组在文献回顾和专家研讨基础上,形成了对新型冠状病毒肺炎流行病学特征的最新认识。病毒最初的来源为武汉市华南海鲜市场,穿山甲为潜在的动物宿主。目前传染源主要是新型冠状病毒感染的患者,隐... 中华预防医学会新型冠状病毒肺炎防控专家组在文献回顾和专家研讨基础上,形成了对新型冠状病毒肺炎流行病学特征的最新认识。病毒最初的来源为武汉市华南海鲜市场,穿山甲为潜在的动物宿主。目前传染源主要是新型冠状病毒感染的患者,隐性感染者也可能成为传染源,主要经呼吸道飞沫传播和接触传播,人群普遍易感。平均潜伏期5.2 d,流行初期基本再生数(R0)为2.2。患者多数表现为普通型和轻型。病死率为2.38%,合并基础疾病的老年男性病死率较高。新型冠状病毒肺炎的防控要点包括完善疫情信息监测、隔离诊治传染源、加快疑似病例诊断、规范密切接触者管理、重视聚集性疫情防控和院内感染防控、关注返程人员的疫情防控和加强社区防控。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 2019冠状病毒病 流行病学 特征

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基于改进的SEIR^+CAQ传染病动力学模型进行新型冠状病毒肺炎疫情趋势分析 被引量：49

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作者 魏永越 卢珍珍 +6 位作者 杜志成 张志杰 赵杨 沈思鹏 王波 郝元涛 陈峰 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期470-474,475,共6页

目的拟合并预测新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情的发展趋势,为疫情防控提供科学依据。方法基于SEIR动力学模型,考虑COVID-19的传播机制、感染谱、隔离措施等,建立SEIR^+CAQ传播动力学模型。基于官方公布的每日确诊病例数进行建模,利用2... 目的拟合并预测新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情的发展趋势,为疫情防控提供科学依据。方法基于SEIR动力学模型,考虑COVID-19的传播机制、感染谱、隔离措施等,建立SEIR^+CAQ传播动力学模型。基于官方公布的每日确诊病例数进行建模,利用2020年1月20日至2月7日的报告疫情数据进行拟合。采用2月8-12日的数据评估预测效果,并进行疫情预测。结果SEIR^+CAQ模型对全国(湖北省除外)和湖北省(武汉市除外)的累计确诊病例数的过去10日拟合偏差<5%;未来5日预测偏差<10%,略有高估。全国(湖北省除外)和湖北省(武汉市除外)的每日新增确诊病例数已于2月1-2日达峰值;武汉市亦已于2月9日达到高峰。在当前防控措施不变的情况下,截至2月29日,预计全国累计确诊病例将达80417例。预测结果尚未包含临床诊断病例。结论SEIR^+CAQ模型可用于COVID-19疫情趋势预测,为疫情防控决策和效果评价提供参考。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 SEIR^+CAQ传染病动力学模型 疫情预测

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关于科学、规范、有序地开展新型冠状病毒肺炎相关临床试验的建议 被引量：23

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作者 陈峰 郝元涛 +9 位作者 张志杰 唐金陵 夏结来 詹思延 赵杨 杜志成 魏永越 沈思鹏 姜庆五 李立明 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第3期301-302,共2页

最近,一批卫生统计学与流行病学工作者在网上讨论我国新型冠状病毒肺炎流行势态时,就目前国内开展的新型冠状病毒肺炎的临床试验发表了各自的看法,并经讨论达成以下共识。截至2020年2月22日10:00,在中国临床试验注册中心(http://www.chi... 最近,一批卫生统计学与流行病学工作者在网上讨论我国新型冠状病毒肺炎流行势态时,就目前国内开展的新型冠状病毒肺炎的临床试验发表了各自的看法,并经讨论达成以下共识。截至2020年2月22日10:00,在中国临床试验注册中心(http://www.chictr.org.cn/)注册的以COVID-19为题目或疾病名称的各类研究已经多达200项。其中,治疗性临床试验139项,诊断性研究9项,观察性研究44项,其他类型研究8项[1]。 展开更多

关键词 临床试验 卫生统计学 观察性研究 网上讨论 疾病名称 肺炎

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全球新型冠状病毒肺炎疫情对我国的输入风险评估 被引量：22

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作者 沈思鹏 魏永越 +3 位作者 赵杨 姜玥 官锦兴 陈峰 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1582-1587,共6页

目的评估全球新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情对我国的输入风险。方法基于收集的疫情数据(各国家每日累计确诊病例数、境外输入病例累计确诊病例数)、人口学数据(各国人口密度、人口数)、旅客潜在来源群体信息(华侨华人常住人口数、在... 目的评估全球新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情对我国的输入风险。方法基于收集的疫情数据(各国家每日累计确诊病例数、境外输入病例累计确诊病例数)、人口学数据(各国人口密度、人口数)、旅客潜在来源群体信息(华侨华人常住人口数、在外中国留学生数、海外务工人员数、来华留学生数、航班旅客数估计)和全球健康安全指数(GHS)等信息,进行近期(2月1日-4月25日)和未来(4月26日-)风险分析及预测,构建输入风险得分。结果各国境外输入病例数、累计确诊数、罹患率、华侨华人数、境外留学生数、来华留学生数、航班乘客数和GHS变量间有较强的正相关性。近期风险分析中,俄罗斯输入病例明显较高,英国、美国、法国、西班牙次之。在未来风险预测中,通过各国罹患率指数和平均每日入境乘客数估计值两项信息,评估美国、新加坡等44个国家为未来潜在高风险国家。结论通过COVID-19疫情各国家输入风险评估,可以识别近期及未来的高风险区域,为加强疫情防控,为最终战胜疫情提高帮助。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 境外输入 世界流行趋势 风险预测

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常见新型冠状病毒肺炎疫情预测方法及其评价 被引量：19

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作者 黄丽红 魏永越 +2 位作者 沈思鹏 朱畴文 陈峰 《中国卫生统计》 CSCD 北大核心 2020年第3期322-326,共5页

自新型冠状病毒肺炎疫情发生以来,一些学者利用疫情公开数据建立预测模型。所用预测方式包括曲线拟合、传染病动力学模型及人工智能算法三大类。传统的曲线拟合预测方式无法考虑传染病特征,预测结果并不可靠。传染病动力学模型是本次疫... 自新型冠状病毒肺炎疫情发生以来,一些学者利用疫情公开数据建立预测模型。所用预测方式包括曲线拟合、传染病动力学模型及人工智能算法三大类。传统的曲线拟合预测方式无法考虑传染病特征,预测结果并不可靠。传染病动力学模型是本次疫情预测应用最多的一类,能够考虑传染病的传播速度、传播模式及各种防控措施等因素,但由于考虑的参数不可能全面,且参数可能在疫情不同阶段发生动态变化,因此预测效果往往不佳,但对早期预警、防控决策支持及防控效果评价具有重要应用价值。人工智能方法可以综合考虑不同防控措施以及多种因素的影响,如果考虑得当,预测效果将会有所提高。在综合利用动力学模型优势的基础上,尽可能多地考虑不同影响因素,利用人工智能构建仿真模型,将是一个新的发展趋势。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 传染病模型 统计预测 动力学模型 人工智能

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基于动态基本再生数的新型冠状病毒肺炎疫情防控现状评估 被引量：17

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作者 黄丽红 沈思鹏 +1 位作者 余平 魏永越 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第4期466-469,共4页

目的对全国各省份的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控现状进行分析,建立预测模型预估现有防控措施预期成效,为决策部门提供科学信息。方法基于COVID-19疫情网络公开数据,估计全国、各省份以及武汉市不同时间基本再生数(R0)的动态变化... 目的对全国各省份的新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情防控现状进行分析,建立预测模型预估现有防控措施预期成效,为决策部门提供科学信息。方法基于COVID-19疫情网络公开数据,估计全国、各省份以及武汉市不同时间基本再生数(R0)的动态变化R0(t),以评估在现有防控措施下,COVID-19传染速率随时间变化的趋势,预估现有防控措施的预期成效。结果从结果稳定性考虑,选择累积确诊病例数>100例的地区进行分析,共24个省份纳入分析。在疫情初期,全国整体R0(t)不稳定,数值较大,误差也较大。随着防控措施的进一步加强,R0(t)普遍在1月下旬开始呈现下降趋势,2月始下降趋势稳定。截至数据分析日,纳入分析的24个省份中已有18个省份(75%)R0(t)降到1以下。这为有条件地开放人员流动提供了信息。结论动态R0(t)有助于动态评估COVID-19传染速率变化情况,本次疫情防控措施已初显成效,如能继续保持,全国疫情有望短期内得到全面控制。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 动态基本再生数 统计预测

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SEIR动力学模型辅助北京市新发地新型冠状病毒肺炎疫情传播起始时间溯源和防控效果评价 被引量：13

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作者 魏永越 官锦兴 +2 位作者 赵杨 沈思鹏 陈峰 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1772-1776,共5页

目的推测2020年6月北京市新发地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情首例感染的传播时间起点,辅助传染病溯源,评价当前综合防控效果。方法根据北京市卫生健康委员会官方报告统计每日发病人数,建立SEIR传染病动力学模型,基于每日发病人数拟... 目的推测2020年6月北京市新发地新型冠状病毒肺炎(COVID-19)疫情首例感染的传播时间起点,辅助传染病溯源,评价当前综合防控效果。方法根据北京市卫生健康委员会官方报告统计每日发病人数,建立SEIR传染病动力学模型,基于每日发病人数拟合动力学模型,并搜寻本次疫情的传播时间起点;考虑不同的防控效果而拟合6月12日至7月1日的累计发病人数,以评估当前综合防控措施效果。结果北京市新发地疫情传播首例感染应起始于5月22日至5月28日之间(累计概率为95%),起始于5月25日的概率最大(23%)。本次疫情R0为4.22(95%CI:2.88~7.02)。模型拟合结果提示,截至6月11日,累计发病为99例(95%CI:77~121),符合实际情况。若不加控制,则截至7月1日累计发病估计将达到65090例(95%CI:39068~105037)。截至7月1日,较之无防控措施的理论情况,实际感染人数减少了99%。自6月12日起,北京市采取了强有力的综合防控措施,疫情实际走势接近于传播率降低95%的推演结果,敏感性分析支持这一结果。结论针对突发性疫情,传染病动力学模型可用来辅助推演传染病传播起始时间,辅助疫情溯源。北京市针对本次突发疫情所及时采取的综合防控措施迅速控制了95%以上的传播途径,减少了99%的感染人数,快速遏制了疫情,对于未来疫情防控具有重要的指导意义。 展开更多

关键词 新型冠状病毒肺炎 传染病动力学模型 传染病溯源

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Implementation of Clinical Diagnostic Criteria and Universal Symptom Survey Contributed to Lower Magnitude and Faster Resolution of the COVID-19 Epidemic in Wuhan 被引量：10

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作者 Yongyue Wei Liangmin Wei +10 位作者 Yue Jiang Sipeng Shen Yang Zhao Yuantao Hao Zhicheng Du Jinling Tang Zhijie Zhang Qingwu Jiang Liming Li Feng Chen Hongbing Shen 《Engineering》 SCIE EI 2020年第10期1287-1293,共7页

自新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)疫情发生以来,中国大多数的病例集中在武汉市。虽然早期病例数和死亡人数迅速增加,但通过采取多种防控措施,疫情得以快速遏制。纵观全球,疫情已蔓延至全球六大洲的187个国家,确... 自新型冠状病毒肺炎(coronavirus disease 2019, COVID-19)疫情发生以来,中国大多数的病例集中在武汉市。虽然早期病例数和死亡人数迅速增加,但通过采取多种防控措施,疫情得以快速遏制。纵观全球,疫情已蔓延至全球六大洲的187个国家,确诊病例数已超过300万,这一数字仍在快速增长。在此特殊背景下,有必要对我国疫情防控措施开展科学的、定量的评估,为全球疫情防控提供决策依据。为此,本研究评估了临床诊断标准实施和全城症状排查对武汉市疫情控制的贡献。考虑COVID-19的传播机理、隔离措施等,建立SEIR+Q传播动力学模型。基于武汉市截至2020年2月14日官方公布的每日确诊病例数和未确诊的临床诊断病例数进行建模,并预测2月14日以后的疫情态势。基于实际疫情数据,与模型预测趋势相比较,评价防控措施效果。结果显示,若维持2月14日以前防控措施不变,那么预测将于3月25日和4月29日,每日新增病例数分别降至100例和10例以下,将于5月31日首次现零。而事实上,截至3月6日,武汉市每日新增病例数降至100例以下,截至3月11日降至10例以下,3月18日首次实现零增长,较之模型预测结果分别提前了19 d、49 d和74 d。截至3月30日,实际累计病例数为50 006例,比模型预测值减少19 951例。有效再生数[effective reproductive number, R(t)]分析显示,2月6-10日的第一次全城症状排查后,R(t)显现出下降趋势,2月12-14日的临床诊断标准实施和2月17-19日的第二次全城症状排查后,R(t)显现出较大的降幅,与实际情况较为一致。综上所述,武汉市临床诊断标准的实施和全城症状排查等综合防控措施成效显著,可为世界各国的疫情防控决策提供科学依据。 展开更多

关键词 COVID-19 SEIR+Q传染病动力学模型 临床诊断标准 全城症状排查 干预效果评价

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多组学数据整合分析的统计方法研究进展 被引量：5

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作者 沈思鹏 张汝阳 +1 位作者 魏永越 陈峰 《中华疾病控制杂志》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期763-765,771,共4页

复杂疾病往往是由环境因素、遗传因素(多个组学层面)共同作用所致。全面分析不同分子水平的信息对认识疾病的发生发展至关重要。多组学数据整合分析能够提高特征筛选检验效能、改善疾病预测精度。本文从统计学角度出发,对多组学数据整... 复杂疾病往往是由环境因素、遗传因素(多个组学层面)共同作用所致。全面分析不同分子水平的信息对认识疾病的发生发展至关重要。多组学数据整合分析能够提高特征筛选检验效能、改善疾病预测精度。本文从统计学角度出发,对多组学数据整合分析的统计理论方法研究进展做一述评。 展开更多

关键词 多组学数据 整合分析 统计方法

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基于马尔科夫链蒙特卡罗模拟方法的COVID-19年龄别病死率估计 被引量：4

10

作者 杜志成 郝元涛 +7 位作者 魏永越 张志杰 沈思鹏 赵杨 唐金陵 陈峰 姜庆五 李立明 《中华流行病学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2020年第11期1777-1781,共5页

目的新型冠状病毒肺炎疫情已席卷全球,疫情结束前,其病死率的估计受现有确诊病例和发病到死亡时间分布的影响,且结论尚不明确,本研究旨在对新型冠状病毒肺炎的年龄别病死率进行估计。方法收集国家卫生健康委员会和CDC发布的新型冠状病... 目的新型冠状病毒肺炎疫情已席卷全球,疫情结束前,其病死率的估计受现有确诊病例和发病到死亡时间分布的影响,且结论尚不明确,本研究旨在对新型冠状病毒肺炎的年龄别病死率进行估计。方法收集国家卫生健康委员会和CDC发布的新型冠状病毒肺炎疫情数据信息,采用Gamma分布拟合发病到死亡时间分布规律,采用马尔科夫链蒙特卡罗模拟估计年龄别病死率。结果新型冠状病毒肺炎的发病到死亡时间M=13.77(P25~P75:9.03~21.02)d,总病死率为4.1%(95%CI:3.7%~4.4%),0~、10~、20~、30~、40~、50~、60~、70~和≥80岁组病死率分别为0.1%、0.4%、0.4%、0.4%、0.8%、2.3%、6.4%、14.0%和25.8%。结论校正删失的马尔科夫链蒙特卡罗模拟方法适用于新发突发传染病疫情期间的病死率估计,尽早明确新型冠状病毒肺炎的病死率有助于疫情的防控。 展开更多

关键词 病死率 马尔科夫链蒙特卡罗模拟 新型冠状病毒肺炎

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大数据思维与传统统计思维差异的思考 被引量：2

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作者 陈超 沈思鹏 +2 位作者 赵杨 陈峰 魏永越 《南京医科大学学报（社会科学版）》 2016年第6期477-479,共3页

大数据时代已经来临,随之而来的巨量信息正变革人们的思维模式以及理解世界的方式。认识到大数据思维和传统统计思维的差异,有助于思维的变革和方法论的演进,以便于充分利用数据的潜在价值,对于创新统计思维模式有重要意义。文章就大数... 大数据时代已经来临,随之而来的巨量信息正变革人们的思维模式以及理解世界的方式。认识到大数据思维和传统统计思维的差异,有助于思维的变革和方法论的演进,以便于充分利用数据的潜在价值,对于创新统计思维模式有重要意义。文章就大数据思维和传统统计思维的差异进行分析和探讨。 展开更多

关键词 大数据思维 生物医学研究 数据挖掘 传统统计思维

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TRIZ理论在地方工科大学“双创”教育中的引入模式研究 被引量：1

12

作者 郭艺 沈思鹏 《创新创业理论研究与实践》 2021年第7期91-92,132,共3页

在深化高等教育供给侧结构性改革的过程中,高校创新创业教育发展迅速,但普遍存在同质化现象,创新创业内涵缺失。如果不能够改善这种情况,将会对高等教育的人才培养带来影响。为了改善高等教育人才培养现状,增强创新创业教育效果,该文通... 在深化高等教育供给侧结构性改革的过程中,高校创新创业教育发展迅速,但普遍存在同质化现象,创新创业内涵缺失。如果不能够改善这种情况,将会对高等教育的人才培养带来影响。为了改善高等教育人才培养现状,增强创新创业教育效果,该文通过归纳分析影响大学生创新创业能力的因素,提出在大学生创新创业能力培养中引入TRIZ理论,运用TRIZ理论分析地方高校创新创业的问题,为传统的创新创业人才培养模式提供了新的思路,为地方高校成果转化提供了新的方向。 展开更多

关键词 高校 创新创业 TRIZ理论

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生物医学大数据统计分析方法与临床应用研究

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作者 张汝阳 魏永越 +2 位作者 沈思鹏 赵杨 陈峰 《中国科技成果》 2020年第19期6-9,共4页

以基因组学为代表的生物医学"大数据"时代已经来临.面对上百万指标的数据,常规分析方法已不能满足实际需求.新形势下生物医学研究迫切需要新的分析策略与方法.项目以"创新多组学数据填补与整合分析方法→创新疾病关键基... 以基因组学为代表的生物医学"大数据"时代已经来临.面对上百万指标的数据,常规分析方法已不能满足实际需求.新形势下生物医学研究迫切需要新的分析策略与方法.项目以"创新多组学数据填补与整合分析方法→创新疾病关键基因的筛选策略与方法→高维交互作用分析挖掘协同/拮抗因素→率先论证呼吸系统急重症的因果机制"为主线,深入地研究多种组学数据的分析方法及策略,解决了一系列统计理论方法技术难题,并成功运用于肺癌、急性呼吸窘迫综合征等研究领域. 展开更多

关键词 生物医学 大数据 组学 统计分析方法 策略

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全表观基因组关联研究的数据质控、分析流程和可视化

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作者 樊娟娟 吉昕宇 +3 位作者 沈思鹏 张汝阳 魏永越 陈峰 《中国循证医学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第6期721-728,共8页

表观遗传是指在基因遗传序列不变的前提下,外界和内在环境因素对基因产生修饰作用,导致基因表达水平或功能发生改变,进而对多种表型或疾病结局产生影响,近年来愈发受到关注。其中,DNA的甲基化修饰已被证实与人类发育和疾病发生发展密切... 表观遗传是指在基因遗传序列不变的前提下,外界和内在环境因素对基因产生修饰作用,导致基因表达水平或功能发生改变,进而对多种表型或疾病结局产生影响,近年来愈发受到关注。其中,DNA的甲基化修饰已被证实与人类发育和疾病发生发展密切相关。而全基因组尺度的甲基化检测所产生的高维度基因组学数据,能够较为全面地体现基因组层面整体和局部的表观遗传修饰情况,已成为该领域的主要研究内容之一。本文基于全基因组甲基化芯片数据,总结该类组学数据的质控流程,常见表观遗传组学关联性的统计分析方法和思路,以及基于SAS JMP Genomics 10软件的主要结果的可视化实现,为同类研究提供参考。 展开更多

关键词 全表观遗传组学关联研究 数据质控 统计分析策略 可视化

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