本研究以欧李全基因组和转录组数据为基础,对欧李AP2家族基因进行鉴定。结果表明:AP2家族基因在欧李中有17个成员,都具有两个AP2结构域。氨基酸数在356~854之间,分子量在40092.00~93434.48 k D之间,等电点为4.81~9.37之间,无规则地分布...本研究以欧李全基因组和转录组数据为基础,对欧李AP2家族基因进行鉴定。结果表明:AP2家族基因在欧李中有17个成员,都具有两个AP2结构域。氨基酸数在356~854之间,分子量在40092.00~93434.48 k D之间,等电点为4.81~9.37之间,无规则地分布在5条染色体上。二级结构多为无规则卷曲。根据亚细胞定位显示:ChAP2-7存在于细胞质中,ChAP2-3、ChAP2-6、ChAP2-11和ChAP2-15存在于细胞核中。聚类分析将其分为三大类:AP2、euANT、basal ANT,其中,ChAP2-14与At5g67180,ChAP2-16与At2g28550,ChAP2-10与At3g54320等亲缘关系最近。综合来看,AP2家族的17个基因在不同的组织和不同的品种间表达差异较大。AP2-4和AP2-6在不同组织均有表达,AP2-2,AP2-3等基因在不同组织均不表达。AP2-4和AP2-6在‘农大4号’果实中表达较高,在‘农大5号’果实中几乎不表达。本研究结果为进一步研究欧李AP2基因家族的生物学功能与利用提供参考。展开更多
文摘本研究以欧李全基因组和转录组数据为基础,对欧李AP2家族基因进行鉴定。结果表明:AP2家族基因在欧李中有17个成员,都具有两个AP2结构域。氨基酸数在356~854之间,分子量在40092.00~93434.48 k D之间,等电点为4.81~9.37之间,无规则地分布在5条染色体上。二级结构多为无规则卷曲。根据亚细胞定位显示:ChAP2-7存在于细胞质中,ChAP2-3、ChAP2-6、ChAP2-11和ChAP2-15存在于细胞核中。聚类分析将其分为三大类:AP2、euANT、basal ANT,其中,ChAP2-14与At5g67180,ChAP2-16与At2g28550,ChAP2-10与At3g54320等亲缘关系最近。综合来看,AP2家族的17个基因在不同的组织和不同的品种间表达差异较大。AP2-4和AP2-6在不同组织均有表达,AP2-2,AP2-3等基因在不同组织均不表达。AP2-4和AP2-6在‘农大4号’果实中表达较高,在‘农大5号’果实中几乎不表达。本研究结果为进一步研究欧李AP2基因家族的生物学功能与利用提供参考。
