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题名大黄鱼虹彩病毒分型PCR检测方法的建立与应用
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作者
杨西西
陈秀霞
郑在予
江秋欢
潘滢
池洪树
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机构
福建省农业科学院生物技术研究所
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出处
《福建畜牧兽医》
2024年第4期27-29,33,共4页
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基金
福建省农业科学院自由探索科技创新项目(ZYTS202214)
福建省属公益类科研院所基本科研专项(2021R1027003)资助。
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文摘
大黄鱼虹彩病毒(large yellow croaker iridovirus,LYCIV)引起的虹彩病毒病是大黄鱼夏季高温期的主要流行病害之一,对大黄鱼养殖业造成巨大的经济损失,早期诊断对该病的防治具有重要意义。本研究根据大黄鱼虹彩病毒基因组序列的ORF026特异性区域设计1对特异性引物,建立了可区分LYCIV不同亚型(RSIV-Ia和RSIV-Ib亚型)的PCR检测方法,该方法对RSIV-Ib亚型具有高度的检测特异性,对真鲷虹彩病毒、石斑鱼虹彩病毒、鳜蛙虹彩病毒、黄鳍鲷腹水病虹彩病毒、锦鲤疱疹病毒等病原均无交叉反应;检测灵敏性高,灵敏度可达到102copies/uL;对19份宁德大黄鱼养殖海区的临床阳性样品检测发现,15份样品呈RSIV-Ia亚型,4份样品呈RSIV-Ib亚型,说明该方法能够有效区分大黄鱼虹彩病毒两种不同亚型。
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关键词
大黄鱼虹彩病毒
PCR方法
亚型
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Keywords
Large yellow croaker iridovirus
PCR method
Subtype
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分类号
S943
[农业科学—水产养殖]
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题名一株寄生于大黄鱼的盾纤毛虫分子鉴定与系统进化分析
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作者
池洪树
江秋欢
潘滢
林能锋
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机构
福建省农业科学院生物技术研究所
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出处
《福建畜牧兽医》
2023年第4期1-6,共6页
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基金
福建省科技重大专项专题(2020NZ08003)
国家重点研发计划(2022YFD2401000)
福建省农业科学院对外合作项目(DWHZ-2021-10)资助。
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文摘
在大黄鱼稚鱼上发现一种可侵入患鱼体表、肌肉、腹腔和脑的盾纤毛虫,为了进一步明确该盾纤毛虫的分类地位,提取患鱼样品总DNA,对该虫株SSU rDNA和线粒体cox1部分序列进行PCR扩增、测序,与GenBank中纤毛虫的SSU rDNA和线粒体cox1序列进行同源性分析并构建系统发育树。结果显示,该盾纤毛虫874 bp的SSU rDNA部分序列与显赫针口虫(Porpostoma notata)同源性最高,相似性为98.97%。在基于SSU rDNA构建系统发育树中与显赫针口虫(P.notata)聚为一支,并独立于嗜污科(Philasteridae)的分支;获得该虫1 086 bp的cox1部分序列,与其SSU rDNA序列相比表现出更大的遗传变异度,在基于cox1部分序列构建系统发育树中,该虫株与嗜污科(Philasteridae)、尾丝虫科(Uronematidae)的分支也有一定距离。综上,该盾纤毛虫应是嗜污目(Philasterida)、针口虫属(Porpostoma)的显赫针口虫(P.notata)或其近缘种。
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关键词
盾纤毛虫
核糖体小亚基基因序列
线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基
大黄鱼
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Keywords
Scuticociliate
SSU rDNA cox1
Large yellow croaker
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分类号
Q95
[生物学—动物学]
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