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不同地区红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)养殖群体遗传多样性分析
1
作者
程慧涛
戴远棠
+8 位作者
阮炘贺
李育森
李丽华
段
旭
琢
单金红
贾弦泽
徐斌
王庆
赵会宏
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2024年第2期85-92,共8页
为了解国内广东省湛江市、广东省佛山市、广东省惠州市、广西自治区南宁市、浙江省湖州市5个地区红螯螯虾养殖群体的遗传结构,我们鉴定了红螯螯虾8个微卫星位点。利用8个微卫星标记对5个地区的红螯螯虾养殖群体进行了遗传分析,8对引物在...
为了解国内广东省湛江市、广东省佛山市、广东省惠州市、广西自治区南宁市、浙江省湖州市5个地区红螯螯虾养殖群体的遗传结构,我们鉴定了红螯螯虾8个微卫星位点。利用8个微卫星标记对5个地区的红螯螯虾养殖群体进行了遗传分析,8对引物在150个样本个体中共检测出237个等位基因。所有8个微卫星的等位基因数范围为2~10,平均为6.05。H_(o)和H_(e)平均值分别为0.490和0.614。每组的等位基因数在6.000(广西南宁GXNN)到6.625(广东佛山GDFS)之间。所有群体中平均H e在0.593(广东惠州GDHZ)到0.646(广东湛江GDZJ)之间。由此可以看出种群的遗传多样性并未显著降低。F_(is)、F_(st)值、分子方差分析(AMOVA)结果显示,这些红螯螯虾群体大部分的遗传变异来源于种群内部,并且各个群体都保持着较高水平的遗传距离,其中GDZJ和ZJHZ群体之间遗传距离最大(0.1077)。推测导致这些差异的产生可能是随机遗传漂变和人工选择。
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关键词
红螯螯虾(Cherax
quadricarinatus)
微卫星位点
遗传分析
遗传结构
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职称材料
斜带石斑鱼CCR6a基因的克隆、表达模式及抗病毒能力研究
2
作者
汪慧
何学泓
+11 位作者
秦洲
赵培杏
张敏琳
黄枫淇
段
旭
琢
贾弦泽
梁凯珊
赵会宏
冯春元
孙佩银
戴远棠
王庆
《渔业研究》
2023年第2期101-109,共9页
趋化因子受体是具有7个疏水性跨膜结构的G蛋白偶联受体,是一类低分子蛋白质,可以募集并激活白细胞作用于感染部位。相关研究表明,趋化因子及其受体在病原体感染、创伤修复、肿瘤形成及其转移等方面起重要作用。本研究从斜带石斑鱼(Epine...
趋化因子受体是具有7个疏水性跨膜结构的G蛋白偶联受体,是一类低分子蛋白质,可以募集并激活白细胞作用于感染部位。相关研究表明,趋化因子及其受体在病原体感染、创伤修复、肿瘤形成及其转移等方面起重要作用。本研究从斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)组织中克隆出了CCR6a(CC chemokine receptor 6a,CCR6a)基因ORF序列,并对其序列和进化关系进行了分析,研究该基因组织分布、亚细胞定位和抗病毒功能情况。研究结果表明:斜带石斑鱼CCR6a基因ORF序列全长为1131 bp,编码376个氨基酸;进化树分析结果表明斜带石斑鱼CCR6a与鞍带石斑鱼CCR6a聚为一支;荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CCR6a基因组织分布发现CCR6a在所有检测组织中均有表达,在免疫组织肾脏和鳃的表达量最高,在皮肤中的表达量次之;亚细胞定位显示该基因为膜分布,在石斑鱼细胞中过表达CCR6a可显著抑制赤点石斑鱼神经坏死病毒(Red-spotted grouper nervous necrosis virus,RGNN)的复制。研究结果将有助于理解鱼类趋化因子在病毒感染中的作用。
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关键词
斜带石斑鱼
CCR6a
RGNNV
抗病毒
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职称材料
题名
不同地区红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)养殖群体遗传多样性分析
1
作者
程慧涛
戴远棠
阮炘贺
李育森
李丽华
段
旭
琢
单金红
贾弦泽
徐斌
王庆
赵会宏
机构
华南农业大学
广州南沙华农渔业研究院
广东海大集团股份有限公司
广东东源县现代农业综合服务中心
出处
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2024年第2期85-92,共8页
基金
河源市科技计划项目(2019041,2021004)
国家自然科学基金(31972768,31972769,41806151)
2023年广州市级财政农业农村项目(22304146)。
文摘
为了解国内广东省湛江市、广东省佛山市、广东省惠州市、广西自治区南宁市、浙江省湖州市5个地区红螯螯虾养殖群体的遗传结构,我们鉴定了红螯螯虾8个微卫星位点。利用8个微卫星标记对5个地区的红螯螯虾养殖群体进行了遗传分析,8对引物在150个样本个体中共检测出237个等位基因。所有8个微卫星的等位基因数范围为2~10,平均为6.05。H_(o)和H_(e)平均值分别为0.490和0.614。每组的等位基因数在6.000(广西南宁GXNN)到6.625(广东佛山GDFS)之间。所有群体中平均H e在0.593(广东惠州GDHZ)到0.646(广东湛江GDZJ)之间。由此可以看出种群的遗传多样性并未显著降低。F_(is)、F_(st)值、分子方差分析(AMOVA)结果显示,这些红螯螯虾群体大部分的遗传变异来源于种群内部,并且各个群体都保持着较高水平的遗传距离,其中GDZJ和ZJHZ群体之间遗传距离最大(0.1077)。推测导致这些差异的产生可能是随机遗传漂变和人工选择。
关键词
红螯螯虾(Cherax
quadricarinatus)
微卫星位点
遗传分析
遗传结构
Keywords
Cherax quadricarinatus
microsatellite loci
genetic analysis
genetic drift
分类号
S966.1 [农业科学—水产养殖]
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职称材料
题名
斜带石斑鱼CCR6a基因的克隆、表达模式及抗病毒能力研究
2
作者
汪慧
何学泓
秦洲
赵培杏
张敏琳
黄枫淇
段
旭
琢
贾弦泽
梁凯珊
赵会宏
冯春元
孙佩银
戴远棠
王庆
机构
华南农业大学海洋学院
东源县现代农业综合服务中心
广东海元农业科技有限公司
出处
《渔业研究》
2023年第2期101-109,共9页
基金
国家自然科学基金面上项目(42176103)
广东省自然科学基金项目(2022A1515012505)
广州市科技计划项目(202002030206)。
文摘
趋化因子受体是具有7个疏水性跨膜结构的G蛋白偶联受体,是一类低分子蛋白质,可以募集并激活白细胞作用于感染部位。相关研究表明,趋化因子及其受体在病原体感染、创伤修复、肿瘤形成及其转移等方面起重要作用。本研究从斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)组织中克隆出了CCR6a(CC chemokine receptor 6a,CCR6a)基因ORF序列,并对其序列和进化关系进行了分析,研究该基因组织分布、亚细胞定位和抗病毒功能情况。研究结果表明:斜带石斑鱼CCR6a基因ORF序列全长为1131 bp,编码376个氨基酸;进化树分析结果表明斜带石斑鱼CCR6a与鞍带石斑鱼CCR6a聚为一支;荧光定量PCR(RT-qPCR)检测CCR6a基因组织分布发现CCR6a在所有检测组织中均有表达,在免疫组织肾脏和鳃的表达量最高,在皮肤中的表达量次之;亚细胞定位显示该基因为膜分布,在石斑鱼细胞中过表达CCR6a可显著抑制赤点石斑鱼神经坏死病毒(Red-spotted grouper nervous necrosis virus,RGNN)的复制。研究结果将有助于理解鱼类趋化因子在病毒感染中的作用。
关键词
斜带石斑鱼
CCR6a
RGNNV
抗病毒
Keywords
Epinephelus coioides
CCR6a
RGNNV
antiviral
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
不同地区红螯螯虾(Cherax quadricarinatus)养殖群体遗传多样性分析
程慧涛
戴远棠
阮炘贺
李育森
李丽华
段
旭
琢
单金红
贾弦泽
徐斌
王庆
赵会宏
《淡水渔业》
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
斜带石斑鱼CCR6a基因的克隆、表达模式及抗病毒能力研究
汪慧
何学泓
秦洲
赵培杏
张敏琳
黄枫淇
段
旭
琢
贾弦泽
梁凯珊
赵会宏
冯春元
孙佩银
戴远棠
王庆
《渔业研究》
2023
0
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职称材料
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