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基于Oncomine和TCGA数据库分析肌球蛋白10在头颈部鳞癌中的表达、意义及分子机制 被引量：1
1
作者 张妮 江耀飞 +2 位作者 毛明玉 欧海斌 刘羽 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2024年第5期538-544,551,共8页
目的:通过生物信息学方法分析肌球蛋白10(MYO10)基因在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达、意义及分子机制。方法:下载TCGA数据库中HNSCC样本的基因表达数据集,寻找差异基因并用基因集富集分析(GSEA)软件分析MYO10可能作用的信号通路。收... 目的:通过生物信息学方法分析肌球蛋白10(MYO10)基因在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)中的表达、意义及分子机制。方法:下载TCGA数据库中HNSCC样本的基因表达数据集,寻找差异基因并用基因集富集分析(GSEA)软件分析MYO10可能作用的信号通路。收集Oncomine数据库中MYO10表达在HNSCC中的研究,进行荟萃分析,并利用该数据库及Kaplan-Meier在线分析对MYO10在HNSCC中表达及预后进行验证。使用CPTAC、HPA在线数据库分析MYO10蛋白表达水平,使用ESTIMATE数据库、EPIC数据库探究MYO10表达和肿瘤免疫浸润的关系。使用Maftools R包、ComplexHeatmap R包探究了MYO10表达与肿瘤基因组异质性和突变景观的关系。结果:对TCGA数据库中519例HNSCC癌组织样本及44例癌旁样本进行分析,MYO10在HNSCC中显著高表达(P<0.0001)。对Oncomine数据库中的9项有关MYO10表达的HNSCC研究进行分析,MYO10在HNSCC中表达有差异(P<0.05)。生存分析发现,高表达MYO10的患者总生存期较低表达组显著降低(P<0.05)。免疫浸润相关分析显示,MYO10与多种免疫细胞浸润显著相关。GSEA分析显示,高表达的MYO10可能通过激活黏着斑激酶(FAK)、调节细胞骨架蛋白及Wnt信号通路、抑制氧化磷酸化、核糖体等信号通路发挥作用。结论:MYO10在HNSCC中高表达,其高表达可通过抑制免疫浸润、激活或抑制某些信号通路影响HNSCC患者预后,该基因有望成为治疗HNSCC的一个新靶点。 展开更多
关键词 头颈部鳞状细胞癌 肌球蛋白X Oncomine TCGA
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非小细胞肺癌局限性脑转移患者不同放疗方式的临床疗效评价
2
作者 毛明玉 杨柳 +2 位作者 张妮 欧海斌 刘羽 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2024年第4期413-419,共7页
目的:探讨全脑放疗(WBRT)、立体定向放射外科(SRS)在治疗非小细胞肺癌(NSCLC)局限性脑转移患者的临床疗效。方法:回顾性分析近4年来武汉大学中南医院肿瘤放化疗科91例NSCLC局限性脑转移患者的临床资料。依据不同放疗方式,将其分为WBRT+... 目的:探讨全脑放疗(WBRT)、立体定向放射外科(SRS)在治疗非小细胞肺癌(NSCLC)局限性脑转移患者的临床疗效。方法:回顾性分析近4年来武汉大学中南医院肿瘤放化疗科91例NSCLC局限性脑转移患者的临床资料。依据不同放疗方式,将其分为WBRT+SRS、WBRT、SRS组。对3组患者治疗疗效进行比较,分析不同放疗方式对NSCLC局限性脑转移患者总体生存时间(OS)及颅内局控时间(IPFS)的影响。结果:共纳入患者91例,其中WBRT+SRS组10人,WBRT组55人,SRS组26人,中位随访时间13个月。各组中位OS依次为17.5、16.0、12.5个月,组间脑部放疗后OS无显著差异(P=0.492);各组中位IPFS依次为11.5、7、6个月,WBRT+SRS组较WBRT、SRS组显著延长(P=0.034)。多因素分析显示,颅外病灶控制情况、全身治疗方式(靶向治疗、化学治疗)是影响OS的主要预后因素;放疗方式是影响IPFS的主要预后因素。结论:WBRT联合SRS对NSCLC局限性脑转移患者颅内病情的控制有较好的疗效,但WBRT+SRS、WBRT、SRS组间无显著生存差异。颅外病灶控制情况、全身治疗方式是影响生存的主要预后因素。 展开更多
关键词 非小细胞肺癌 脑转移瘤 全脑放疗 立体定向放射治疗 联合治疗
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钙黏蛋白S100A10对人乳腺癌细胞增殖能力的影响 被引量：3
3
作者 邵晶 欧海斌 +3 位作者 沈惠 江耀飞 席子尧 刘羽 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2021年第1期61-66,共6页
目的:探讨钙黏蛋白S100A10对人乳腺癌SK-BR-3、MCF-7细胞增殖能力的影响。方法:通过慢病毒感染构建稳定过表达S100A10的SK-BR-3、MCF-7细胞系,并用实时荧光定量PCR(qPCR)和免疫印迹法(Western Blot)检测过表达效率;通过细胞增殖实验、... 目的:探讨钙黏蛋白S100A10对人乳腺癌SK-BR-3、MCF-7细胞增殖能力的影响。方法:通过慢病毒感染构建稳定过表达S100A10的SK-BR-3、MCF-7细胞系,并用实时荧光定量PCR(qPCR)和免疫印迹法(Western Blot)检测过表达效率;通过细胞增殖实验、平板克隆实验检测S100A10对细胞增殖、克隆形成能力的影响;通过流式细胞术检测S100A10对细胞周期进程的影响,蛋白印迹法验证S100A10对周期相关蛋白cyclin D1和cyclin E1的表达影响;通过小鼠原位成瘤实验探究S100A10对乳腺癌肿瘤形成能力的影响(n=3)。结果:qPCR和Western Blot结果分别显示感染过表达慢病毒后S100A10在mRNA和蛋白水平的表达增多(P<0.05),稳定过表达S100A10的SK-BR-3及MCF-7细胞系构建成功;细胞增殖实验和平板克隆实验结果显示过表达S100A10可增强SK-BR-3及MCF-7细胞的增殖和克隆形成能力(P<0.05);流式细胞周期结果显示过表达S100A10后上述乳腺癌细胞系G0/G1期细胞减少,G2/M期细胞增多(P<0.05);Western Blot结果显示过表达S100A10后,周期相关蛋白cyclin D1和cyclin E1含量增多。小鼠原位成瘤实验结果表明过表达S100A10能显著促进乳腺癌的肿瘤形成能力(P<0.05)。结论:S100A10通过调控细胞周期增强乳腺癌SK-BR-3、MCF-7细胞的增殖能力,为后续深入探讨S100A10作为乳腺癌潜在治疗靶点的研究奠定了理论基础。 展开更多
关键词 S100A10 SK-BR-3 MCF-7 细胞增殖 细胞周期
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非传统型肌球蛋白Myo10对结肠癌细胞SW620生长的影响及其机制 被引量：3
4
作者 欧海斌 隋铭 +5 位作者 邵晶 沈惠 江耀飞 张斌 周云峰 刘羽 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2019年第4期552-557,共6页
目的:利用CRISPR/Cas9技术构建Myo10蛋白敲除稳定细胞系,探讨Myo10对结肠癌细胞SW620形态、增殖和细胞周期的影响。方法:根据sgRNA设计网站选择并合成5对针对人Myo10基因的sgRNA序列,经退火形成双链后,用T4DNA连接酶将其与经BsmBⅠ线性... 目的:利用CRISPR/Cas9技术构建Myo10蛋白敲除稳定细胞系,探讨Myo10对结肠癌细胞SW620形态、增殖和细胞周期的影响。方法:根据sgRNA设计网站选择并合成5对针对人Myo10基因的sgRNA序列,经退火形成双链后,用T4DNA连接酶将其与经BsmBⅠ线性化的Lenti-CRISPR v2慢病毒载体连接,包装成病毒感染SW620细胞。经嘌呤霉素筛选后用Western Blot检测Myo10的表达,选择敲除效率最高的sgRNA序列,进行单克隆细胞筛选,最后再用Western Blot验证Myo10是否敲除。用显微镜、Rhodanmine phalloidin细胞染色观察细胞形态;CCK-8实验及流式细胞术检测细胞增殖及细胞周期变化。结果:经测序鉴定成功构建了5对sgRNA-LentiCRISPR v2慢病毒载体,嘌呤霉素筛选后得到Myo10完全敲除的SW620细胞系。敲除Myo10的SW620细胞形态变圆,其增殖能力明显减弱,细胞周期S期比例增加。结论:成功构建Myo10完全敲除的SW620稳定细胞系;Myo10可影响SW620细胞形态和增殖能力;该实验为后续深入探讨Myo10作为结直肠癌潜在靶向基因的机制研究奠定了基础。 展开更多
关键词 Myo10 CRISPR/Cas9 SW620 细胞增殖 细胞周期
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空基自组网中基于负载均衡的路由策略 被引量：1
5
作者 欧海斌 尹艳 熊建新 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2011年第14期79-81,共3页
针对空基网中节点负载失衡以及吞吐量低下的问题,提出基于负载均衡的优化路由协议。该协议在获得位置信息的前提下,预测出通信链路的有效时间,在满足数据的时延、带宽以及链路有效性等多约束条件下,以均衡节点负载为优化目标,使得网络... 针对空基网中节点负载失衡以及吞吐量低下的问题,提出基于负载均衡的优化路由协议。该协议在获得位置信息的前提下,预测出通信链路的有效时间,在满足数据的时延、带宽以及链路有效性等多约束条件下,以均衡节点负载为优化目标,使得网络节点都能合理承担数据传输任务。仿真结果表明,该路由协议能够保证网络节点合理分担传输任务,充分利用链路资源,从而提高网络的吞吐量。 展开更多
关键词 空基自组网 负载均衡 数据传输 吞吐量 路由协议
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RFID技术和防冲撞算法的设计 被引量：1
6
作者 胡峰松 欧海斌 《中小企业管理与科技》 2012年第21期213-214,共2页
本文针对RFID技术中标签碰撞问题进行了详细的分析和研究,提出了一种改进的基于序列号对时隙数运算的排序算法用于解决标签碰撞问题,通过算法仿真得到了较好的效果,具有一定的推广意义。
关键词 RFID 防冲撞 标签冲突
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制造执行系统中的生产调度智能优化算法
7
作者 欧海斌 张传宏 《农业网络信息》 2010年第5期112-114,共3页
生产调度直接影响到生产的速度,是生产管理控制的核心部分。分析了制造执行系统中的生产流程,提出了一种生产调度智能优化算法,并将这个算法运用到南京机床厂的制造执行系统的开发中,利用这种算法编写生产调度程序,计算时间短,调度结果... 生产调度直接影响到生产的速度,是生产管理控制的核心部分。分析了制造执行系统中的生产流程,提出了一种生产调度智能优化算法,并将这个算法运用到南京机床厂的制造执行系统的开发中,利用这种算法编写生产调度程序,计算时间短,调度结果令人满意,在实际中得到了很好的运用效果。 展开更多
关键词 生产调度 制造执行系统 智能优化算法
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Myosin X对肺癌H1975细胞系放射敏感性调节及机制探讨 被引量：1
8
作者 沈惠 欧海斌 +4 位作者 邵晶 江耀飞 刘羽 张俊红 谢丛华 《中华放射肿瘤学杂志》 CSCD 北大核心 2021年第9期949-955,共7页
目的探讨Myosin X对肺癌H1975细胞系放射敏感性调节及相关机制。方法蛋白免疫印迹法检测肺癌细胞系中Myosin X表达量以获取实验对象。运用CRISPR/Cas9技术建立敲除Myosin X的H1975细胞系(KO组)和感染对照病毒的H1975细胞系(NC组),并进... 目的探讨Myosin X对肺癌H1975细胞系放射敏感性调节及相关机制。方法蛋白免疫印迹法检测肺癌细胞系中Myosin X表达量以获取实验对象。运用CRISPR/Cas9技术建立敲除Myosin X的H1975细胞系(KO组)和感染对照病毒的H1975细胞系(NC组),并进行敲除效率验证。克隆形成实验及多靶单击模型检测两组细胞对射线敏感性差异。γ-H_(2)AX焦点形成实验及RNAseq差异分析技术寻找可能参与Myonsin X介导的肺癌细胞系放射敏感性调节机制。结果Myosin X在H1975细胞中表达量明显高于其他细胞系(P<0.01)。经鉴定成功构建了Myosin X sgRNA-Lenti-CRISPR v2慢病毒载体,嘌呤霉素筛选后得到Myosin X完全敲除的H1975(KO组)及对照组(NC组)细胞系。克隆形成实验证明相较于NC组,KO组对射线的敏感性更强(D_(0)值从1.28 Gy下降至1.03 Gy,SF_(2)从0.29下降至0.21,放射敏感性比为1.24)。γ-H_(2)AX焦点形成实验显示照后1、6 h KO组形成的损伤焦点数均多于NC组(P<0.05),RNAseq差异分析技术结果显示KO组ISLR蛋白表达明显低于NC组(P<0.05)。结论敲除Myosin X可以增强肺癌H1975细胞的放射敏感性,其机制可能与干扰DNA双链损伤修复以及降低ISLR表达有关。 展开更多
关键词 肌球蛋白X CRISPR/Cas9技术 放射敏感性 H1975细胞系
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Neogenin在非小细胞肺癌预后中的临床价值及分子机制
9
作者 席子尧 李湘浪 +3 位作者 张妮 毛明玉 欧海斌 刘羽 《武汉大学学报（医学版）》 CAS 2023年第6期699-705,共7页
目的:探讨Neogenin在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达及患者预后中的临床价值,及其参与NSCLC发生发展的机制。方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)的测序数据评估NSCLC中Neogenin表达水平与癌旁正常组织是否有差异;KM-plotter数据库的资料预... 目的:探讨Neogenin在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达及患者预后中的临床价值,及其参与NSCLC发生发展的机制。方法:利用癌症基因组图谱(TCGA)的测序数据评估NSCLC中Neogenin表达水平与癌旁正常组织是否有差异;KM-plotter数据库的资料预测Neogenin在NSCLC及其不同组织亚型中的预后作用;进一步利用真实世界NSCLC的临床病理资料验证Neogenin及其配体排斥导向分子C(RGMc)在癌组织中的表达水平及其与临床病理学特征的关系。使用Cox回归分析评估探讨Neogenin、RGMc在NSCLC患者预后中的临床价值。并采用质粒构建及体外转染模型,利用共聚焦显微镜技术初步研究Neogenin参与NSCLC形成的可能机制。结果:Neogenin在NSCLC组织中表达明显下调(P<0.05)。RGMc在正常组织与癌组织中的表达并无明显差异;Neogenin表达下调与病理组织学分级、临床分期及患者不良预后显著相关(P<0.05)。体外细胞转染模型显示Neogenin通过调控胞内RGMc的转运及分布参与了RGMc介导的相关信号通路。结论:Neogenin作为抑癌基因在NSCLC组织中低表达且与患者预后显著相关。其机制可能与调控其配体RGMc在胞内的转运有关。本研究为后续深入探讨Neogenin作为抑癌基因参与NSCLC形成的分子机制研究奠定了基础。 展开更多
关键词 NEOGENIN 排斥导向分子 非小细胞肺癌 预后 囊泡转运
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一种改进的RFID标签防冲撞算法
10
作者 胡峰松 欧海斌 《计算机光盘软件与应用》 2012年第16期59-60,共2页
无线射频识别(RFID)技术是无线通讯中一项新的应用,主要利用无线电波来传递或获取各类标签中的资料信息,但在实际应用中却存在标签碰撞的问题。本文针对RFID技术中标签碰撞问题进行了详细的分析和研究,提出了一种改进的基于序列号对时... 无线射频识别(RFID)技术是无线通讯中一项新的应用,主要利用无线电波来传递或获取各类标签中的资料信息,但在实际应用中却存在标签碰撞的问题。本文针对RFID技术中标签碰撞问题进行了详细的分析和研究,提出了一种改进的基于序列号对时隙数运算的排序算法用于解决标签碰撞问题,通过仿真得到了较好的效果,具有一定的推广意义。 展开更多
关键词 RFID 防冲撞 标签冲突
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