期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到6篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
基于RNA-seq的无量山乌骨鸡(Gallus gallus)肝脏脂代谢相关miRNAs的筛选
1
作者 施艳燕 段俊保 +2 位作者 欧正淼 周杰珑 陈粉粉 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期78-90,共13页
为研究无量山乌骨鸡(Gallus gallus)肝组织脂代谢相关miRNA(microRNA)在不同发育阶段的表达特征,本研究采集出壳当日(D1)和168日龄(D168)母鸡肝组织样品作为试验材料,利用DNBSEQ平台进行测序,采用DEGseq筛选差异表达的miRNA及其靶基因,... 为研究无量山乌骨鸡(Gallus gallus)肝组织脂代谢相关miRNA(microRNA)在不同发育阶段的表达特征,本研究采集出壳当日(D1)和168日龄(D168)母鸡肝组织样品作为试验材料,利用DNBSEQ平台进行测序,采用DEGseq筛选差异表达的miRNA及其靶基因,随机选取9个差异表达miRNA进行RT-qPCR验证,KEGG通路分类筛选出脂代谢相关miRNA并进行聚类分析,预测脂代谢相关miRNA靶基因并进行GO和KEGG通路功能富集,构建脂代谢相关miRNA和靶基因关联网络。分析结果表明,筛选出106个差异表达miRNAs,包括54个上调miRNA和52个下调miRNA;聚类得到41个脂代谢相关的miRNAs;预测到38个靶基因,对靶基因的功能注释确定主要富集于甘油磷脂代谢、脂肪酸代谢和鞘脂代谢等脂质代谢相关通路,novel-gga-miR2311-5p-DGKZ、novel-gga-miR2047-3p-ACACA、novel-gga-miR866-3p-DGKH是脂代谢相关候选miRNA-mRNA关系对。研究提示无量山乌骨鸡肝组织miRNA在不同发育阶段的表达特征存在差异,研究结果可为无量山乌骨鸡肝组织miRNA调控脂代谢的分子机制提供参考。 展开更多
关键词 无量山乌骨鸡 肝组织 脂代谢 miRNA
原文传递
肉用型和蛋用型鸡胚胎期皮下脂肪组织发育特征及FASN基因表达差异分析
2
作者 冷堂健 李秋玉 +2 位作者 欧正淼 周杰珑 陈粉粉 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第10期40-46,111,共8页
为了探究爱拔益加(AA)肉鸡和海兰灰蛋鸡胚胎期皮下脂肪组织发育特征和差异,试验选取AA肉鸡和海兰灰蛋鸡种蛋各100枚进行孵化,将孵化24 h记为1胚龄(E1),从能分离到皮下脂肪组织时的胚龄开始至出壳当天(D0)选取6个时间点,每个时间点每个... 为了探究爱拔益加(AA)肉鸡和海兰灰蛋鸡胚胎期皮下脂肪组织发育特征和差异,试验选取AA肉鸡和海兰灰蛋鸡种蛋各100枚进行孵化,将孵化24 h记为1胚龄(E1),从能分离到皮下脂肪组织时的胚龄开始至出壳当天(D0)选取6个时间点,每个时间点每个品种选取8枚发育正常的鸡胚,称量胚胎重(E20包含卵黄囊重量)/体重及皮下脂肪组织(主要包括颈部、胸部及腿部的皮下脂肪)重量,计算相对皮下脂肪组织含量;称量结束后随机从8枚鸡胚中选取3枚鸡胚,取其左侧后肢皮下脂肪组织制作石蜡切片进行H.E.染色,观察皮下脂肪组织细胞发育状态和测定皮下脂肪组织细胞平均面积,同时提取皮下脂肪组织RNA,检测不同时间点脂肪酸合成酶(FASN)基因的mRNA相对表达量。结果表明:AA肉鸡和海兰灰蛋鸡胚胎重/体重均随孵化时间增加而总体呈增加趋势,均在E20后增长趋势趋于稳定,且E20和D0间差异不显著(P>0.05),但均极显著高于E12、E14、E16、E18(P<0.01);不同时间点AA肉鸡的胚胎重/体重均高于海兰灰蛋鸡,其中在E12时差异不显著(P>0.05),E14时差异显著(P<0.05),E16、E18、E20和D0时差异极显著(P<0.01)。在落盘前(E12~E18),AA肉鸡和海兰灰蛋鸡皮下脂肪组织重量、相对皮下脂肪含量和皮下脂肪细胞平均面积均随胚龄增加而增加,且同一品种不同时间点间均差异极显著(P<0.01)。在落盘后(E18后),AA肉鸡和海兰灰蛋鸡不同时间点的皮下脂肪组织重量均差异不显著(P>0.05),但AA肉鸡皮下脂肪重量均极显著高于海兰灰肉鸡(P<0.01);AA肉鸡和海兰灰蛋鸡相对皮下脂肪含量均呈先降低后升高趋势;在E18时,海兰灰蛋鸡相对皮下脂肪含量极显著高于AA肉鸡(P<0.01);AA肉鸡和海兰灰蛋鸡皮下脂肪细胞平均面积变化逐渐趋于稳定,不同时间点间均差异不显著(P>0.05)。在E12~D0时,海兰灰蛋鸡皮下脂肪细胞平均面积均大于AA肉鸡,且除在E12时两品种� 展开更多
关键词 爱拔益加(AA)肉鸡 海兰灰蛋鸡 胚胎 生长发育 皮下脂肪组织 脂肪酸合成酶(FASN)基因
原文传递
赤水乌骨鸡ExFABP基因序列生物信息学及组织表达分析 被引量：1
3
作者 吴芸 欧正淼 +2 位作者 李秋玉 陈粉粉 闫吉美 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第12期161-165,共5页
本研究旨在对赤水乌骨鸡的ExFABP基因编码区(Coding Sequence,CDS)序列进行测序及生物信息学分析,检测其在不同组织中的表达,探究ExFABP对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR对赤水乌骨鸡ExFABP基因的编码区序列进行扩增测序,并对其... 本研究旨在对赤水乌骨鸡的ExFABP基因编码区(Coding Sequence,CDS)序列进行测序及生物信息学分析,检测其在不同组织中的表达,探究ExFABP对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR对赤水乌骨鸡ExFABP基因的编码区序列进行扩增测序,并对其氨基酸序列进行生物学特性分析,构建物种进化树揭示亲缘关系,同时通过实时荧光定量PCR检测了赤水乌骨鸡不同组织中ExFABP的差异表达情况。结果显示,赤水乌骨鸡ExFABP基因编码区长537 bp,编码178个氨基酸。赤水乌骨鸡ExFABP编码氨基酸序列与原鸡的同源性最高,达到100%。系统进化树分析表明,赤水乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近。ExFABP基因在各组织中均有表达,在肺脏中的表达量最高,显著高于其他组织,在胸肌中的表达量最低。研究结果为进一步研究改善赤水乌骨鸡肉品质、风味提供基础材料。 展开更多
关键词 赤水乌骨鸡 ExFABP基因 生物信息学分析 组织表达
下载PDF
赤水乌骨鸡PITX1基因克隆、生物信息学及组织表达分析
4
作者 吴芸 欧正淼 +2 位作者 李秋玉 陈粉粉 闫吉美 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期3896-3905,共10页
【目的】克隆赤水乌骨鸡成对样同源结构域转录因子1(paired-like homeodomain transcription factor 1,PITX1)基因并进行生物信息学分析,检测PITX 1基因在赤水乌骨鸡不同组织中的表达水平,为探究PITX 1基因在鸡肌肉生长发育中的生物学... 【目的】克隆赤水乌骨鸡成对样同源结构域转录因子1(paired-like homeodomain transcription factor 1,PITX1)基因并进行生物信息学分析,检测PITX 1基因在赤水乌骨鸡不同组织中的表达水平,为探究PITX 1基因在鸡肌肉生长发育中的生物学功能提供材料。【方法】以赤水乌骨鸡胸肌组织cDNA为模板,克隆PITX 1基因CDS区序列并测序,利用在线软件对所获序列进行比对及生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测PITX 1基因在赤水乌骨鸡心脏、肝脏、脾脏、肾脏、肺脏、胸肌和腿肌组织中的表达量。【结果】赤水乌骨鸡PITX 1基因CDS区长909 bp,存在5处同义突变,编码302个氨基酸。赤水乌骨鸡PITX 1基因氨基酸序列与原鸡、绿头鸭、日本鹌鹑、兔、小鼠的相似性分别为100%、99.7%、99.0%、85.0%和84.4%,与人、牛和野猪的相似性均为85.7%。系统进化树分析表明,赤水乌骨鸡和原鸡的亲缘关系最近,与人的亲缘关系最远。赤水乌骨鸡PITX1蛋白属于亲水性蛋白,无跨膜结构和信号肽,有47个潜在磷酸化位点、1个N-糖基化修饰位点和15个O-糖基化修饰位点,主要分布在细胞核中。PITX1蛋白二级结构由无规则卷曲、α-螺旋、延伸链和β-转角组成,三级结构预测结果与其一致。蛋白互作分析结果显示,PITX1蛋白可能与BARX1、NKX2-8、POU1F1、EGR1、NR5A1、CTNNB1、TBX5和TBX4蛋白存在相互作用。实时荧光定量PCR结果显示,PITX 1基因在赤水乌骨鸡各组织中均有表达,其中在肺脏中的表达量最高,其次是肝脏和腿肌,在胸肌中的表达量最低。【结论】赤水乌骨鸡PITX 1基因CDS区长909 bp,编码302个氨基酸,为亲水性蛋白,主要分布在细胞核中。PITX 1基因在赤水乌骨鸡各组织中均有表达,且在肺脏中表达量最高。试验结果为进一步研究鸡PITX 1基因功能提供参考。 展开更多
关键词 赤水乌骨鸡 PITX 1基因 生物信息学 表达
下载PDF
赤水乌骨鸡PTGDS基因克隆、序列特征及组织表达分析
5
作者 吴芸 欧正淼 +3 位作者 殴小嫚 陈粉粉 闫吉美 李盼盼 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第23期22-27,共6页
为研究赤水乌骨鸡PTGDS基因的结构和功能,检测其在赤水乌骨鸡不同组织、胸肌和腿肌中的表达情况,探究PTGDS基因对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR获得PTGDS基因CDS序列,对其氨基酸序列进行生物信息学分析,揭示其结构特征和亲缘关... 为研究赤水乌骨鸡PTGDS基因的结构和功能,检测其在赤水乌骨鸡不同组织、胸肌和腿肌中的表达情况,探究PTGDS基因对赤水乌骨鸡肉质性能的影响。运用RT-PCR获得PTGDS基因CDS序列,对其氨基酸序列进行生物信息学分析,揭示其结构特征和亲缘关系,同时通过qPCR检测赤水乌骨鸡PTGDS基因在同一时期不同组织中的表达特性。结果显示,赤水乌骨鸡PTGDS基因编码区长558 bp,编码186个氨基酸,保守性分析发现赤水乌骨鸡PTGDS基因与原鸡的同源性最高,核酸和氨基酸序列比对同源性分别为100%;系统进化分析发现,赤水乌骨鸡与原鸡的亲缘关系最近,与黑天鹅和鸿雁的亲缘关系最远。PTGDS基因在各组织中均有表达,在肾中的表达量最高,显著高于其他组织(P<0.05);肌肉中腿肌的表达量高于胸肌,但差异不显著(P>0.05)。研究结果可为进一步揭示PTGDS基因的功能和调控机制提供参考。 展开更多
关键词 赤水乌骨鸡 PTGDS基因 生物信息学分析 组织mRNA表达
下载PDF
基于RNA-Seq的无量山乌骨鸡肝脏组织脂代谢相关基因筛选及其表达分析
6
作者 欧正淼 周家文 +2 位作者 刘莉莉 吴芸 陈粉粉 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期976-988,共13页
旨在通过分析不同日龄无量山乌骨鸡肝组织mRNA表达谱,挖掘肝脂代谢相关基因及其所参与的调控通路,并确定部分关键基因在肝发育中的表达特征。本研究采集1日龄(D1)和168日龄(D168)各3只母鸡肝组织样品,利用DNBSEQ平台进行转录组测序,随... 旨在通过分析不同日龄无量山乌骨鸡肝组织mRNA表达谱,挖掘肝脂代谢相关基因及其所参与的调控通路,并确定部分关键基因在肝发育中的表达特征。本研究采集1日龄(D1)和168日龄(D168)各3只母鸡肝组织样品,利用DNBSEQ平台进行转录组测序,随机选取10个差异表达基因进行RT-qPCR验证。以|log2FC|≥2、Q value≤0.01和差异基因KEGG分析筛选参与脂代谢的差异表达基因,对筛选出的脂代谢相关差异表达基因进行GO富集、KEGG通路和蛋白互作分析。100只雌性雏鸡以出壳体重组间无差异随机分为5组,每组20只鸡,在D1、D42、D84、D126和D168共5个阶段每组随机屠宰2只健康母鸡(n=10),并提取肝组织RNA,RT-qPCR构建部分差异基因mRNA表达谱。结果,筛选出50个与脂代谢相关的差异表达基因,其中38个基因表达上调,12个基因表达下调。差异表达基因主要富集在脂质代谢、氧化还原、脂肪酸生物合成、脂肪酸代谢、胆固醇生物合成和甾醇生物合成等过程;差异表达基因参与了类固醇生物合成、脂肪酸代谢、甘油脂类代谢、不饱和脂肪酸生物合成和PPAR信号通路。蛋白互作分析筛选出SCD、ACSBG2、SQLE、HSD17B7、LCAT和LPIN1等关键蛋白基因,通过其mRNA表达量不同参与脂代谢调控。通过转录组测序挖掘出与脂代谢相关的差异表达基因50个,且42个差异表达基因之间存在相互作用关系,该研究结果为进一步解析优质鸡脂代谢相关基因的分子调控提供了理论依据。 展开更多
关键词 无量山乌骨鸡 RNA-SEQ 肝组织 脂代谢 差异表达基因
下载PDF
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部