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尼罗罗非鱼CD247基因克隆及其组织表达分析
被引量:
6
1
作者
樊
博琳
黎源
+3 位作者
汪志文
鲁义善
王蓓
简纪常
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第6期6-12,共7页
【目的】克隆尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)CD247基因(Gen Bank登录号:MF975639;On-CD247),分析On-CD247的生物信息学特征及其在正常和经灭活无乳链球菌注射刺激的尼罗罗非鱼组织中的表达。【方法】设计CD247基因引物并对CD247基...
【目的】克隆尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)CD247基因(Gen Bank登录号:MF975639;On-CD247),分析On-CD247的生物信息学特征及其在正常和经灭活无乳链球菌注射刺激的尼罗罗非鱼组织中的表达。【方法】设计CD247基因引物并对CD247基因片段进行扩增,运用荧光定量PCR技术分析尼罗罗非鱼CD247组织分布。【结果与结论】CD247基因编码区为453 bp,编码150个氨基酸,理论分子质量为16.9 ku,等电点为6.33,在跨膜区域有保守的ASP27、Asp35残基,胞内具有三段保守的免疫受体酪氨酸激活基序(ITAM)。On-CD247序列与红笛鲷(Lutjanus sanguineus)相似性最高,为74.0%,与其他鱼类的相似性介于35.8%~73.0%之间。On-CD247在健康尼罗罗非鱼各组织中均有表达,其中在胸腺中表达量最高,其次是皮肤、肌肉、鳃,在头肾中表达量最低。经灭活无乳链球菌刺激后,On-CD247的表达量在胸腺、头肾和肠道中均显著上调,而在脾脏中却显著下调,且有明显的时序性。胸腺、头肾和肠道均在3 h表达量最高,脾脏在12 h表达量最低,头肾中的表达量也在12 h回落,表明On-CD247表达可被无乳链球菌所诱导。
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关键词
尼罗罗非鱼
CD247
基因
克隆
组织表达
无乳链球菌
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职称材料
纳米材料在渔用疫苗中的研究进展
被引量:
5
2
作者
陈信锦
王忠良
+3 位作者
黄瑜
樊
博琳
简纪常
王蓓
《广东农业科学》
CAS
2021年第1期134-141,共8页
鱼病治疗研究已从大量使用抗生素转向主要以灭活细菌为基础的疫苗开发。渔用疫苗主要为注射疫苗,虽能有效防治许多不同的水产疾病,但注射疫苗存在的副作用不可忽视。相比之下,口服疫苗和浸泡疫苗可能是鱼类接种的最佳途径,但鱼类对抗原...
鱼病治疗研究已从大量使用抗生素转向主要以灭活细菌为基础的疫苗开发。渔用疫苗主要为注射疫苗,虽能有效防治许多不同的水产疾病,但注射疫苗存在的副作用不可忽视。相比之下,口服疫苗和浸泡疫苗可能是鱼类接种的最佳途径,但鱼类对抗原的摄取有限,通常需要反复多次接种。纳米颗粒作为疫苗递送系统已被认为是改善和解决这些问题的有力工具。纳米颗粒是具有低毒性、良好生物降解性和特定物理属性(大小、表面电荷或负载能力)的分散体或固体颗粒,允许受控输送,从而改善免疫系统的靶向性和刺激性。这些纳米递送系统在鱼类中的应用还处于开发的初始阶段。综述了纳米颗粒在鱼类疫苗研究中的应用进展,重点介绍了聚乳酸-乙醇酸纳米颗粒、壳聚糖纳米颗粒、脂质体和碳纳米管,提出了未来渔用疫苗研究的热点方向以及需要解决的问题,为渔用疫苗的开发提供一个新思路。
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关键词
纳米颗粒
渔用疫苗
疫苗递送
聚乳酸-羟基乙酸(PLGA)
壳聚糖
脂质体
碳纳米管
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职称材料
运城市水产养殖现状调查及对策
被引量:
1
3
作者
郭斌
樊
博琳
《农业技术与装备》
2023年第3期48-50,共3页
运城市地处秦晋豫三省交界的黄河三角洲交界地带,具有发展渔业得天独厚的优势,作为山西省最大的商品鱼生产基地,水产品产量常年稳定在全省产量的50%左右。文章概述了运城市渔业资源特点、水产养殖现状,并提出运城市水产养殖业发展中存...
运城市地处秦晋豫三省交界的黄河三角洲交界地带,具有发展渔业得天独厚的优势,作为山西省最大的商品鱼生产基地,水产品产量常年稳定在全省产量的50%左右。文章概述了运城市渔业资源特点、水产养殖现状,并提出运城市水产养殖业发展中存在的一些问题,针对这些问题提出解决对策。
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关键词
运城市
水产养殖
现状
模式
调查
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职称材料
罗非鱼源无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)新型AI-2信号分子受体RbsB蛋白结晶生长研究
被引量:
1
4
作者
樊
博琳
潘丽霞
+3 位作者
王忠良
黎源
简纪常
王蓓
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期132-140,共9页
为了开展无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)核糖结合蛋白(Ribose binding protein B,RbsB)结构功能的研究,本实验根据已知无乳链球菌ZQ0910全基因组序列设计相关引物。采用PCR方法扩增其RbsB基因,随后将该基因定向克隆到原核表达载...
为了开展无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)核糖结合蛋白(Ribose binding protein B,RbsB)结构功能的研究,本实验根据已知无乳链球菌ZQ0910全基因组序列设计相关引物。采用PCR方法扩增其RbsB基因,随后将该基因定向克隆到原核表达载体pGEX-6p-1中,在大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中进行IPTG诱导表达;采用HRV 3C蛋白酶切除GST标签,分子筛分离获得RbsB蛋白;运用生物信息学软件对RbsB基因序列进行分析,并对RbsB蛋白二级和三级结构进行预测;采用NeXtal Tubes JCSG Core Suite结晶试剂盒筛选蛋白结晶条件。研究结果表明,该基因全长为969碱基,编码322个氨基酸,RbsB蛋白理论分子量33.9ku,等电点为9.41,二级结构中α螺旋结构所占比重最高,建立RbsB蛋白三维结构模式图;经IPTG诱导后表达的融合蛋白分子量为59ku,筛选RbsB蛋白的初始结晶条件为(0.2mol/L di-Potassium hydrogen phosphate,20%(W/V)PEG3350;1.5mol/L ammonium sulfate,25%(V/V)Glycerol),获得RbsB蛋白结晶体。本研究结果可为无乳链球菌核糖结合蛋白(RbsB)的功能解析提供实验及理论基础。
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关键词
无乳链球菌
RbsB蛋白
蛋白纯化
结晶化
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职称材料
微塑料及其表面生物膜形成的研究进展
5
作者
樊
博琳
张宇辉
王蓓
《中文科技期刊数据库(全文版)自然科学》
2024年第5期0105-0109,共5页
微塑料为粒径小于5 mm的微型塑料颗粒,对动植物、人类以及生态环境等均产生危害。尽管微塑料污染已被国际社会公认为是热点环境问题,但人们对其在水体环境中的认识仍处在初级阶段。目前国内外关于微塑料及其表面微生物的研究非常有限,...
微塑料为粒径小于5 mm的微型塑料颗粒,对动植物、人类以及生态环境等均产生危害。尽管微塑料污染已被国际社会公认为是热点环境问题,但人们对其在水体环境中的认识仍处在初级阶段。目前国内外关于微塑料及其表面微生物的研究非常有限,已有研究表明微塑料可成为微生物的新基质,而微生物主要以微生物膜形式存在。在此从微塑料及其表面形成的生物膜方面进行阐述,讲述了微塑料的主要来源,微塑料表面生物膜与微生物的多样性,微生物膜的形成对细菌病原菌的选择性富集作用,微生物膜的形成增加了水生生态系统中的基因交换以及微生物膜的形成是对多重抗生素和金属产生的一种共作用耐药机制。提出了未来微塑料研究的热点方向建议,通过对微塑料生物膜的分析,以期为微塑料污染的研究和治理提供新的解决思路。
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关键词
微塑料
生物膜
作用机制
防治建议
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职称材料
题名
尼罗罗非鱼CD247基因克隆及其组织表达分析
被引量:
6
1
作者
樊
博琳
黎源
汪志文
鲁义善
王蓓
简纪常
机构
广东海洋大学水产学院
广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室
广东省水产经济动物病害控制重点实验室
出处
《广东海洋大学学报》
CAS
2018年第6期6-12,共7页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31702386)
广东省科技厅国际科技合作领域项目(2017A050501037)
文摘
【目的】克隆尼罗罗非鱼(Oreochromis niloticus)CD247基因(Gen Bank登录号:MF975639;On-CD247),分析On-CD247的生物信息学特征及其在正常和经灭活无乳链球菌注射刺激的尼罗罗非鱼组织中的表达。【方法】设计CD247基因引物并对CD247基因片段进行扩增,运用荧光定量PCR技术分析尼罗罗非鱼CD247组织分布。【结果与结论】CD247基因编码区为453 bp,编码150个氨基酸,理论分子质量为16.9 ku,等电点为6.33,在跨膜区域有保守的ASP27、Asp35残基,胞内具有三段保守的免疫受体酪氨酸激活基序(ITAM)。On-CD247序列与红笛鲷(Lutjanus sanguineus)相似性最高,为74.0%,与其他鱼类的相似性介于35.8%~73.0%之间。On-CD247在健康尼罗罗非鱼各组织中均有表达,其中在胸腺中表达量最高,其次是皮肤、肌肉、鳃,在头肾中表达量最低。经灭活无乳链球菌刺激后,On-CD247的表达量在胸腺、头肾和肠道中均显著上调,而在脾脏中却显著下调,且有明显的时序性。胸腺、头肾和肠道均在3 h表达量最高,脾脏在12 h表达量最低,头肾中的表达量也在12 h回落,表明On-CD247表达可被无乳链球菌所诱导。
关键词
尼罗罗非鱼
CD247
基因
克隆
组织表达
无乳链球菌
Keywords
Nile tilapia(Oreochromis niloticus)
CD247
gene
clone
tissue expression
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
Q959.483
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职称材料
题名
纳米材料在渔用疫苗中的研究进展
被引量:
5
2
作者
陈信锦
王忠良
黄瑜
樊
博琳
简纪常
王蓓
机构
广东海洋大学水产学院/广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室/广东省水产经济动物病害控制重点实验室
中国科学院实验海洋生物学重点实验室/中国科学院海洋研究所/海洋生物学与生物技术功能实验室/青岛海洋科学与技术试点国家实验室
出处
《广东农业科学》
CAS
2021年第1期134-141,共8页
基金
国家自然科学基金(31702386)
广东省国际科技合作领域项目(2017A050501037)。
文摘
鱼病治疗研究已从大量使用抗生素转向主要以灭活细菌为基础的疫苗开发。渔用疫苗主要为注射疫苗,虽能有效防治许多不同的水产疾病,但注射疫苗存在的副作用不可忽视。相比之下,口服疫苗和浸泡疫苗可能是鱼类接种的最佳途径,但鱼类对抗原的摄取有限,通常需要反复多次接种。纳米颗粒作为疫苗递送系统已被认为是改善和解决这些问题的有力工具。纳米颗粒是具有低毒性、良好生物降解性和特定物理属性(大小、表面电荷或负载能力)的分散体或固体颗粒,允许受控输送,从而改善免疫系统的靶向性和刺激性。这些纳米递送系统在鱼类中的应用还处于开发的初始阶段。综述了纳米颗粒在鱼类疫苗研究中的应用进展,重点介绍了聚乳酸-乙醇酸纳米颗粒、壳聚糖纳米颗粒、脂质体和碳纳米管,提出了未来渔用疫苗研究的热点方向以及需要解决的问题,为渔用疫苗的开发提供一个新思路。
关键词
纳米颗粒
渔用疫苗
疫苗递送
聚乳酸-羟基乙酸(PLGA)
壳聚糖
脂质体
碳纳米管
Keywords
nanoparticles
fish vaccines
vaccine delivery
polylactic acid-glycolic acid(PLGA)
chitosan
liposome
carbon nanotubes
分类号
S917.4 [农业科学—水产科学]
下载PDF
职称材料
题名
运城市水产养殖现状调查及对策
被引量:
1
3
作者
郭斌
樊
博琳
机构
运城市农业农村局
出处
《农业技术与装备》
2023年第3期48-50,共3页
文摘
运城市地处秦晋豫三省交界的黄河三角洲交界地带,具有发展渔业得天独厚的优势,作为山西省最大的商品鱼生产基地,水产品产量常年稳定在全省产量的50%左右。文章概述了运城市渔业资源特点、水产养殖现状,并提出运城市水产养殖业发展中存在的一些问题,针对这些问题提出解决对策。
关键词
运城市
水产养殖
现状
模式
调查
Keywords
Yuncheng City
aquaculture current situation
model
investigation
分类号
S9-9 [农业科学—水产科学]
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职称材料
题名
罗非鱼源无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)新型AI-2信号分子受体RbsB蛋白结晶生长研究
被引量:
1
4
作者
樊
博琳
潘丽霞
王忠良
黎源
简纪常
王蓓
机构
广东海洋大学水产学院广东省水产经济动物病原生物学及流行病学重点实验室广东省水产经济动物病害控制重点实验室
广西科学院
中国科学院实验海洋生物学重点实验室中国科学院海洋研究所
海洋生物学与生物技术功能实验室青岛海洋科学与技术试点国家实验室
出处
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期132-140,共9页
基金
国家自然科学基金项目,31702386号
广东省科技厅国际合作领域项目,2017A050501037号
文摘
为了开展无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)核糖结合蛋白(Ribose binding protein B,RbsB)结构功能的研究,本实验根据已知无乳链球菌ZQ0910全基因组序列设计相关引物。采用PCR方法扩增其RbsB基因,随后将该基因定向克隆到原核表达载体pGEX-6p-1中,在大肠杆菌BL21(DE3)感受态细胞中进行IPTG诱导表达;采用HRV 3C蛋白酶切除GST标签,分子筛分离获得RbsB蛋白;运用生物信息学软件对RbsB基因序列进行分析,并对RbsB蛋白二级和三级结构进行预测;采用NeXtal Tubes JCSG Core Suite结晶试剂盒筛选蛋白结晶条件。研究结果表明,该基因全长为969碱基,编码322个氨基酸,RbsB蛋白理论分子量33.9ku,等电点为9.41,二级结构中α螺旋结构所占比重最高,建立RbsB蛋白三维结构模式图;经IPTG诱导后表达的融合蛋白分子量为59ku,筛选RbsB蛋白的初始结晶条件为(0.2mol/L di-Potassium hydrogen phosphate,20%(W/V)PEG3350;1.5mol/L ammonium sulfate,25%(V/V)Glycerol),获得RbsB蛋白结晶体。本研究结果可为无乳链球菌核糖结合蛋白(RbsB)的功能解析提供实验及理论基础。
关键词
无乳链球菌
RbsB蛋白
蛋白纯化
结晶化
Keywords
Streptococcus agalactiae
RbsB protein
protein purification
crystallization
分类号
Q789 [生物学—分子生物学]
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职称材料
题名
微塑料及其表面生物膜形成的研究进展
5
作者
樊
博琳
张宇辉
王蓓
机构
运城市农业农村局
水产技术推广服务工作站
广东海洋大学水产学院
广东省水产动物病害防控与健康养殖重点实验室
出处
《中文科技期刊数据库(全文版)自然科学》
2024年第5期0105-0109,共5页
基金
国家自然科学基金(32002426,U20A2065,32073006)
广东省科技厅国际合作领域项目(2017A050501037)。
文摘
微塑料为粒径小于5 mm的微型塑料颗粒,对动植物、人类以及生态环境等均产生危害。尽管微塑料污染已被国际社会公认为是热点环境问题,但人们对其在水体环境中的认识仍处在初级阶段。目前国内外关于微塑料及其表面微生物的研究非常有限,已有研究表明微塑料可成为微生物的新基质,而微生物主要以微生物膜形式存在。在此从微塑料及其表面形成的生物膜方面进行阐述,讲述了微塑料的主要来源,微塑料表面生物膜与微生物的多样性,微生物膜的形成对细菌病原菌的选择性富集作用,微生物膜的形成增加了水生生态系统中的基因交换以及微生物膜的形成是对多重抗生素和金属产生的一种共作用耐药机制。提出了未来微塑料研究的热点方向建议,通过对微塑料生物膜的分析,以期为微塑料污染的研究和治理提供新的解决思路。
关键词
微塑料
生物膜
作用机制
防治建议
分类号
X505 [环境科学与工程—环境工程]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
尼罗罗非鱼CD247基因克隆及其组织表达分析
樊
博琳
黎源
汪志文
鲁义善
王蓓
简纪常
《广东海洋大学学报》
CAS
2018
6
下载PDF
职称材料
2
纳米材料在渔用疫苗中的研究进展
陈信锦
王忠良
黄瑜
樊
博琳
简纪常
王蓓
《广东农业科学》
CAS
2021
5
下载PDF
职称材料
3
运城市水产养殖现状调查及对策
郭斌
樊
博琳
《农业技术与装备》
2023
1
下载PDF
职称材料
4
罗非鱼源无乳链球菌(Streptococcus agalactiae)新型AI-2信号分子受体RbsB蛋白结晶生长研究
樊
博琳
潘丽霞
王忠良
黎源
简纪常
王蓓
《海洋与湖沼》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
下载PDF
职称材料
5
微塑料及其表面生物膜形成的研究进展
樊
博琳
张宇辉
王蓓
《中文科技期刊数据库(全文版)自然科学》
2024
0
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职称材料
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