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油橄榄转录组数据库中HMGR基因的挖掘及生物信息学分析 被引量:6
1
作者 王浩君 蒲祥 +4 位作者 朱庆平 谢琴鼎 陈华萍 黄乾明 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期3011-3024,共14页
药用植物中萜类次生代谢产物数量庞大,结构多样,药理活性突出。3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)是MVA途径中第一个速控酶,对药用植物活性萜类成分的生物合成起重要调控作用。HMGR在很多植物中均有研究,但未见油橄榄中该基因... 药用植物中萜类次生代谢产物数量庞大,结构多样,药理活性突出。3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR)是MVA途径中第一个速控酶,对药用植物活性萜类成分的生物合成起重要调控作用。HMGR在很多植物中均有研究,但未见油橄榄中该基因的报道。本研究从油橄榄转录组数据库中挖掘到两条HMGR基因序列(Oe HMGR1和Oe HMGR2),并对其编码蛋白的理化性质、结构特征、功能及系统进化关系进行了预测分析。结果表明,Oe HMGR1基因与人参Pg HMGR基因一致性达到80%,含有1 713 bp的开放阅读框(ORF);Oe HMGR2基因与人参Pg HMGR基因一致性达到76%,含有1 773 bp的ORF。Oe HMGR基因编码蛋白均包含2个跨膜区,不含信号肽,具有N、L、S 3个催化活性中心结构域。Oe HMGR基因位于双子叶植物进化枝,在进化中保守度较高,Oe HMGR1与Eu HMGR和Pg HMGR遗传距离较近,Oe HMGR2与Js HMGR遗传距离最近。本研究为进一步鉴定Oe HMGR的功能和开展萜类成分的合成生物学研究提供了一定的理论依据。 展开更多
关键词 HMGR 油橄榄 转录组 基因挖掘 生物信息学
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油橄榄分子标记及转录组学研究进展 被引量:5
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作者 周力 +4 位作者 唐开宇 朱庆平 谢琴鼎 陈华萍 黄乾明 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2016年第12期3469-3478,共10页
油橄榄(Olea europaea L.)为世界"四大木本油料植物"之一,含有多酚、黄酮、苦苷等生物活性物质以及多种有益人类健康的微量元素,具有重要的营养价值和经济价值。分子标记技术的快速发展,为油橄榄开展遗传多样性、遗传变异、... 油橄榄(Olea europaea L.)为世界"四大木本油料植物"之一,含有多酚、黄酮、苦苷等生物活性物质以及多种有益人类健康的微量元素,具有重要的营养价值和经济价值。分子标记技术的快速发展,为油橄榄开展遗传多样性、遗传变异、种质资源和育种等研究提供了有效途径。而油橄榄转录组学的研究,为匮乏的油橄榄基因组信息提供了重要参考价值,打开了油橄榄的基因组时代。本综述对近年来几种分子标记技术在油橄榄中的应用以及油橄榄转录组学研究进行综述和讨论,以期为油橄榄分子方面的进一步研究提供信息。 展开更多
关键词 油橄榄 分子标记 遗传多样性 转录组
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油橄榄类黄酮生物合成相关酶的研究进展 被引量:4
3
作者 唐亚琴 +3 位作者 陈瑶 谢琴鼎 黄乾明 陈华萍 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期2110-2117,共8页
类黄酮是酚类代谢物的一大亚组,其生物合成属于苯丙素代谢途径的分支,它们广泛分布在整个植物界。不仅在植物中有极其重要的生理、生化和生态功能,而且对动物的生物活性及提供营养等方面做出重要贡献。油橄榄叶、果实、根都富含类黄酮,... 类黄酮是酚类代谢物的一大亚组,其生物合成属于苯丙素代谢途径的分支,它们广泛分布在整个植物界。不仅在植物中有极其重要的生理、生化和生态功能,而且对动物的生物活性及提供营养等方面做出重要贡献。油橄榄叶、果实、根都富含类黄酮,具有重要研究价值。本研究综述了油橄榄类黄酮生物合成途径相关酶(CHI,CHS,F3H,DFR,FLS,FNSI,LAR,F3'H,F3',5'H)的底物特异性和功能性区域,分析总结了编码这些酶的基因在不同物种间的序列相似性和在不同组织的表达特异性。这对深入研究植物类黄酮生物合成相关酶的结构和功能,基因的克隆、表达和调控以及对油橄榄类黄酮生物合成途径相关酶的研究具有参考价值。 展开更多
关键词 油橄榄 类黄酮 相关酶 底物特异性 保守位点
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油橄榄叶挥发油研究进展 被引量:1
4
作者 唐开宇 +4 位作者 谢琴鼎 陈瑶 唐亚琴 黄乾明 陈华萍 《分子植物育种》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期2702-2707,共6页
文章综述了近年来国内外叶挥发油常见提取方法;水蒸气蒸馏法、溶剂浸提法、同时蒸馏法、顶空固相微萃取法、超临界CO_2萃取法以及新型混合太阳能蒸馏提取法,并分析比较各种方法的优缺点;归纳出油橄榄叶挥发油主要化学成分为脂肪族化合... 文章综述了近年来国内外叶挥发油常见提取方法;水蒸气蒸馏法、溶剂浸提法、同时蒸馏法、顶空固相微萃取法、超临界CO_2萃取法以及新型混合太阳能蒸馏提取法,并分析比较各种方法的优缺点;归纳出油橄榄叶挥发油主要化学成分为脂肪族化合物、萜烯类化合物、芳香族化合物及其它含氮含硫化合物及其生物活性,以期为油橄榄的综合开发利用奠定基础。 展开更多
关键词 油橄榄 叶挥发油 研究进展
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油橄榄HMGR基因家族的克隆表达及功能验证
5
作者 蒲祥 +4 位作者 朱庆平 谢琴鼎 陈华萍 杨泽身 黄乾明 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第5期2003-2012,共10页
3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR),催化3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A(HMG-Co A)生成甲羟戊酸(MVA),是MVA途径中第一个关键酶。油橄榄是一种重要的经济油料作物,其含有的萜类物质具有重要营养价值,但关于调控萜类物质代... 3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶(HMGR),催化3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A(HMG-Co A)生成甲羟戊酸(MVA),是MVA途径中第一个关键酶。油橄榄是一种重要的经济油料作物,其含有的萜类物质具有重要营养价值,但关于调控萜类物质代谢途径的关键基因研究较少。为研究萜类合成途径关键酶基因HMGR,本研究采用RT-PCR法克隆油橄榄HMGR基因,进行生物信息学分析及构建原核表达载体,对表达蛋白生物活性进行功能验证,并采用荧光定量PCR分析HMGR在油橄榄不同生长阶段的表达量。结果表明:克隆出油橄榄HMGR基因家族的三个基因,分别命名为Oe HMGR1、Oe HMGR2、Oe HMGR3,m RNA ORF的长度分别为1 713 bp、1 773 bp、1 737 bp,编码570、590、578个氨基酸;基因编码蛋白均有2个跨膜区及HMGR催化活性的结构域,不含信号肽;构建了原核表达载体p ET30b(+)-Oe HMGR,转入到大肠杆菌BL21中成功表达,3个重组酶蛋白分子量大小均在66.2~68.0 k D之间,分离纯化重组蛋白进行功能验证,GC-MS检测表明该蛋白具有HMGR催化活性功能;荧光定量PCR分析表明该家族基因在果实和叶片中表达量较高,而在根、茎、花中表达量较低,在开花后45 d、90 d、120 d表达量较低,但在花后165 d表达量上升至较高水平。该研究为进一步鉴定Oe HMGR的功能及油橄榄萜类物质的合成生物学研究奠定基础。 展开更多
关键词 油橄榄 3-羟基-3-甲基戊二酸单酰辅酶A还原酶 基因克隆 生物信息学 原核表达 荧光定量PCR
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青川县笋用竹产业发展实践探索与策略剖析 被引量:1
6
作者 贾春红 +3 位作者 刘义明 张勇 文林章 王裕斌 《南方农业》 2021年第3期162-163,共2页
青川县是四川省林业大县,当地林业产业在林农经济收入中占有很大比重。近年来,青川县大力推进示范园区建设、产品结构转化、产业融合发展,笋用竹产业发展成效显著,但仍受经营管理水平、产品加工能力、产业融合程度等因素制约。基于此,... 青川县是四川省林业大县,当地林业产业在林农经济收入中占有很大比重。近年来,青川县大力推进示范园区建设、产品结构转化、产业融合发展,笋用竹产业发展成效显著,但仍受经营管理水平、产品加工能力、产业融合程度等因素制约。基于此,阐述青川县笋用竹产业发展取得的成效,分析笋用竹产业发展相关的制约因素,并提出相关的解决策略,以期为笋用竹产业的可持续发展提供参考。 展开更多
关键词 笋用竹 产业发展 制约因素 策略 四川省青川县
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青川县茶树村生态扶贫模式及对策
7
作者 贾春红 +1 位作者 邓海鹰 文在飞 《南方农业》 2021年第5期133-135,共3页
生态扶贫是一种科学的扶贫发展模式,协调扶贫发展与生态保护,实现了生态效益和经济利润双赢。基于此,以四川省广元市青川县茶树村为例,研究了在精准扶贫思想下该贫困村的生态扶贫模式,提出了一些对策,以期为该地区未来生态文明建设提供... 生态扶贫是一种科学的扶贫发展模式,协调扶贫发展与生态保护,实现了生态效益和经济利润双赢。基于此,以四川省广元市青川县茶树村为例,研究了在精准扶贫思想下该贫困村的生态扶贫模式,提出了一些对策,以期为该地区未来生态文明建设提供一定的理论基础和参考价值。 展开更多
关键词 生态扶贫 模式 生态文明 四川省青川县茶树村
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