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基于SLAF-seq技术的沙带鱼(Lepturacanthus savala)微卫星标记开发以及在近缘种中的通用性 被引量：9
1
作者 张浩冉 梁镇邦 +6 位作者 吴仁协 牛素芳 梁炎 王权 韦欢 肖瑶 孙贝 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第8期3331-3338,共8页
沙带鱼是带鱼科中一种重要的海洋经济鱼类,广泛分布于印度-西太平洋海域。近年来,过度捕捞和渔业生态环境变化使沙带鱼的自然资源和种群结构受到了严重影响。因此,为了制定出科学合理的资源保护和管理措施,急需开发出大量多态的沙带鱼... 沙带鱼是带鱼科中一种重要的海洋经济鱼类,广泛分布于印度-西太平洋海域。近年来,过度捕捞和渔业生态环境变化使沙带鱼的自然资源和种群结构受到了严重影响。因此,为了制定出科学合理的资源保护和管理措施,急需开发出大量多态的沙带鱼微卫星位点以促进其种群遗传学研究。本研究采用SLAF-seq技术,首次在沙带鱼基因组DNA中筛选出28个多态性微卫星位点。每个位点的等位基因数为2~18,平均值9.11;观测杂合度和期望杂合度分别为0.077~0.871（平均值0.634）和0.151~0.942（平均值0.711）;各位点多态信息含量为0.137~0.919,平均值0.670。经过Bonferroni校正后,有3个位点显著偏离哈迪-温伯格平衡（HWE）,并显示出较高的近交系数和无效等位基因频率,其余25个位点均符合HWE。这些多态性微卫星DNA标记可为沙带鱼的种群遗传资源研究提供有效的分子标记和技术支撑。此外,跨物种扩增结果表明,有19个微卫星标记在4种带鱼属鱼类中具有较好的通用性,这些标记可为阐明带鱼科属间或种间的系统进化关系提供新的研究手段和视角。 展开更多
关键词 沙带鱼 微卫星标记 高通量测序 SLAF-seq技术 跨物种通用性
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中国近海带鱼Trichiurus japonicus的命名和分类学地位研究 被引量：6
2
作者 吴仁协 张浩冉 +6 位作者 郭刘军 孙贝 刘静 庄志猛 柳淑芳 牛素芳 梁镇邦 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2018年第9期3782-3791,共10页
带鱼属（Trichiurus）鱼类是中国最重要的海洋渔业捕捞对象之一。然而,有关中国南北沿海均有分布的这种带鱼（简称中国近海带鱼）应取何名、属于何种及其系统进化过程等问题仍未有统一的认识和定论。本研究通过测定中国近海带鱼14个群... 带鱼属（Trichiurus）鱼类是中国最重要的海洋渔业捕捞对象之一。然而,有关中国南北沿海均有分布的这种带鱼（简称中国近海带鱼）应取何名、属于何种及其系统进化过程等问题仍未有统一的认识和定论。本研究通过测定中国近海带鱼14个群体共计166个个体的线粒体16S r RNA基因序列,分析该物种与中国近海其他3种带鱼属鱼类的序列变异,比较该种带鱼与世界其他带鱼属有效种的形态差异,综合探讨其命名、分类地位及系统进化过程。基于Kimura双参数模型计算,中国近海带鱼（Tsp-CH）与台湾（Tj-WT）及日本（Tj-JP）的带鱼（Trichiurus japonicus）的组间净遗传距离（0.000 7-0.002 1）远低于带鱼属内其他种间的净遗传距离（0.065 6-0.082 0）,也明显低于高鳍带鱼（Trichiurus lepturus）地理群体间的遗传距离（0.010-0.016）;分子变异分析（AMOVA）和FST分析均表明这三组带鱼组间遗传分化不显著。结果表明,中国近海带鱼与来自台湾及日本的带鱼（T.japonicus）的遗传分化处于种内水平。采用邻接法构建的分子系统树显示,不同地理来源的带鱼（T.japonicus）（即包括Tsp-CH,Tj-WT,Tj-JP）与高鳍带鱼（T.lepturus）、南海带鱼（Trichiurus nanhaiensis）、短带鱼（Trichiurus brevis）等3种带鱼属鱼类互为单系,在属内各自形成独立的进化分支。结合分子数据和形态学比较研究资料,本研究确认中国南北沿海均有分布的这种带鱼是Trichiurus japonicus Temminck et Schlegel,1844,它在种的分化、形成、分布及形态上与世界其他带鱼属鱼类存在系列差异。 展开更多
关键词 带鱼 中国近海 16S RRNA基因 序列变异 分类 系统进化
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利用SLAF-seq技术开发带鱼(Trichiurus japonicus)微卫星标记以及跨物种扩增检测 被引量：6
3
作者 张浩冉 梁镇邦 +6 位作者 吴仁协 牛素芳 柯宗宇 宿帅 韦欢 王权 孙贝 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2019年第2期574-585,共12页
带鱼(Trichiurus japonicus)是广泛分布于东亚大陆架海域的暖温性近底层鱼类,长期位居我国单鱼种渔获量第一位。自上世纪70年代以来,持续过度捕捞和海洋环境变化导致中国近海带鱼资源基础和遗传多样性受到严重影响,但有关带鱼种群的微卫... 带鱼(Trichiurus japonicus)是广泛分布于东亚大陆架海域的暖温性近底层鱼类,长期位居我国单鱼种渔获量第一位。自上世纪70年代以来,持续过度捕捞和海洋环境变化导致中国近海带鱼资源基础和遗传多样性受到严重影响,但有关带鱼种群的微卫星DNA标记研究却较为缺乏,不利于该物种遗传资源评估和保护。为此,本研究采用基于高通量测序平台的SLAF-seq技术,从带鱼的195 308个SLAF标签中识别出25 704个二至六碱基重复微卫星位点。经过引物扩增验证,最终筛选出36个具有多态性的微卫星标记。各位点等位基因数4～35,均值14.47。观测杂合度0.214～1.000,期望杂合度0.456～0.979,均值分别为0.620和0.803。所有位点的多态信息含量值均大于0.25。经Bonferroni校正,21个位点符合哈迪-温伯格平衡,且各位点间不存在连锁不平衡。这21个多态性微卫星标记可为带鱼的种群遗传资源研究提供新的有效分子标记和技术支撑。Bottleneck分析结果表明,宁波近海带鱼群体未检测到近期的遗传瓶颈效应,这可能与目前东海区带鱼野生群体数量还比较庞大、遗传变异仍然较为丰富有关。跨物种扩增结果显示,分别有12、16、4和3个带鱼微卫星标记在带鱼属(Trichiurus)、沙带鱼(Lepturacanthus savala)、窄颅带鱼(Tentoriceps cristatus)及小带鱼(Eupleurogrammus muticus)中具有较好的通用性,这些微卫星标记为今后带鱼科相应属、种的系统进化关系研究提供新的分析手段和契机。 展开更多
关键词 带鱼 微卫星DNA标记 高通量测序 SLAF-seq技术 跨物种扩增
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石斑鱼转录因子NR1D1和NR1D2在冷胁迫中的调控作用
4
作者 苗奔奔 林楚 +4 位作者 曹文科 梁燕珊 吴仁协 牛素芳 梁镇邦 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第1期147-159,共13页
NR1D1和NR1D2转录因子属于核受体转录因子家族,二者通过调控靶基因表达参与众多生物学过程,尤其在昼夜节律调节中发挥重要作用。本研究通过分析NR1D1和NR1D2的蛋白质分子特征以及在冷胁迫下珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus♀&... NR1D1和NR1D2转录因子属于核受体转录因子家族,二者通过调控靶基因表达参与众多生物学过程,尤其在昼夜节律调节中发挥重要作用。本研究通过分析NR1D1和NR1D2的蛋白质分子特征以及在冷胁迫下珍珠龙胆石斑鱼(Epinephelus fuscoguttatus♀×Epinephelus lanceolatus♂)的基因调控关系以及它们所参与的通路,揭示它们在鱼类低温环境中的功能作用。生物信息学比较分析显示NR1D1和NR1D2基因序列均有23个开放阅读框,编码的蛋白质均属于不稳定的亲水性蛋白质。NR1D1和NR1D2蛋白质均含有ZF-C4类锌脂蛋白结构域和Hormone_Recep核激素受体的配体结合域,主要配体为含铁原卟啉IX。这两种蛋白主要在细胞核中发挥调控基因表达的作用,且与昼夜节律通路的多个关键基因有直接作用关系。结果表明,在冷胁迫下NR1D1和NR1D2作为转录因子可通过调控靶基因的表达,参与昼夜节律调节并促进糖脂代谢、线粒体氧化等过程,为珍珠龙胆石斑鱼提供必要的能量,有助于增强其耐寒性。 展开更多
关键词 海洋生物学 珍珠龙胆石斑鱼 冷胁迫 核受体转录因子家族 昼夜节律调节
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南海北部近海5种石斑鱼的骨骼系统比较研究
5
作者 吴晓东 陈菁菁 +4 位作者 徐佳晟 李海燕 梁镇邦 初庆柱 吴仁协 《广西科学院学报》 2024年第1期93-102,共10页
为揭示骨骼系统在石斑鱼类的物种鉴定和系统进化关系研究中的应用潜力,本研究采用传统的骨骼系统比较法分析南海北部近海的尾纹九棘鲈(Cephalopholis urodeta)、鸢鮨(Triso dermopterus)、青石斑鱼(Epinephelus awoara)、拟青石斑鱼(E.f... 为揭示骨骼系统在石斑鱼类的物种鉴定和系统进化关系研究中的应用潜力,本研究采用传统的骨骼系统比较法分析南海北部近海的尾纹九棘鲈(Cephalopholis urodeta)、鸢鮨(Triso dermopterus)、青石斑鱼(Epinephelus awoara)、拟青石斑鱼(E.fasciatomaculosus)和断带石斑鱼(E.craigi)等3属5种石斑鱼类的骨骼特征。结果显示,在分析的15种骨片中,中筛骨、额骨、翼耳骨、上枕骨、前鳃盖骨、上匙骨、尾舌骨等7种骨片显示出明显的属特征。尾纹九棘鲈的骨片形态结构总体较简单,而鸢鮨和石斑鱼属(Epinephelus)石斑鱼的骨片形态结构更为分化且复杂,并且二者具有相似类型的骨片数最多(8种)。有10种骨片可将断带石斑鱼与青石斑鱼、拟青石斑鱼有效区分,其中翼蝶骨、蝶耳骨、翼耳骨、上枕骨和前鳃盖骨等5种骨片在断带石斑鱼中显示出显著的种类特性。青石斑鱼和拟青石斑鱼的主要骨骼差异在于额骨、前鳃盖骨、上匙骨。本研究的结果支持了鸢鮨属(Triso)与石斑鱼属有较为密切的亲缘关系以及九棘鲈属(Cephalopholis)是较石斑鱼属更为原始的一个独立类群的分子系统学研究结论。同时,本研究为断带石斑鱼的物种有效性提供了骨骼方面的重要证据,也厘清了青石斑鱼和拟青石斑鱼这两个近缘种的差别。本研究结果表明骨骼系统可作为石斑鱼物种辨别和阐明其系统进化关系的重要研究手段。 展开更多
关键词 南海北部近海 石斑鱼科 骨骼比较 物种鉴别 系统进化
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竹?鱼微卫星标记开发及跨物种扩增 被引量：1
6
作者 梁镇邦 吴仁协 +1 位作者 牛素芳 罗惠桂 《广东海洋大学学报》 CAS 2019年第4期5-12,共8页
【目的】筛选高多态性竹?鱼(Trachurus japonicus)微卫星(SSR)标记,并验证其在鲹科鱼类中的通用性。【方法】采用SLAF-seq技术识别竹?鱼基因组SSR标记,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点,并进行跨物种PCR扩增。【结... 【目的】筛选高多态性竹?鱼(Trachurus japonicus)微卫星(SSR)标记,并验证其在鲹科鱼类中的通用性。【方法】采用SLAF-seq技术识别竹?鱼基因组SSR标记,利用聚丙烯酰胺凝胶电泳和毛细管电泳筛选高多态性位点,并进行跨物种PCR扩增。【结果与结论】识别出43264个二至六碱基重复SSR标记,二、三碱基重复SSR标记较多(90.33%)。筛选出37个多态性的二、三碱基SSR位点,各位点的等位基因数为4~26,期望杂合度为0.481~0.935,多态信息含量为0.440~0.934。有30个位点符合哈迪-温伯格平衡,且各位点间不存在连锁不平衡现象。共有28个竹.鱼SSR标记可在1种以上鲹科鱼类中有效扩增,分别有24、21、20、19和11个SSR位点可在蓝圆鲹(Decapterus maruadsi)、长身圆鲹(Decapterus macrosoma)、无斑圆鲹(Decapterus kurroides)、颌圆鲹(Decapterus macarellus)及金带细鲹(Selaroides leptolepis)中稳定扩增,可为竹?鱼遗传资源评估和部分鲹科鱼类的系统进化分析提供重要遗传物质基础及有力的分析手段。 展开更多
关键词 竹.鱼 微卫星标记 跨物种扩增 SLAF-Seq技术
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《海洋无脊椎动物学实验》教材的编写与探索
7
作者 吴仁协 梁镇邦 +3 位作者 罗晓霞 王学锋 牛素芳 谢恩义 《科教文汇》 2023年第17期95-98,共4页
海洋无脊椎动物学实践教学是国内涉海学科高校常开设的一项专业基础训练,但至今未有配套的实验教材出版。文章通过阐述《海洋无脊椎动物学实验》教材编写的必要性和意义、指导思想和实践过程,总结了教材编写的总体框架和特色,以及教材... 海洋无脊椎动物学实践教学是国内涉海学科高校常开设的一项专业基础训练,但至今未有配套的实验教材出版。文章通过阐述《海洋无脊椎动物学实验》教材编写的必要性和意义、指导思想和实践过程,总结了教材编写的总体框架和特色,以及教材在海洋无脊椎动物学人才培养和学科发展方面的重要地位和作用,并对教材使用评价和教材编写革新进行了构思,为今后教材的编写修订提供了思路和探索方向,从而提升教材编写水平,提高教材的适用性。 展开更多
关键词 海洋无脊椎动物学 实验教学 教材编写 教材使用
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房地产业运营环境更加艰难
8
作者 曾启贤 梁镇邦 +1 位作者 王智健 刘长浩 《中国经济报告》 2014年第10期61-63,共3页
预计2014年余下时间全国房地产市场销售将温和改善,支持因素包括新推出项目数量增加、按揭贷款供应量增加、选择性放松限购2012年11月,我们将中国房地产行业展望从负面调整为稳定,随后于2014年5月调整为负面,在此期间我们采取的正面评... 预计2014年余下时间全国房地产市场销售将温和改善,支持因素包括新推出项目数量增加、按揭贷款供应量增加、选择性放松限购2012年11月,我们将中国房地产行业展望从负面调整为稳定,随后于2014年5月调整为负面,在此期间我们采取的正面评级行动数量超出负面行动的3.6倍。鉴于房地产业运营环境会更加艰难,我们预计未来12个月该比率可能会下降。对开发商稳定的评级展望反映了尽管我们对中国房地产业的展望为负面,但我们预计受评开发商仍能保持销售增长水平以及充足的流动性。 展开更多
关键词 房地产业 运营环境 行业展望 中国房地产 支持因素 一线城市 住宅房地产 恒大 信用质量 地产开发商
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海洋无脊椎动物学实验课程体系构建的研究
9
作者 吴仁协 罗晓霞 +3 位作者 王学锋 牛素芳 梁镇邦 谢恩义 《江西电力职业技术学院学报》 CAS 2022年第11期141-143,共3页
当前,涉海高校普遍对海洋无脊椎动物的实验教学不够重视,尚未建立独立的实验课程体系。通过分析海洋无脊椎动物学实验课程体系构建的必要性和意义,阐述了构建海洋无脊椎动物学实验课程体系的主要内容,为其他高校开展海洋无脊椎动物学实... 当前,涉海高校普遍对海洋无脊椎动物的实验教学不够重视,尚未建立独立的实验课程体系。通过分析海洋无脊椎动物学实验课程体系构建的必要性和意义,阐述了构建海洋无脊椎动物学实验课程体系的主要内容,为其他高校开展海洋无脊椎动物学实验课程教学提供借鉴,以促进海洋无脊椎动物学科发展和人才培养。 展开更多
关键词 海洋无脊椎动物 实验教学 课程体系
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广播新闻写作前期准备与技巧浅谈
10
作者 梁镇邦 《传播力研究》 2018年第28期125-125,共1页
新媒体时代的来临,新兴媒介的新闻传播给广播新闻行业带来不少冲击。如可以做到画面与文字完美结合的电视新闻行业,又或者是具有自主性、参与性的网络新闻行业。与此同时,作为一种传统的信息媒介,广播新闻行业如何做好前期准备和利用原... 新媒体时代的来临,新兴媒介的新闻传播给广播新闻行业带来不少冲击。如可以做到画面与文字完美结合的电视新闻行业,又或者是具有自主性、参与性的网络新闻行业。与此同时,作为一种传统的信息媒介,广播新闻行业如何做好前期准备和利用原则提高新闻传播效果,是新闻工作者需要关注的方面。 展开更多
关键词 广播新闻 写作原则
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