目的找出与间变胶质瘤癫痫起病相关的基因改变。方法从The Cancer Genome Atlas(TCGA)网站下载胶质瘤全基因组测序数据库,其中包含间变胶质瘤243例,其中119例是以癫痫症状起病,其他124例是以非癫痫症状起病,运用非配对t检验来筛选癫痫...目的找出与间变胶质瘤癫痫起病相关的基因改变。方法从The Cancer Genome Atlas(TCGA)网站下载胶质瘤全基因组测序数据库,其中包含间变胶质瘤243例,其中119例是以癫痫症状起病,其他124例是以非癫痫症状起病,运用非配对t检验来筛选癫痫起病组和非癫痫起病组的差异基因,中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)作为验证,Kaplan-Meier曲线被用来检测预后的分布结果。结果在TCGA中,本研究发现在间变胶质瘤中,以癫痫起病的患者预后要好于非癫痫起病的患者(P=0.04)。在癫痫起病组和非癫痫起病组,902个基因表达量有差别,将902个基因带入DAVID网站(https://david.ncifcrf.gov)进行分析,调控多种细胞组织生长通路在这两组差别最大,主要是7个基因(STAT5B、AFG3L2、FTO、APP、GDF5、MBD5、PIK3CA),在中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)进行验证,只有STAT5B是有意义的,但是STAT5B不能够预测患者预后。结论间变胶质瘤中,有术前癫痫的患者的生存期明显好于无术前癫痫的患者。STAT5B高表达的患者不容易发生术前癫痫。STAT5B在肿瘤中表达量决定患者是否以癫痫起病。展开更多
文摘目的找出与间变胶质瘤癫痫起病相关的基因改变。方法从The Cancer Genome Atlas(TCGA)网站下载胶质瘤全基因组测序数据库,其中包含间变胶质瘤243例,其中119例是以癫痫症状起病,其他124例是以非癫痫症状起病,运用非配对t检验来筛选癫痫起病组和非癫痫起病组的差异基因,中国脑胶质瘤基因组图谱计划(CGGA)作为验证,Kaplan-Meier曲线被用来检测预后的分布结果。结果在TCGA中,本研究发现在间变胶质瘤中,以癫痫起病的患者预后要好于非癫痫起病的患者(P=0.04)。在癫痫起病组和非癫痫起病组,902个基因表达量有差别,将902个基因带入DAVID网站(https://david.ncifcrf.gov)进行分析,调控多种细胞组织生长通路在这两组差别最大,主要是7个基因(STAT5B、AFG3L2、FTO、APP、GDF5、MBD5、PIK3CA),在中国脑胶质瘤基因组图谱(CGGA)进行验证,只有STAT5B是有意义的,但是STAT5B不能够预测患者预后。结论间变胶质瘤中,有术前癫痫的患者的生存期明显好于无术前癫痫的患者。STAT5B高表达的患者不容易发生术前癫痫。STAT5B在肿瘤中表达量决定患者是否以癫痫起病。
