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缺失OSR结构域功能的GS3蛋白正向调控水稻籽粒大小
被引量:
2
1
作者
谷玉娟
梁
大安
+2 位作者
郝天琪
高倩
刘磊
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1133-1140,共8页
水稻种子粒型是影响产量的重要因素。GS3基因是水稻第一个被克隆的粒型基因,主要调控籽粒的粒长和粒重。GS3蛋白包含N端的OSR(Organ size regulation)和C端的Cys-rich功能结构域。GS3基因主要存在4种自然变异类型,分别为GS3-1至GS3-4。...
水稻种子粒型是影响产量的重要因素。GS3基因是水稻第一个被克隆的粒型基因,主要调控籽粒的粒长和粒重。GS3蛋白包含N端的OSR(Organ size regulation)和C端的Cys-rich功能结构域。GS3基因主要存在4种自然变异类型,分别为GS3-1至GS3-4。其中,GS3-1编码全长GS3蛋白;GS3-2编码的蛋白质插入1个氨基酸;GS3-3导致GS3完整蛋白缺失,表现为籽粒变长;GS3-4编码N端的OSR结构域,表现为籽粒明显变短。截至目前,在水稻自然变异中仍未发现仅编码C端的Cysrich结构域的GS3变异类型,其对籽粒大小的调控也不清楚。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术在DNA序列两侧设计靶点删除大片段序列,创制出仅编码C端Cys-rich功能结构域的突变类型gs3-5,并获得纯合突变株系。与受体背景中花11相比,gs3-5纯合突变株系表现为粒长和千粒重增加。上述结果表明OSR结构域是GS3蛋白作为籽粒大小的负调控因子所必需的,为进一步解析OSR结构域对籽粒大小的调控以及探索新的育种改良方法提供了参考。
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关键词
CRISPR/Cas9
GS3
粒长
粒重
水稻
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职称材料
基于加权基因共表达网络分析鉴定调控油菜种子次生休眠候选基因
2
作者
谷玉娟
刘磊
+7 位作者
赵祥祥
刘福霞
路芳芳
梁
大安
郝天琪
高倩
吴德鹏
高慧
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期524-532,共9页
油菜种子的次生休眠容易导致油菜自生苗发生,影响制种品质和安全。本研究以课题组自主培育的Huaiyou-WSD-H2(次生休眠弱)和Huaiyou-SSD-V1(次生休眠强)品系为材料,利用聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)模拟干旱,诱导种子次生休眠,对...
油菜种子的次生休眠容易导致油菜自生苗发生,影响制种品质和安全。本研究以课题组自主培育的Huaiyou-WSD-H2(次生休眠弱)和Huaiyou-SSD-V1(次生休眠强)品系为材料,利用聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)模拟干旱,诱导种子次生休眠,对次生休眠诱导前、后的油菜种子进行高通量转录组测序。利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)将高通量转录组测序中17706个高表达基因(FPKM>5)划分为17个共表达模块。结合GO/KEGG富集分析和差异表达分析,在与次生休眠极显著正相关的yellow模块中筛选到3个与色氨酸代谢相关的基因(BnaC08g25400D、BnaC09g31260D和BnaC09g49740D)在诱导后的强、弱次生休眠材料间存在差异表达,利用qRT-PCR进行验证,并初步分析了候选基因的调控网络,为解析依赖色氨酸的生长素生物合成途径调控油菜种子次生休眠的遗传基础提供理论依据。
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关键词
甘蓝型油菜
次生休眠
加权基因共表达网络分析
转录组
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职称材料
高海拔地区杂交稻制种的不利气候因素和技术对策总结
3
作者
卢云祥
梁
大安
《杂交水稻》
CSCD
北大核心
1996年第5期39-39,46,共2页
高海拔地区杂交稻制种的不利气候因素和技术对策总结Technicalcountermeasurestotheunfavourableclimaticfactorsinhybridriceseedproductionof...
高海拔地区杂交稻制种的不利气候因素和技术对策总结Technicalcountermeasurestotheunfavourableclimaticfactorsinhybridriceseedproductionofthehighelevationa...
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关键词
高海拔地区
杂交水稻
制种
气候因素
下载PDF
职称材料
题名
缺失OSR结构域功能的GS3蛋白正向调控水稻籽粒大小
被引量:
2
1
作者
谷玉娟
梁
大安
郝天琪
高倩
刘磊
机构
淮阴师范学院生命科学学院
出处
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第4期1133-1140,共8页
基金
江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目(202210323028Z)。
文摘
水稻种子粒型是影响产量的重要因素。GS3基因是水稻第一个被克隆的粒型基因,主要调控籽粒的粒长和粒重。GS3蛋白包含N端的OSR(Organ size regulation)和C端的Cys-rich功能结构域。GS3基因主要存在4种自然变异类型,分别为GS3-1至GS3-4。其中,GS3-1编码全长GS3蛋白;GS3-2编码的蛋白质插入1个氨基酸;GS3-3导致GS3完整蛋白缺失,表现为籽粒变长;GS3-4编码N端的OSR结构域,表现为籽粒明显变短。截至目前,在水稻自然变异中仍未发现仅编码C端的Cysrich结构域的GS3变异类型,其对籽粒大小的调控也不清楚。本研究利用CRISPR/Cas9基因编辑技术在DNA序列两侧设计靶点删除大片段序列,创制出仅编码C端Cys-rich功能结构域的突变类型gs3-5,并获得纯合突变株系。与受体背景中花11相比,gs3-5纯合突变株系表现为粒长和千粒重增加。上述结果表明OSR结构域是GS3蛋白作为籽粒大小的负调控因子所必需的,为进一步解析OSR结构域对籽粒大小的调控以及探索新的育种改良方法提供了参考。
关键词
CRISPR/Cas9
GS3
粒长
粒重
水稻
Keywords
CRISPR/Cas9
GS3
grain length
grain weight
rice
分类号
S511 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
基于加权基因共表达网络分析鉴定调控油菜种子次生休眠候选基因
2
作者
谷玉娟
刘磊
赵祥祥
刘福霞
路芳芳
梁
大安
郝天琪
高倩
吴德鹏
高慧
机构
河北科技师范学院
淮阴师范学院江苏省区域现代农业与环境保护协同创新中心
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第3期524-532,共9页
基金
江苏省农业自主创新项目(CX(21)3118)
江苏省区域现代化农业与环境保护协同创新中心团队集体攻关项目(HSXT30123)
国家自然科学基金(31701514)。
文摘
油菜种子的次生休眠容易导致油菜自生苗发生,影响制种品质和安全。本研究以课题组自主培育的Huaiyou-WSD-H2(次生休眠弱)和Huaiyou-SSD-V1(次生休眠强)品系为材料,利用聚乙二醇(polyethylene glycol,PEG)模拟干旱,诱导种子次生休眠,对次生休眠诱导前、后的油菜种子进行高通量转录组测序。利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)将高通量转录组测序中17706个高表达基因(FPKM>5)划分为17个共表达模块。结合GO/KEGG富集分析和差异表达分析,在与次生休眠极显著正相关的yellow模块中筛选到3个与色氨酸代谢相关的基因(BnaC08g25400D、BnaC09g31260D和BnaC09g49740D)在诱导后的强、弱次生休眠材料间存在差异表达,利用qRT-PCR进行验证,并初步分析了候选基因的调控网络,为解析依赖色氨酸的生长素生物合成途径调控油菜种子次生休眠的遗传基础提供理论依据。
关键词
甘蓝型油菜
次生休眠
加权基因共表达网络分析
转录组
Keywords
Brassica napus L.
secondary dormancy
weighted gene co-expression network
transcriptome
分类号
S565.4 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
高海拔地区杂交稻制种的不利气候因素和技术对策总结
3
作者
卢云祥
梁
大安
机构
贵州省独山县
贵州省独山县种子公司
出处
《杂交水稻》
CSCD
北大核心
1996年第5期39-39,46,共2页
文摘
高海拔地区杂交稻制种的不利气候因素和技术对策总结Technicalcountermeasurestotheunfavourableclimaticfactorsinhybridriceseedproductionofthehighelevationa...
关键词
高海拔地区
杂交水稻
制种
气候因素
分类号
S511.035 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
缺失OSR结构域功能的GS3蛋白正向调控水稻籽粒大小
谷玉娟
梁
大安
郝天琪
高倩
刘磊
《植物遗传资源学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
2
下载PDF
职称材料
2
基于加权基因共表达网络分析鉴定调控油菜种子次生休眠候选基因
谷玉娟
刘磊
赵祥祥
刘福霞
路芳芳
梁
大安
郝天琪
高倩
吴德鹏
高慧
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
3
高海拔地区杂交稻制种的不利气候因素和技术对策总结
卢云祥
梁
大安
《杂交水稻》
CSCD
北大核心
1996
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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