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双乾肉羊PDK4基因的组织表达差异及多态性分析
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作者 缪立生 肖成 +7 位作者 杨少滢 赵文军 沈宏旭 刘宇 曹阳 巩俊明 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2024年第1期47-53,共7页
为了研究丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因在双乾肉羊不同组织中的表达差异,以及基因外显子多态性对肉质性状的影响,试验以45只健康的8月龄双乾肉羊公羊为研究对象,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾... 为了研究丙酮酸脱氢酶激酶4(pyruvate dehydrogenase kinase 4,PDK4)基因在双乾肉羊不同组织中的表达差异,以及基因外显子多态性对肉质性状的影响,试验以45只健康的8月龄双乾肉羊公羊为研究对象,屠宰后采集心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、十二指肠及背最长肌,利用PCR法与Sanger测序法结合的方式检测PDK4基因外显子中的单核苷酸多态性位点(SNP),并与肉质性状数据进行关联分析。结果表明:PDK4基因广泛分布于各组织中,在十二指肠组织中的相对表达量最高。PDK4基因第1外显子存在2个SNP位点,分别为Chr 4.14723148 T>C突变、Chr 4.14723208 T>C突变。Chr 4.14723148 T>C存在2种基因型,分别为CC和CT基因型;Chr 4.14723208 T>C存在3种基因型,分别是TT、TC和CC基因型。突变基因型分布符合哈代温伯格(Hardy-Weinberg)定律,突变个体在群体中处于稳定状态。Chr 4.14723148 T>C和Chr 4.14723208 T>C位点的多态性信息含量分别为0.94和0.61,均为高度多态(P>0.5),Chr 4.14723148 T>C突变中CC基因型为优势基因型,其个体压榨水分率显著低于CT基因型个体(P<0.05)。说明双乾肉羊群体稳定存在Chr 4.14723148突变位点,并且CC优势基因型个体肌肉水分保持能力更强,正向影响肉质性状。 展开更多
关键词 双乾肉羊 PDK4基因 突变位点 肉质性状 组织表达谱
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吉林地方鸡及其杂交群体RB1基因多态性及屠宰性状、肉质性状相关分析
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作者 陈小辛 丛含羽 +5 位作者 刘艺 柳俭强 安鼎杰 李旭 张立春 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期144-149,共6页
本试验旨在探寻吉林地方鸡(吉林芦花鸡、吉林矮小芦花鸡和吉林黑鸡)及其杂交群体RB1基因多态性及特定SNP位点与屠宰、肉质性状的相关性。首先通过基因组PCR直接测序方法检测RB1基因多态性,特定SNP位点利用高分辨率溶解曲线法(High Resol... 本试验旨在探寻吉林地方鸡(吉林芦花鸡、吉林矮小芦花鸡和吉林黑鸡)及其杂交群体RB1基因多态性及特定SNP位点与屠宰、肉质性状的相关性。首先通过基因组PCR直接测序方法检测RB1基因多态性,特定SNP位点利用高分辨率溶解曲线法(High Resolution Melting,HRM)对其在不同群体间的遗传多样性进行分析,最后结合屠宰与肉质数据对不同群体内各基因型个体间进行差异显著性分析。PCR产物测序结果发现,RB1基因多态位点较为丰富,共发现6处单碱基突变和一处8碱基插入突变,但上述突变均位于内含子区。以g.28256G>A位点为目标,HRM检测发现3个亲本和6个正反杂交群体除黑鸡与矮小鸡杂交群体外其他群体中GG基因型均为优势基因型;Hardy-Weinberg检验显示除了矮小鸡群体外,其他群体均处于不平衡状态;各群体该位点均处于中度多态信息含量(Polymorphism Information Content,PIC)水平。差异性分析结果发现该位点不同基因型个体屠宰及肉质性状多个指标差异显著,但在不同群体间差异不显著。其中值得关注的是腹脂率指标,除矮小鸡群体外,各群体均表现为显著差异。地方鸡RB1基因多态性的发现及屠宰、肉质性状相关性鉴定为利用该基因进行地方鸡选育奠定了基础。 展开更多
关键词 吉林芦花鸡 矮脚芦花鸡 吉林黑鸡 杂交群体 RB1基因 多态性
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吉林芦花鸡IGF-2基因多态位性与生产性能相关分析
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作者 张英惠 +5 位作者 陈小辛 柳俭强 刘艺 李旭 安鼎杰 张立春 《东北农业科学》 2023年第6期101-106,共6页
为探究吉林芦花鸡IGF-2基因遗传多样性及与生长性能相关性,本试验通过RT-PCR方法克隆正常吉林芦花鸡和矮小吉林芦花鸡肝脏组织IGF-2基因并进行SNP筛选,再通过特定单碱基多态位点(Single-nucleotide Polymorphisms,SNP)高分辨率溶解曲线(... 为探究吉林芦花鸡IGF-2基因遗传多样性及与生长性能相关性,本试验通过RT-PCR方法克隆正常吉林芦花鸡和矮小吉林芦花鸡肝脏组织IGF-2基因并进行SNP筛选,再通过特定单碱基多态位点(Single-nucleotide Polymorphisms,SNP)高分辨率溶解曲线(High Resolution Melting analysis,HRM)法对7个不同地方鸡群体进行分析,最后对正常芦花鸡和矮小芦花鸡生产性能进行相关分析。RT-PCR表明IGF-2在两类鸡肝脏组织表达,测序发现c.345 T>C和3´UTR19 G>A突变。不同群体c.345 T>C位点遗传多样性分析发现除寿光鸡群体TC基因型为优势基因型外,其他群体优势基因型均为TT型。其中汶上芦花鸡群体中完全不存在T>C突变,黄鸡和油鸡群体中亦未检测到CC基因型。Hardy-Weinberg平衡检验发现该位点在芦花鸡、矮小芦花鸡、黄鸡和寿光鸡群体处于不平衡状态。矮小芦花鸡群体生长性能相关分析发现母鸡中TT型个体体重显著高于TC型个体(P<0.05),公鸡TT和TC基因型个体胸深极显著高于CC基因型个体(P<0.01)。吉林芦花鸡IGF-2基因多态位点及其与生产性能相关性的发现为利用该位点进行群体内选育奠定理论基础。 展开更多
关键词 吉林芦花鸡 吉林矮小芦花鸡 IGF-2基因 多态性 生长性状
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