目的对不同干旱胁迫程度下党参Codonopsispilosula叶、茎、根进行转录组测序,探究干旱胁迫对党参差异基因和多糖合成相关酶基因的调控。方法利用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常水分(85%~90%)和轻度(65%~70%)、中度(50%~55%)...目的对不同干旱胁迫程度下党参Codonopsispilosula叶、茎、根进行转录组测序,探究干旱胁迫对党参差异基因和多糖合成相关酶基因的调控。方法利用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常水分(85%~90%)和轻度(65%~70%)、中度(50%~55%)、重度干旱胁迫(35%~40%)下生长旺盛期党参叶、茎、根组织进行测序并建立c DNA数据库,经de novo拼接后得到Unigene,并进一步开展生物信息学分析。结果共获得Unigene 60377条,分别有51477、29896、33479、35912、47378、18649、31833条被非冗余数据库(non-redundant protein sequence database,NR)、真核生物蛋白相邻类的聚簇(clusters of orthologous group for eukaryotic complete,KOG)、基因本体(gene ontology,GO)、Swiss-Prot、egg NOG、京都基因与基因组数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、Pfam等数据库注释,筛选到9个差异组DEGs总和89369条,GO富集分析发现,党参叶、茎、根中的DEGs在GO功能注释中分布基本一致,主要集中于细胞、细胞部分、细胞过程、代谢过程、结合蛋白、催化活性等功能。KEGG途径富集结果表明,干旱胁迫下叶中DEGs显著富集在不饱和脂肪酸、苯丙烷生物合成,茎中DEGs主要富集在苯丙烷、角质、琥珀和蜡、淀粉和蔗糖、单萜的生物合成,根中DEGs主要富集于黄酮、苯丙烷、二苯乙烯、二芳基庚烷和姜酚的生物合成及戊糖、葡萄糖醛酸转换。轻度干旱能引起叶中多糖合成途径关键酶基因的表达上调,是促进党参多糖成分积累的基础。结论通过转录组测序,初步表明干旱胁迫影响党参不同组织差异基因的表达,并调控党参根中多糖合成的相关酶基因,以期为从分子基因培育优质党参提供参考和依据。展开更多
文摘目的对不同干旱胁迫程度下党参Codonopsispilosula叶、茎、根进行转录组测序,探究干旱胁迫对党参差异基因和多糖合成相关酶基因的调控。方法利用Illumina HiSeq 2500高通量测序技术对正常水分(85%~90%)和轻度(65%~70%)、中度(50%~55%)、重度干旱胁迫(35%~40%)下生长旺盛期党参叶、茎、根组织进行测序并建立c DNA数据库,经de novo拼接后得到Unigene,并进一步开展生物信息学分析。结果共获得Unigene 60377条,分别有51477、29896、33479、35912、47378、18649、31833条被非冗余数据库(non-redundant protein sequence database,NR)、真核生物蛋白相邻类的聚簇(clusters of orthologous group for eukaryotic complete,KOG)、基因本体(gene ontology,GO)、Swiss-Prot、egg NOG、京都基因与基因组数据库(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)、Pfam等数据库注释,筛选到9个差异组DEGs总和89369条,GO富集分析发现,党参叶、茎、根中的DEGs在GO功能注释中分布基本一致,主要集中于细胞、细胞部分、细胞过程、代谢过程、结合蛋白、催化活性等功能。KEGG途径富集结果表明,干旱胁迫下叶中DEGs显著富集在不饱和脂肪酸、苯丙烷生物合成,茎中DEGs主要富集在苯丙烷、角质、琥珀和蜡、淀粉和蔗糖、单萜的生物合成,根中DEGs主要富集于黄酮、苯丙烷、二苯乙烯、二芳基庚烷和姜酚的生物合成及戊糖、葡萄糖醛酸转换。轻度干旱能引起叶中多糖合成途径关键酶基因的表达上调,是促进党参多糖成分积累的基础。结论通过转录组测序,初步表明干旱胁迫影响党参不同组织差异基因的表达,并调控党参根中多糖合成的相关酶基因,以期为从分子基因培育优质党参提供参考和依据。
