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基于表达谱的Zunyimycin C抗肝细胞癌的机制分析
1
作者 张桢淳 栗午娟 +5 位作者 郭雨悦 李振豪 王卓灵 孙心悦 吕玉红 岳昌武 《成都医学院学报》 CAS 2024年第2期220-224,236,共6页
目的 探讨蒽酮类抗生素Zunyimycin C治疗肝细胞癌(HCC)的作用机制。方法 通过PharmGKB网络药理学工具预测Zunyimycin C抗HCC的作用靶点;以Zunyimycin C干预HCC HepG2和人源正常肝细胞L02,分为试剂处理组、空白对照组、药物处理组及药物... 目的 探讨蒽酮类抗生素Zunyimycin C治疗肝细胞癌(HCC)的作用机制。方法 通过PharmGKB网络药理学工具预测Zunyimycin C抗HCC的作用靶点;以Zunyimycin C干预HCC HepG2和人源正常肝细胞L02,分为试剂处理组、空白对照组、药物处理组及药物处理后加抑制剂组。对不同处理组进行基因测序分析,筛选差异性表达基因,运用在线数据库进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,根据基因表达谱进行聚类分析。结果 预测得到细胞内与Zunyimycin C结合得分最高的20个靶点,这些靶点主要参与代谢和肿瘤发生发展的通路。KEGG通路富集分析表明,癌症、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)、RAS相关蛋白(Rap1)、细胞黏附分子、焦点黏附、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)是Zunyimycin C发挥抗HCC的主要通路。结论 Zunyimycin C可能是通过多靶点多通路的方式发挥抗肿瘤作用。 展开更多
关键词 Zunyimycin C 肝细胞癌 网络药理学
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链霉菌FJS31-2 abx R2基因克隆表达及蛋白纯化
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作者 李泽鑫 王兰林 +5 位作者 栗午娟 杨逸 张悦萌 高佩舒 田红英 岳昌武 《化学与生物工程》 CAS 2023年第12期34-38,共5页
利用原核表达系统获得链霉菌FJS31-2 AbxR2重组蛋白,并进行纯化。通过PCR扩增abx R2基因,将扩增产物克隆至pET32a质粒上构建重组质粒pET32a-abx R2;将重组质粒转化至大肠埃希菌Rosetta(DE3)感受态细胞中进行IPTG诱导表达,并通过尿素洗... 利用原核表达系统获得链霉菌FJS31-2 AbxR2重组蛋白,并进行纯化。通过PCR扩增abx R2基因,将扩增产物克隆至pET32a质粒上构建重组质粒pET32a-abx R2;将重组质粒转化至大肠埃希菌Rosetta(DE3)感受态细胞中进行IPTG诱导表达,并通过尿素洗涤方式对AbxR2重组蛋白进行纯化。酶切和测序结果均证实重组质粒pET32a-abx R2构建成功;在菌液OD 600值为0.6、28℃、110 r·min^(-1)、1.0 mmol·L^(-1) IPTG诱导4 h时,AbxR2重组蛋白的表达效果较好;采用尿素洗涤方式纯化AbxR2重组蛋白,可得到单一特异蛋白条带,效果较好。为研究AbxR2蛋白的结构和功能及提高Zunyimycins产量奠定了基础。 展开更多
关键词 链霉菌 AbxR2 基因簇 原核表达 蛋白纯化
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基于网络药理学和体外实验探讨加味七福饮抗阿尔茨海默病的作用机制
3
作者 王兰林 李泽鑫 +3 位作者 栗午娟 闫龙 吕玉红 岳昌武 《延安大学学报（医学科学版）》 2023年第1期16-23,共8页
目的通过网络药理学和体外实验探讨加味七福饮抗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)的作用机制。方法利用网络药理学对药物成分-疾病靶标网络进行可视化分析。通过蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)、基因本体(gene on... 目的通过网络药理学和体外实验探讨加味七福饮抗阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease,AD)的作用机制。方法利用网络药理学对药物成分-疾病靶标网络进行可视化分析。通过蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)、基因本体(gene ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Gene and Genome Encyclopedia,KEGG)通路富集分析加味七福饮抗AD的作用靶点。通过体外实验进一步验证网络药理学预测的结果。结果网络药理学收集到46个加味七福饮的候选活性成分和521个预测靶点,并得到与AD共同靶点105个,包括白术三醇、山柰酚、植物甾醇、甘草苷、豆甾醇和β-谷甾醇等关键化合物和丝氨酸/苏氨酸激酶1(serine/threonine kinase 1,AKT1)、肿瘤坏死因子(tumor necrosis factor,TNF)、JUN基因(JUN)、白介素1β(interleukin 1β,IL-1β)、前列腺内环氧化物合酶2(prostaglandin-endoperoxide synthase 2,PTGS2)以及干扰素-γ(interferon-γ,IFNG)等潜在的作用靶点;GO富集分析结果主要涉及氧化还原酶活性、细胞分泌调节、细胞凋亡和突触信号转导等生物过程,KEGG富集分析得到脂质和动脉粥样硬化信号通路、化学致癌-受体激活信号通路、神经活性配体-受体相互作用信号通路、cGMP-PKG信号通路和PI3K-AKT信号通路等20条潜在作用通路;体外实验表明加味七福饮具有免疫增强活性,并能显著抑制神经胶质细胞炎症因子的释放(TNF-α、IL-2、IL-6),缓解神经炎症反应。结论本研究运用网络药理学预测了加味七福饮的核心靶点和通路并通过体外实验进行了相关验证,表明加味七福饮可通过多途径-多靶点-多通路对AD发挥治疗作用,为深入探讨加味七福饮治疗AD提供了理论依据。 展开更多
关键词 加味七福饮 阿尔茨海默病 网络药理学 神经炎症
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