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甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析
1
作者
何淼
林强
乾
+2 位作者
赵艳超
张淑波
陈维田
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期81-86,共6页
基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段(C9MP)。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所...
基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段(C9MP)。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所在的C9MP与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V和第13位氨基酸P所在的C9MP在PB1MP1相互作用面上具有最低的共进化值。结合DSSP程序的分析表明,由PA蛋白第670位氨基酸Q与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V与第13位氨基酸P构成的区域可能成为潜在的相互作用位点。
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关键词
共进化理论
甲型流感病毒
PB1蛋白
PA蛋白
相互作用位点
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职称材料
题名
甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析
1
作者
何淼
林强
乾
赵艳超
张淑波
陈维田
机构
中山大学生命科学学院
香港理工大学屋宇设备工程系
出处
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2011年第2期81-86,共6页
基金
国家自然科学基金重点资助项目(60736028)
广东省科技计划项目重大专项资助项目(2003A3080503)
文摘
基于共进化理论,探究了甲型流感病毒PB1蛋白与PA蛋白上具有共同进化可能性的保守九聚片段(C9MP)。结构信息显示PB1蛋白的第1-15位氨基酸与PA蛋白的第239-716位氨基酸具有相互作用域;对该区域变异分布的分析发现,PA蛋白第670位氨基酸Q所在的C9MP与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V和第13位氨基酸P所在的C9MP在PB1MP1相互作用面上具有最低的共进化值。结合DSSP程序的分析表明,由PA蛋白第670位氨基酸Q与PB1蛋白的第9位氨基酸F、第12位氨基酸V与第13位氨基酸P构成的区域可能成为潜在的相互作用位点。
关键词
共进化理论
甲型流感病毒
PB1蛋白
PA蛋白
相互作用位点
Keywords
co-evolution theory
influenza A virus
PB1
PA
interaction site
分类号
Q354 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
甲型流感病毒PB1-PA蛋白作用位点的发现与分析
何淼
林强
乾
赵艳超
张淑波
陈维田
《中山大学学报(自然科学版)》
CAS
CSCD
北大核心
2011
0
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