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槐猪和杜洛克猪背最长肌差异表达基因的筛选与注释 被引量：8
1
作者 杨建敏 胡宇平 +4 位作者 林威敏 张金耀 黄守婷 叶鼎承 肖天放 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第2期192-195,共4页
为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.... 为了筛选槐猪和杜洛克猪背最长肌中的差异表达基因,对槐猪和杜洛克猪背最长肌进行转录组测序,并进行生物信息学分析.结果表明,槐猪和杜洛克猪分别获得36 177 844和34 496 450条可用读段,且与猪参考基因组的比对率分别为78.71%和80.09%.槐猪和杜洛克猪间共有953个差异表达基因,以杜洛克猪为对照组,槐猪与之相比,有589个上调基因和364个下调基因.槐猪和杜洛克猪的差异表达基因共分类到48个基因本体(GO)条目中,其中,细胞组分13个、分子功能12个和生物学过程23个.显著富集的KEGG通路共计6个,其中,PPAR信号通路是与调节脂类代谢显著相关的通路. 展开更多
关键词 槐猪 杜洛克猪 背最长肌 差异表达 转录组测序
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莆田黑猪不同组织DNA甲基化的MSAP分析 被引量：2
2
作者 胡宇平 张金耀 +4 位作者 林瑞意 林威敏 陈静 汪稳 肖天放 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2017年第3期305-310,共6页
为研究莆田黑猪不同组织间基因组DNA甲基化水平差异及各组织甲基化水平在不同生长发育阶段之间的变化规律,采用甲基化敏感扩增片段多态性(MSAP)方法检测了1、25和210日龄莆田黑猪的心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾6个组织基因组DNA的甲... 为研究莆田黑猪不同组织间基因组DNA甲基化水平差异及各组织甲基化水平在不同生长发育阶段之间的变化规律,采用甲基化敏感扩增片段多态性(MSAP)方法检测了1、25和210日龄莆田黑猪的心脏、肝脏、肌肉、脂肪、耳和尾6个组织基因组DNA的甲基化水平.结果表明:心脏和肝脏组织的甲基化水平随日龄增长呈下降趋势,且日龄间的甲基化水平差异显著(P<0.05);25日龄肌肉组织的甲基化水平与1日龄的差异不显著(P>0.05),但显著高于210日龄(P<0.05);25日龄脂肪和耳组织的甲基化水平显著高于1和210日龄(P<0.05);3个日龄间尾组织的甲基化水平差异不显著(P>0.05);3个日龄的肝脏与脂肪组织之间、肝脏与耳组织之间的甲基化水平均存在显著差异(P<0.05),表明DNA甲基化在肝脏与脂肪组织之间、肝脏与耳组织之间存在组织特异性. 展开更多
关键词 DNA甲基化 组织 甲基化敏感扩增多态性(MSAP) 莆田黑猪
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西红花苷在动物抗氧化作用中的研究进展
3
作者 王静 宋红兵 +2 位作者 吴艳玲 林威敏 肖天放 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2023年第6期2233-2244,共12页
西红花苷(crocin)作为西红花的主要生物活性化合物,有清除自由基、缓解氧化应激的能力,具备成为绿色安全抗氧化剂的潜力。西红花苷主要在肠道中分解代谢,通过血液运输至机体各部位。心脏、脾脏、肾脏和肺脏的西红花苷代谢产物较高,即在... 西红花苷(crocin)作为西红花的主要生物活性化合物,有清除自由基、缓解氧化应激的能力,具备成为绿色安全抗氧化剂的潜力。西红花苷主要在肠道中分解代谢,通过血液运输至机体各部位。心脏、脾脏、肾脏和肺脏的西红花苷代谢产物较高,即在这些部位发挥其生物学作用。西红花苷为低毒物质,可用于缓解机体发生的氧化损伤。目前,西红花苷抗氧化功能多应用于缓解神经退行性疾病、抑制肿瘤生长、保护生殖系统和心脏系统。缓解氧化应激是西红花苷调控机体适应异常环境的主要方式之一,降低氧化产物产生和提高抗氧化酶活性是其主要调节手段。西红花苷可作用于多条信号通路(TLR2/NF-κB、JAK2-STAT3-ERK、Nrf2等通路),以缓解外界物质刺激所引起的机体内促氧化剂和抗氧化剂之间的失衡。作者综述了西红花苷抗氧化作用在调控动物健康中的应用以及在不同调控系统中的作用机制,为进一步深入研究西红花苷抗氧化作用机制及其调控动物健康提供理论依据;为开发新型天然抗氧化剂在疾病或机体异常中的治疗应用提供指导。 展开更多
关键词 西红花苷 动物健康 抗氧化 氧化应激 生物学活性
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畜禽DNA甲基化研究进展
4
作者 林威敏 肖天放 《福建畜牧兽医》 2016年第4期35-38,共4页
基因组甲基化是通过甲基转移酶催化胞嘧啶转化为5-甲基胞嘧啶,是表观遗传学的重要组成部分,对许多生理活动具有重要影响。文中主要从甲基化在畜禽上的研究进展,以及近几年在长链非编码RNA等研究进展,概述DNA甲基化研究的发展。
关键词 甲基化 表观遗传学 畜禽
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莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2的遗传多态性
5
作者 汪稳 林威敏 +3 位作者 陈静 胡宇平 毛小鸿 肖天放 《福建农林大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2016年第4期420-426,共7页
以莆田黑鸭为材料,对其主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ基因外显子2进行PCR扩增和DNA测序,分析其遗传多态性及变异特征,为进一步寻求抗病分子提供依据.结果表明,莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2处有丰富的遗传多态性,核苷酸变异以颠换为主,同义... 以莆田黑鸭为材料,对其主要组织相容性复合体(MHC)Ⅰ基因外显子2进行PCR扩增和DNA测序,分析其遗传多态性及变异特征,为进一步寻求抗病分子提供依据.结果表明,莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2处有丰富的遗传多态性,核苷酸变异以颠换为主,同义替换率大于非同义替换率,总GC含量较高,为59%,其中,密码子第3位的GC含量最高,为82.7%.莆田黑鸭MHCⅠ基因外显子2编码的氨基酸有明显的疏水性,对维持MHC分子的结构和功能具有重要作用.聚类分析结果表明,禽类分支中,莆田黑鸭与家鹅的亲缘关系较近,与鸡的亲缘关系较远. 展开更多
关键词 莆田黑鸭 主要组织相容性复合体Ⅰ(MHCⅠ) DNA测序 遗传多态性
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