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基于网络药理学和生物信息学探索金雀异黄酮对肝细胞癌的作用机制
1
作者 林丽桥 黄敬媚 +1 位作者 黄小晓 李政钊 《现代医药卫生》 2024年第11期1814-1822,共9页
目的通过网络药理学及生物信息学方法阐明金雀异黄酮对肝细胞癌的作用机制。方法利用网络药理学、生物信息学和实验验证方法。从Pharm Mapper数据库获取金雀异黄酮的潜在作用靶点。使用Gene Cards数据库获取肝细胞癌的致病基因,分析确... 目的通过网络药理学及生物信息学方法阐明金雀异黄酮对肝细胞癌的作用机制。方法利用网络药理学、生物信息学和实验验证方法。从Pharm Mapper数据库获取金雀异黄酮的潜在作用靶点。使用Gene Cards数据库获取肝细胞癌的致病基因,分析确定金雀异黄酮潜在靶点与肝细胞癌相关靶点的交集基因。采用TCGA的肝细胞癌组织样本和正常组织样本的RNA测序数据及临床信息,筛选出差异表达的共同靶基因,并进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过单因素Cox分析筛选影响患者总体生存期的差异表达基因(DEGs),利用STRING平台构建DEGs的靶点交互网络,并筛选核心基因进行验证。进行分子对接试验,检测金雀异黄酮对肝细胞癌增殖的影响。结果共筛选出235个金雀异黄酮的潜在作用靶点和9415个肝细胞癌的治疗靶点,其中40个差异表达的共同靶基因影响患者的预后。其中,ESR1、AR、HRAS、CCNA2、MMP9和CYP3A4为核心靶点。GO功能注释富集分析获得333个富集项,KEGG通路富集分析获得23个富集结果。分子对接结果显示,金雀异黄酮与核心靶蛋白有强烈的结合能力。体外实验证实,金雀异黄酮显著抑制了肝细胞癌的增殖。结论金雀异黄酮通过多个代谢和信号通路抑制肝细胞癌的发展机制。ESR1、AR、HRAS、CCNA2、MMP9和CYP3A4的表达水平可用于预测肝细胞癌患者的预后,为治疗提供有价值的靶点。 展开更多
关键词 肝肿瘤 网络药理学 生物信息学 金雀异黄酮 肝细胞癌
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鱼腥草对肝癌细胞生物学行为的影响及网络药理学分析
2
作者 李华道 林丽桥 +2 位作者 梁羽冰 黄恩浩 潘灵辉 《中国癌症防治杂志》 CAS 2024年第3期277-284,共8页
目的探讨鱼腥草(Herba Houttuyniae)对肝癌细胞生物学行为的影响及其潜在的分子机制。方法使用不同浓度的鱼腥草提取物处理肝癌细胞SMMC-7721和SK-Hep-1,利用CCK-8检测细胞的活力,使用Transwell实验检测肝癌细胞的迁移和侵袭能力,细胞... 目的探讨鱼腥草(Herba Houttuyniae)对肝癌细胞生物学行为的影响及其潜在的分子机制。方法使用不同浓度的鱼腥草提取物处理肝癌细胞SMMC-7721和SK-Hep-1,利用CCK-8检测细胞的活力,使用Transwell实验检测肝癌细胞的迁移和侵袭能力,细胞免疫荧光实验检测转移相关蛋白MMP-9的表达情况,活性氧(ROS)检测试剂盒检测细胞ROS水平,TUNEL染色检测细胞凋亡情况,Western blot检测细胞中凋亡相关蛋白表达水平。采用网络药理学筛选鱼腥草的活性成分并构建蛋白间相互作用(PPI)网络识别鱼腥草治疗肝癌的作用靶点,通过GO和KEGG通路富集分析探索与鱼腥草抗肝癌作用靶点相关的信号通路,利用qRT-PCR检测关键靶点的mRNA表达水平。结果CCK-8、Transwell、细胞免疫荧光实验结果显示鱼腥草提取物可抑制SMMC-7721和SK-Hep-1细胞的活力、迁移和侵袭能力以及转移相关蛋白MMP-9的表达(均P<0.05)。TUNEL染色、ROS检测、Western blot结果显示鱼腥草提取物可促进SMMC-7721和SK-Hep-1细胞凋亡及升高细胞中ROS水平和促凋亡蛋白BAX的表达水平(均P<0.05)。网络药理学预测鱼腥草治疗肝癌主要通过作用于TNF、AKT1、TP53等靶点,涉及癌症、TNF、PI3K-AKT等信号通路。qRT-PCR证实鱼腥草提取物可降低SMMC-7721和SK-Hep-1细胞中TNF-α、AKT1基因的mRNA表达水平,增加TP53基因的mRNA表达水平(均P<0.05)。结论鱼腥草可能通过调节TNF、AKT1、TP53等基因抑制肝癌细胞的细胞活力及迁移和侵袭能力,且促进肝癌细胞凋亡。 展开更多
关键词 肝癌 鱼腥草 网络药理学 药理机制
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