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非编码RNA的生物信息学研究方法:RNA结构预测及其应用
被引量：
5
1
作者
张浩文
杨
禹
丞
鲁志
《生命科学》
CSCD
2014年第3期219-227,共9页
近10多年来的研究逐步揭示了RNA的各种生物学功能。RNA不仅是信息从DNA传递到蛋白质的中间体,还直接参与基因沉默、表观遗传学修饰等生物学过程。单链的RNA在体内通过碱基配对折叠成一定的二级结构。介绍了现在预测RNA二级结构的主要算...
近10多年来的研究逐步揭示了RNA的各种生物学功能。RNA不仅是信息从DNA传递到蛋白质的中间体,还直接参与基因沉默、表观遗传学修饰等生物学过程。单链的RNA在体内通过碱基配对折叠成一定的二级结构。介绍了现在预测RNA二级结构的主要算法及其应用,其中包括基于热力学、同源比对和统计学习的各种算法,以及如何引入实验数据辅助预测。二级结构预测算法被广泛用于寻找RNA功能单元和预测新非编码RNA等各种问题。如何利用高通量实验数据帮助结构预测,探索长非编码RNA功能,研究RNA与蛋白质相互作用,是RNA二级结构预测算法和应用的一些前沿方向。
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关键词
RNA二级结构预测
自由能
共突变
非编码RNA
原文传递
循环荷载作用下RC框架内填Y型钢支撑结构的试验研究
被引量：
12
2
作者
杨
禹
丞
于安林
赵宝成
《苏州科技学院学报（工程技术版）》
CAS
2010年第2期41-45,共5页
为研究RC框架内填Y型钢支撑结构的整体受力性能,对2榀采用不同耗能梁段长度的内填Y型钢支撑RC框架及1榀传统RC框架结构进行1/3比例模型的循环加载试验。结果表明,RC框架内填Y型钢支撑结构相对传统RC框架结构,承载力提高了3倍左右,抗侧...
为研究RC框架内填Y型钢支撑结构的整体受力性能,对2榀采用不同耗能梁段长度的内填Y型钢支撑RC框架及1榀传统RC框架结构进行1/3比例模型的循环加载试验。结果表明,RC框架内填Y型钢支撑结构相对传统RC框架结构,承载力提高了3倍左右,抗侧刚度提高了2倍左右,但延性有所降低。RC框架内填Y型钢支撑结构的整体性能与耗能梁段的长度有关,增加耗能梁段的长度,结构的承载力和刚度均减小,但延性增加。
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关键词
Y型钢支撑
钢筋混凝土框架
耗能梁段
试验研究
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职称材料
组蛋白赖氨酸甲基化:转录调控的重要机制
被引量：
1
3
作者
杨
禹
丞
王琰
+3 位作者
徐茂鑫
陈呢喃
徐硕琪
邹珍友
《生命的化学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期688-694,共7页
组蛋白赖氨酸甲基化是表观遗传调控的重要机制之一。组蛋白H3的K4、K9、K27、K36、K79和H4的K20均可被特定的赖氨酸甲基转移酶甲基化。人类、果蝇、酿酒酵母和裂殖酵母中已鉴定出多种赖氨酸甲基转移酶,并作了生化和遗传学研究,以确定其...
组蛋白赖氨酸甲基化是表观遗传调控的重要机制之一。组蛋白H3的K4、K9、K27、K36、K79和H4的K20均可被特定的赖氨酸甲基转移酶甲基化。人类、果蝇、酿酒酵母和裂殖酵母中已鉴定出多种赖氨酸甲基转移酶,并作了生化和遗传学研究,以确定其潜在的生物功能。H3K4、H3K36和H3K79甲基化参与基因转录激活,而H3K9、H3K27和H4K20的甲基化则抑制基因转录。此外X染色体失活也与特定赖氨酸的甲基化相关。组蛋白各位点赖氨酸的甲基化参与生长、发育和病变。最后,文章评述了"组蛋白密码"假说,指出了目前的研究方向,并探讨了表观遗传机制与获得性遗传的关系。
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关键词
表观遗传
组蛋白修饰
组蛋白赖氨酸甲基化
组蛋白赖氨酸甲基转移酶
原文传递
题名
非编码RNA的生物信息学研究方法:RNA结构预测及其应用
被引量：
5
1
作者
张浩文
杨
禹
丞
鲁志
机构
清华大学生命科学学院生物信息学教育部重点实验室
出处
《生命科学》
CSCD
2014年第3期219-227,共9页
基金
国家自然科学基金青年基金项目(31100601)
国家自然科学基金面上项目(31271402)
+4 种基金
国家重点基础研究发展计划("973"项目)(2012CB316503)
国家高技术研究发展计划("863"项目)(2014AA021100)
IBM基金
Bayer基金
罗氏基金
文摘
近10多年来的研究逐步揭示了RNA的各种生物学功能。RNA不仅是信息从DNA传递到蛋白质的中间体,还直接参与基因沉默、表观遗传学修饰等生物学过程。单链的RNA在体内通过碱基配对折叠成一定的二级结构。介绍了现在预测RNA二级结构的主要算法及其应用,其中包括基于热力学、同源比对和统计学习的各种算法,以及如何引入实验数据辅助预测。二级结构预测算法被广泛用于寻找RNA功能单元和预测新非编码RNA等各种问题。如何利用高通量实验数据帮助结构预测,探索长非编码RNA功能,研究RNA与蛋白质相互作用,是RNA二级结构预测算法和应用的一些前沿方向。
关键词
RNA二级结构预测
自由能
共突变
非编码RNA
Keywords
RNA secondary structure prediction
free energy
co-variation
noncoding RNA
分类号
Q811.4 [生物学—生物工程]
Q52
原文传递
题名
循环荷载作用下RC框架内填Y型钢支撑结构的试验研究
被引量：
12
2
作者
杨
禹
丞
于安林
赵宝成
机构
苏州科技学院土木工程学院
信息产业电子第十一设计研究院有限公司苏州分院
出处
《苏州科技学院学报（工程技术版）》
CAS
2010年第2期41-45,共5页
文摘
为研究RC框架内填Y型钢支撑结构的整体受力性能,对2榀采用不同耗能梁段长度的内填Y型钢支撑RC框架及1榀传统RC框架结构进行1/3比例模型的循环加载试验。结果表明,RC框架内填Y型钢支撑结构相对传统RC框架结构,承载力提高了3倍左右,抗侧刚度提高了2倍左右,但延性有所降低。RC框架内填Y型钢支撑结构的整体性能与耗能梁段的长度有关,增加耗能梁段的长度,结构的承载力和刚度均减小,但延性增加。
关键词
Y型钢支撑
钢筋混凝土框架
耗能梁段
试验研究
Keywords
Y-eccentrically brace
reinforced concrete frames
link beam
experimental study
分类号
TU375.4 [建筑科学—结构工程]
下载PDF
职称材料
题名
组蛋白赖氨酸甲基化:转录调控的重要机制
被引量：
1
3
作者
杨
禹
丞
王琰
徐茂鑫
陈呢喃
徐硕琪
邹珍友
机构
南京大学生命科学学院
南京农业大学生命科学实验中心
出处
《生命的化学》
CAS
CSCD
北大核心
2010年第5期688-694,共7页
基金
南京农业大学生命科学实验中心开放课题基金(680810150)
江西省教育基金(GJJ10613)资助
文摘
组蛋白赖氨酸甲基化是表观遗传调控的重要机制之一。组蛋白H3的K4、K9、K27、K36、K79和H4的K20均可被特定的赖氨酸甲基转移酶甲基化。人类、果蝇、酿酒酵母和裂殖酵母中已鉴定出多种赖氨酸甲基转移酶,并作了生化和遗传学研究,以确定其潜在的生物功能。H3K4、H3K36和H3K79甲基化参与基因转录激活,而H3K9、H3K27和H4K20的甲基化则抑制基因转录。此外X染色体失活也与特定赖氨酸的甲基化相关。组蛋白各位点赖氨酸的甲基化参与生长、发育和病变。最后,文章评述了"组蛋白密码"假说,指出了目前的研究方向,并探讨了表观遗传机制与获得性遗传的关系。
关键词
表观遗传
组蛋白修饰
组蛋白赖氨酸甲基化
组蛋白赖氨酸甲基转移酶
Keywords
epigenetics
histone modification
lysine methyltransferases
lysine methylation
分类号
Q75 [生物学—分子生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
非编码RNA的生物信息学研究方法:RNA结构预测及其应用
张浩文
杨
禹
丞
鲁志
《生命科学》
CSCD
2014
5
原文传递
2
循环荷载作用下RC框架内填Y型钢支撑结构的试验研究
杨
禹
丞
于安林
赵宝成
《苏州科技学院学报（工程技术版）》
CAS
2010
12
下载PDF
职称材料
3
组蛋白赖氨酸甲基化:转录调控的重要机制
杨
禹
丞
王琰
徐茂鑫
陈呢喃
徐硕琪
邹珍友
《生命的化学》
CAS
CSCD
北大核心
2010
1
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