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CLIP-PCR直接检测血液中疟原虫雌性配子体特异转录产物s25 mRNA
1
作者
杨
珺
源
骈红茹
+1 位作者
杨
明珠
郑直
《基础医学与临床》
2022年第1期139-144,共6页
目的建立一种疟原虫雌性配子体的分子检测法。方法根据疟原虫雌性配子体特异性mRNA靶标(待测靶序列)即动合子表面蛋白(s25)的转录产物,设计特异性的捕获探针和连接探针。血液样品经裂解释放的mRNAs,无需核酸提取,通过“三明治”杂交被...
目的建立一种疟原虫雌性配子体的分子检测法。方法根据疟原虫雌性配子体特异性mRNA靶标(待测靶序列)即动合子表面蛋白(s25)的转录产物,设计特异性的捕获探针和连接探针。血液样品经裂解释放的mRNAs,无需核酸提取,通过“三明治”杂交被捕获到96孔板表面。洗去未结合探针后,将结合在mRNA靶标上的连接探针进行连接,得到两端为特殊设计序列的单链扩增模板。再用通用引物进行染料法qPCR扩增,或在端部设计TaqMan探针序列,用通用引物和通用TaqMan探针进行探针法qPCR扩增。评价这一基于捕获和连接扩增的方法(CLIP-PCR)的灵敏度、特异性和重复性并与普通的RT-qPCR方法进行比较,将其应用于临床样品的检测。结果该CLIP-PCR具有较高的灵敏度和特异性。与普通的RT-qPCR一样,均可检测低至11拷贝数的s25 mRNA靶标;而且该CLIP-PCR操作更简便。该CLIP-PCR可准确检测到疟疾患者血液中的雌性配子体。可将96个样品的检测时间缩短至3 h。结论建立了灵敏高效的染料法和通用TaqMan探针法CLIP-PCR检测疟原虫雌性配子体,为疟疾传播的控制、配子体大规模筛查奠定了基础。
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关键词
疟原虫
配子体
检测方法
捕获
连接
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题名
CLIP-PCR直接检测血液中疟原虫雌性配子体特异转录产物s25 mRNA
1
作者
杨
珺
源
骈红茹
杨
明珠
郑直
机构
中国医学科学院基础医学研究所北京协和医学院基础学院生物化学与分子生物学系
出处
《基础医学与临床》
2022年第1期139-144,共6页
基金
国家科技重大专项(2018ZX10101001-001-005)
中国医学科学院医学与健康科技创新(2018-I2M-1-001)
国家自然科学基金(81902167)。
文摘
目的建立一种疟原虫雌性配子体的分子检测法。方法根据疟原虫雌性配子体特异性mRNA靶标(待测靶序列)即动合子表面蛋白(s25)的转录产物,设计特异性的捕获探针和连接探针。血液样品经裂解释放的mRNAs,无需核酸提取,通过“三明治”杂交被捕获到96孔板表面。洗去未结合探针后,将结合在mRNA靶标上的连接探针进行连接,得到两端为特殊设计序列的单链扩增模板。再用通用引物进行染料法qPCR扩增,或在端部设计TaqMan探针序列,用通用引物和通用TaqMan探针进行探针法qPCR扩增。评价这一基于捕获和连接扩增的方法(CLIP-PCR)的灵敏度、特异性和重复性并与普通的RT-qPCR方法进行比较,将其应用于临床样品的检测。结果该CLIP-PCR具有较高的灵敏度和特异性。与普通的RT-qPCR一样,均可检测低至11拷贝数的s25 mRNA靶标;而且该CLIP-PCR操作更简便。该CLIP-PCR可准确检测到疟疾患者血液中的雌性配子体。可将96个样品的检测时间缩短至3 h。结论建立了灵敏高效的染料法和通用TaqMan探针法CLIP-PCR检测疟原虫雌性配子体,为疟疾传播的控制、配子体大规模筛查奠定了基础。
关键词
疟原虫
配子体
检测方法
捕获
连接
Keywords
Plasmodium
gametocyte
detection method
capture
ligation
分类号
R331 [医药卫生—人体生理学]
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作者
出处
发文年
被引量
操作
1
CLIP-PCR直接检测血液中疟原虫雌性配子体特异转录产物s25 mRNA
杨
珺
源
骈红茹
杨
明珠
郑直
《基础医学与临床》
2022
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