目的:建立Illumina Miseq深度测序筛查酸奶中微生物的方法,分析酸奶中微生物的多样性。方法:以9种酸奶样品为研究对象,提取酸奶中细菌基因组DNA,应用高通量测序技术测定细菌的16S r DNA v1-v3变异区序列,得到9种样品中微生物群体分布和...目的:建立Illumina Miseq深度测序筛查酸奶中微生物的方法,分析酸奶中微生物的多样性。方法:以9种酸奶样品为研究对象,提取酸奶中细菌基因组DNA,应用高通量测序技术测定细菌的16S r DNA v1-v3变异区序列,得到9种样品中微生物群体分布和丰度、以及不同样品间的菌种差异与进化关系。结果:酸奶中微生物主要为厚壁菌门(Firmicutes),占据99.6%之高,其中厚壁菌门主要以链球菌属(Streptococcus、87.1%)、乳杆菌属(Lactobacillus、10.3%)、乳球菌属(Lactococcus、0.3%)组成,9种酸奶中有3种同时含有链球菌属和乳杆菌属,其余6种样品中链球菌属几乎占据全部(>97%)。结论:Illumina Miseq深度测序技术可快速精确深入掌握酸奶中微生物多样性,结果对比显示不同酸奶菌种同质化程度高,其中链球菌属占绝对优势,同时发现部分酸奶标签标示不符。展开更多
单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)是一种重要的食源性致病菌,能引起人和动物的李斯特菌病,利用双向电泳通过裂解液组成、上样量、聚焦时间等相关技术的比较研究和条件优化,获得单核增生性李斯特菌菌体全蛋白双向电泳图...单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)是一种重要的食源性致病菌,能引起人和动物的李斯特菌病,利用双向电泳通过裂解液组成、上样量、聚焦时间等相关技术的比较研究和条件优化,获得单核增生性李斯特菌菌体全蛋白双向电泳图谱,提取部分蛋白质点酶解,利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorp-tion/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)测定肽质量指纹图谱,Mascot软件查询Swiss-Prot数据库,最终鉴定出李斯特菌中特异性蛋白包括核糖体蛋白L10、S6,李斯特菌推测蛋白LMOf2365_2340,ArsC蛋白,推测蛋白lin1505、lin1144,翻译起始因子IF-1等,反映出李斯特菌的多种差异及生长特性。展开更多
文摘目的:建立Illumina Miseq深度测序筛查酸奶中微生物的方法,分析酸奶中微生物的多样性。方法:以9种酸奶样品为研究对象,提取酸奶中细菌基因组DNA,应用高通量测序技术测定细菌的16S r DNA v1-v3变异区序列,得到9种样品中微生物群体分布和丰度、以及不同样品间的菌种差异与进化关系。结果:酸奶中微生物主要为厚壁菌门(Firmicutes),占据99.6%之高,其中厚壁菌门主要以链球菌属(Streptococcus、87.1%)、乳杆菌属(Lactobacillus、10.3%)、乳球菌属(Lactococcus、0.3%)组成,9种酸奶中有3种同时含有链球菌属和乳杆菌属,其余6种样品中链球菌属几乎占据全部(>97%)。结论:Illumina Miseq深度测序技术可快速精确深入掌握酸奶中微生物多样性,结果对比显示不同酸奶菌种同质化程度高,其中链球菌属占绝对优势,同时发现部分酸奶标签标示不符。
文摘单核细胞增生李斯特菌(Listeria monocytogenes,LM)是一种重要的食源性致病菌,能引起人和动物的李斯特菌病,利用双向电泳通过裂解液组成、上样量、聚焦时间等相关技术的比较研究和条件优化,获得单核增生性李斯特菌菌体全蛋白双向电泳图谱,提取部分蛋白质点酶解,利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorp-tion/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)测定肽质量指纹图谱,Mascot软件查询Swiss-Prot数据库,最终鉴定出李斯特菌中特异性蛋白包括核糖体蛋白L10、S6,李斯特菌推测蛋白LMOf2365_2340,ArsC蛋白,推测蛋白lin1505、lin1144,翻译起始因子IF-1等,反映出李斯特菌的多种差异及生长特性。
