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一个亚洲棉MYB家族新基因的克隆及特征分析
被引量:
14
1
作者
杨
召
恩
杨
作仁
+3 位作者
刘坤
刘传亮
张朝军
李付广
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期195-204,共10页
【目的】克隆亚洲棉MYB家族的一个新基因(GaMYB2),研究其表达模式,分析其预期编码蛋白。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆亚洲棉MYB2的cDNA序列全长;应用生物信息学软件分析该基因及预期编码蛋白的特征;采用实时荧光定量PCR技术对该基...
【目的】克隆亚洲棉MYB家族的一个新基因(GaMYB2),研究其表达模式,分析其预期编码蛋白。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆亚洲棉MYB2的cDNA序列全长;应用生物信息学软件分析该基因及预期编码蛋白的特征;采用实时荧光定量PCR技术对该基因的组织特异性和PEG6000模拟干旱胁迫处理下的表达模式进行分析。【结果】从亚洲棉(Gossypium arboreum L.)中克隆了MYB家族的一个新基因MYB2,该基因全长1 117 bp,ORF全长840 bp,编码279个氨基酸,含有MYB保守域,氨基酸的BALSTP分析表明GaMYB2氨基酸序列与已报道的水稻(BAA23338.1)、小麦(AAT37168.1)等的序列有40.50%到68.20%的相似性。亚细胞定位表明该基因在细胞核中表达,实时荧光定量PCR结果表明该基因在根和花中的表达量较高,并且响应17%的PEG6000模拟干旱胁迫处理,上调表达。【结论】GaMYB2是亚洲棉MYB家族的一个新基因,并认为该基因可能在棉花调控干旱胁迫的生理适应过程中发挥重要作用。
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关键词
亚洲棉
GaMYB2
干旱模拟
上调表达
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职称材料
陆地棉粉花花蕾与黄花花蕾的比较转录组分析
2
作者
刘林强
韩笑
+6 位作者
杨
兰
闫青地
胡伟
靳羽莹
于洁
杨
召
恩
李付广
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2023年第4期259-273,共15页
【目的】挖掘影响棉花花色多态性的代谢物质和候选基因。【方法】以陆地棉黄色花品种中棉所24和粉色花品系中遗红为研究材料,取花瓣变色前后的花蕾进行花色苷含量测定和转录组测序分析。【结果】在开花前,中棉所24和中遗红的花蕾颜色已...
【目的】挖掘影响棉花花色多态性的代谢物质和候选基因。【方法】以陆地棉黄色花品种中棉所24和粉色花品系中遗红为研究材料,取花瓣变色前后的花蕾进行花色苷含量测定和转录组测序分析。【结果】在开花前,中棉所24和中遗红的花蕾颜色已表现出差异,随着花蕾的发育,花色差异逐渐增大,其中天竺葵素-3-O-葡萄糖苷、矢车菊素-3-O-半乳糖苷、矢车菊素-3-O-葡萄糖苷和矢车菊素-3-O-(6''-O-丙二酰)-葡萄糖苷在中遗红花蕾中特异性积累。对中棉所24和中遗红花蕾中差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)进行联合分析,共获得8790个上调表达基因和8521个下调表达基因,它们在液泡质子ATP酶(V型ATP酶)复合体、类黄酮生物合成过程等通路富集。进一步分析发现,花色苷合成相关的基因在2个材料中的表达水平并无明显差异,而调控花色苷合成、转运以及液泡酸碱平衡的基因Gh_A07G083500、bHLH基因Gh_D11G130400、GST基因Gh_A07G079800和V型ATP酶基因Gh_A09G123000、Gh_A08G012100和Gh_D09G115200在中遗红中高水平表达。【结论】本研究构建了粉花花色形成的调控通路,鉴定了与棉花花色相关的候选基因,为棉花育种提供基因资源。
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关键词
陆地棉
花色苷
转录组
花蕾
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职称材料
棉花磷胁迫响应基因GhWRKY6克隆及功能分析
被引量:
4
3
作者
李智
韩笑
+2 位作者
张一豪
马峙英
杨
召
恩
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019年第3期182-191,共10页
【目的】提高棉花在低磷胁迫下的抗性,挖掘棉花磷胁迫相关功能基因。【方法】用生物信息学方法分析Gh WRKY6基因的结构特征和进化关系;构建基因超表达载体转化拟南芥,分析转基因拟南芥在低磷胁迫下的抗性;利用荧光定量PCR(Real-time qua...
【目的】提高棉花在低磷胁迫下的抗性,挖掘棉花磷胁迫相关功能基因。【方法】用生物信息学方法分析Gh WRKY6基因的结构特征和进化关系;构建基因超表达载体转化拟南芥,分析转基因拟南芥在低磷胁迫下的抗性;利用荧光定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction, qRT-PCR)分析拟南芥中磷信号途径Marker基因表达量的变化。【结果】以陆地棉cDNA为模板克隆得到Gh WRKY6基因,生物信息学分析表明该基因序列含有一个WRKY保守结构域,是WRKY家族转录因子。在低磷胁迫下,转基因拟南芥与野生型相比,种子萌发速度、主根长度、侧根数目、生物量均低于野生型,而在正常生长条件下两者并无差别。qRT-PCR分析表明GhWRKY6能够影响关键的磷转运蛋白基因的表达。【结论】GhWRKY6作为一个负调控因子参与到植物低磷胁迫响应信号途径中。
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关键词
棉花
WRKY转录因子
低磷胁迫
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职称材料
过表达拟南芥AtCIPK 23、AtAKT 1和AtCBL 1基因棉花苗期耐低钾的差异及机制研究
被引量:
4
4
作者
张斌
刘记
+5 位作者
张朝军
孔德培
王鹏
杨
召
恩
李付广
张雪妍
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2018年第3期205-214,共10页
【目的】评价过表达拟南芥At CIPK 23、At AKT 1和At CBL 1基因棉花苗期耐低钾能力的差异,为棉花钾高效品种培育提供理论依据。【方法】通过室内水培法,测定比较了转基因棉花和中棉所24(CCRI 24)在适钾、低钾条件下苗期的长势、干物质...
【目的】评价过表达拟南芥At CIPK 23、At AKT 1和At CBL 1基因棉花苗期耐低钾能力的差异,为棉花钾高效品种培育提供理论依据。【方法】通过室内水培法,测定比较了转基因棉花和中棉所24(CCRI 24)在适钾、低钾条件下苗期的长势、干物质质量、钾浓度和钾累积量等指标,并从根系形态、钾利用指数、钾转运能力和受胁迫程度等方面综合分析了其可能的生理机制。【结果】适钾条件下,转基因棉花和中棉所24长势基本一致,无显著差异。低钾胁迫时,过表达At AKT 1基因棉花幼苗总根长、根表面积和根体积约为中棉所24的3倍,整株干物质质量是中棉所24的1.66倍,具有明显的生长优势,并且钾转运能力强、钾利用指数高,受胁迫程度明显降低;而过表达拟南芥At CIPK 23和At CBL 1基因棉花幼苗的各项指标与中棉所24相当,无显著差异。【结论】在棉花中过表达拟南芥钾离子通道蛋白基因At AKT 1能显著提升棉花本身的耐低钾能力。
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关键词
中棉所24
苗期
耐低钾
钾利用
胁迫
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职称材料
题名
一个亚洲棉MYB家族新基因的克隆及特征分析
被引量:
14
1
作者
杨
召
恩
杨
作仁
刘坤
刘传亮
张朝军
李付广
机构
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室/农业部棉花遗传改良实验室
周口师范学院植物遗传与分子育种重点实验室
出处
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013年第1期195-204,共10页
基金
国家杰出青年基金项目"棉花高频再生性状的遗传与应用研究"(31125020)
文摘
【目的】克隆亚洲棉MYB家族的一个新基因(GaMYB2),研究其表达模式,分析其预期编码蛋白。【方法】利用RT-PCR和RACE技术克隆亚洲棉MYB2的cDNA序列全长;应用生物信息学软件分析该基因及预期编码蛋白的特征;采用实时荧光定量PCR技术对该基因的组织特异性和PEG6000模拟干旱胁迫处理下的表达模式进行分析。【结果】从亚洲棉(Gossypium arboreum L.)中克隆了MYB家族的一个新基因MYB2,该基因全长1 117 bp,ORF全长840 bp,编码279个氨基酸,含有MYB保守域,氨基酸的BALSTP分析表明GaMYB2氨基酸序列与已报道的水稻(BAA23338.1)、小麦(AAT37168.1)等的序列有40.50%到68.20%的相似性。亚细胞定位表明该基因在细胞核中表达,实时荧光定量PCR结果表明该基因在根和花中的表达量较高,并且响应17%的PEG6000模拟干旱胁迫处理,上调表达。【结论】GaMYB2是亚洲棉MYB家族的一个新基因,并认为该基因可能在棉花调控干旱胁迫的生理适应过程中发挥重要作用。
关键词
亚洲棉
GaMYB2
干旱模拟
上调表达
Keywords
Gossypium arboreum L.
GaMYB2
drought tolerance simulation
up-regulate expression
分类号
S562 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
陆地棉粉花花蕾与黄花花蕾的比较转录组分析
2
作者
刘林强
韩笑
杨
兰
闫青地
胡伟
靳羽莹
于洁
杨
召
恩
李付广
机构
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2023年第4期259-273,共15页
基金
国家自然科学基金青年科学基金项目(31801416)。
文摘
【目的】挖掘影响棉花花色多态性的代谢物质和候选基因。【方法】以陆地棉黄色花品种中棉所24和粉色花品系中遗红为研究材料,取花瓣变色前后的花蕾进行花色苷含量测定和转录组测序分析。【结果】在开花前,中棉所24和中遗红的花蕾颜色已表现出差异,随着花蕾的发育,花色差异逐渐增大,其中天竺葵素-3-O-葡萄糖苷、矢车菊素-3-O-半乳糖苷、矢车菊素-3-O-葡萄糖苷和矢车菊素-3-O-(6''-O-丙二酰)-葡萄糖苷在中遗红花蕾中特异性积累。对中棉所24和中遗红花蕾中差异表达基因(differentially expressed gene,DEG)进行联合分析,共获得8790个上调表达基因和8521个下调表达基因,它们在液泡质子ATP酶(V型ATP酶)复合体、类黄酮生物合成过程等通路富集。进一步分析发现,花色苷合成相关的基因在2个材料中的表达水平并无明显差异,而调控花色苷合成、转运以及液泡酸碱平衡的基因Gh_A07G083500、bHLH基因Gh_D11G130400、GST基因Gh_A07G079800和V型ATP酶基因Gh_A09G123000、Gh_A08G012100和Gh_D09G115200在中遗红中高水平表达。【结论】本研究构建了粉花花色形成的调控通路,鉴定了与棉花花色相关的候选基因,为棉花育种提供基因资源。
关键词
陆地棉
花色苷
转录组
花蕾
Keywords
upland cotton(Gossypium hirsutum L.)
anthocyanin
transcriptome
flower bud
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
棉花磷胁迫响应基因GhWRKY6克隆及功能分析
被引量:
4
3
作者
李智
韩笑
张一豪
马峙英
杨
召
恩
机构
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
河北农业大学/棉花生物学国家重点实验室河北基地
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019年第3期182-191,共10页
基金
国家自然科学基金
青年科学基金项目(31801416)
文摘
【目的】提高棉花在低磷胁迫下的抗性,挖掘棉花磷胁迫相关功能基因。【方法】用生物信息学方法分析Gh WRKY6基因的结构特征和进化关系;构建基因超表达载体转化拟南芥,分析转基因拟南芥在低磷胁迫下的抗性;利用荧光定量PCR(Real-time quantitative polymerase chain reaction, qRT-PCR)分析拟南芥中磷信号途径Marker基因表达量的变化。【结果】以陆地棉cDNA为模板克隆得到Gh WRKY6基因,生物信息学分析表明该基因序列含有一个WRKY保守结构域,是WRKY家族转录因子。在低磷胁迫下,转基因拟南芥与野生型相比,种子萌发速度、主根长度、侧根数目、生物量均低于野生型,而在正常生长条件下两者并无差别。qRT-PCR分析表明GhWRKY6能够影响关键的磷转运蛋白基因的表达。【结论】GhWRKY6作为一个负调控因子参与到植物低磷胁迫响应信号途径中。
关键词
棉花
WRKY转录因子
低磷胁迫
Keywords
cotton(Gossypium hirsutum L.)
WRKY transcription factor
low-phosphorus stress
分类号
S562 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
过表达拟南芥AtCIPK 23、AtAKT 1和AtCBL 1基因棉花苗期耐低钾的差异及机制研究
被引量:
4
4
作者
张斌
刘记
张朝军
孔德培
王鹏
杨
召
恩
李付广
张雪妍
机构
中国农业科学院棉花研究所/棉花生物学国家重点实验室
出处
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2018年第3期205-214,共10页
基金
中央级公益性科研院所基本科研业务费专项(1610162016011)
国家重点研发计划-棉花品质
抗逆等重要性状的功能基因组与调控网络(2016YFD0101006)
文摘
【目的】评价过表达拟南芥At CIPK 23、At AKT 1和At CBL 1基因棉花苗期耐低钾能力的差异,为棉花钾高效品种培育提供理论依据。【方法】通过室内水培法,测定比较了转基因棉花和中棉所24(CCRI 24)在适钾、低钾条件下苗期的长势、干物质质量、钾浓度和钾累积量等指标,并从根系形态、钾利用指数、钾转运能力和受胁迫程度等方面综合分析了其可能的生理机制。【结果】适钾条件下,转基因棉花和中棉所24长势基本一致,无显著差异。低钾胁迫时,过表达At AKT 1基因棉花幼苗总根长、根表面积和根体积约为中棉所24的3倍,整株干物质质量是中棉所24的1.66倍,具有明显的生长优势,并且钾转运能力强、钾利用指数高,受胁迫程度明显降低;而过表达拟南芥At CIPK 23和At CBL 1基因棉花幼苗的各项指标与中棉所24相当,无显著差异。【结论】在棉花中过表达拟南芥钾离子通道蛋白基因At AKT 1能显著提升棉花本身的耐低钾能力。
关键词
中棉所24
苗期
耐低钾
钾利用
胁迫
Keywords
CCR124
seedling
tolerance to low-potassium
potassium utilization
stress
分类号
S562.01 [农业科学—作物学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
一个亚洲棉MYB家族新基因的克隆及特征分析
杨
召
恩
杨
作仁
刘坤
刘传亮
张朝军
李付广
《中国农业科学》
CAS
CSCD
北大核心
2013
14
下载PDF
职称材料
2
陆地棉粉花花蕾与黄花花蕾的比较转录组分析
刘林强
韩笑
杨
兰
闫青地
胡伟
靳羽莹
于洁
杨
召
恩
李付广
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2023
0
下载PDF
职称材料
3
棉花磷胁迫响应基因GhWRKY6克隆及功能分析
李智
韩笑
张一豪
马峙英
杨
召
恩
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2019
4
下载PDF
职称材料
4
过表达拟南芥AtCIPK 23、AtAKT 1和AtCBL 1基因棉花苗期耐低钾的差异及机制研究
张斌
刘记
张朝军
孔德培
王鹏
杨
召
恩
李付广
张雪妍
《棉花学报》
CSCD
北大核心
2018
4
下载PDF
职称材料
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