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解淀粉芽孢杆菌群体遗传特征分析
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作者 王依婷 李素珍 +8 位作者 毛志涛 廖小平 许慧敏 邱艺华 闫雪崧 李贞景 郭庆彬 刘欢欢 《食品研究与开发》 CAS 北大核心 2023年第17期160-170,共11页
通过平均核苷酸一致性分析、基因预测、泛基因组构建、功能注释等流程,以66株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)的基因组为对象,进行该物种的泛基因组分析。平均核苷酸一致性分析表明,上述菌株可划为具有明显物种边界的两个... 通过平均核苷酸一致性分析、基因预测、泛基因组构建、功能注释等流程,以66株解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)的基因组为对象,进行该物种的泛基因组分析。平均核苷酸一致性分析表明,上述菌株可划为具有明显物种边界的两个独立分支;获得的泛基因组共包含13051个基因,其中核心基因2165个;碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZy)功能注释显示,B.amyloliquefaciens相比Bacillus属内其他菌株在分解淀粉、β-葡聚糖和木聚糖上具有较大优势;在促植物生长方面,B.amyloliquefaciens通过吲哚丙酮酸途径合成吲哚乙酸,并通过碱性磷酸脂酶和植酸酶分解磷元素;抗生素耐药性分析发现,多数菌株含链霉素以及大环内酯类抗生素抗性基因。此外,在所有基因组中均发现杆菌烯和杆菌肽等次级代谢产物基因簇。上述研究进一步明确B.amyloliquefaciens基因组水平的分类学特点、核心基础代谢特征,以及菌株在碳水化合物代谢、植物促生、生物防治等方面的优势及潜力,可为开发利用该菌作参考。 展开更多
关键词 解淀粉芽孢杆菌 泛基因组 吲哚乙酸 解磷 耐药性 次级代谢产物
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产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种ZW18益生基因分析
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作者 李欣媛 +2 位作者 吕厚姣 耿伟涛 王艳萍 《中国酿造》 CAS 北大核心 2023年第12期62-69,共8页
产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种(Lactobacillus kefiranofaciens subsp.kefiranofaciens)作为新食品原料具有很多益生特性,该研究利用全基因组测序对产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种ZW18基本特征和益生功能基因进行全面分析。结果表明,该菌株由一... 产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种(Lactobacillus kefiranofaciens subsp.kefiranofaciens)作为新食品原料具有很多益生特性,该研究利用全基因组测序对产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种ZW18基本特征和益生功能基因进行全面分析。结果表明,该菌株由一个环状染色体和两个质粒组成,全长约2.4 Mbp,有更多独特基因和特性。通过数据库注释可得菌株ZW18具有较好的生存能力与稳定性,且对碳水化合物利用能力强,保证了菌体细胞的物质基础和能量供给。该菌株基因组中含有与抵抗氧化应激、耐酸耐胆盐、黏附和聚集、免疫、细菌素等相关的基因,与硫胺素、核黄素等多种维生素及赖氨酸、蛋氨酸等人体所需氨基酸合成相关基因,表明其具有多种潜在益生特性,为进一步深入研究与应用提供基础数据。 展开更多
关键词 产马乳酒乳杆菌马乳酒亚种 基因组 益生特性
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耕地多功能权衡与协同关系的尺度效应——以武汉城市圈为例 被引量:5
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作者 胡伟艳 +1 位作者 刘恬 张丝雨 《浙江农业学报》 CSCD 北大核心 2022年第1期184-195,共12页
探讨耕地多功能权衡与协同关系的尺度效应对有效的耕地保护和可持续利用具有重要意义。以武汉城市圈为例,在建立评价指标体系开展耕地多功能评价的基础上,运用斯皮尔曼(Spearman)相关分析法,从4级尺度分析揭示耕地多功能权衡与协同关系... 探讨耕地多功能权衡与协同关系的尺度效应对有效的耕地保护和可持续利用具有重要意义。以武汉城市圈为例,在建立评价指标体系开展耕地多功能评价的基础上,运用斯皮尔曼(Spearman)相关分析法,从4级尺度分析揭示耕地多功能权衡与协同关系的尺度变化规律。结果显示:耕地单项功能指数和多功能指数在不同尺度上呈现较明显的空间分异。耕地各功能之间的权衡与协同关系具有尺度效应,随着尺度的变化而变化。该研究可为不同层级管理决策者实施差异化耕地保护联动策略,进而促进耕地的多功能协同效应与可持续利用提供依据。 展开更多
关键词 耕地可持续利用 耕地多功能 权衡 协同 尺度效应 武汉城市圈
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Exploring the Scale Effects of Trade-offs and Synergies of Multifunctional Cultivated Land——Evidence from Wuhan Metropolitan Area 被引量:2
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作者 YANG Fengyanzi HU Weiyan 《Journal of Resources and Ecology》 CSCD 2022年第6期1116-1127,共12页
The purpose of this paper is to explore the trade-offs and synergies of multifunctional cultivated land(MCL) at multiple scales. The study area is Wuhan Metropolitan Area, China. The entropy method and the method of S... The purpose of this paper is to explore the trade-offs and synergies of multifunctional cultivated land(MCL) at multiple scales. The study area is Wuhan Metropolitan Area, China. The entropy method and the method of Spearman’s rank correlation were employed for the analysis of combined land use/cover data, administrative division data, population data and statistical yearbook data, from the multi-scale perspectives of cities, counties and townships. The results showed that:(1) The multi-functionality of cultivated land had obvious spatial differences and its overall spatial patterns were relatively robust, which did not change very much at the single scale.(2) At each single scale, the MCL’s trade-offs and synergies had spatial heterogeneity.(3) Scale effects existed in the MCL’s trade-offs and synergies. From the prefecture-level city scale, to the county scale, and to the township scale, the MCL’s trade-offs were changed to synergies, and some synergic relationships were enhanced. This article contributes to the literature by deepening the multiscale analysis of trade-offs and synergies of multifunctional cultivated land. The conclusions might provide a basis for helping policy-makers to implement protection measures for the multi-functionality of cultivated land at the right spatial scale, and to promote the higher-level synergies of multifunctional cultivated land to realize its sustainable use. 展开更多
关键词 sustainable cultivated land use multifunctional cultivated land trade-offs and synergies scale effects Wuhan Metropolitan Area
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农地多功能权衡与协同研究进展与趋势 被引量:1
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作者 胡伟艳 +1 位作者 余婷 余波平 《国土资源科技管理》 2021年第2期31-39,共9页
采用文献资料法、比较法、归纳演绎法系统梳理国内外关于农地多功能权衡与协同作用的研究文献,揭示其研究进展和未来研究趋势。研究发现:(1)从农地多功能权衡与协同单一时间尺度研究转向时空动态变化研究;从省级、市级、区县级、街道级... 采用文献资料法、比较法、归纳演绎法系统梳理国内外关于农地多功能权衡与协同作用的研究文献,揭示其研究进展和未来研究趋势。研究发现:(1)从农地多功能权衡与协同单一时间尺度研究转向时空动态变化研究;从省级、市级、区县级、街道级和空间格网尺度等单一尺度研究,逐渐转向多尺度研究;从线性相关关系研究逐渐转向非线性关系研究。(2)与国外研究相比,国内研究多侧重划分功能分类,构建评价指标体系,利用统计数据开展省级、市级、区县级等单一行政尺度研究,近来利用空间数据开展栅格尺度的研究较多,且开始重视行政尺度或栅格尺度或者两个尺度结合的多尺度研究,试图揭示权衡与协同的多尺度效应,但尺度之间的作用机制研究较少。国外研究集中于更小尺度考虑地方情景的农地多功能权衡与协同形成机制、驱动因素,关注权衡与协同研究在空间规划、管理政策制定中的应用。研究结论:该研究结果可以为农地多功能权衡与协同领域的进一步深入研究提供依据,也可指导农地多功能空间管理和农田建设实践,从而实现农地利用经济、社会和生态的可持续性。 展开更多
关键词 土地管理 农地多功能 权衡与协同 综述
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