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基于生物信息学方法筛选脑动脉瘤中免疫浸润相关基因并构建miRNA-mRNA调控网络
1
作者 杜书迪 颜睿 梁绍栋 《中文科技期刊数据库（引文版）医药卫生》 2024年第1期0108-0113,共6页
脑动脉瘤仍然是最具破坏性的神经系统疾病之一。然而,脑动脉瘤形成和发展的病理生理学机制仍不清楚。本研究的目的是确定脑动脉瘤中的关键microRNA(miRNA/miR)和核心基因,有助于阐明脑动脉瘤发生的机制。方法 在本研究中,通过利用基因... 脑动脉瘤仍然是最具破坏性的神经系统疾病之一。然而,脑动脉瘤形成和发展的病理生理学机制仍不清楚。本研究的目的是确定脑动脉瘤中的关键microRNA(miRNA/miR)和核心基因,有助于阐明脑动脉瘤发生的机制。方法 在本研究中,通过利用基因表达总库整合mRNA的公开基因表达数据,并结合生物信息学预测,共鉴定出2211个差异表达的mRNA,通过免疫浸润分析、WGCNA分析以及PPI网络提取核心基因,最终筛选出了与免疫细胞浸润显著相关的前10个核心基因。这些靶基因的生物学功能和途径被证实为与脑动脉瘤相关。收集2021年09月至2022年9月牡丹江医学院附属红旗医院神经外二科进行开颅动脉瘤夹闭的患者样本以及4例对照组织进行miRNA测序分析,并进行差异分析,鉴定了52个差异表达的miRNA。通过miRWalk数据库预测了调控这些核心基因的miRNA,发现许多miRNA-靶基因对的表达水平呈负相关,它们被用来构建脑动脉瘤中miRNA-靶基因的调控网络。统计学分析均由R软件4.0.2版本进行完成,对于两组间计量资料的比较,若数据为正态分布,则使用t检验;若数据不服从正态分布,则使用秩和检验;相关性分析采用Spearman法进行。P<0.05表示有统计学意义。结果 本研究成功构建脑动脉瘤中miRNA-靶基因的调控网络,在这个网络中,发现了一些可能在脑动脉瘤中起关键作用的miRNA和基因,如hsa-miR-675-3p和hsa-miR-363-5p等17个miRNA,以及7个核心基因包括INSR、NOTCH3、CACNB1、NTRK2、TRDN、KCND3和TAC1。结论 本研究中的综合分析通过构造miRNA-靶基因的调控网络可能有助于理解脑动脉瘤的潜在分子机制和寻找新的治疗靶点。 展开更多
关键词 脑动脉瘤 免疫浸润 MIRNA MRNA 调控网络
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Turcot综合征3例并文献复习
2
作者 杜书迪 谷春雨 +5 位作者 王浩然 吉俊鹏 宁威海 杨庆哲 刘宁 张明山 《中华神经外科杂志》 CSCD 北大核心 2023年第8期840-842,共3页
Turcot综合症(TS)是指中枢神经系统恶性肿瘤与结直肠恶性肿瘤同时或先后出现的一种遗传性疾病,通常需要结合病史及病理学进行确诊,5年生存率<5%。首都医科大学三博脑科医院神经外科2018年11月至2021年5月共治疗3例TS患者,所有患者均... Turcot综合症(TS)是指中枢神经系统恶性肿瘤与结直肠恶性肿瘤同时或先后出现的一种遗传性疾病,通常需要结合病史及病理学进行确诊,5年生存率<5%。首都医科大学三博脑科医院神经外科2018年11月至2021年5月共治疗3例TS患者,所有患者均行开颅手术,全切除或近全切除肿瘤,术后辅助放化疗。术后病理学证实均为胶质母细胞瘤。1例患者肿瘤多次复发并死亡,1例术后8个月生存良好,1例失访。 展开更多
关键词 开颅手术 脑科医院 胶质母细胞瘤 遗传性疾病 病理学 神经外科 辅助放化疗 结直肠恶性肿瘤
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心肌缺血小鼠牛磺酸代谢和保护作用的分子机制 被引量：3
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作者 张增雷 刘星 +2 位作者 胡静 杜书迪 任凤云 《中国老年学杂志》 CAS 北大核心 2018年第16期3996-3999,共4页
目的研究心肌缺血小鼠牛磺酸代谢和保护作用的分子机制。方法健康雄性昆明种小鼠40只随机分为模型组(异丙肾上腺素2 mg·kg^(-1)·d^(-1),ip.)、正常对照组(生理盐水,10 ml·kg^(-1)·d^(-1),ig.)、牛磺酸组(牛磺酸,400... 目的研究心肌缺血小鼠牛磺酸代谢和保护作用的分子机制。方法健康雄性昆明种小鼠40只随机分为模型组(异丙肾上腺素2 mg·kg^(-1)·d^(-1),ip.)、正常对照组(生理盐水,10 ml·kg^(-1)·d^(-1),ig.)、牛磺酸组(牛磺酸,400 mg·kg^(-1)·d^(-1),ig.),每组10只。腹腔注射异丙肾上腺素(ISO)构建小鼠心肌缺血模型,观察牛磺酸对小鼠心肌含水量(MWC)及心肌指数(MI)的影响,采取比色法对血清丙二醛(MDA)含量及超氧化物歧化酶(SOD)活性进行测定。采用酶联免疫吸附试验(ELISA)测定小鼠血液中白细胞介素(IL)-6、C反应蛋白(CRP)的变化,采取免疫蛋白印迹法对牛磺酸转运体(TAUT),半胱氨酸双加氧酶(CDO)及半胱氨酸亚磺酸脱羧酶(CSD)蛋白的表达水平进行检测。结果模型组与正常对照组进行比较,血清总SOD活性明显下降,MDA含量明显上升(P<0.05)。牛磺酸组与模型组比较,血清总SOD活性明显升高(P<0.05),MDA含量明显下降(P<0.05)。与正常对照组进行比较,模型组及牛磺酸组MWC及MI明显增高(P<0.05)。与模型组比较,牛磺酸组MWC及MI显著降低(P<0.05)。与正常对照组比较,模型组及牛磺酸组各时间段IL-6及CRP表达水平明显提升(P<0.05)。与模型组比较,牛磺酸组IL-6及CRP表达明显减少(P<0.05)。与正常对照组比较,模型组和牛磺酸组心肌组织TAUT表达下调;与模型组比较,牛磺酸组心肌组织TAUT蛋白表达上调;与正常对照组比较,模型组和牛磺酸组心肌组织CDO及CSD蛋白的表达上调;与模型组进行比较,牛磺酸组心肌组织CDO及CSD蛋白的表达下调(P<0.05)。结论牛磺酸对小鼠心肌缺血存在一定的保护作用,其作用机制可能是提升氧自由基清除系统活性,避免脂质过氧化,提高TAUT蛋白的表达,减少CDO及CSD蛋白的表达,从而发挥其对心肌缺血的保护作用。 展开更多
关键词 心肌缺血 牛磺酸 代谢 保护机制
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咳尔康颗粒对肺腺癌细胞A549的体外抗肿瘤作用 被引量：2
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作者 侯广玉 李孟全 +3 位作者 赵鹏程 王一成 朱立双 杜书迪 《医药导报》 CAS 北大核心 2019年第1期27-32,共6页
目的制备咳尔康颗粒并观察其对人肺腺癌细胞A549的体外抗肿瘤作用。方法将处方药材经水提取,减压浓缩,用淀粉和糊精为辅料制备咳尔康颗粒。以黄芩苷为指认成分,采用高效液相色谱(HPLC)法建立咳尔康颗粒质量控制标准。以不同浓度的咳尔... 目的制备咳尔康颗粒并观察其对人肺腺癌细胞A549的体外抗肿瘤作用。方法将处方药材经水提取,减压浓缩,用淀粉和糊精为辅料制备咳尔康颗粒。以黄芩苷为指认成分,采用高效液相色谱(HPLC)法建立咳尔康颗粒质量控制标准。以不同浓度的咳尔康颗粒溶液作用于肿瘤细胞A549,光学显微镜观察细胞形态,4,6-联脒-2-苯基吲哚(DAPI)染色后荧光显微镜观察细胞核固缩的凋亡过程,噻唑蓝(MTT)实验测定细胞增殖,实时定量聚合酶链反应(PCR)测定c-myc、c-fos、bax/bcl-2和caspase-9基因mRNA表达。结果制得咳尔康颗粒并建立HPLC质量控制标准,线性回归系数(r)为0.9929,平均加样回收率为98.03%,RSD为2.571%,指认成分黄芩苷含量为0.3498‰。咳尔康颗粒作用于肿瘤细胞A549后,细胞形态出现体积缩小,与周围的细胞脱离,核质浓缩,核膜破碎,最终形成凋亡小体;细胞增殖受到剂量依赖性抑制,半数抑制浓度(IC50)为74.07 g·L^(-1);原癌基因c-myc和c-fos的mRNA表达量降低,凋亡基因bax/bcl-2和caspase-9的mRNA表达量增加。结论咳尔康颗粒具有体外抗肿瘤作用。 展开更多
关键词 咳尔康颗粒 色谱法 高效液相 A549细胞系 抗肿瘤作用
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变应性鼻炎中细胞因子的研究进展
5
作者 颜睿 杜书迪 +2 位作者 李新颖 陈宏志 王乐秋 《牡丹江医学院学报》 2022年第6期149-151,146,共4页
变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)作为一种鼻黏膜慢性炎症,发病率高,发病机制复杂。现已知的发病机制主要为辅助性T细胞Th1/Th2细胞平衡紊乱所诱导产生各种细胞因子而导致鼻黏膜致敏。尚有研究报告称AR患者体内存在IL-9、IL-17、IL-33... 变应性鼻炎(allergic rhinitis,AR)作为一种鼻黏膜慢性炎症,发病率高,发病机制复杂。现已知的发病机制主要为辅助性T细胞Th1/Th2细胞平衡紊乱所诱导产生各种细胞因子而导致鼻黏膜致敏。尚有研究报告称AR患者体内存在IL-9、IL-17、IL-33等其他新型细胞因子,并可能存在IL-2、sIL-2R与IL-6的相关通路。本文将围绕上述细胞因子进行综述。 展开更多
关键词 变应性鼻炎 细胞因子 发病机制
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