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基于全局图注意力元路径异构网络的药物-疾病关联预测
1
作者
郁湧
杨雨洁
+2 位作者
李
虓
晗
高悦
于倩
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期576-583,共8页
提出了一个基于全局图注意力元路径异构网络模型(MHNGA)来进行药物-疾病关联预测。首先,收集整理药物和疾病数据,将已知的药物-疾病关联、药物相似性、疾病相似性构建为一个异构网络;其次,引入多个基于元路径的子图,使用图注意力神经网...
提出了一个基于全局图注意力元路径异构网络模型(MHNGA)来进行药物-疾病关联预测。首先,收集整理药物和疾病数据,将已知的药物-疾病关联、药物相似性、疾病相似性构建为一个异构网络;其次,引入多个基于元路径的子图,使用图注意力神经网络提取这些子图的邻居节点的特征,并且通过通道注意力和空间注意力机制来增强特征;最后,通过十折交叉验证的评估,MHNGA取得了93.5%的精确召回曲线下的面积和99.4%的准确率。
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关键词
异构图
药物-疾病关联
预测
图注意力神经网络
元路径
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职称材料
题名
基于全局图注意力元路径异构网络的药物-疾病关联预测
1
作者
郁湧
杨雨洁
李
虓
晗
高悦
于倩
机构
云南大学软件学院
云南省软件工程重点实验室
出处
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024年第4期576-583,共8页
基金
国家自然科学基金(62366058)
云南省科技厅面上项目(202001BB050063)
云南省软件工程重点实验室开放项目(2020SE315)。
文摘
提出了一个基于全局图注意力元路径异构网络模型(MHNGA)来进行药物-疾病关联预测。首先,收集整理药物和疾病数据,将已知的药物-疾病关联、药物相似性、疾病相似性构建为一个异构网络;其次,引入多个基于元路径的子图,使用图注意力神经网络提取这些子图的邻居节点的特征,并且通过通道注意力和空间注意力机制来增强特征;最后,通过十折交叉验证的评估,MHNGA取得了93.5%的精确召回曲线下的面积和99.4%的准确率。
关键词
异构图
药物-疾病关联
预测
图注意力神经网络
元路径
Keywords
heterogeneous graph
drug-disease association
prediction
graph attention neural network
meta-path
分类号
TP181 [自动化与计算机技术—控制理论与控制工程]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
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1
基于全局图注意力元路径异构网络的药物-疾病关联预测
郁湧
杨雨洁
李
虓
晗
高悦
于倩
《电子科技大学学报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
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