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题名基于高通量测序检测甜菜生尾孢中真菌病毒多样性
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作者
李盈曦
周梦轲
杨一舟
鲍方维
韩成贵
王颖
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机构
中国农业大学植物保护学院
中国农业大学生物学院
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出处
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期370-379,共10页
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基金
国家级大学生创新训练项目(202010019010)
财政部和农业农村部国家现代农业产业技术体系(CARS-170304)。
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文摘
为明确甜菜生尾孢Cercospora beticola中真菌病毒的多样性,2020年自新疆维吾尔自治区、内蒙古自治区、黑龙江省和北京市采集感染褐斑病甜菜病叶,鉴定获得78株甜菜生尾孢菌株,运用高通量的宏转录组测序技术检测甜菜生尾孢所携带的真菌病毒种类;将分离到的甜菜生尾孢按照菌落生长表型分为4组,进行宏转录组测序,将得到的序列经过拼接、聚类和基因功能注释,筛选出真菌病毒相关同源序列。序列分析结果显示,4组样品共比对到6个真菌病毒科,包括双分体病毒科Partitiviridae、双核糖核酸病毒科Birnaviridae、低毒病毒科Hypoviridae、裸露RNA病毒科Narnaviridae、泛欧尔密病毒科Botourmiaviridae和转座病毒科Metaviridae,以及未分科的负义单链RNA病毒。研究结果丰富了甜菜生尾孢真菌病毒资源库。
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关键词
甜菜生尾孢
高通量测序
真菌病毒
低毒病毒
双分体病毒
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Keywords
Cercospora beticola
high-throughput sequencing
mycovirus
Hypovirus
Partitivirus
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分类号
S435.663
[农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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