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油桐LACS4和LACS8基因克隆及其表达分析 被引量：7
1
作者 李捷宇 龙洪旭 +3 位作者 张琳 王哲 李泽 谭晓风 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第11期1982-1990,共9页
以油桐的近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序结果设计引物,采用RT-PCR技术克隆了油桐长链脂酰辅酶A合成酶基因家族的两个成员的全长cDNA序列,分别命名为VfLACS4(Gen Bank登录号:KP996689)和VfLACS8(Gen Bank登录号:KT362743),通过实... 以油桐的近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序结果设计引物,采用RT-PCR技术克隆了油桐长链脂酰辅酶A合成酶基因家族的两个成员的全长cDNA序列,分别命名为VfLACS4(Gen Bank登录号:KP996689)和VfLACS8(Gen Bank登录号:KT362743),通过实时定量PCR的方法检测了不同组织部位和种子不同发育时期该基因的表达水平,并采用索式提取法测定了种子发育时期的油脂含量。结果表明:VfLACS4的CDS长度为1 989 bp,编码662个氨基酸,与其他物种的LACS4氨基酸序列具有较高的相似性,其中与蓖麻的LACS4相似性最高;VfLACS8的CDS长度为2 199 bp,编码732个氨基酸,与麻疯树和蓖麻的LACS8具有较高的相似性;实时定量RT-PCR结果表明VfLACS4基因在花、茎、叶和根中均有少量表达,并在种子发育的10月10日表达量达到最大;VfLACS8基因在种子、花、茎、叶和根中均有一定量的表达,在雌蕊中的表达量最高;油桐种子发育过程中的油脂积累呈现出"S"型,Vf LACS8基因的在发育种子中的表达模式与之相一致,推测VfLACS8基因与种子发育过程中的油脂积累相关。 展开更多
关键词 油桐 LACS4 LACS8 基因克隆 基因表达
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油茶甘油二酯激酶基因(CoDGK3)的克隆与表达分析
2
作者 江南 张维利 +2 位作者 李捷宇 刘奇龙 刘敏 《食品与生物技术学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1090-1095,共6页
以油茶转录组数据为基础,采用RT-PCR和RACE技术,根据Unigene序列设计油茶甘油二酯激酶基因(Co DGK)RACE引物,分离克隆了DGK基因全长c DNA序列,命名为Co DGK3(Gene Bank登录号:KM068056),基因全长1 568 bp,开放阅读框1 455 bp,编码485个... 以油茶转录组数据为基础,采用RT-PCR和RACE技术,根据Unigene序列设计油茶甘油二酯激酶基因(Co DGK)RACE引物,分离克隆了DGK基因全长c DNA序列,命名为Co DGK3(Gene Bank登录号:KM068056),基因全长1 568 bp,开放阅读框1 455 bp,编码485个氨基酸;氨基酸同源比对及序列分析表明油茶与其它物种的DGK氨基酸序列具有较高的相似性,其中与麻风树和毛果杨相似性最高,达到78%;利用生物学软件对蛋白质进行生物信息学分析,获得其结构特点及理化性质;分析转录组数据中DGK相关的Unigene序列RTKM值和对Co DGK3基因实施实时荧光定量PCR,结果表明Co DGK3在油茶种子发育各时期表达量变化差异不大,并且发现转录组数据分析和实时荧光定量分析的结果变化规律一致,证明了转录组测序的有效性。 展开更多
关键词 油茶 甘油二酯激酶基因 克隆 生物信息学分析 基因表达
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油桐ALDH22A1和ALDH2C4基因克隆及其序列分析 被引量：2
3
作者 华园榕 龙洪旭 +3 位作者 刘美兰 吕佳斌 李捷宇 谭晓风 《经济林研究》 北大核心 2017年第3期35-43,共9页
为给油桐ALDH基因的结构与功能研究提供理论依据,以葡萄桐的近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序结果设计引物,采用RT-PCR技术克隆了油桐ALDH22A1基因和ALDH2C4基因的全长cDNA序列。ALDH22A1的cDNA序列全长1 782 bp,编码593个氨基酸,... 为给油桐ALDH基因的结构与功能研究提供理论依据,以葡萄桐的近成熟种子为材料,根据油桐转录组测序结果设计引物,采用RT-PCR技术克隆了油桐ALDH22A1基因和ALDH2C4基因的全长cDNA序列。ALDH22A1的cDNA序列全长1 782 bp,编码593个氨基酸,该基因编码蛋白质的相对分子质量为65.60 kDa,理论等电点为6.62,蛋白二级结构以α螺旋为主,具有1个明显的跨膜结构,是稳定的非分泌蛋白。ALDH2C4的cDNA序列全长1 506 bp,编码501个氨基酸,该基因编码蛋白质的相对分子质量为54.82 kDa,理论等电点为6.58,蛋白二级结构以α螺旋为主,是不具有跨膜结构的膜外蛋白。BLASTp分析结果表明,这2个基因所编码序列与麻疯树、蓖麻的乙醛脱氢酶一致性最高,高达80%以上,含有醛脱氢酶基因家族的保守结构域。 展开更多
关键词 油桐 ALDH CDNA克隆 序列分析
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