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5-氟尿嘧啶和5-氯尿嘧啶及其互变异构体的理论计算研究 被引量:15
1
作者 李宝 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2005年第16期1495-1499,共5页
采用HF/3-21G方法,对6种气相和水相中可能存在的5-氟尿嘧啶(和5-氯尿嘧啶)互变异构体进行了构象分析.采用B3LYP/6-311+G**方法对处于优势构象时的各互变异构体进行了几何全优化,并计算出它们的总能量、焓、熵、吉布斯自由能.Onsager反... 采用HF/3-21G方法,对6种气相和水相中可能存在的5-氟尿嘧啶(和5-氯尿嘧啶)互变异构体进行了构象分析.采用B3LYP/6-311+G**方法对处于优势构象时的各互变异构体进行了几何全优化,并计算出它们的总能量、焓、熵、吉布斯自由能.Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算.计算结果表明,5-氟尿嘧啶和5-氯尿嘧啶在气相中和水相中主要以双酮形式存在.5-氟尿嘧啶和5-氯尿嘧啶的熵效应小,对互变异构平衡没有显著的影响,而焓变对互变异构产生了主要的影响.讨论了水溶剂化作用对异构体的能量、电荷分布和偶极矩的影响.溶剂化自由能与异构体的气相偶极矩存在相关性.另外,详细地将5-氟尿嘧啶和5-氯尿嘧啶与尿嘧啶进行了对比,获得三者最稳定异构体间电子结构异同的有用信息. 展开更多
关键词 5-氟尿嘧啶 5-氯尿嘧啶 互变异构体 密度泛函理论方法 自洽反应场方法 偶极矩 计算研究 Onsager 溶剂化作用
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取代芳烃对呆鲦鱼急性毒性的QSAR研究 被引量:16
2
作者 顾云兰 陶建清 +1 位作者 费正皓 李宝 《环境科学与技术》 CAS CSCD 北大核心 2009年第4期24-27,共4页
应用密度泛函方法(DFT)在B3LYP/6-311G**水平上全优化计算25个取代芳烃的量子化学参数,结合疏水性参数与化合物对呆鲦鱼的急性毒性进行定量构效关系研究(QSAR)。经逐步回归筛选变量后,所建多元线性回归方程的相关系数R及去一法交互检验... 应用密度泛函方法(DFT)在B3LYP/6-311G**水平上全优化计算25个取代芳烃的量子化学参数,结合疏水性参数与化合物对呆鲦鱼的急性毒性进行定量构效关系研究(QSAR)。经逐步回归筛选变量后,所建多元线性回归方程的相关系数R及去一法交互检验复相关系数R2cv分别为0.967和0.907。用预测集样本进行了外部预测,所得外部预测样本复相关系数R2ext和外部预测集交互检验Q2ext分别为0.881和0.836。模型结果显示:分子疏水性参数logP较大时具有较大的脂溶性,化合物的毒性较大;取代基的吸电子能力越强,苯环的正电性越大,化合物的毒性越大。 展开更多
关键词 取代芳烃 急性毒性 密度泛函方法 B3LYP/6-311G**
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脂肪胺、醇HOMO能级与质子亲和能关系 被引量:13
3
作者 李宝 《分子科学学报》 CAS CSCD 2002年第2期122-124,共3页
关键词 脂肪胺 脂肪醇 HOMO能级 最高占据分子轨轨道 质子亲和能 量子化学计算
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2-巯基苯并咪唑及其类似物互变异构的理论研究 被引量:13
4
作者 国永敏 李宝 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2007年第16期1561-1567,共7页
采用B3LYP/6-311G**方法,计算了2-巯基苯并咪唑及其类似物(2-巯基苯并噁唑、2-巯基苯并噻唑、2-羟基苯并咪唑、2-羟基苯并噁唑、2-羟基苯并噻唑以及2-巯基咪唑、2-巯基噁唑、2-巯基噻唑、2-羟基咪唑、2-羟基噁唑、2-羟基噻唑)的(硫)醇式... 采用B3LYP/6-311G**方法,计算了2-巯基苯并咪唑及其类似物(2-巯基苯并噁唑、2-巯基苯并噻唑、2-羟基苯并咪唑、2-羟基苯并噁唑、2-羟基苯并噻唑以及2-巯基咪唑、2-巯基噁唑、2-巯基噻唑、2-羟基咪唑、2-羟基噁唑、2-羟基噻唑)的(硫)醇式与(硫)酮式结构进行质子迁移的3种可能途径:(a)分子内质子迁移;(b)水助质子迁移;(c)甲醇助质子迁移.结果表明,途经b和c所需要的活化能较小,氢键在降低反应活化能方面起重要作用.采用PCM方法研究了反应体系的溶剂化效应.结果表明孤立分子、一水合物和一甲醇合物的最稳定异构体相同,都为(硫)酮式,与气相结论一致.溶剂化效应对异构化能垒的影响较小. 展开更多
关键词 2-巯基苯并咪唑 2-巯基咪唑 互变异构 密度泛函理论方法 自洽反应场
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可乐定分子构象异构和互变异构的理论研究 被引量:16
5
作者 李宝 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第4期278-282,共5页
采用HF/6-31G*方法,对氨基型和亚胺型可乐定中性分子以及质子化的可乐定分子进行了构象分析.之后采用B3LYP/6-31G**方法对处于势能面上的能量极小构象异构体进行全自由度几何优化和频率分析.Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算.结果表... 采用HF/6-31G*方法,对氨基型和亚胺型可乐定中性分子以及质子化的可乐定分子进行了构象分析.之后采用B3LYP/6-31G**方法对处于势能面上的能量极小构象异构体进行全自由度几何优化和频率分析.Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算.结果表明,在气相和水相中可乐定中性分子主要以亚胺型存在,这同已有实验结果一致.进一步,寻找构象异构化过渡态和氨基型亚胺型互变异构化过渡态,探讨质子化和水溶剂化效应对异构化过程的几何结构和能量的影响.为了考察氯苯的共轭效应对可乐定互变异构体稳定性的影响,在B3LYP/6-31G**水平上,研究了2-氨基-2-咪唑啉的互变异构化反应机理. 展开更多
关键词 可乐定 互变异构 构象异构 密度泛函理论方法 白洽反应场方法
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苯甲酸衍生物对兔子主动脉造粒系统的QSAR研究 被引量:15
6
作者 刘天宝 彭艳芬 李宝 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第4期533-535,共3页
应用分子力学方法MM+和半经验量子化学PM3法得到了32种苯甲酸衍生物的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构、几何结构和拓扑结构参数,并将这些参数与苯甲酸衍生物在兔子主动脉造粒系统中的生理活性的大小相关联。结... 应用分子力学方法MM+和半经验量子化学PM3法得到了32种苯甲酸衍生物的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构、几何结构和拓扑结构参数,并将这些参数与苯甲酸衍生物在兔子主动脉造粒系统中的生理活性的大小相关联。结果表明:苯甲酸衍生物在兔子主动脉造粒系统中的生理活性大小与改进的分子连接性指数1J、第20号碳原子电荷Q和分子激化率P的关系密切。一下建立了32种苯甲酸衍生物的构效关系式。 展开更多
关键词 苯甲酸衍生物 PM3 分子激化率 QSAR
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2-硫代黄嘌呤互变异构体的密度泛函理论计算 被引量:13
7
作者 李宝 《物理化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第12期1455-1458,共4页
在密度泛函B3LYP/6-311G水平上,对14种气相和水相中可能存在的2-硫代黄嘌呤互变异构体进行了几何构型全自由度优化,并计算出它们的总能量、焓、熵、吉布斯自由能.Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算.计算结果表明,2-硫代黄嘌呤在气相... 在密度泛函B3LYP/6-311G水平上,对14种气相和水相中可能存在的2-硫代黄嘌呤互变异构体进行了几何构型全自由度优化,并计算出它们的总能量、焓、熵、吉布斯自由能.Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算.计算结果表明,2-硫代黄嘌呤在气相和水相中主要以酮式结构形式存在,与已有实验结果一致.在气相和水相中,酮式结构—N(7)(H)均比酮式结构—N(9)(H)更稳定.2-硫代黄嘌呤互变异构的熵效应小,对互变异构平衡没有显著的影响,而焓变对互变异构却产生了主要的影响.水溶剂化自由能与异构体的气相偶极矩存在相关性.另外,较详细地考察了2-硫代黄嘌呤与6-硫代黄嘌呤的相对稳定性. 展开更多
关键词 2-硫代黄嘌呤 异构体 密度泛函理论 自洽反应场方法 偶极矩
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1,1-二苯基乙烯衍生物抗雌激素活性与结构相关性研究 被引量:12
8
作者 李宝 顾云兰 +1 位作者 国永敏 马桂林 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2003年第3期261-263,共3页
应用半经验量子化学AM1法得到了19种1,1-二苯基乙烯衍生物的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构、几何结构和拓扑结构参数,并将这些参数与1,1-二苯基乙烯衍生物的抗雌激素活性相关联。结果表明:1,1-二苯基乙烯衍生... 应用半经验量子化学AM1法得到了19种1,1-二苯基乙烯衍生物的优势构象,利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构、几何结构和拓扑结构参数,并将这些参数与1,1-二苯基乙烯衍生物的抗雌激素活性相关联。结果表明:1,1-二苯基乙烯衍生物的抗雌激素活性与扩展的引力指数、17号氢原子的净电荷及24号氧原子和17号氢原子之间库仑力的相关性较好,成功地建立了19种1,1-二苯基乙烯衍生物的构效关系式。 展开更多
关键词 1 1-二苯基乙烯衍生物 抗雌激素活性 结构 QSAR 相关性 抗雌激素药物 乳腺癌
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4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD 的抑制活性与结构关系研究 被引量:12
9
作者 顾云兰 国永敏 +1 位作者 李宝 马桂林 《计算机与应用化学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期845-848,共4页
应用分子力学方法MM_+和半经验量子化学AM1法得到了17种4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物的优势构象,再利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性回归分析和人工神经网络误差反传算法(BP),将这些... 应用分子力学方法MM_+和半经验量子化学AM1法得到了17种4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物的优势构象,再利用量子化学算法和分子图形学技术获得电子结构参数和几何结构参数,采用多元线性回归分析和人工神经网络误差反传算法(BP),将这些参数和4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3β-羟类固醇脱氢酶(3BHSD)的抑制活性相关联。结果表明,4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物对3BHSD 的抑制活性大小和分子范德华体积(V)、分子最高占用轨道能(E_(HOMO))及9号碳原子的净电荷(Q)的相关性较好,成功地建立了17种4-X-N-Y-6-氮杂雄4-烯-3-酮衍生物的构效关系式。HOMO 轨道组成分析表明,A 环上的4号、5号碳原子和羰基氧原子(O_(18))及B 环上的7号、8号碳原子和6号氮原子可能是与受体作用时的活性位点。 展开更多
关键词 4-X-N-Y-6-氮杂雄-4-烯-3-酮衍生物 AMl 分子范德华体积 分子最高占用轨道能 定量构效关系
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有机气体麻醉活性的构效关系研究 被引量:8
10
作者 彭艳芬 刘天宝 李宝 《山东大学学报(理学版)》 CAS CSCD 北大核心 2006年第5期148-150,共3页
应用量子化学HF/6-31G**从头算法得到了18种有机气体的优势构象,在此基础上结合分子图形学技术,获得相应优化构象的电子结构参数和几何结构参数,并将这些参数与有机气体的麻醉活性参数相关联.结果表明:有机气体的麻醉活性与分子范德华... 应用量子化学HF/6-31G**从头算法得到了18种有机气体的优势构象,在此基础上结合分子图形学技术,获得相应优化构象的电子结构参数和几何结构参数,并将这些参数与有机气体的麻醉活性参数相关联.结果表明:有机气体的麻醉活性与分子范德华体积、辛醇/水分配系数和分子最高占用轨道能的相关性较好,成功地建立了18种有机气体的构效关系式. 展开更多
关键词 有机气体 从头算 QSAR 麻醉活性
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6-巯基嘌呤互变异构体的密度泛函理论计算 被引量:8
11
作者 李宝 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2004年第11期1075-1079,M006,共6页
在密度泛函B3LYP/6 3 11G 水平下 ,对 8种气相和水相中可能存在的 6 巯基嘌呤异构体进行了几何构型的全自由度优化 ,并计算出它们的总能量、焓、熵、吉布斯自由能 .Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算 .计算结果表明 ,6 巯基嘌呤在... 在密度泛函B3LYP/6 3 11G 水平下 ,对 8种气相和水相中可能存在的 6 巯基嘌呤异构体进行了几何构型的全自由度优化 ,并计算出它们的总能量、焓、熵、吉布斯自由能 .Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算 .计算结果表明 ,6 巯基嘌呤在气相和水相中主要以硫酮形式存在 .在气相中 ,硫酮 N( 7) (H)要比硫酮 N( 9) (H)更稳定 ,而在水相中 ,则硫酮 N( 9)(H)要比硫酮 N( 7) (H)更稳定 .计算结果同已有实验结果一致 .6 巯基嘌呤的熵效应小 ,对互变异构平衡几乎没有显著的影响 ,而焓变对互变异构产生了主要的影响 .较详细地讨论了水溶剂化作用对异构体的能量、几何结构、电荷分布和偶极矩的影响 。 展开更多
关键词 6-巯基嘌呤 互变异构体 密度泛函理论 几何构型 水溶剂化作用 自洽反应场方法 偶极矩
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单酮类有机物气相色谱保留值与结构参数的相关性 被引量:7
12
作者 李宝 《分子科学学报》 CAS CSCD 2004年第3期56-59,共4页
 应用半经验量子化学AM1方法和分子图形学技术获得了42种单酮类有机物分子的电子结构和几何结构参数,并将这些参数与它们在非极性固定相(SE-30柱)上的气相色谱保留值相关联,采用逐步回归分析方法,成功地建立了拟合度高、物理意义明确...  应用半经验量子化学AM1方法和分子图形学技术获得了42种单酮类有机物分子的电子结构和几何结构参数,并将这些参数与它们在非极性固定相(SE-30柱)上的气相色谱保留值相关联,采用逐步回归分析方法,成功地建立了拟合度高、物理意义明确、预测能力强的气相色谱保留值-结构参数定量关系方程,找出了影响气相色谱保留值的主要结构因素. 展开更多
关键词 单酮类有机物 气相色谱保留值 结构参数 相关性 半经验量子化学 分子图形学
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AlPO_4-5分子筛模板剂的量子化学计算 被引量:7
13
作者 李宝 国永敏 庞文琴 《高等学校化学学报》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2002年第4期636-639,共4页
以23种有机分子作为模板剂用于AlPO4-5分子筛的合成,利用分子图形技术研究这些有机分子的形状和尺寸,采用量子化学PM3方法研究这些有机分子的电子性质,计算它们与AlPO4-5分子筛骨架模型簇之间的相互作用能.结果表明... 以23种有机分子作为模板剂用于AlPO4-5分子筛的合成,利用分子图形技术研究这些有机分子的形状和尺寸,采用量子化学PM3方法研究这些有机分子的电子性质,计算它们与AlPO4-5分子筛骨架模型簇之间的相互作用能.结果表明,量子化学计算数据可以作为寻找合成AlPO4-5分子筛新型模板剂时的重要参考依据. 展开更多
关键词 量子化学 AlPO4-5分子筛 有机分子模板剂 电子性质 分子间相互作用 合成
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金属卤化物拓扑指数与理化性质的相关性 被引量:7
14
作者 顾云兰 汪玉静 李宝 《徐州建筑职业技术学院学报》 2004年第1期28-31,共4页
在Randic分子价连接性拓扑指数的基础上 ,构建了无机分子的连接性指数 (mT ,其具有优异的结构选择性 ,其中 0 ,1阶指数0 T、1T与碱金属卤化物的晶格能、碱土金属卤化物的晶格能和卤化锡的化学位移呈高度的线性相关性 ,1阶指数的幂函数 (... 在Randic分子价连接性拓扑指数的基础上 ,构建了无机分子的连接性指数 (mT ,其具有优异的结构选择性 ,其中 0 ,1阶指数0 T、1T与碱金属卤化物的晶格能、碱土金属卤化物的晶格能和卤化锡的化学位移呈高度的线性相关性 ,1阶指数的幂函数 (1T)与碱金属卤化物的F心能带、熔点和磁化率呈高度的相关性 ,拟合回归方程的相关性基本优于已报道的研究结果 ,预测结果与文献数据基本吻合 . 展开更多
关键词 金属卤化物 拓扑指数 拟合回归方程 相关性 理化性质
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有机物对蝴蝶幼虫麻醉活性与结构参数的关系 被引量:7
15
作者 李宝 《分子科学学报》 CAS CSCD 2004年第1期60-62,共3页
 应用量子化学HF/3-21G从头算法得到了20种有机分子的优势构象,利用HF/3-21G和分子图形学技术获得其电子结构参数和几何结构参数,并将这些参数与有机物对蝴蝶幼虫的麻醉活性相关联.结果表明,有机物麻醉活性与分子的范德华体积、分子最...  应用量子化学HF/3-21G从头算法得到了20种有机分子的优势构象,利用HF/3-21G和分子图形学技术获得其电子结构参数和几何结构参数,并将这些参数与有机物对蝴蝶幼虫的麻醉活性相关联.结果表明,有机物麻醉活性与分子的范德华体积、分子最低空轨道能和分子偶极矩之间存在良好的多元线性相关性,成功地建立有机物对蝴蝶幼虫麻醉活性的构效关系式. 展开更多
关键词 有机物 麻醉活性 蝴蝶幼虫 从头算 定量构效关系
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直链饱和一元醇物理性质递变规律研究 被引量:7
16
作者 李宝 李艳荣 国永敏 《化学研究》 CAS 2001年第2期30-32,共3页
以直链饱和一元醇同系物结构重复单元数值连续变化为模型假定 ,获得了描述直链饱和一元醇同系物物理性质递变规律的数学表达式 :P =(a0 +a1n) / (1+b1n) ,其中a0 ,a1,b1均为常数 ,n为结构重复单元数值 ,P为直链饱和一元醇同系物的物理性... 以直链饱和一元醇同系物结构重复单元数值连续变化为模型假定 ,获得了描述直链饱和一元醇同系物物理性质递变规律的数学表达式 :P =(a0 +a1n) / (1+b1n) ,其中a0 ,a1,b1均为常数 ,n为结构重复单元数值 ,P为直链饱和一元醇同系物的物理性质 .通过非线性回归分析 ,得到回归方程 ,结果表明直链饱和一元醇同系物的物理性质与重复单元数值之间满足上述关系式 。 展开更多
关键词 直链饱和一元醇 物理性质 定量构效关系 同系物 递变规律
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5-氟胞嘧啶互变异构的密度泛函理论计算 被引量:6
17
作者 李宝 《化学学报》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第13期1299-1303,共5页
采用BH-HLYP/6-311+G**方法对10种气相和水相中可能存在的5-氟胞嘧啶互变异构体进行了几何全优化,并计算出它们的总能量和吉布斯自由能.Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算.计算结果表明,5-氟胞嘧啶在气相中主要以烯醇式-氨基式形式存... 采用BH-HLYP/6-311+G**方法对10种气相和水相中可能存在的5-氟胞嘧啶互变异构体进行了几何全优化,并计算出它们的总能量和吉布斯自由能.Onsager反应场溶剂模型用于水相的计算.计算结果表明,5-氟胞嘧啶在气相中主要以烯醇式-氨基式形式存在,在水相中主要以酮式-氨基式形式存在.溶剂化自由能与异构体的气相偶极矩存在相关性.进一步求得互变异构化以及构象异构化和顺反异构化的过渡态,探讨异构化过程中的几何结构和能量的变化. 展开更多
关键词 5-氟胞嘧啶 互变异构 密度泛函理论方法 自洽反应场方法 过渡态
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三苯基丙烯腈衍生物的定量结构-活性关系研究 被引量:4
18
作者 顾云兰 国永敏 +1 位作者 李宝 马桂林 《分子科学学报》 CAS CSCD 2003年第3期155-158,共4页
 应用半经验量子化学AM1方法得到了24种三苯基丙烯腈衍生物的优势构象,利用AM1方法和分子图形学技术获得其电子结构、几何结构及拓扑结构参数,并将这些参数与三苯基丙烯腈衍生物对乳腺癌细胞(MCF-7)的生物活性相关联.结果表明,三苯基...  应用半经验量子化学AM1方法得到了24种三苯基丙烯腈衍生物的优势构象,利用AM1方法和分子图形学技术获得其电子结构、几何结构及拓扑结构参数,并将这些参数与三苯基丙烯腈衍生物对乳腺癌细胞(MCF-7)的生物活性相关联.结果表明,三苯基丙烯腈衍生物对MCF-7的活性与羟基指示数、分子表面积和B环上原子净电荷之和之间存在良好的多元线性相关性,成功地建立了三苯基丙烯腈衍生物的构效关系式. 展开更多
关键词 三苯基丙烯腈衍生物 定量构效关系 羟基指标 分子表面积 药物研究 乳腺癌 生物活性
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甲醛与乙腈相互作用的理论研究 被引量:5
19
作者 李宝 《Chinese Journal of Chemical Physics》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2003年第5期375-378,共4页
在HF/ 6 311G(d ,p)、MP2 / 6 311G(d ,p)和B3LYP/ 6 311G(d ,p)水平上 ,对H2 CO和CH3 CN以及设计的 4种结构H2 CO…CH3 CN复合物等进行几何全优化和振动频率计算 ,排除振动频率为负值的非局域极小点结构 ,并对稳定的环状构型复合物... 在HF/ 6 311G(d ,p)、MP2 / 6 311G(d ,p)和B3LYP/ 6 311G(d ,p)水平上 ,对H2 CO和CH3 CN以及设计的 4种结构H2 CO…CH3 CN复合物等进行几何全优化和振动频率计算 ,排除振动频率为负值的非局域极小点结构 ,并对稳定的环状构型复合物结合能进行基组重叠误差校正和零点振动能校正 .分子间相互作用的能量分解分析显示 ,静电能在H2 CO…CH3 CN相互作用能量中占主导地位 ,电荷转移能居第二位 . 展开更多
关键词 甲醛 乙腈 相互作用 从头算 密度泛函
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脂肪胺的脂水分配系数与结构参数的关系 被引量:5
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作者 李宝 《化学研究》 CAS 2003年第4期57-59,共3页
研究了脂肪胺的脂水分配系数实验值与半经验量子化学计算获得的理论计算参数值间的相关关系,结果表明:实验测定值与分子范德华体积及碳氮键长之间有良好的多元线性关系.
关键词 脂肪胺 脂水分配系数 结构参数 量子化学计算 分子范德华体积 碳氮键
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