目的探讨敲低YTH结构域N^6甲基腺嘌呤(m^6A)RNA结合蛋白2(YTHDF2)对人宫颈癌细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法利用人蛋白图谱(Human Protein Atlas)数据库分析YTHDF2在宫颈癌中表达及与生存时间的关系。收集宫颈癌和正常宫颈组织各31例...目的探讨敲低YTH结构域N^6甲基腺嘌呤(m^6A)RNA结合蛋白2(YTHDF2)对人宫颈癌细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法利用人蛋白图谱(Human Protein Atlas)数据库分析YTHDF2在宫颈癌中表达及与生存时间的关系。收集宫颈癌和正常宫颈组织各31例,采用免疫组织化学法检测YTHDF2的蛋白表达差异;利用敲低YTHDF2的短发夹RNA(shRNA)及空载质粒包装慢病毒,并感染至宫颈癌HeLa细胞和SiHa细胞,实时荧光定量PCR及Western blot法检测YTHDF2的mRNA及蛋白水平,敲低YTHDF2后,采用CCK-8法检测细胞增殖活性,集落形成实验检测细胞集落形成能力;流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡情况。结果检测数据库发现YTHDF2在宫颈癌中表达越高生存时间越短,与正常宫颈组织相比,YTHDF2在宫颈癌组织高表达。敲低YTHDF2后,抑制宫颈癌细胞增殖,促进细胞凋亡,使细胞阻滞于S期。结论YTHDF2在宫颈癌组织中高表达,敲低后抑制宫颈癌细胞增殖并促进其凋亡。展开更多
【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20,HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中H...【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20,HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中HSP20家族成员并进行相关分析。【结果】在烟草中鉴定得到了58个HSP20家族基因,进化分析将其划分为13个亚家族,分布在13条染色体上;共线性分析表明烟草中有5对基因存在染色体片段复制;顺式作用元件分析表明NtHSP20成员上游存在生长发育、胁迫响应等多种顺式作用元件;HSP20家族基因具有显著的组织特异表达性,在根、茎中基因表达数量和表达水平较明显,在花中的表达数量和表达水平较低;qRT-PCR分析表明NtHSP20家族部分成员对干旱胁迫具有特异性响应,且在不同的胁迫阶段不同基因表达量有显著差异。【结论】该研究为后续烟草HSP20家族生长发育和抗逆胁迫等机理研究奠定了基础。展开更多
文摘目的探讨敲低YTH结构域N^6甲基腺嘌呤(m^6A)RNA结合蛋白2(YTHDF2)对人宫颈癌细胞增殖、周期和凋亡的影响。方法利用人蛋白图谱(Human Protein Atlas)数据库分析YTHDF2在宫颈癌中表达及与生存时间的关系。收集宫颈癌和正常宫颈组织各31例,采用免疫组织化学法检测YTHDF2的蛋白表达差异;利用敲低YTHDF2的短发夹RNA(shRNA)及空载质粒包装慢病毒,并感染至宫颈癌HeLa细胞和SiHa细胞,实时荧光定量PCR及Western blot法检测YTHDF2的mRNA及蛋白水平,敲低YTHDF2后,采用CCK-8法检测细胞增殖活性,集落形成实验检测细胞集落形成能力;流式细胞术检测细胞周期和细胞凋亡情况。结果检测数据库发现YTHDF2在宫颈癌中表达越高生存时间越短,与正常宫颈组织相比,YTHDF2在宫颈癌组织高表达。敲低YTHDF2后,抑制宫颈癌细胞增殖,促进细胞凋亡,使细胞阻滞于S期。结论YTHDF2在宫颈癌组织中高表达,敲低后抑制宫颈癌细胞增殖并促进其凋亡。
文摘【背景和目的】热休克蛋白20(Heat Shock Protein 20,HSP20)是一个重要的蛋白质家族,在植物生长发育及抗逆胁迫中发挥重要作用,目前HSP20基因在烟草中还未有广泛的研究。【方法】通过茄科数据库,利用生物信息学分析手段,确定普通烟草中HSP20家族成员并进行相关分析。【结果】在烟草中鉴定得到了58个HSP20家族基因,进化分析将其划分为13个亚家族,分布在13条染色体上;共线性分析表明烟草中有5对基因存在染色体片段复制;顺式作用元件分析表明NtHSP20成员上游存在生长发育、胁迫响应等多种顺式作用元件;HSP20家族基因具有显著的组织特异表达性,在根、茎中基因表达数量和表达水平较明显,在花中的表达数量和表达水平较低;qRT-PCR分析表明NtHSP20家族部分成员对干旱胁迫具有特异性响应,且在不同的胁迫阶段不同基因表达量有显著差异。【结论】该研究为后续烟草HSP20家族生长发育和抗逆胁迫等机理研究奠定了基础。
