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深圳地区结核临床分离菌基因突变与耐药的关系 被引量：8
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作者 陈建波 刘映霞 +7 位作者 罗燕芬 李劭源 刘厚明 单万水 邓群益 陆坚 曹开源 曾谷城 《热带医学杂志》 CAS 2013年第8期939-943,共5页
目的研究深圳地区结核分枝杆菌临床分离株的基因突变与利福平(RFP)、异烟肼(INH)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)耐药之间的关系。方法采用反向斑点杂交技术(RDBHA)对182株结核分枝杆菌临床分离株的rpoB、katG、inhA、rpsL和embB基因突变... 目的研究深圳地区结核分枝杆菌临床分离株的基因突变与利福平(RFP)、异烟肼(INH)、链霉素(SM)和乙胺丁醇(EMB)耐药之间的关系。方法采用反向斑点杂交技术(RDBHA)对182株结核分枝杆菌临床分离株的rpoB、katG、inhA、rpsL和embB基因突变位点进行检测,并采用L-J比例法检测这些分离株对RFP、INH、SM、EMB的耐药性。结果 182株临床分离株中,总的基因突变率为34.62%(63/182),其中rpoB基因突变率最高,达24.17%(44/182)。多重耐药结核菌(MDR-TB)占17.03%(31/182)。以L-J比例法作为金标准,采用RDBHA技术检测分别与RFP、INH、SM、EMB耐药相关的rpoB、katG/inhA、rpsL、embB基因突变,其灵敏度分别为88.89%、67.50%、81.82%和64.29%,特异度分别为97.08%、94.37%、97.99%和92.86%。结论深圳地区结核分离株ropB基因突变最普遍,S531L位点是其突变率最高的位点。深圳地区结核分枝杆菌对4个一线抗痨药物耐药现象均较严重,反向斑点杂交技术(RDBHA)可快速检测结核分枝杆菌耐药基因突变,能给临床提供快速用药指导。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐药 基因突变
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高通量测序筛选结核分枝杆菌耐药株差异基因 被引量：3
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作者 李劭源 张国良 +4 位作者 文玉欣 毛冬婷 曹开源 陈心春 曾谷城 《热带医学杂志》 CAS 2014年第5期547-550,共4页
目的比较结核分枝杆菌中敏感株、多耐药株、广泛耐药株三者间基因表达的差异,为进一步针对耐药菌株的研究提供方向。方法从深圳市第三人民医院收集敏感株、多耐药株、广泛耐药株各1株,提取菌株RNA,然后构建cDNA文库,使用Genome Analyzer... 目的比较结核分枝杆菌中敏感株、多耐药株、广泛耐药株三者间基因表达的差异,为进一步针对耐药菌株的研究提供方向。方法从深圳市第三人民医院收集敏感株、多耐药株、广泛耐药株各1株,提取菌株RNA,然后构建cDNA文库,使用Genome Analyzer IIx高通量测序仪进行全基因组测序,经过筛选比对后得到测序结果 ,再比较3个菌株间的基因表达差异。结果高通量测序后共得到基因3 968个。将耐药株与敏感株的基因进行比较,选取表达差异高于10倍的基因,筛选得到多耐药株差异基因16个、广泛耐药株差异基因10个。这些表达差异基因大部分与毒素-抗毒素系统、PE/PPE家族蛋白、金属转运蛋白相关。还在多耐药株中发现了一系列高表达的前噬菌体基因及噬菌体整合相关的基因。结论通过高通量测序筛选得到一系列耐药株差异表达基因,为未来对耐药菌株的研究提供依据。 展开更多
关键词 结核分枝杆菌 耐药株 高通量测序
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