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龙眼胚性愈伤组织DlHOS1基因克隆与表达分析
被引量：
1
1
作者
肖小娥
徐小萍
+4 位作者
李佳
蜜
张梓浩
赖瑞联
林玉玲
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2018年第2期293-299,共7页
以龙眼胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE-PCR技术对植物抗寒重要调控因子HOS1(DlHOS1)进行克隆,并进行密码子使用偏爱性、生物信息学和低温胁迫下表达等方面的分析。结果表明:DlHOS1基因序列全长3 577 bp,包含ORF 3 000 bp,编码999...
以龙眼胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE-PCR技术对植物抗寒重要调控因子HOS1(DlHOS1)进行克隆,并进行密码子使用偏爱性、生物信息学和低温胁迫下表达等方面的分析。结果表明:DlHOS1基因序列全长3 577 bp,包含ORF 3 000 bp,编码999个氨基酸,5’UTR和3’UTR分别162 bp和415 bp(GenBank登录号:KY990404);密码子使用偏爱性分析表明,DlHOS1密码子的选择偏爱性较弱,偏爱以A/T结尾;生物信息学分析结果表明,DlHOS1编码的蛋白属于不稳定的疏水性跨膜蛋白,不含信号肽,定位于细胞质和细胞核,二级结构富含α螺旋,与柑橘的亲缘关系较近;qPCR结果发现,DlHOS1能够响应低温胁迫诱导,总体上低温下其表达水平上升。研究结果认为,DlHOS1参与龙眼抗寒和低温胁迫过程。
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关键词
龙眼
DlHOS1
基因克隆
密码子使用偏爱性
qPCR
下载PDF
职称材料
龙眼DlICE1基因克隆及低温胁迫表达分析
2
作者
霍雯
李佳
蜜
+5 位作者
徐小萍
赖瑞联
陈晓慧
林玉玲
陈裕坤
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2020年第5期964-970,共7页
本研究以龙眼胚性愈伤组织为材料,根据龙眼转录组数据库,采用RACE-PCR和RT-PCR技术获取龙眼DlICE1cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析与低温胁迫下表达分析。结果表明,龙眼DlICE1 cDNA全长为2327 bp,其中开放式阅读框(ORF)序列长161...
本研究以龙眼胚性愈伤组织为材料,根据龙眼转录组数据库,采用RACE-PCR和RT-PCR技术获取龙眼DlICE1cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析与低温胁迫下表达分析。结果表明,龙眼DlICE1 cDNA全长为2327 bp,其中开放式阅读框(ORF)序列长1614bp,共编码537个氨基酸。生物信息学分析表明,龙眼DlICE1编码的蛋白质属于不稳定的弱酸性蛋白,不具有典型的信号肽,且不属于分泌蛋白;亚细胞定位表明其位于细胞核内,与甜橙的同源蛋白亲缘关系最近;实时荧光定量PCR表明,龙眼DlICE1能够有效响应低温胁迫,低温诱导其表达量提高。研究结果显示,龙眼DlICE1基因参与龙眼胚性愈伤组织抗寒过程。
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关键词
龙眼
胚性愈伤组织
DlICE1基因
基因克隆
实时荧光定量PCR
下载PDF
职称材料
题名
龙眼胚性愈伤组织DlHOS1基因克隆与表达分析
被引量：
1
1
作者
肖小娥
徐小萍
李佳
蜜
张梓浩
赖瑞联
林玉玲
赖钟雄
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
福建省农业科学院果树研究所
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2018年第2期293-299,共7页
基金
国家自然科学基金(No.31572088
No.31672127)
福建省重大科技专项(No.2015NZ0002-1)
文摘
以龙眼胚性愈伤组织为材料,采用RT-PCR和RACE-PCR技术对植物抗寒重要调控因子HOS1(DlHOS1)进行克隆,并进行密码子使用偏爱性、生物信息学和低温胁迫下表达等方面的分析。结果表明:DlHOS1基因序列全长3 577 bp,包含ORF 3 000 bp,编码999个氨基酸,5’UTR和3’UTR分别162 bp和415 bp(GenBank登录号:KY990404);密码子使用偏爱性分析表明,DlHOS1密码子的选择偏爱性较弱,偏爱以A/T结尾;生物信息学分析结果表明,DlHOS1编码的蛋白属于不稳定的疏水性跨膜蛋白,不含信号肽,定位于细胞质和细胞核,二级结构富含α螺旋,与柑橘的亲缘关系较近;qPCR结果发现,DlHOS1能够响应低温胁迫诱导,总体上低温下其表达水平上升。研究结果认为,DlHOS1参与龙眼抗寒和低温胁迫过程。
关键词
龙眼
DlHOS1
基因克隆
密码子使用偏爱性
qPCR
Keywords
Dimocarpus longan Lour., DIHOS1
gene cloning
codon bias
Real-time fluorescent quantitative PCR
分类号
S667.2 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
龙眼DlICE1基因克隆及低温胁迫表达分析
2
作者
霍雯
李佳
蜜
徐小萍
赖瑞联
陈晓慧
林玉玲
陈裕坤
赖钟雄
机构
福建农林大学园艺植物生物工程研究所
出处
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2020年第5期964-970,共7页
基金
国家自然科学基金(No.31572088)
福建省高原学科建设项目(No.102/71201801101),福建农林大学科技创新基金(No.CXZX2017189,No.CXZX2018076)。
文摘
本研究以龙眼胚性愈伤组织为材料,根据龙眼转录组数据库,采用RACE-PCR和RT-PCR技术获取龙眼DlICE1cDNA全长序列,并对其进行生物信息学分析与低温胁迫下表达分析。结果表明,龙眼DlICE1 cDNA全长为2327 bp,其中开放式阅读框(ORF)序列长1614bp,共编码537个氨基酸。生物信息学分析表明,龙眼DlICE1编码的蛋白质属于不稳定的弱酸性蛋白,不具有典型的信号肽,且不属于分泌蛋白;亚细胞定位表明其位于细胞核内,与甜橙的同源蛋白亲缘关系最近;实时荧光定量PCR表明,龙眼DlICE1能够有效响应低温胁迫,低温诱导其表达量提高。研究结果显示,龙眼DlICE1基因参与龙眼胚性愈伤组织抗寒过程。
关键词
龙眼
胚性愈伤组织
DlICE1基因
基因克隆
实时荧光定量PCR
Keywords
Dimocarpus longan Lour.
embryogenic callus
DlICE1 gene
gene cloning
real-time fluorescent quantitative PCR
分类号
S667.2 [农业科学—果树学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
龙眼胚性愈伤组织DlHOS1基因克隆与表达分析
肖小娥
徐小萍
李佳
蜜
张梓浩
赖瑞联
林玉玲
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2018
1
下载PDF
职称材料
2
龙眼DlICE1基因克隆及低温胁迫表达分析
霍雯
李佳
蜜
徐小萍
赖瑞联
陈晓慧
林玉玲
陈裕坤
赖钟雄
《热带作物学报》
CSCD
北大核心
2020
0
下载PDF
职称材料
已选择
0
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导出题录
引用分析
参考文献
引证文献
统计分析
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