目的:采用网络药理学方法对菟丝子主要活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、多靶点、靶点相关信号通路及生物学过程的相互关系。方法:首先借助中药系统药理学分析平台(Chinese medicine system pharmacology analysis platform,TCM...目的:采用网络药理学方法对菟丝子主要活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、多靶点、靶点相关信号通路及生物学过程的相互关系。方法:首先借助中药系统药理学分析平台(Chinese medicine system pharmacology analysis platform,TCMSP)筛选出菟丝子中的活性成分及相关作用靶点,然后通过Uniprot数据库对提取靶点进行筛选与转化,并利用CTD网络在线分析平台获取与靶点相关的疾病,利用Cytoscape 3.6.1及其插件ClueGO构建“活性成分-靶点”“靶点-疾病”“靶点-生物学通路”网络图,最后利用Cytoscape 3.6.1中的Network Analyzer插件分析网络图,获取相关拓扑异构信息,建立菟丝子成分-靶点-通路网络模型。结果:筛选得到菟丝子8个活性成分,涉及靶点118个,靶点相关疾病516种;对所得靶点进行GO分析,再经Kappa算法聚类,共获得79类相关生物学过程和57类信号相关信号通路。结论:初步探讨菟丝子主要活性成分的作用机制,为深入研究菟丝子的药效作用及其机制提供参考。展开更多
目的:以甘草黄酮类成分预测其作用靶点和药效作用,构建甘草黄酮多成分-多靶点网络。方法:依托中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索甘草的化学成分,...目的:以甘草黄酮类成分预测其作用靶点和药效作用,构建甘草黄酮多成分-多靶点网络。方法:依托中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索甘草的化学成分,把口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥50%和类药性(drug likeness,DL)≥0.18作为筛选条件,并根据分子结构筛选黄酮类成分;通过TCMSP和Swiss Target Prediction数据库获取黄酮类活性成分的相关靶点。通过UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,并利用生物学信息注释数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)对靶点进行相关通路富集。最后用Cytoscape 3.2.0软件构建"成分-靶点"和"靶点-通路"网络图。结果:筛选得到28个黄酮类活性成分,可作用于97个潜在靶点和61条相关通路,涉及抗肿瘤、抗炎、内分泌调节和氨基酸代谢等多个环节,预测结果得到文献印证。结论:通过网络药理学验证了甘草黄酮多成分、多靶点、多通路的作用特点,为系统研究甘草活性成分药效作用及机制提供了参考。展开更多
文摘目的:采用网络药理学方法对菟丝子主要活性成分的作用机制进行分析,探讨其成分、多靶点、靶点相关信号通路及生物学过程的相互关系。方法:首先借助中药系统药理学分析平台(Chinese medicine system pharmacology analysis platform,TCMSP)筛选出菟丝子中的活性成分及相关作用靶点,然后通过Uniprot数据库对提取靶点进行筛选与转化,并利用CTD网络在线分析平台获取与靶点相关的疾病,利用Cytoscape 3.6.1及其插件ClueGO构建“活性成分-靶点”“靶点-疾病”“靶点-生物学通路”网络图,最后利用Cytoscape 3.6.1中的Network Analyzer插件分析网络图,获取相关拓扑异构信息,建立菟丝子成分-靶点-通路网络模型。结果:筛选得到菟丝子8个活性成分,涉及靶点118个,靶点相关疾病516种;对所得靶点进行GO分析,再经Kappa算法聚类,共获得79类相关生物学过程和57类信号相关信号通路。结论:初步探讨菟丝子主要活性成分的作用机制,为深入研究菟丝子的药效作用及其机制提供参考。
文摘目的:以甘草黄酮类成分预测其作用靶点和药效作用,构建甘草黄酮多成分-多靶点网络。方法:依托中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)检索甘草的化学成分,把口服生物利用度(oral bioavailability,OB)≥50%和类药性(drug likeness,DL)≥0.18作为筛选条件,并根据分子结构筛选黄酮类成分;通过TCMSP和Swiss Target Prediction数据库获取黄酮类活性成分的相关靶点。通过UniProt数据库提取作用靶点的基因名称,并利用生物学信息注释数据库(database for annotation,visualization and integrated discovery,DAVID)对靶点进行相关通路富集。最后用Cytoscape 3.2.0软件构建"成分-靶点"和"靶点-通路"网络图。结果:筛选得到28个黄酮类活性成分,可作用于97个潜在靶点和61条相关通路,涉及抗肿瘤、抗炎、内分泌调节和氨基酸代谢等多个环节,预测结果得到文献印证。结论:通过网络药理学验证了甘草黄酮多成分、多靶点、多通路的作用特点,为系统研究甘草活性成分药效作用及机制提供了参考。
