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基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析
被引量：
1
1
作者
曹心雨
李东
翱
+3 位作者
路平
王秦虎
江聪
刘慧泉
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期1466-1478,共13页
为明确植物病原真菌禾谷镰刀菌Fusarium graminearum全生活史的转录组特征和基因表达模式,采用生物信息学技术对其生活史不同阶段15个时期或组织的链特异性RNA-seq数据进行分析。结果表明,共有8106个基因在所有时期均有表达,为禾谷镰刀...
为明确植物病原真菌禾谷镰刀菌Fusarium graminearum全生活史的转录组特征和基因表达模式,采用生物信息学技术对其生活史不同阶段15个时期或组织的链特异性RNA-seq数据进行分析。结果表明,共有8106个基因在所有时期均有表达,为禾谷镰刀菌生活史核心基因,占总基因数的47.2%;有性生殖和侵染过程中表达的基因数相对较多,其中有性生殖后期表达的基因数最多,达15221个;无性产孢和侵染小麦穗过程中基因表达水平整体较高,而分生孢子中基因表达水平最低。在燕麦培养基上禾谷镰刀菌气生菌丝的基因表达模式与侵染过程中的基因表达模式较为相似,而与营养生长菌丝的基因表达模式差异较大。该菌次生代谢物合成特征酶基因和分泌蛋白基因的表达模式均分成3类,即分别在侵染、营养生长和有性生殖过程上调表达,暗示其在生活史不同阶段的特异性功能。
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关键词
禾谷镰刀菌
赤霉病
转录组
RNA-SEQ
原文传递
小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展
2
作者
李东
翱
刘慧泉
王秦虎
《生物技术进展》
2021年第5期610-617,共8页
由禾谷镰刀菌引起的小麦赤霉病直接为害作物穗部,不仅严重影响小麦产量,还可因为毒素污染问题威胁人畜健康。近年来对小麦与禾谷镰刀菌互作的转录组学研究带来了很多新见解,概述了小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展,主要比较了...
由禾谷镰刀菌引起的小麦赤霉病直接为害作物穗部,不仅严重影响小麦产量,还可因为毒素污染问题威胁人畜健康。近年来对小麦与禾谷镰刀菌互作的转录组学研究带来了很多新见解,概述了小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展,主要比较了不同抗性品种、不同器官、不同籽粒发育时期的小麦穗部在禾谷镰刀菌侵染时的基因表达特征,总结了赤霉病感染时小麦的激素响应、信号传导、转录调控和防卫相关基因的表达规律,以期促进研究者对小麦响应禾谷镰刀菌侵染规律的理解。
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关键词
小麦赤霉病
小麦
禾谷镰刀菌
转录组
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职称材料
题名
基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析
被引量：
1
1
作者
曹心雨
李东
翱
路平
王秦虎
江聪
刘慧泉
机构
西北农林科技大学植物保护学院
出处
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021年第6期1466-1478,共13页
基金
国家自然科学基金(31872918)。
文摘
为明确植物病原真菌禾谷镰刀菌Fusarium graminearum全生活史的转录组特征和基因表达模式,采用生物信息学技术对其生活史不同阶段15个时期或组织的链特异性RNA-seq数据进行分析。结果表明,共有8106个基因在所有时期均有表达,为禾谷镰刀菌生活史核心基因,占总基因数的47.2%;有性生殖和侵染过程中表达的基因数相对较多,其中有性生殖后期表达的基因数最多,达15221个;无性产孢和侵染小麦穗过程中基因表达水平整体较高,而分生孢子中基因表达水平最低。在燕麦培养基上禾谷镰刀菌气生菌丝的基因表达模式与侵染过程中的基因表达模式较为相似,而与营养生长菌丝的基因表达模式差异较大。该菌次生代谢物合成特征酶基因和分泌蛋白基因的表达模式均分成3类,即分别在侵染、营养生长和有性生殖过程上调表达,暗示其在生活史不同阶段的特异性功能。
关键词
禾谷镰刀菌
赤霉病
转录组
RNA-SEQ
Keywords
Fusarium graminearum
Fusarium head blight
transcriptome
RNA-seq
分类号
S432.44 [农业科学—植物病理学]
原文传递
题名
小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展
2
作者
李东
翱
刘慧泉
王秦虎
机构
西北农林科技大学植物保护学院
出处
《生物技术进展》
2021年第5期610-617,共8页
基金
国家自然科学基金项目(32072505)
大学生创新创业训练计划(202110712255)。
文摘
由禾谷镰刀菌引起的小麦赤霉病直接为害作物穗部,不仅严重影响小麦产量,还可因为毒素污染问题威胁人畜健康。近年来对小麦与禾谷镰刀菌互作的转录组学研究带来了很多新见解,概述了小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展,主要比较了不同抗性品种、不同器官、不同籽粒发育时期的小麦穗部在禾谷镰刀菌侵染时的基因表达特征,总结了赤霉病感染时小麦的激素响应、信号传导、转录调控和防卫相关基因的表达规律,以期促进研究者对小麦响应禾谷镰刀菌侵染规律的理解。
关键词
小麦赤霉病
小麦
禾谷镰刀菌
转录组
Keywords
Fusarium head blight
wheat
Fusarium graminearum
transcriptome
分类号
S435.121.45 [农业科学—农业昆虫与害虫防治]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
基于链特异性RNA-seq的禾谷镰刀菌全生活史转录组分析
曹心雨
李东
翱
路平
王秦虎
江聪
刘慧泉
《植物保护学报》
CAS
CSCD
北大核心
2021
1
原文传递
2
小麦响应禾谷镰刀菌侵染的转录组学研究进展
李东
翱
刘慧泉
王秦虎
《生物技术进展》
2021
0
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