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梨CRK家族基因及其腐烂病菌侵染响应成员的鉴定 被引量:5
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作者 刘河 +4 位作者 赵丹 孙娥 马富鹏 马春玲 左存武 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第5期963-973,共11页
在植物响应逆境过程中,半胱氨酸富集类受体激酶(Cysteine-rich receptor like kinase,CRK)起重要的调控作用。本研究中以结构域Stress-antifung(Pfam:PF01657)和Pkinase(Pfam:PF00069)的保守序列为种子序列,在全基因组范围鉴定了梨(Pryu... 在植物响应逆境过程中,半胱氨酸富集类受体激酶(Cysteine-rich receptor like kinase,CRK)起重要的调控作用。本研究中以结构域Stress-antifung(Pfam:PF01657)和Pkinase(Pfam:PF00069)的保守序列为种子序列,在全基因组范围鉴定了梨(Pryus spp.)CRK家族成员。此外,对其蛋白理化性质、进化特征、基因在染色体上的位置、顺式作用元件(cis-acting regulatory element,cis-element)和表达模式进行了分析。共获得32个CRK家族成员,其氨基酸数、分子量和等电点分别介于440~1 217、48.90~137.02 k D和5.31~8.59,主要位于质膜。根据进化分析,将来自梨、拟南芥、苹果、番茄和水稻的156个CRK分为6个亚组,梨CRK主要分布于亚组Ⅳ,Ⅴ和Ⅵ。梨CRK中存在5个串联重复的基因簇,共包含了20个成员。此外,该基因家族所有成员的启动子区域都存在多个响应激素和逆境信号的cis-element。接种腐烂病菌Valsa pyr(iVp)后,杜梨(Pyrus betulifolia,抗病)和‘早酥’梨(Pyrus bretschneideri,感病)中分别发现8个和10个CRK发生了差异表达,6个基因在两种资源中都发生了差异表达。差异基因中,Pbr001477.1和Pbr000205.4在抗、感病资源中都显著上调,而其他基因的表达量在两种资源中呈现不同的变化趋势。 展开更多
关键词 CRK 基因家族 腐烂病 生物信息分析
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苹果L-LEC-RLK基因家族鉴定及响应病原真菌信号的表达分析 被引量:4
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作者 田丹 +2 位作者 刘河 吕前前 左存武 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第3期421-432,共12页
以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus×domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-LectinReceptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性... 以L型类凝集素(Lectin-LegB;Pfam:PF00139)和激酶(Pkinase;Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了苹果(Malus×domestica Borkh.)L型类凝集素类受体激酶(L-LectinReceptor-like kinase,L-LEC-RLK)家族成员,并对其理化性状、进化特征、亚细胞定位、染色体位置和表达模式进行分析。通过鉴定,共获得41个成员,其氨基酸序列大小介于423~1 291 aa,分子量介于47.12~143.27 kD,等电点介于5.50~8.91,其中28个成员位于质膜。根据进化分析将拟南芥、水稻、马铃薯、杨树和苹果等5个物种的L-LEC-RLKs分为8个亚组,苹果L-LEC-RLKs分布于亚组Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅴ、Ⅵ和Ⅷ。染色体位置分析表明苹果L-LEC-RLKs存在多个串联重复。该家族成员在不同组织中存在多样化的表达模式。27个成员在苹果接种腐烂病菌(Valsa mali,Vm)或斑点落叶病菌(Alternaria alternata apple pathotype,AAAP)后存在差异表达。其中,MD15G1226500和MD14G1055200的表达量在两种病害发生后都发生了显著的差异。以上差异基因可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。 展开更多
关键词 苹果 L-LEC-RLK 生物信息学分析 苹果腐烂病 苹果斑点落叶病
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具有苹果枝条降解及生防能力真菌的筛选与鉴定 被引量:2
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作者 杜文彪 刘尚巧 +4 位作者 冒霞 赵丹 王超 左存武 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 2022年第5期118-125,137,共9页
【目的】筛选具有苹果废弃枝条纤维素降解及生防能力的真菌菌株,为果园废弃枝条的资源化利用奠定基础。【方法】以羧甲基刚果红培养基初筛、粉碎枝条为菌源复筛、纤维素酶活性测定、枝条发酵培养和离体对峙试验,从废弃枯枝样品中筛选具... 【目的】筛选具有苹果废弃枝条纤维素降解及生防能力的真菌菌株,为果园废弃枝条的资源化利用奠定基础。【方法】以羧甲基刚果红培养基初筛、粉碎枝条为菌源复筛、纤维素酶活性测定、枝条发酵培养和离体对峙试验,从废弃枯枝样品中筛选具有苹果枝条降解能力和腐烂病生防能力的真菌菌株;结合形态特征和基因序列的同源性分析鉴定,明确菌株的分类地位。【结果】筛选出4株具有产纤维素酶的真菌菌株,分别命名为MM1、MX-1、MX-2和Z-2-1。MX-2的滤纸酶活性高达(12.96±0.02)U/mL,MM1、Z-2-1、MX-1的滤纸酶活性分别为(10.08±0.01)、(10.47±0.18)、(6.16±0.15)U/mL;MX-2枝条纤维素降解率高达(21.27±0.56)%,Z-2-1和MM1的枝条纤维素降解率分别为(14.65±0.35)%和(12.73±0.91)%,MX-1最低。对峙试验表明,Z-2-1可与腐烂病菌形成抑菌带。经鉴定,MM1、MX-1、MX-2和Z-2-1分别为深绿木霉、雅致放射毛霉、黑曲霉和穗状弯孢菌。【结论】获得的4株真菌均对苹果废弃枝条具有降解作用,其中MX-2的降解效果最好,Z-2-1对苹果腐烂病具有一定的拮抗能力,有望被应用在废弃苹果枝条纤维素降解的生产活动中。 展开更多
关键词 纤维素降解 菌株筛选 滤纸酶 分子鉴定 生物防治
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苹果和梨LysM-RLK响应腐烂病信号成员鉴定 被引量:2
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作者 王东东 温有福 +3 位作者 赵丹 王超 左存武 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第2期381-392,共12页
以LysM(Pfam:PF01476)和Pkinase(Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在苹果属(Malus spp.)及梨属(Pyrus spp.)植物基因组范围内鉴定了4个物种[苹果(M.pumila)‘嘎啦’、山荆子(M.baccata)、杜梨(P.betulifolia)、白梨(Pyrus bret... 以LysM(Pfam:PF01476)和Pkinase(Pfam:PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,在苹果属(Malus spp.)及梨属(Pyrus spp.)植物基因组范围内鉴定了4个物种[苹果(M.pumila)‘嘎啦’、山荆子(M.baccata)、杜梨(P.betulifolia)、白梨(Pyrus bretschneideri)‘玉露香’]的LysM-RLK家族成员,并对该家族成员的生物信息学和响应腐烂病菌(Valsa canker)信号的表达模式进行了分析。共获得37个LysM-RLK家族成员,主要定位于质膜;进化分析发现以上4个物种及拟南芥(Arabidopsis thaliana)和水稻(Oryza sativa)的LysM-RLK分为2个亚组;基因重复分析发现苹果和梨中都存在全基因组重复或片段重复现象,但仅苹果‘嘎啦’中存在基因串联重复现象;该基因家族成员的启动子区域存在多个响应植物激素或逆境胁迫信号的元件;在腐烂病菌侵染后31个LysM-RLK成员存在差异表达,其中成员MD04G1238900、MD04G1238700、Chr9.g46389和Chr4.g40822(GDR数据库)表达量显著上调,可作为进一步开展抗病研究和功能分析的候选基因。 展开更多
关键词 LysM-RLK 生物信息学 腐烂病菌 基因表达
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山荆子WAK类受体激酶基因家族鉴定与表达分析 被引量:1
5
作者 冒霞 王超 +2 位作者 余宏强 左存武 《分子植物育种》 CAS 北大核心 2022年第12期3921-3930,共10页
以表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF,Pfam PF00008.28)和激酶(pkinase,Pfam PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了山荆子(Malus baccata)WAK-RLK(Wall-associated kinases-Reporter like kinase)家族成员,对其家族成员... 以表皮生长因子(epidermal growth factor,EGF,Pfam PF00008.28)和激酶(pkinase,Pfam PF00069)保守域全蛋白序列为种子序列,鉴定了山荆子(Malus baccata)WAK-RLK(Wall-associated kinases-Reporter like kinase)家族成员,对其家族成员理化性质、进化关系、重复现象和表达模式等进行分析。结果表明,山荆子WAK基因家族包括27个成员,其氨基酸序列大小介于496~805,分子量介于55.45~89.61 kD,理论等电点介于5.15~8.75,主要分布于质膜;根据进化分析,将拟南芥、水稻、番茄、香蕉、苹果、山荆子6个物种的WAK-RLK分为8个亚组,山荆子WAK主要分布于亚组Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ、Ⅴ、Ⅶ和Ⅷ。基因重复分析表明山荆子WAK成员扩增的主要原因是发生基因组范围的重复(wide-genome duplication,WGD)。启动子顺式作用元件(cis-acting regulatory element,cis-element)分析表明,该家族成员主要响应多种激素和逆境信号。PCR表达分析表明,WAK基因在山荆子不同组织中存在差异表达,且在苹果树腐烂病菌(Valsa mali)侵染后,MABA031460、MABA030455和MABA014609在前期显著上调表达。由此表明山荆子WAK家族成员发生扩增,响应逆境和腐烂病信号,MABA031460、MABA030455和MABA014609可作为抗腐烂病研究的候选基因。本研究结果为进一步抗病研究和功能分析提供了参考。 展开更多
关键词 RLK WAK 苹果树腐烂病菌 生物信息学分析 表达谱
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植物Gly-RLK基因家族鉴定及其在苹果中的表达分析 被引量:2
6
作者 赵兴刚 +5 位作者 吕前前 王东东 冒霞 刘河 赵丹 左存武 《园艺学报》 CAS CSCD 北大核心 2020年第10期1883-1894,共12页
类受体激酶(receptor like kinase,RLK)在植物生长发育和环境适应中起重要作用。前期研究发现苹果(Malus′domestica)中存在一类具有Glyco18胞外结构域(SM000636或SM000704)的RLK,命名为Glyco_18-RLK(Gly-RLK)。本试验中以Glyco18和Pkin... 类受体激酶(receptor like kinase,RLK)在植物生长发育和环境适应中起重要作用。前期研究发现苹果(Malus′domestica)中存在一类具有Glyco18胞外结构域(SM000636或SM000704)的RLK,命名为Glyco_18-RLK(Gly-RLK)。本试验中以Glyco18和Pkinase(SM000220)保守域全蛋白序列为种子序列,对53种被子植物基因组中的Gly-RLK进行鉴定,并分析其进化特征;明确苹果Gly-RLK(MdGly-RLK)的理化性状、亚细胞定位,基因在染色体上的分布、启动子区域的顺式作用元件和表达模式。结果表明,仅19种植物中存在Gly-RLK,家族成员数介于1~20,单子叶植物中均未发现该家族成员。根据进化分析将其分为8个亚组,亚组Ⅲ、Ⅶ和Ⅷ分布基因数较多。共发现6个MdGly-RLK,其编码的氨基酸序列大小、分子量和等电点分别介于451~776、50.99~87.33 kD和5.95~8.21,主要位于质膜,4个为串联重复。MdGly-RLK在苹果各组织和品种间存在不同的表达模式;接种苹果腐烂病菌(Valsa mali)后,6个MdGly-RLK均差异表达,MdGly-RLK6(MD15G1156900)可上调至对照的16.33倍。综上,Gly-RLK仅在部分双子叶植物中存在,家族成员的扩增速度较快。MdGly-RLK响应苹果生长发育和黑腐皮壳菌信号,MdGly-RLK6可作为苹果抗腐烂病研究的候选基因。 展开更多
关键词 苹果 Glyco_18-RLK(Gly-RLK) 进化特征 表达模式 腐烂病
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苹果和梨抗病相关基因的诱导与表达分析 被引量:1
7
作者 孙娥 闫文萍 +3 位作者 余宏强 赵丹 左存武 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第9期1468-1476,共9页
该研究结合蔷薇科数据库,经多序列比对、表达分析和验证,筛选了苹果和梨抗病反应Marker基因及其检测引物,并以腐烂病抗性资源杜梨和东北山荆子悬浮细胞为材料,经20%腐烂病菌(Vp)代谢物处理,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析Marker基因... 该研究结合蔷薇科数据库,经多序列比对、表达分析和验证,筛选了苹果和梨抗病反应Marker基因及其检测引物,并以腐烂病抗性资源杜梨和东北山荆子悬浮细胞为材料,经20%腐烂病菌(Vp)代谢物处理,采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)分析Marker基因对腐烂病信号响应的表达模式,为苹果、梨抗病反应的快速检测和杜梨抗腐烂病机理的系统研究奠定基础。结果显示:(1)经检索比对共筛选出水杨酸(SA)、茉莉酸(JA)、乙烯(ET)、系统获得型抗性(SAR)反应、病原相关分子模式激发的免疫反应(PTI)、植保素和防御相关等信号的15个Marker基因及其对应引物。(2)各处理cDNA浓度采用100 ng·μL^(-1)时Cq值均介于18~25,且PCR扩增效率高,表明所选的15个Marker基因的引物均可准确反映抗性反应的激活状况,可作为各自信号通路的Marker基因。(3)与对照相比,Vp代谢物处理后杜梨悬浮细胞中ROS的积累随处理时间的延长呈逐渐显著上升的趋势,并于处理6 h时,ROS信号值达到对照的3.2倍,表明Vp代谢物会激活体内的免疫反应(PTI),进而导致植物体内ROS的爆发。(4)RT-qPCR验证分析显示,Vp代谢物处理后,杜梨悬浮细胞中SA、JA、PTI、SAR、R基因、植保素、防御相关等信号通路的Marker基因都呈上调表达趋势,其中,SA、JA和SAR通路的Marker基因ChiV(Chitinase class V)、LOX1(Lipoxygenase 1)和PR4(Pathogenesis-Related 4)及防御相关基因PAL1(Phe Ammonia Lyase 1)的表达上调最为明显,最高分别可上升至对照的1718、691、6369和1072倍,表明杜梨受到Vp代谢物胁迫时,主要激活了植物体内的SA、JA、SAR和防御相关信号通路的基因,进而能够抵御病原的进一步入侵。研究发现,SA、JA、SAR和防御反应等信号参与了杜梨对腐烂病胁迫的响应,进而提高其抗病性。 展开更多
关键词 腐烂病 Marker基因 植物免疫 差异表达
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苹果β-半乳糖苷酶基因家族响应腐烂病菌信号
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作者 赵丹 +2 位作者 吕前前 田玉珍 左存武 《植物生理学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期1319-1328,共10页
以GH35(glyco_hydro_35,PF01301)结构域保守序列为种子序列,在基因组范围鉴定了苹果(Malus domestica)等6种植物的β-半乳糖苷酶(β-galactosidases,BGals)基因家族,并对苹果BGals(MdBGals)进行了生物信息学和表达模式分析。结果表明,... 以GH35(glyco_hydro_35,PF01301)结构域保守序列为种子序列,在基因组范围鉴定了苹果(Malus domestica)等6种植物的β-半乳糖苷酶(β-galactosidases,BGals)基因家族,并对苹果BGals(MdBGals)进行了生物信息学和表达模式分析。结果表明,苹果基因组存在23个BGal基因,其氨基酸序列数、分子质量和等电点分别介于163~924、18.99~103.57 kDa和5.14~9.05之间,主要位于细胞壁。在不同植物中BGals相对保守,但在部分植物类群中存在较快的进化速率。苹果BGals启动子区域存在多个响应脱落酸、茉莉酸甲酯和水杨酸等激素信号和防卫信号的顺式作用元件。接种腐烂病菌后,苹果韧皮组织中多个BGals呈下调表达的趋势,也有少数成员上调表达。MD02G1079200、MD15G1306800和MD10G1301600表达量的变化较为明显,可作为进一步研究苹果抗腐烂病的候选基因。 展开更多
关键词 苹果 Β-半乳糖苷酶基因 进化特征 顺式作用元件 苹果树腐烂病
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蔷薇科果树类受体激酶的研究进展
9
作者 左存武 高博 +2 位作者 赵丹 陈佰鸿 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第10期1793-1800,共8页
类受体激酶(receptor like kinase,RLK)参与调控植物几乎所有的生命活动,是植物生长发育和环境适应的“中央处理器”。该文对近年来国内外有关蔷薇科果树RLK基因鉴定、进化特征及其在各器官生长发育、非生物和生物逆境中的作用及调控机... 类受体激酶(receptor like kinase,RLK)参与调控植物几乎所有的生命活动,是植物生长发育和环境适应的“中央处理器”。该文对近年来国内外有关蔷薇科果树RLK基因鉴定、进化特征及其在各器官生长发育、非生物和生物逆境中的作用及调控机制等方面的研究进展进行了综述。蔷薇科果树基因组中存在数目庞大的RLKs,不同树种间的RLK数目和各亚家族成员数目都存在较大差异,而且蔷薇科果树RLK存在极为普遍的部分重复和串联重复现象,是导致家族成员迅速变化的重要原因。有研究发现,一些RLKs调控蔷薇科果树器官发育和对环境的适应性。在器官发育方面,LRR-RLK亚家族成员调控根系发育,CrRLK1L、LysM-RLK和LRR-RLK亚家族部分成员参与调控果实发育,CrRLK1L亚家族成员参与调控花粉管发育,LRR-RLK、LysM-RLK、L-LEC-RLK和B-Lectin-RLK亚家族部分成员调控蔷薇科果树对生物逆境的适应。今后RLK功能研究可侧重于蔷薇科果树特色性状,通过提高目标基因的筛选和验证的效率,加速主效RLKs的筛选进程,并通过筛选主效RLKs诱导方式和加速分子育种进程等途径,将研究成果应用于实际生产。 展开更多
关键词 RLKs 蔷薇科果树 进化特征 果树发育 非生物抗性 抗病性
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注射用奥美拉唑钠的临床应用合理性分析
10
作者 杨永秀 武银桂 +2 位作者 候永婷 辛盛泽 《中文科技期刊数据库(文摘版)医药卫生》 2024年第7期0122-0125,共4页
研究当前注射用奥美拉唑钠在临床用药过程中对合理用药产生影响的因素,总结可靠的干预措施。方法 将2021年10月到2023年10月到我院经过注射用奥美拉唑钠治疗的100例患者作为研究对象,对所有患者的有关资料进行调查,调查期间存在不合理... 研究当前注射用奥美拉唑钠在临床用药过程中对合理用药产生影响的因素,总结可靠的干预措施。方法 将2021年10月到2023年10月到我院经过注射用奥美拉唑钠治疗的100例患者作为研究对象,对所有患者的有关资料进行调查,调查期间存在不合理用药的患者人数,并将不合理用药患者的资料和合理用药患者的有关资料进行对比,统计对注射用奥美拉唑钠合理用药产生影响的因素。结果 (1)100例使用注射用奥美拉唑钠的患者存在不合理用药的28例,占28.00%,合理用药患者72例,占72.00%;(2)经卡方检验,药物配伍不合理、溶媒选择不当、输注时间不当、药物剂量不当、用药途径不当、未留意肝功能影响、药物储存不当、个体性差异、缺乏用药监测是注射用奥美拉唑钠合理用药的单因素,差异有统计学意义(P<0.05);(3)经Logistic多因素回归分析,药物配伍不合理、溶媒选择不当、未留意肝功能影响、药物储存不当、缺乏用药监测是注射用奥美拉唑钠合理用药的独立危险因素,差异有统计学意义(P<0.05)。结论 对注射用奥美拉唑钠的用药合理性产生影响的因素是多方面的,要重视分析对用药合理性产生影响的因素,并采取措施进行干预,提升注射用奥美拉唑钠用药的合理性,保证患者的用药安全。 展开更多
关键词 注射用 奥美拉唑钠 用药合理性 单因素 独立危险因素
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一例猪传染性萎缩性鼻炎的诊治
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作者 《国外畜牧学(猪与禽)》 2011年第4期71-71,共1页
猪萎缩性鼻炎病(Atrophic Rhinitis,AR)是猪呼吸道的一种主要的传染性疾病。此病病因复杂,病原因子和环境因素在此病的发生中均起一定的作用。现已确认猪传染性萎缩性鼻炎其主要病原是由支气管败血波氏杆菌引起的猪的一种慢性传染病,传... 猪萎缩性鼻炎病(Atrophic Rhinitis,AR)是猪呼吸道的一种主要的传染性疾病。此病病因复杂,病原因子和环境因素在此病的发生中均起一定的作用。现已确认猪传染性萎缩性鼻炎其主要病原是由支气管败血波氏杆菌引起的猪的一种慢性传染病,传染性极强,发病率高,但死亡率低。本病通过病猪或带菌猪的鼻液、飞沫直接和间接传播,各年龄段的猪均易感染本病。病猪表现代谢障碍,生长发育迟缓,甚至停滞,给养猪业带来巨大的经济损失。到目前为止,尚未发现彻底治愈此病的办法。它是集约化养猪业的大敌,世界动物卫生纽织(OIE)将其列为B类传染病。综合防治此病,对提高生猪出栏率、减少养猪业损失意义重大。 展开更多
关键词 猪萎缩性鼻炎 防治 措施
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初中数学生活化教学探究 被引量:3
12
作者 《甘肃教育》 2020年第18期175-175,共1页
数学源于生活,用于生活。新课改提出,数学教学要紧密联系学生的生活实际,从学生的经验和已有知识出发,创设具体生动的教学情境,并挖掘生活中的数学素材,将之引入课堂,从而拉近数学与学生之间的距离。实践证明,紧密联系生活实际,将抽象... 数学源于生活,用于生活。新课改提出,数学教学要紧密联系学生的生活实际,从学生的经验和已有知识出发,创设具体生动的教学情境,并挖掘生活中的数学素材,将之引入课堂,从而拉近数学与学生之间的距离。实践证明,紧密联系生活实际,将抽象的数学知识转化为学生看得见、摸得着的生活实例,能消除学生对知识的陌生感,有利于数学知识的理解和掌握,更有利于学习兴趣的激发和学习积极性的调动,从而促进了教学效率的提升。同时,让学生体会到了数学的价值所在。因此,教学时,教师要综合考虑教学实际,实施生活化教学。 展开更多
关键词 初中数学 生活化教学 生活素材 生活语言 实践活动
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浅谈如何培养学生的数学能力
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作者 《学周刊》 2019年第11期70-70,共1页
新课改下的数学教学强调要落实素质教育的要求,培养学生的学科素养。这就意味着教师要摒弃应试教育的旧思想,切实从学生学习成长的需求出发开展初中数学教学活动,落实三维目标的培养要求,真正使学生在数学学习中能够收获知识,提升能力。
关键词 培养 学生 数学能力
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