高通量测序方法在重症肺炎病原体检测的应用 被引量：21

1

作者 刘孝荣 马东礼 +7 位作者 姜含芳 陈虹宇 蔡德丰 朱纯青 郑跃杰 粟东芳 杨振宇 刘艳红 《中华检验医学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第8期609-613,共5页

目的 建立高通量测序技术检测重症肺炎病原体的流程和方法,并评估其可行性.方法 临床对照研究. 收集2015年3月至2016年12月深圳儿童医院就诊的76例重症肺炎的患者（实验组）和18例气管软化并排除细菌感染的患者（对照组）,采集肺泡灌洗... 目的 建立高通量测序技术检测重症肺炎病原体的流程和方法,并评估其可行性.方法 临床对照研究. 收集2015年3月至2016年12月深圳儿童医院就诊的76例重症肺炎的患者（实验组）和18例气管软化并排除细菌感染的患者（对照组）,采集肺泡灌洗液标本,同时进行临床检测和高通量测序,并对高通量测序的结果采用PCR方法进行确认,然后对基于高通量测序的重症肺炎病原体检测方法进行评估.采用χ2检验对高通量测序组和非高通量测序组的检出率进行相关性分析.结果 建立了基于高通量测序的重症肺炎病原体的检测流程及方法,该流程包括：标本收集、DNA提取、文库构建、上机测序及生物信息学分析.在76例重症肺炎患者中,66例患者的肺泡灌洗液标本的高通量测序结果为阳性,灵敏度86.84%,显著高于传统临床检验所用的细菌培养、免疫荧光法和定量PCR 3种方法综合检测的灵敏度（68.42%,52/76,χ^2=7.426,P〈0.001）.66份高通量测序阳性标本中,共检测到13种病原体,其中主要的病原体包括肺炎支原体、肺炎链球菌、流感嗜血杆菌和腺病毒等,非高通量测序法共检测到9种病原体.比较临床检验和高通量测序结果,在76份实验组标本中,发现61份（80.26%）标本两者结果完全一致,15份（19.74%）标本结果不完全一致,这些不一致检出的标本主要集中在高通量测序检测出腺病毒、肺炎链球菌和流感嗜血杆菌而临床培养和免疫荧光方法不能检出这些病原体.PCR验证结果显示高通量检测结果与PCR的检测结果差异没有统计学意义（χ^2=0.517,P=0.472）,高通量检测结果与培养及免疫荧光方法检测结果差异有统计学意义（χ^2=11.671,P＆lt;0.001）.结论 基于高通量测序的重症肺炎病原体的检测方法灵敏度高,能检测出未知病原体,优于传统临床检验所用方法. 展开更多

关键词 高通量核苷酸序列分析 肺炎 肺炎支原体

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31株深圳地区婴幼儿感染百日咳鲍特菌的流行特点、基因型、亲缘关系与大环内酯耐药性 被引量：11

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作者 姜含芳 刘孝荣 +3 位作者 陈虹宇 朱纯青 邢志浩 马东礼 《中华微生物学和免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第4期270-276,共7页

目的通过分析百日咳感染患儿的临床信息和鉴定百日咳鲍特菌的基因型、耐药性和亲缘性,了解深圳地区百日咳鲍特菌的流行特点、基因组变异与大环内酯类耐药情况。方法百日咳患儿的临床信息采集自深圳市儿童医院电子病历系统。我们对分离... 目的通过分析百日咳感染患儿的临床信息和鉴定百日咳鲍特菌的基因型、耐药性和亲缘性,了解深圳地区百日咳鲍特菌的流行特点、基因组变异与大环内酯类耐药情况。方法百日咳患儿的临床信息采集自深圳市儿童医院电子病历系统。我们对分离自患儿咽拭子的31株百日咳鲍特菌进行二代测序和基因组从头组装。通过序列比对鉴定多位点序列分型(multilocus sequence typing,MLST)、毒力基因型与23S rRNA突变位点。通过构建系统进化树分析亲缘性。通过E-test鉴定临床分离株对大环内酯类抗生素的耐药性。结果31株百日咳鲍特菌的MLST分型均为ST-2。毒力基因型呈多样性,其中2株为prn缺失型。基于进化树,深圳株与疫苗株亲缘关系远。19株百日咳鲍特菌为红霉素耐药,均携带23S rRNA编码基因的A2047G突变。结论深圳地区百日咳鲍特菌的毒力基因型呈多样性,非疫苗株的基因型逐渐增多。大环内酯耐药株已有传播。本研究为改进百日咳的防治和疫苗策略提供了参考。 展开更多

关键词 百日咳鲍特菌 二代测序 基因型 大环内酯耐药性

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深圳地区手足口病肠道病毒核酸检测及流行特征分析 被引量：6

3

作者 朱纯青 马东礼 +2 位作者 蔡德丰 刘孝荣 钟山 《中国医师杂志》 CAS 2018年第5期693-696,700,共5页

目的分析2015年1月至2016年12月深圳地区的手足口病病原学特征,为手足口病的防治提供理论依据。方法统计2015年至2016年度深圳市儿童医院检验科的7 758份结果 ,运用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)法检测肠道病毒通用型(EV)、肠... 目的分析2015年1月至2016年12月深圳地区的手足口病病原学特征,为手足口病的防治提供理论依据。方法统计2015年至2016年度深圳市儿童医院检验科的7 758份结果 ,运用实时荧光逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)法检测肠道病毒通用型(EV)、肠道病毒71型(EV71)和柯萨奇病毒A组16型(CoxA16),分析患者年龄、性别以及流行时间。结果在2015年及2016年度,深圳地区手足口病肠道病毒阳性率分别为67.19%(2 679/3 987)和52.61%(1 984/3 771),差异有统计学意义(x^2=71.84,P<0.05);男女患儿比例分别为1.91:1(1 757/922)和1.83:1(1 283/701),男女患病率差异有统计学意义(P<0.05);患儿年龄集中在<5岁(占患病总人数的90%以上);4～7月为发病高峰期;手足口病肠道病毒以其他肠道病毒为主(占患病总人数的82%以上);随着年龄的增长,重症手足口病患儿中,EV71比例递增,其他肠道病毒比例递减。结论接种疫苗不失为一种预防手足口病的好方法 ,针对手足口病的流行特征,监护机构应尽早送患儿进行诊治。 展开更多

关键词 手足口病/病毒学 肠道病毒属/遗传学 流行病学研究

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5G核心网切片技术与应用研究 被引量：2

4

作者 张玉峰 王磊 朱纯青 《江苏通信》 2023年第2期14-18,共5页

5G切片技术聚焦垂直行业赋能,支持客户自定义产品需求参数,为客户提供更快、更优、更加隔离的业务体验。结合切片相关技术特征、核心网端到端切片架构、核心网切片方案,分析应用案例,进行通信测试及网络时延对比,经多个项目的实践检验,... 5G切片技术聚焦垂直行业赋能,支持客户自定义产品需求参数,为客户提供更快、更优、更加隔离的业务体验。结合切片相关技术特征、核心网端到端切片架构、核心网切片方案,分析应用案例,进行通信测试及网络时延对比,经多个项目的实践检验,采用基于全部共享CP/UP的智能驾驶GBR 2B切片,在下班高峰期城区道路实测隔离,时延降低明显,降低了网络损耗,提高了网络资源复用率,缩短了响应时间。 展开更多

关键词 5G 核心网 切片 NSMF CSMF

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基于双会话的4/5G专网分流方案研究

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作者 王磊 袁菲 +5 位作者 蔡小峰 涂晶 朱纯青 蔡云霞 张如成 王建华 《江苏通信》 2024年第4期21-25,40,共6页

随着5G网络覆盖不断深入,5G专网业务也逐渐推广。在实际部署中基于5G ULCL(Uplink Classifier上行分离器)特性的分流业务存在漫游场景下公网流量回归属地时延增大、4/5G接入不兼容、不支持IPv6地址细分、不支持国际漫游等问题。针对这... 随着5G网络覆盖不断深入,5G专网业务也逐渐推广。在实际部署中基于5G ULCL(Uplink Classifier上行分离器)特性的分流业务存在漫游场景下公网流量回归属地时延增大、4/5G接入不兼容、不支持IPv6地址细分、不支持国际漫游等问题。针对这些问题,提出一种基于双会话的分流解决方案,即在网络侧为用户同时建立公网DNN(Data Network Name数据网络名称)和专网DNN,分别接入拜访地公网和归属地专网,并通过在PCF(Policy Control Function策略控制功能)签约的分流策略,将用户公网业务和专网业务分流到两个DNN,解决了传统ULCL分流方案的不足。 展开更多

关键词 5G 双会话 专网分流 ULCL

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深圳某哨点医院儿童脑炎脑膜炎症候群监测结果分析 被引量：5

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作者 曾宇苑 梁肇海 +3 位作者 陈思平 申红卫 石向辉 朱纯青 《热带医学杂志》 CAS 2019年第9期1174-1176,1179,共4页

目的初步了解深圳地区儿童脑炎脑膜炎症候群(AMES)的病原谱组成,为制定防控措施提供依据。方法收集符合病例定义的儿童AMES的脑脊液标本,进行分离培养、药敏检测和常见12种病原体的PCR检测,并收集患者的临床资料。结果 2016-2018年共收... 目的初步了解深圳地区儿童脑炎脑膜炎症候群(AMES)的病原谱组成,为制定防控措施提供依据。方法收集符合病例定义的儿童AMES的脑脊液标本,进行分离培养、药敏检测和常见12种病原体的PCR检测,并收集患者的临床资料。结果 2016-2018年共收集145例儿童AMES的脑脊液,70例检出病原体,依次分别为16例无乳链球菌、11例肺炎链球菌、11例大肠埃希菌、10例肠道病毒、3例单纯疱疹病毒。无乳链球菌主要发生在小于1月龄的婴儿(75.0%),肺炎链球菌主要发生在3月~5岁的儿童(90.9%),所有肠道病毒发生在1岁以上儿童。4株肺炎链球菌对青霉素、四环素、复方新诺明的耐药率均为75.0%;7株无乳链球菌对四环素和克林霉素的耐药率均为100.0%;8株大肠埃希菌对氨苄西林和复方新诺明的耐药率分别为87.5%和75.0%,多重耐药指数为0.25~0.75。结论无乳链球菌和大肠埃希菌是小于1月龄婴儿的主要病原体,肺炎链球菌和肠道病毒是1岁以上儿童的主要病原体。多重耐药在大肠埃希菌中较为严重,应继续实行长期监测。 展开更多

关键词 脑炎 脑膜炎 儿童 病原谱

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深圳市一起B群流行性脑脊髓膜炎疫情的调查 被引量：3

7

作者 石向辉 范苏云 +3 位作者 朱纯青 钟剑明 曾宇苑 申红卫 《疾病监测》 CAS 2019年第1期80-83,共4页

目的调查B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)疫情的原因。方法于2018年2月22、27日对患者和密切接触者进行流行病学调查,并收集脑脊液、血液和咽拭子样品进行分离培养、PCR检测和二代测序。结果在患者血液及其母亲咽拭子中均分离出B群脑膜炎奈瑟... 目的调查B群流行性脑脊髓膜炎(流脑)疫情的原因。方法于2018年2月22、27日对患者和密切接触者进行流行病学调查,并收集脑脊液、血液和咽拭子样品进行分离培养、PCR检测和二代测序。结果在患者血液及其母亲咽拭子中均分离出B群脑膜炎奈瑟菌,多位点序列分型均为ST-3200/CC4821,2株菌的16S rRNA及耐药基因、多肽编码基因的相似性为100%。结论该疫情是由健康携带B群脑膜炎奈瑟菌的母亲传播给患者而引起。 展开更多

关键词 流行性脑脊髓膜炎 B群脑膜炎奈瑟菌 流行病学调查 二代测序

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2015-2017年深圳市某哨点医院儿童AMES监测病例病原结果分析 被引量：3

8

作者 申红卫 朱纯青 +5 位作者 石向辉 周洁 刘孝荣 莫浩联 欧泳萱 王祖儿 《热带医学杂志》 CAS 2019年第5期617-621,共5页

目的了解深圳市某哨点医院儿童脑炎脑膜炎症候群(AMES)的细菌病原谱及其耐药特征。方法在哨点医院收集病例的血液和脑脊液样品,用镜检、分离培养、乳胶凝集等常规方法检测病原菌,对分离的细菌进行抗生素敏感性试验。结果在2015-2017年的... 目的了解深圳市某哨点医院儿童脑炎脑膜炎症候群(AMES)的细菌病原谱及其耐药特征。方法在哨点医院收集病例的血液和脑脊液样品,用镜检、分离培养、乳胶凝集等常规方法检测病原菌,对分离的细菌进行抗生素敏感性试验。结果在2015-2017年的120例儿童AMES病例中,从26例血液或脑脊液中检出病原菌(21.7%);依次为肺炎链球菌(9例)、大肠杆菌(5例)、表皮葡萄球菌(5例)、无乳链球菌(3例)、肺炎克雷伯杆菌(2例)、铜绿假单胞菌(1例)、金黄色葡萄球菌(1例)。在测试的20株菌株中,无乳链球菌对四环素、克林霉素;肺炎克雷伯杆菌对氨苄西林;表皮葡萄球菌对青霉素、苯唑西林、阿莫西林、阿莫西林/克拉维酸全部耐药。另分离1株耐甲氧西林金黄色葡萄球菌、2株产超广谱β内酰胺酶(ESBL)大肠杆菌、1株ESBL肺炎克雷伯杆菌。结论肺炎链球菌是该医院儿童AMES最主要的细菌病原,大肠杆菌和无乳链球菌是新生儿脑膜炎的主要病原体。应结合病原菌的耐药性特点,合理选择抗生素和加强耐药性监测。 展开更多

关键词 急性脑炎脑膜炎症候群 儿童 肺炎链球菌 大肠杆菌

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多重PCR-毛细管电泳检测儿童5种腹泻病毒的方法建立及应用 被引量：2

9

作者 蔡德丰 陈运生 +4 位作者 朱纯青 孟青 肖丽霞 田洁 马东礼 《临床检验杂志》 CAS 2020年第1期15-18,共4页

目的:建立肠道腺病毒(Adv)、诺如病毒G1及G2型(NoV G1和NoV G2)、A组轮状病毒(RV A)、扎如病毒(SV)及星状病毒(HAstV)5种儿童腹泻病毒多重PCR-毛细管电泳法检测体系。方法:针对Adv、NoV G1、NoV G2、RV A、SV及HAstV保守序列设计特异性... 目的:建立肠道腺病毒(Adv)、诺如病毒G1及G2型(NoV G1和NoV G2)、A组轮状病毒(RV A)、扎如病毒(SV)及星状病毒(HAstV)5种儿童腹泻病毒多重PCR-毛细管电泳法检测体系。方法:针对Adv、NoV G1、NoV G2、RV A、SV及HAstV保守序列设计特异性引物,设计并优化腹泻病毒的多重PCR-毛细管电泳检测体系,琼脂糖凝胶电泳确认扩增片段;进行性能(灵敏度、特异性)评估;收集185例儿童病毒样腹泻样本,采用多重PCR-毛细管电泳体系进行检测,并通过测序验证阳性结果。结果:所设计引物特异性扩增出5种腹泻病毒;多重PCR-毛细管电泳检测体系检出限为102~103 copies/μL,CV均<10%;其他腹泻病原体未出现交叉反应,无明显的非特异杂峰,特异性较好;185例临床病毒样腹泻样本检测阳性132例(71.35%),其中RV A 105例(56.8%)、Adv 22例(11.9%)、SV 15例(8.1%)、NoV G211例(5.9%)和HAstV 10例(5.4%),其中包括双病毒感染样本;毛细管电泳进样量需20μL,3 h内完成全部分析;测序结果与GeneBank比对分析,序列一致。结论:成功建立一种能够快速筛查5种常见儿童腹泻病毒的多重PCR-毛细管电泳检测方法。 展开更多

关键词 儿童 腹泻病毒 多重PCR 毛细管电泳

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儿童无病灶肺炎链球菌菌血症39例临床特征分析 被引量：2

10

作者 刘春艳 李晓楠 +5 位作者 刘晓莉 朱纯青 陈虹宇 郑跃杰 杨永弘 鲍燕敏 《中华实用儿科临床杂志》 CSCD 北大核心 2020年第8期566-568,共3页

目的探讨儿童无病灶肺炎链球菌菌血症(OPB)的临床特征和适宜治疗方案。方法收集深圳市儿童医院2013年1月至2018年12月儿内科病房39例符合入组标准的OPB患儿的病历资料,对其临床特征、药敏结果、抗生素应用情况等进行回顾性分析。结果OP... 目的探讨儿童无病灶肺炎链球菌菌血症(OPB)的临床特征和适宜治疗方案。方法收集深圳市儿童医院2013年1月至2018年12月儿内科病房39例符合入组标准的OPB患儿的病历资料,对其临床特征、药敏结果、抗生素应用情况等进行回顾性分析。结果OPB患儿发病中位年龄2岁4个月,74.4%(29/39例)的患儿年龄6个月~3岁;平均总热程3.69 d(1~14 d),平均住院时间6.74 d;89.7%(35/39例)的患儿外周血白细胞计数>15×10^9/L,76.9%(30/39例)的患儿C-反应蛋白升高,38.9%(14/36例)的患儿降钙素原>2 mg/L;住院期间患儿均接受静脉抗生素治疗,初始抗生素选择:头孢呋辛[11例(28.2%)]、阿莫西林舒巴坦钠[10例(25.6%)]、头孢曲松钠[7例(17.9%)],美洛西林舒巴坦[6例(15.4%)];抗生素治疗平均1.4 d后热退,平均静脉抗生素疗程6.2 d;药敏结果提示青霉素不敏感率为46.2%,阿莫西林、头孢曲松和头孢噻肟不敏感率分别为22.2%、10.3%、17.9%,红霉素100.0%耐药,万古霉素和利奈唑胺未发现耐药。结论OPB好发于6个月~3岁婴幼儿,对阿莫西林、头孢曲松和头孢噻肟耐药率低,对于免疫力健全的儿童抗生素治疗后热退快,预后好。 展开更多

关键词 肺炎链球菌 菌血症 治疗 儿童

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血清型33F肺炎链球菌致右侧肱骨近端急性化脓性骨髓炎并关节炎1例报道 被引量：1

11

作者 姜含芳 唐根 +4 位作者 陈虹宇 朱纯青 孟青 唐盛平 陈运生 《检验医学》 CAS 2021年第6期682-684,共3页

化脓性骨髓炎是细菌感染引起的骨膜、骨质和骨髓的炎症。致病菌可穿入关节,在关节滑膜和关节液中繁殖,形成化脓性关节炎。化脓性骨髓炎并关节炎如未及时治疗,会严重影响患者骨关节功能,甚至危及生命^([1])。

关键词 肺炎链球菌 血清型 急性化脓性骨髓炎 化脓性关节炎

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对HSS用户搬迁割接的两点思考 被引量：1

12

作者 姚勇 朱纯青 《电信技术》 2015年第4期74-76,81,共4页

针对HSS替换HLR的搬迁割接过程,对使用户更新到HSS的方法进行分析,并且分析在搬迁完成后在原HLR上对用户操作的影响,提出注意事项及建议,解决了用户搬迁割接中产生的问题。

关键词 位置更新 位置信息 用户搬迁

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亭湖区生猪屠宰废水污染现状及防治对策

13

作者 朱纯青 《资源节约与环保》 2015年第12期81-81,84,共2页

根据亭湖区生猪屠宰场污染现状,提出防治对策。严格准入,集中建设,优胜劣汰,强化监管是减少污染的必要措施。

关键词 生猪屠宰场 污染 防治

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建设项目竣工环保验收监测中工业危险废物核查的初步认识 被引量：1

14

作者 朱纯青 张娣 《资源节约与环保》 2015年第5期106-106,共1页

工业危险废物占一般工业固废比例虽然很小,但对环境长期破坏性和社会危害性很大,因此对工业危险废物的核查是建设项目竣工环保验收监测的重要内容。有必要对新建项目生产过程中产生的危险废物来源、名称、数量、特性、形态、包装方式、... 工业危险废物占一般工业固废比例虽然很小,但对环境长期破坏性和社会危害性很大,因此对工业危险废物的核查是建设项目竣工环保验收监测的重要内容。有必要对新建项目生产过程中产生的危险废物来源、名称、数量、特性、形态、包装方式、贮存、处置方式进行全面的核实和检查,为建设项目竣工环保验收提供非测试性的技术依据。 展开更多

关键词 验收监测 工业危险废物 核查

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