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2013年广西分离株H9N2亚型禽流感病毒全基因组特性分析
被引量:
4
1
作者
柴丹
崔卓栋
+13 位作者
郭焱
张萍
李金泽
郭丽娇
孙文超
朱
弈
龙
邸洋
李文杰
马海彬
解长占
尹逊哲
郑敏
田明尧
金宁一
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第1期10-14,19,共6页
目的对2013年从广西分离的H9N2亚型禽流感病毒进行全基因测序,并分析其基因组和遗传进化特性,为进一步研究H9N2禽流感病毒的致病机制提供科学依据。方法运用RT-PCR方法克隆广西分离株H9N2亚型禽流感病毒8个基因片段,进行全基因测序,对...
目的对2013年从广西分离的H9N2亚型禽流感病毒进行全基因测序,并分析其基因组和遗传进化特性,为进一步研究H9N2禽流感病毒的致病机制提供科学依据。方法运用RT-PCR方法克隆广西分离株H9N2亚型禽流感病毒8个基因片段,进行全基因测序,对测序结果进行序列比对和遗传进化分析。结果序列比对分析表明,H9N2亚型分离株的HA序列裂解位点为RSSR↓GLF,受体结合位点为YWTNKLY且发生Q226G和G228R双重位点突变,NA耐药相关位点发生3处突变(E119V,R292W和R294G),M2蛋白跨膜区存在S31N变异;编码内部蛋白的6个基因与同年H7N9亚型分离株相似度为90.9%~97.6%。其分子遗传进化关系属于欧亚种系,其中HA基因属于Y280亚系,M基因属于G1亚系,PB2基因属于Korea亚系,PB1、PA、NA、NP和NS属于SH/F/98亚系。结论2013年广西分离株是由4种不同H9N2亚型禽流感病毒亚系发生自然重排的产物,属于低致病性禽流感病毒,但对抗流感药物存在一定耐药性,故应加强对禽农场中H9N2病毒流行株变异趋势和传播风险的监测。
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关键词
H9N2禽流感病毒
H7N9禽流感病毒
序列比对
遗传分析
原文传递
题名
2013年广西分离株H9N2亚型禽流感病毒全基因组特性分析
被引量:
4
1
作者
柴丹
崔卓栋
郭焱
张萍
李金泽
郭丽娇
孙文超
朱
弈
龙
邸洋
李文杰
马海彬
解长占
尹逊哲
郑敏
田明尧
金宁一
机构
长春中医药大学
军事医学科学院军事兽医研究所
广西动物疫病预防控制中心
出处
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017年第1期10-14,19,共6页
基金
国家自然科学基金项目(No.31402175)
吉林省科技发展计划项目(No.20130522090JH)
文摘
目的对2013年从广西分离的H9N2亚型禽流感病毒进行全基因测序,并分析其基因组和遗传进化特性,为进一步研究H9N2禽流感病毒的致病机制提供科学依据。方法运用RT-PCR方法克隆广西分离株H9N2亚型禽流感病毒8个基因片段,进行全基因测序,对测序结果进行序列比对和遗传进化分析。结果序列比对分析表明,H9N2亚型分离株的HA序列裂解位点为RSSR↓GLF,受体结合位点为YWTNKLY且发生Q226G和G228R双重位点突变,NA耐药相关位点发生3处突变(E119V,R292W和R294G),M2蛋白跨膜区存在S31N变异;编码内部蛋白的6个基因与同年H7N9亚型分离株相似度为90.9%~97.6%。其分子遗传进化关系属于欧亚种系,其中HA基因属于Y280亚系,M基因属于G1亚系,PB2基因属于Korea亚系,PB1、PA、NA、NP和NS属于SH/F/98亚系。结论2013年广西分离株是由4种不同H9N2亚型禽流感病毒亚系发生自然重排的产物,属于低致病性禽流感病毒,但对抗流感药物存在一定耐药性,故应加强对禽农场中H9N2病毒流行株变异趋势和传播风险的监测。
关键词
H9N2禽流感病毒
H7N9禽流感病毒
序列比对
遗传分析
Keywords
Avian influenza virus subtype H9N2
avian influenza virus subtype H7N9
phylogenetic analysis
sequencing
分类号
R373 [医药卫生—病原生物学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
2013年广西分离株H9N2亚型禽流感病毒全基因组特性分析
柴丹
崔卓栋
郭焱
张萍
李金泽
郭丽娇
孙文超
朱
弈
龙
邸洋
李文杰
马海彬
解长占
尹逊哲
郑敏
田明尧
金宁一
《中国病原生物学杂志》
CSCD
北大核心
2017
4
原文传递
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参考文献
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