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基于文献计量学的动脉粥样硬化与钙离子信号通路研究态势的可视化分析
1
作者 黄军杰 朱兴墅 +4 位作者 林晨 王烈 赵虎 夏印 郑凡 《中国血管外科杂志（电子版）》 2024年第1期73-80,共8页
目的分析动脉粥样硬化与钙离子信号通路的研究动态及热点,对动脉粥样硬化与钙离子信号通路领域研究进行系统综述和趋势展望。方法基于PubMed文献数据库,使用citexs数据分析平台采用文献计量学方法对2003年1月至2022年12月关于动脉粥样... 目的分析动脉粥样硬化与钙离子信号通路的研究动态及热点,对动脉粥样硬化与钙离子信号通路领域研究进行系统综述和趋势展望。方法基于PubMed文献数据库,使用citexs数据分析平台采用文献计量学方法对2003年1月至2022年12月关于动脉粥样硬化与钙离子信号通路研究进行文献分析及大数据挖掘。结果检索获得有效文献386篇,且该领域年度发文量呈不断上升趋势,其中发文量最多的国家为美国(138篇,35.75%),发文量最多的研究机构为美国印第安纳大学,刊载该领域文献量最多的期刊是Atherosclerosis(16篇)。检索文献关键词出现频率最多的为inflammation、vascular calcification、cardiovascular disease、vascular smooth muscle cells和calcium;最多的关联基因为Apoe(72篇)和NF-κB(66篇)。结论该领域研究正处于快速上升阶段,研究内容随着时间的推移不断深入。钙离子信号通路作为动脉粥样硬化的治疗靶点具有广阔的临床前景。钙调蛋白、钙结合蛋白等发挥钙离子信号通路调控作用的态势不断增高,靶向复杂的炎症信号通路参与动脉粥样硬化的疾病进程是当下研究的热点内容,为动脉粥样硬化的精准治疗提供新的可能性。 展开更多
关键词 动脉粥样硬化 钙离子 信号通路 文献计量学
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基于生物信息学分析林奇综合征相关结直肠癌关键Hub基因的筛选与功能富集分析 被引量：1
2
作者 朱兴墅 黄军杰 +6 位作者 翁才明 刘旺武 陈永元 陈惠燕 赵虎 王瑜 林承志 《生物技术进展》 2023年第2期291-297,共7页
通过生物信息学方法筛选出与林奇综合征相关结直肠癌(colorectal cance,CRC)组织中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。从基因表达总库(gene expression omnibus,GEO)下载林奇综合征相关CRC数据集GSE178516,使用GEO2... 通过生物信息学方法筛选出与林奇综合征相关结直肠癌(colorectal cance,CRC)组织中的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)。从基因表达总库(gene expression omnibus,GEO)下载林奇综合征相关CRC数据集GSE178516,使用GEO2R筛选DEGs,并在人类疾病数据库Malacards中获取CRC和林奇综合征疾病基因,3者的交集取为关键Hub基因,通过功能富集分析鉴定DEGs。利用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络(protein-protein interaction,PPI),并使用Cytoscape软件对PPI网络进行可视化和模块分析。随后在easyGEO数据库中对差异表达基因进行表达验证。从GSE178516共鉴定出261个差异基因,包括117个上调基因和114个下调基因。这些基因与CRC和林奇综合征基因共交集出8个差异表达基因(TGFBR2、PTEN、POLD1、EXO1、EPCAM、CDKN2B、CCND1、BRCA1)。GO、KEGG富集分析显示,其功能主要富集在DNA代谢过程调控、内在凋亡信号通路、错配修复等方面;KEGG通路分析主要富集在CRC等相关癌症路径。通过PPI获得与67个差异表达蛋白存在相互作用关系的892个蛋白,并利用Cytoscape软件构建其重要模块,包含44个节点和630个节点作用关系。利用easyGEO网站对8个差异基因进行表达分析,发现8个基因在林奇综合征相关CRC患者中的表达均具有统计学差异。总体上,研究鉴定出的关键Hub基因有助于了解林奇综合征相关CRC发生和发展的分子机制,并为林奇综合征进展对CRC的诊断和治疗提供新的候选靶点。 展开更多
关键词 林奇综合征 结直肠癌 差异表达基因 Hub基因 生物信息学
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术前超声内镜下钛夹标记预判SiewertⅡ型食管胃结合部腺癌手术入路的临床价值 被引量：1
3
作者 方永超 朱兴墅 +5 位作者 黄言云 吴伟航 林楠 杨劲 刘旺武 王瑜 《中国普通外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第10期1552-1559,共8页
背景与目的:处于食管胃交界处的SiewertⅡ型食管胃结合部腺癌(AEG)由于其在解剖位置上的特殊性,临床上对其最佳手术入路一直存在争议。本研究探讨术前超声内镜(EUS)下钛夹标记预判SiewertⅡ型AEG手术入路的应用价值,以期为临床制定安全... 背景与目的:处于食管胃交界处的SiewertⅡ型食管胃结合部腺癌(AEG)由于其在解剖位置上的特殊性,临床上对其最佳手术入路一直存在争议。本研究探讨术前超声内镜(EUS)下钛夹标记预判SiewertⅡ型AEG手术入路的应用价值,以期为临床制定安全、精准的手术方案提供帮助。方法:采用前瞻性对照研究方法,纳入中国人民解放军联勤保障部队第九〇〇医院2020年2月—2021年12月接受手术治疗的60例SiewertⅡ型AEG患者。将患者随机分为研究组与对照组,每组各30例。完善入院常规检查后,研究组患者在术前1 d行EUS直视下探测肿瘤纵轴最长浸润位置后,在口侧1 cm处用2枚于同一高度平面进行钛夹标记定位,并立即行腹部平片确认钛夹位置。对照组患者不做任何标记。研究组患者根据钛夹与第10胸椎位置关系决定手术入路,对照组患者根据术前常规CT、胃镜等检查决定手术入路。比较两组患者的相关临床数据。结果:两组患者的性别、年龄、体质量指数、吸烟史、饮酒史等基线资料差异无统计学意义(均P>0.05);两组患者的手术时间、术中出血、肿瘤直径、食管切缘、住院时间、术后病理分期、肿瘤T分期及N分期差异均无统计学意义(均P>0.05)。预判手术入路与实际手术入路的符合率的分析结果显示,研究组预判手术入路与实际手术入路的符合率明显高于对照组(96.67%vs.86.21%,P<0.001)。研究组和对照组术后总体并发症发生率分别为26.67%与30.00%,差异无统计学意义(P=0.783)。结论:术前EUS下钛夹标记操作简单、安全、可靠性强,对判断SiewertⅡ型AEG外科手术入路具有实际的临床应用价值。 展开更多
关键词 胃肠肿瘤 食管胃接合处 定位标记 腔内超声检查
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蛋白磷酸酶-1催化亚基β在结直肠癌诊断、预后及免疫浸润中的生物信息学分析
4
作者 朱兴墅 郑师尧 +6 位作者 王庆惠 陈力 刘旺武 纪辉涛 王瑜 赵虎 方永超 《中华细胞与干细胞杂志（电子版）》 2023年第6期321-330,共10页
目的 基于生物信息学探讨蛋白磷酸酶-1催化亚基β(PPP1CB)在结直肠癌(CRC)中的表达、预后、功能富集、免疫浸润及药物敏感性分析。方法 分别从癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库GSE41258下载CRC转录组及相应临床数据。根据PPP1CB表达中... 目的 基于生物信息学探讨蛋白磷酸酶-1催化亚基β(PPP1CB)在结直肠癌(CRC)中的表达、预后、功能富集、免疫浸润及药物敏感性分析。方法 分别从癌症基因组图谱(TCGA)和GEO数据库GSE41258下载CRC转录组及相应临床数据。根据PPP1CB表达中位数分组,确定两组间临床数据的差异情况。利用R语言survminer包分析PPP1CB高低表达组间的生存差异;对PPPICB表达与临床特征进行单因素和多因素Cox回归分析,筛选出影响肿瘤进展的独立预后因素;基于独立预后因素构建预测预后情况的列线图,并通过矫正曲线和ROC对模型进行内外部评估;采用R语言limma包对PPP1CB高低组进行差异分析,在DAVID数据库中进行差异表达基因(DEGs)的功能富集分析;采用R语言cibersort包进行免疫浸润丰度的评估;利用OncoPredict包进行药物敏感性预测。两组间比较采用独立样本t检验,分类变量间比较采用卡方检验。结果 与正常组比较,PPP1CB在肿瘤组中表达降低(P<0.001):其低表达与患者预后不良相关(P=0.021),在M0-1和N1-2亚组的生存分析中也得到相似结果(P=0.012,P=0.024)。ROC曲线下面积为0.746,提示其具有良好的诊断价值。单因素和多因素Cox回归分析结果显示,PPP1CB、年龄、T分期、N分期以及M分期可作为CRC的独立预后因素。模型的矫正曲线拟合度良好,1、3和5年的ROC曲线下面积均大于0.75。在PPP1CB高低表达组中,共有303个DEGs,其中297个基因表达增加,6个基因表达降低。功能富集分析显示,该差异基因主要富集在细胞周期、细胞肌动蛋白骨架调节等多个通路。免疫细胞浸润结果显示,在两组之间存在6种免疫细胞的表达差异,其中与Treg细胞相关性最高为-0.416。OncoPredict包进一步筛选出9种可能针对CRC的治疗药物。结论 PPP1CB在CRC发生发展中可能扮演关键的抑癌基因角色,为CRC患者靶向治疗提供新的潜在靶点。 展开更多
关键词 PPP1CB 结直肠癌 生物信息学 预后 免疫细胞浸润
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肝右动脉变异1例 被引量：1
5
作者 代豹 单增强 +3 位作者 朱兴墅 陈梦杰 沈晓雯 李荣要 《四川解剖学杂志》 2017年第2期40-40,共1页
作者在局部解剖学标本制作过程中发现肝右动脉变异1例,变异类型较为少见,现报道如下。该标本为男性,从腹主动脉上发一短干,起始处外径17.54mm,向左前下方走行31.48mm后分为腹腔干和肠系膜上动脉（见图1）。
关键词 肝右动脉 解剖 变异
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