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iFind:一个结合语义和视觉特征的图像相关反馈检索系统 被引量:34
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作者 张宏江 +1 位作者 刘文印 吴立德 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 2002年第7期681-688,共8页
给出了一个结合语义与视觉特征信息的图像相关反馈检索系统—— i Find.系统通过图像的标注信息构造语义网络 ,并在相关反馈中与图像的视觉特征相结合 ,有效地实现了在两个层次上的相关反馈 ,在基于内容的图像检索中取得了较为理想的效... 给出了一个结合语义与视觉特征信息的图像相关反馈检索系统—— i Find.系统通过图像的标注信息构造语义网络 ,并在相关反馈中与图像的视觉特征相结合 ,有效地实现了在两个层次上的相关反馈 ,在基于内容的图像检索中取得了较为理想的效果 ,具有一定的应用价值 . 展开更多
关键词 iFind 视觉特征 图像相关反馈检索系统 图像语义 多媒体数据库 图像分割 计算机
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SRAP分子标记及其应用概述 被引量:37
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作者 李巧燕 林瑞庆 《热带医学杂志》 CAS 2006年第4期467-469,F0004,共4页
序列相关扩增多态性(SRAP)是近年来发展起来的一种新型分子标记系统,它具有简便、中等产量、高共显性、重复性、易于分离条带及测序等优点,最大的特点是它针对的是基因的阅读框区域(ORFs)。SRAP标记中,引物的设计是关键,它是基于两个引... 序列相关扩增多态性(SRAP)是近年来发展起来的一种新型分子标记系统,它具有简便、中等产量、高共显性、重复性、易于分离条带及测序等优点,最大的特点是它针对的是基因的阅读框区域(ORFs)。SRAP标记中,引物的设计是关键,它是基于两个引物的扩增,上游引物长17bp,对外显子进行特异扩增,下游引物长18bp,特异扩增的是内含子及启动子区域,由于个体不同以及物种之间的内含子、启动子之间间隔长度不同而产生多态性。两个引物均由5P端14~15bp的核心序列,和3’端3个选择性碱基组成,其中核心序列又由长为10~11bp的无特异性的填充序列以及CCGG(正向引物中),或AATT(反向引物中)组成。且正向和反向引物中的填充序列必须不同。扩增的过程采用复性变温法,前5个循环复性温度为35℃,后30~35个循环则为50℃,扩增后的DNA片段可用聚丙烯酰胺或琼脂糖凝胶电泳分离,EB、银染或放射自显影检测。目前SRAP已开始在植物种质资源鉴定评价、种缘进化关系、遗传图谱构建、基因定位、重要性状标记以及比较基因组学方面得到成功应用。 展开更多
关键词 SHAP 分子标记 ORFs PCR
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一种自动门限选取的视频Shot分割方法 被引量:23
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作者 薛向阳 吴立德 《计算机研究与发展》 EI CSCD 北大核心 2000年第1期80-85,共6页
文中首先针对镜头Shot分割在基于内容的视频检索中的重要性,介绍了现在普遍采用的镜头分割新方法,同时针对这些方法的不足,提出了一种基于自动门限选取的镜头分割及分类方法,该方法能同时检测视频中的突变(break)、缓变... 文中首先针对镜头Shot分割在基于内容的视频检索中的重要性,介绍了现在普遍采用的镜头分割新方法,同时针对这些方法的不足,提出了一种基于自动门限选取的镜头分割及分类方法,该方法能同时检测视频中的突变(break)、缓变(gradual)等镜头变换和视频中的闪光灯以及运动区域.通过实际测试。 展开更多
关键词 自动门限 镜头分割 镜头分类 视频检索 多媒体
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猪弓形虫病特异PCR诊断方法的建立 被引量:28
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作者 谢德华 +6 位作者 崔焕粦 丘初集 范万红 廖申权 翟敏莉 林瑞庆 翁亚彪 《中国兽医科技》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期289-293,共5页
以核糖体DNA第一内转录间隔区(ITS1)序列作为弓形虫种特异的遗传标记,建立了猪弓形虫病特异PCR诊断方法。应用人工感染的方法建立了猪弓形虫病动物模型,摸索出猪弓形虫病PCR检测的最佳条件。敏感性和特异性试验结果显示,该PCR方法最低... 以核糖体DNA第一内转录间隔区(ITS1)序列作为弓形虫种特异的遗传标记,建立了猪弓形虫病特异PCR诊断方法。应用人工感染的方法建立了猪弓形虫病动物模型,摸索出猪弓形虫病PCR检测的最佳条件。敏感性和特异性试验结果显示,该PCR方法最低能检测到10 个弓形虫速殖子的DNA,且与相关的8种原虫和线虫均无交叉反应,证明该PCR方法具有高度的敏感性和特异性。动物感染试验结果证明,在试验猪出现明显临床症状时(感染后第5 d),对取材的8 个组织样品用该PCR方法检测,有6个组织样品为阳性,其中检出率最高的组织为肺门淋巴结。 展开更多
关键词 弓形虫 特异PCR 诊断
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重组酶聚合酶扩增技术及其在动物病原快速检测中的应用 被引量:30
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作者 吴耀东 徐民俊 +2 位作者 郑文斌 冯胜勇 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1797-1802,共6页
建立动物疫病的快速诊断,对于我国养殖业疫病的预防及控制、进出口检疫、动物食品安全卫生等方面具有重大意义。重组酶聚合酶扩增技术(RPA)是近几年出现的1种有望替代PCR的新的核酸扩增技术。该技术主要依赖于3种酶:能结合单链寡核苷酸... 建立动物疫病的快速诊断,对于我国养殖业疫病的预防及控制、进出口检疫、动物食品安全卫生等方面具有重大意义。重组酶聚合酶扩增技术(RPA)是近几年出现的1种有望替代PCR的新的核酸扩增技术。该技术主要依赖于3种酶:能结合单链寡核苷酸引物的重组酶、单链DNA结合蛋白和DNA聚合酶。反应过程中不需要模板链的热变性,可以在恒定的低温条件下快速扩增DNA或者RNA。具有特异性强、灵敏度高、快速、操作简便、适用于现场快速诊断等特点,在动物疾病早期诊断、实地检测、进出口快速检疫等方面具有巨大的应用前景和市场。本文对RPA技术进行综述,以期为相关研究提供参考。 展开更多
关键词 重组酶聚合酶扩增(RPA) 检测 诊断 动物病原
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一种新的颜色相似度定义及其计算方法 被引量:15
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作者 薛向阳 罗航哉 +1 位作者 吴立德 《计算机学报》 EI CSCD 北大核心 1999年第9期918-922,共5页
传统的基于直方图的颜色相似度计算方法的优点是与图像旋转、平移和尺寸变化无关,但是其缺陷也非常明显,例如两幅看起来颜色非常相似的图像,如果它们的颜色直方图交集为空或者直方图之间距离很大,那么相似度为零或者很小,这显然不... 传统的基于直方图的颜色相似度计算方法的优点是与图像旋转、平移和尺寸变化无关,但是其缺陷也非常明显,例如两幅看起来颜色非常相似的图像,如果它们的颜色直方图交集为空或者直方图之间距离很大,那么相似度为零或者很小,这显然不符合人的感知.为克服此缺陷,作者首先提出了两幅彩色图像之间颜色相似度计算公式,然后给出基于颜色直方图的新的相似度计算公式,它既保留了用直方图计算相似度的优点,同时克服了其缺陷.实验结果表明。 展开更多
关键词 图像检索 模式识别 图像识别 颜色相似度
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异尖线虫病概述 被引量:23
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作者 曹湛 刘劲松 +2 位作者 何芳 林瑞庆 《热带医学杂志》 CAS 2004年第4期494-497,共4页
异尖线虫病是由异尖线虫科某些种的活的第三期幼虫感染而引起的疾病,可引起人的急腹症、过敏性症状等。异尖线虫病呈世界性分布,已成为重要的食源性人兽共患寄生虫病,严重威胁人类的健康,是我国禁止入境的二类寄生虫病。本文综述了该病... 异尖线虫病是由异尖线虫科某些种的活的第三期幼虫感染而引起的疾病,可引起人的急腹症、过敏性症状等。异尖线虫病呈世界性分布,已成为重要的食源性人兽共患寄生虫病,严重威胁人类的健康,是我国禁止入境的二类寄生虫病。本文综述了该病的病原学、流行病学、病理变化、症状、诊断及其治疗和预防。 展开更多
关键词 异尖线虫病 诊断 防制
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广东集约化猪场结肠小袋纤毛虫感染情况调查 被引量:25
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作者 翁亚彪 胡毅军 +2 位作者 李岩 林瑞庆 《热带医学杂志》 CAS 2005年第6期827-829,共3页
为了解广东省集约化猪场的结肠小袋纤毛虫的感染情况,我们于2001年7月至2003年12月,采用粪便检查法抽检了广东省20个代表性集约化猪场的种猪和肉猪共1906头的粪样。结果发现,场阳性率为100%,各场的感染率为14.2%~72.2%。其中种母猪的... 为了解广东省集约化猪场的结肠小袋纤毛虫的感染情况,我们于2001年7月至2003年12月,采用粪便检查法抽检了广东省20个代表性集约化猪场的种猪和肉猪共1906头的粪样。结果发现,场阳性率为100%,各场的感染率为14.2%~72.2%。其中种母猪的感染率为46.8%,种公猪的感染率为50.5%,育肥猪的感染率为49.8%,生长猪的感染率为34.8%,保育猪的感染率为20.1%。本文的调查结果表明,广东省集约化猪场不同生长阶段猪结肠小袋纤毛虫的感染情况均很严重,调查结果为猪场制定防制结肠小袋纤毛虫的措施提供了科学依据。 展开更多
关键词 集约化猪场 结肠小袋纤毛虫 感染率
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我国猪弓形虫病的研究概况 被引量:19
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作者 谢德华 翁亚彪 《中国兽医寄生虫病》 CAS 2004年第2期33-35,共3页
 弓形虫病是一种分布广泛、危害严重的人兽共患病,不但在公共卫生上有很重要的意义,对养猪生产也曾造成过巨大经济损失。近年来,我国学者在猪弓形虫病的流行情况、致病作用、诊断方法以及防制等方面都进行了研究,本文就该病的研究进行...  弓形虫病是一种分布广泛、危害严重的人兽共患病,不但在公共卫生上有很重要的意义,对养猪生产也曾造成过巨大经济损失。近年来,我国学者在猪弓形虫病的流行情况、致病作用、诊断方法以及防制等方面都进行了研究,本文就该病的研究进行简要概述。 展开更多
关键词 中国 弓形虫病 流行特点 诊断
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弓形虫ITS及5.8S序列的PCR扩增、克隆及分析 被引量:16
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作者 翁亚彪 谢德华 +4 位作者 林瑞庆 李华文 张德林 吴绍强 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期70-73,共4页
通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)及5 8SDNA序列进行PCR扩增、克隆、测序和序列分析,旨在对国内不同宿主间弓形虫虫株的遗传变异情况进... 通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)及5 8SDNA序列进行PCR扩增、克隆、测序和序列分析,旨在对国内不同宿主间弓形虫虫株的遗传变异情况进行分析和验证,为分子遗传学和分子诊断学研究提供资料。结果显示:QH绵羊株、ZS人株、SH人株、CN猪株的ITS及5 8S序列完全一致,且与GenBank上注册RH株的ITS及5 8S序列也一致;仅实验室传代保存的RH株的ITS2序列与其它4株的ITS2有2个碱基的差异。结果表明ITS可作为分子标记用于弓形虫与其它原虫的种间鉴定,但不适合用于弓形虫种内遗传变异的研究。 展开更多
关键词 弓形虫 SH 序列 RH 克隆 宿主 CN 绵羊 PCR扩增 强毒株
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利用抑制消减杂交技术筛选猪蛔虫性别差异表达基因 被引量:16
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作者 吴绍强 邹丰才 +3 位作者 翁亚彪 宋慧群 林瑞庆 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期1040-1045,共6页
为了筛选线虫的性别特异性基因,为线虫乃至寄生虫的性别控制提供新的工具,本研究选择猪蛔虫(Ascarissuum)为模型,分别提取雌性和雄性成虫的mRNA后,采用Clontech公司的PCR-selectTM试剂盒进行反转录合成cDNA并进行抑制消减杂交(SSH),构... 为了筛选线虫的性别特异性基因,为线虫乃至寄生虫的性别控制提供新的工具,本研究选择猪蛔虫(Ascarissuum)为模型,分别提取雌性和雄性成虫的mRNA后,采用Clontech公司的PCR-selectTM试剂盒进行反转录合成cDNA并进行抑制消减杂交(SSH),构建猪蛔虫雌、雄虫性别差异表达的消减cDNA文库,并采用地高辛(DIG)标记的cDNA探针进行Southern杂交检验所构建文库的消减效率。结果表明,雌、雄虫性别差异表达的消减cDNA文库均具有很强的性别特异性。随机从各库中各抽取25个克隆进行测序及在线BLAST分析,发现在25个雄虫ESTs中有20个已知ESTs,5个新的ESTs;25个雌虫ESTs中有11个已知ESTs,还有8个可能为新基因。猪蛔虫性别差异表达的消减cDNA文库的成功构建,为进一步研究性别特异基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 抑制消减杂交技术 筛选 蛔虫 性别差异基因 CDNA文库
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弓首蛔虫线粒体cox1基因的多态性研究 被引量:14
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作者 李明伟 林瑞庆 +4 位作者 邹丰才 宋慧群 曹湛 何芳 《中国兽医科技》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期386-390,共5页
应用PCR SSCP技术和DNA 序列分析对犬弓首蛔虫(Toxocara canis)线粒体DNA(mtDNA)中的细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)进行了分析研究,并与弓首属的猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫、牛弓首蛔虫及弓蛔属的狮弓蛔虫进行了... 应用PCR SSCP技术和DNA 序列分析对犬弓首蛔虫(Toxocara canis)线粒体DNA(mtDNA)中的细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)进行了分析研究,并与弓首属的猫弓首蛔虫、马来西亚弓首蛔虫、牛弓首蛔虫及弓蛔属的狮弓蛔虫进行了种间比较。结果显示,犬弓首蛔虫种群内的pcox1 序列差异为2.72%,与马来西亚弓首蛔虫种群间的序列差异为11.38%,与猫弓首蛔虫种群间的序列差异为11. 20%,与牛弓首蛔虫种群间的序列差异为10.40%,与狮弓蛔虫种群间的序列差异为11.48%;马来西亚弓首蛔虫种群内的pcox1 序列差异为0.57%,与猫弓首蛔虫的序列差异为8.23%,与牛弓首蛔虫的序列差异为8.70%,与狮弓蛔虫的序列差异为10.60%。研究证实,犬弓首蛔虫不同地方虫株的pcox1 有一定差异,与同属其他种类及狮弓蛔虫的差异较大;马来西亚弓首蛔虫确为一独立种。 展开更多
关键词 弓首蛔虫 线粒体DNA cox1基因 PCR—SSCP
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我国片形吸虫(Fasciola)线粒体细胞色素c氧化酶亚基基因(cox1)部分序列的多态性 被引量:15
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作者 董世娟 黄维义 +4 位作者 林瑞庆 钱德 吴绍强 宋慧群 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第4期378-381,共4页
用33P对引物进行标记,对来自国内不同地区不同宿主的片形吸虫(Fasciola)的线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基基因(pcox1)部分序列进行PCR扩增及DNA单链构象多态性(SSCP)分析,结果76个虫体均成功地扩增出约450bp的基因片段;SSCP分析显示,... 用33P对引物进行标记,对来自国内不同地区不同宿主的片形吸虫(Fasciola)的线粒体基因组细胞色素氧化酶亚基基因(pcox1)部分序列进行PCR扩增及DNA单链构象多态性(SSCP)分析,结果76个虫体均成功地扩增出约450bp的基因片段;SSCP分析显示,不同地区或同一地区的不同样品在pcox1的SSCP带型上存在多态性;代表性样品的测序结果表明,其碱基序列存在差异。试验结果显示,我国片形吸虫pcox1序列种内变异不明显,种间变异显著,表明cox1序列可以作为片形吸虫分类鉴定中一个可靠的遗传标记。 展开更多
关键词 片形吸虫 cox1 PCR-SSCP 多态性
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中国4个弓形虫虫株GRA6基因的比较分析 被引量:20
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作者 谢德华 翁亚彪 +4 位作者 李华文 郑唤钦 林瑞庆 张德林 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第7期1495-1500,共6页
通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的致密颗粒抗原(GRA6)基因进行PCR-RFLP分析,首次对中国弓形虫虫株进行了基因分型研究,旨在了解中国弓形虫基因型的分布情况,从而为... 通过对国内来源于不同宿主的ZS人株、SH人株、CN猪株、QH绵羊株4个弓形虫虫株,以及国际标准强毒株RH株的致密颗粒抗原(GRA6)基因进行PCR-RFLP分析,首次对中国弓形虫虫株进行了基因分型研究,旨在了解中国弓形虫基因型的分布情况,从而为进一步的分子遗传学研究以及弓形虫病的防制提供资料。PCR-RFLP分析显示两种带型:RH、SH、CN3株弓形虫为一种带型,QH和ZS2株弓形虫为另一种电泳带型。GRA6序列分析结果显示:RH、SH、CN3株弓形虫的GRA6基因序列上的MseΙ酶切位点与国外报道的RH株一致,同属于基因型Ι,为强毒株;QH和ZS2株弓形虫的MseΙ酶切位点与国外报道的弱毒株BEVERLEY株和ME49株一致,同属于基因型Ⅱ,与PCR-RFLP分析结果一致。除MseΙ酶切位点外,中国的几个虫株GRA6序列与GenBankTM注册的RH株及BEVERLEY和ME49两个弱毒株有个别碱基的差异。结果证明中国人源弓形虫包含了Ι、Ⅱ两种基因型,而动物源性弓形虫则因宿主和来源地不同亦有Ι、Ⅱ两个基因型。 展开更多
关键词 虫株 比较分析 RFLP分析 酶切位点 分析结果 基因型 遗传学研究 PCR MSe 致密颗粒 国际标准 基因分型 分布情况 弓形虫病 基因序列 强毒株 弱毒株 H株 带型 中国人 来源地 动物源 宿主 RH 显示 国外 绵羊 抗原
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棕熊蛔虫ITS rDNA的PCR扩增与序列分析 被引量:16
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作者 彭仕明 黄勉 +5 位作者 陈武 唐剑栋 蔡勤辉 梁玉珍 林瑞庆 《中国兽医寄生虫病》 CAS 2008年第3期1-5,共5页
目的以核糖体DNA(rDNA)的第一与第二内转录间隔区序列(ITS-1及ITS-2)鉴定从广州动物园棕熊分离的蛔虫种类。方法应用PCR方法以保守引物NC5和NC2扩增蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA序列,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEsay载体,... 目的以核糖体DNA(rDNA)的第一与第二内转录间隔区序列(ITS-1及ITS-2)鉴定从广州动物园棕熊分离的蛔虫种类。方法应用PCR方法以保守引物NC5和NC2扩增蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA序列,将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEsay载体,用菌落PCR及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落进行测序,并与Gen.Bank“公布的人蛔虫(Ascaris lumbricoides)、猪蛔虫(Ascariis suum)、浣熊贝利斯蛔虫(Baylisascaris procyonh)及狮弓蛔虫(Toxascaris leonina)ITS序列比较。结果从棕熊分离的2个蛔虫样本的ITS及5.8SrDNA总长为859—861bp,种内相似性为99.7%,与GenBank^TM公布的人蛔虫、猪蛔虫、浣熊贝利斯蛔虫及狮弓蛔虫的相似性分别为84.6%、84.5%、89.3%及72.3%,序列差异明显。结论棕熊蛔虫不同于上述种类蛔虫,可能为Baylisacaris transfuga. 展开更多
关键词 棕熊 蛔虫 内转录间隔区(ITS) PCR扩增 序列比较
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鸡异刺线虫ITS rDNA的PCR扩增、克隆及序列分析 被引量:15
16
作者 吕召宏 徐广庭 +2 位作者 林瑞庆 宋慧群 《中国畜牧兽医》 CAS 2005年第8期41-44,共4页
应用PCR方法用保守引物NC5及NC2,扩增了从广州地区鸡体分离的鸡异刺线虫rDNA的第一、第二内转录间隔区(ITS-1,ITS-2)及5.8S基因。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEasy载体,用菌落PCR及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落进行测序。试验... 应用PCR方法用保守引物NC5及NC2,扩增了从广州地区鸡体分离的鸡异刺线虫rDNA的第一、第二内转录间隔区(ITS-1,ITS-2)及5.8S基因。将PCR扩增出的片段纯化后克隆至pGEM-TEasy载体,用菌落PCR及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落进行测序。试验结果表明,ITS-1长为428bp,ITS-2长为386bp。通过与网上发表的来自澳大利亚的鸡异刺线虫基因序列比较结果表明,广州鸡体内的异刺线虫和澳大利亚鸡异刺线虫的ITS-2序列是完全一样的,ITS-1序列有微小差异,广州鸡的2个不同虫体样本的ITS序列完全一致。本项研究结果为鸡异刺线虫的进一步分子生物学研究奠定了基础,并为寄生虫分子系统学研究提供了资料。 展开更多
关键词 鸡异刺线虫 内转录间隔区 RDNA PCR 序列分析
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猪食道口线虫ITS-1和ITS-2rDNA的PCR-SSCP分析 被引量:13
17
作者 林瑞庆 张新高 +4 位作者 胡友兰 李国清 翁亚彪 宋慧群 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第3期323-326,331,共5页
以采自我国不同地区猪体的食道口线虫虫株为研究对象,PCR扩增出ITS-1和ITS-2序列片段,然后采用单链构象多态性(SSCP)方法分析PCR产物,对不同地区食道口线虫进行分子鉴定。所有样品经SSCP分析显示两种带型,第一种为有齿食道口线虫带型,... 以采自我国不同地区猪体的食道口线虫虫株为研究对象,PCR扩增出ITS-1和ITS-2序列片段,然后采用单链构象多态性(SSCP)方法分析PCR产物,对不同地区食道口线虫进行分子鉴定。所有样品经SSCP分析显示两种带型,第一种为有齿食道口线虫带型,另一种为未定种食道口线虫带型。代表性样品的测序结果表明,未定种食道口线虫带型的样品为四棘食道口线虫。本研究在国际上首次报道了中国猪四棘食道口线虫的ITS序列,并建立了区分有齿食道口线虫和四棘食道口线虫的PCR-SSCP方法,从而为食道口线虫的分子生物学的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 食道口线虫 ITS-1 ITS-2 单链构象多态性(SSCP)
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有齿食道口线虫ITS及5.8S DNA片段的PCR扩增、克隆及序列分析 被引量:14
18
作者 林瑞庆 陈丽莎 +5 位作者 翁亚彪 吴绍强 邹丰才 李明伟 宋慧群 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期639-642,共4页
运用 PCR 方法以保守引物 NC5 及 NC2 扩增了从广东阳江地区猪体分离的食道口线虫 rDNA 的内转录间隔区(ITS)及 5.8S 序列。将 PCR 扩增出的片段纯化后克隆至 pGEM-T Easy 载体,用 PCR 技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒 DNA 进行... 运用 PCR 方法以保守引物 NC5 及 NC2 扩增了从广东阳江地区猪体分离的食道口线虫 rDNA 的内转录间隔区(ITS)及 5.8S 序列。将 PCR 扩增出的片段纯化后克隆至 pGEM-T Easy 载体,用 PCR 技术及酶切鉴定阳性菌落,对阳性菌落质粒 DNA 进行测序。结果表明,扩增的片段大小为 828 bp,包含部分的 18S、28S 及全部的 ITS-1(362 bp)、5.8S(153 bp)及 ITS-2(217 bp)序列。序列比较表明,该食道口线虫为有齿食道口线虫。本研究在国际上首次报道了中国猪有齿食道口线虫的 ITS 及 5.8S 序列,为食道口线虫的分子生物学的进一步研究奠定了基础。 展开更多
关键词 阳性 菌落 PCR扩增 克隆 阳江地区 首次 DNA片段 食道口线虫 中国猪 猪体
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湖南长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体cox1基因的克隆及序列分析 被引量:17
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作者 刘国华 戴荣四 +4 位作者 赵光辉 林瑞庆 刘伟 刘毅 《热带医学杂志》 CAS 2009年第2期117-120,共4页
目的研究湖南省长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况,并用pcox1序列重构泡状带绦虫与其他带科绦虫的种群遗传关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增泡状带绦虫虫株的pcox1,... 目的研究湖南省长沙及湘西泡状带绦虫分离株线粒体细胞色素c氧化酶第I亚基(cox1)基因部分序列(pcox1)的遗传变异情况,并用pcox1序列重构泡状带绦虫与其他带科绦虫的种群遗传关系。方法应用聚合酶链反应(PCR)扩增泡状带绦虫虫株的pcox1,应用ClustalX1.81程序对序列进行比对,然后用Phylip3.67程序MP法和Mage4.0程序NJ法绘制种系发育树,并用Puzzle5.2程序构建最大似然树;同时利用DNAstar5.0中的Megalign程序进行同源性分析,并与GenBankTM中已知泡状带绦虫相应基因序列进行比较分析。结果所获得的pcox1序列长度一致,均为343bp,与GenBankTM公布的带科绦虫序列进行比较分析表明,湖南长沙分离株1和湘西分离株5与已知泡状带绦虫相应基因的相似性分别为99.4%和99.7%,与其它带科绦虫的相似性均小于90.0%;湖南长沙1和湘西分离株5与已知泡状带绦虫相应基因遗传距离分别为0.006和0.003,与其他带科绦虫的遗传距离均大于0.100。种系发育树表明,2个分离株与已知泡状带绦虫位于同一分枝,Bootstrap值在97%以上。结论由于泡状带绦虫pcox1序列种内相对保守,种间差异较大,故可作为种间遗传变异研究的标记,研究结果为进一步研究泡状带绦虫的群体遗传结构奠定了基础。 展开更多
关键词 泡状带绦虫 线粒体DNA cox1基因 种系发育关系
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重组酶聚合酶扩增技术及其在寄生虫检测中的应用 被引量:17
20
作者 郑文斌 吴耀东 +2 位作者 马剑钢 周东辉 《中国寄生虫学与寄生虫病杂志》 CAS CSCD 北大核心 2015年第5期382-386,共5页
重组酶聚合酶扩增技术(RPA)是以T4噬菌体体内核酸复制机制为原理,以多种蛋白及酶参与的一种新型核酸等温扩增技术,可在37--42qC条件下,20min内将核酸扩增至可检测水平。具有较高的敏感性和特异性,且操作简单,可在非实验室条件下... 重组酶聚合酶扩增技术(RPA)是以T4噬菌体体内核酸复制机制为原理,以多种蛋白及酶参与的一种新型核酸等温扩增技术,可在37--42qC条件下,20min内将核酸扩增至可检测水平。具有较高的敏感性和特异性,且操作简单,可在非实验室条件下实现对核酸的快速检测。自2006年问世后,已广泛应用于农业、食品安全、医学和转基因检测等多个领域。本文综述了RPA技术的研究进展及其在寄生虫检测中的应用。 展开更多
关键词 重组酶聚合酶扩增技术(RPA) 寄生虫 隐孢子虫 贾第鞭毛虫 疟原虫
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