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红藤水溶性部位的LC-MS分析及抗炎活性成分的虚拟筛选
1
作者 汤建 曹裕旻 +3 位作者 左亚锋 李艳玲 靳彪 夏海平 《中国野生植物资源》 CSCD 2023年第12期25-29,36,共6页
目的:基于分子对接,确定中药红藤75%乙醇提取物的水溶性部位(HT_(W))中的抗炎物质基础及相关的炎症因子。方法:采用液质联用(LC-MS)技术确定HT_(W)中的主要化学成分。采用软件Autodock Vina对化合物与肿瘤坏死因子-α、白介素-1β转化酶... 目的:基于分子对接,确定中药红藤75%乙醇提取物的水溶性部位(HT_(W))中的抗炎物质基础及相关的炎症因子。方法:采用液质联用(LC-MS)技术确定HT_(W)中的主要化学成分。采用软件Autodock Vina对化合物与肿瘤坏死因子-α、白介素-1β转化酶、IL-6、IκB激酶β、诱导性一氧化氮合酶(iNOS)及Toll样受体2(TLR2)等6种靶点蛋白的结合能进行打分,虚拟筛选出抗炎活性成分以及关键靶点。结果:通过LC-MS分析,共确定14个含量较为丰富的小分子化合物,主要为苯丙酸、苯乙醇和木脂素类化合物,其中绿原酸类化合物含量最高。分子对接结果显示,TLR2与HT_(W)中化合物的结合能平均值最高,其中与化合物2、3、7、11-13的结合能均超过-9.0 kcal/mol,远超过阈值-7.2 kcal/mol。TLR2与木通苯乙醇苷B(12)的结合能为-9.7 kcal/mol,与绿原酸(3)及其异构体(2)亦有较好的结合力。iNOS对HT_(W)中化合物也较敏感,与苯乙醇苷类化合物10的结合能为-9.8 kcal/mol。结论:绿原酸、苯乙醇苷等化合物可能是红藤水溶性部位(HT_(W))最重要的抗炎活性物质;其抗炎关键靶点可能是TLR2和iNOS。 展开更多
关键词 红藤 木通苯乙醇苷B 抗炎 虚拟筛选 TLR2
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基于分子对接法预测红藤Sargentol及类似物紫丁香苷抗炎靶点的研究
2
作者 耿春叶 曹裕旻 +3 位作者 王培 王雪茹 刘东 汤建 《中国野生植物资源》 CSCD 2022年第6期18-22,共5页
目的:发现红藤中Sargentol及其类似物紫丁香苷的抗炎作用靶点。方法:选取26个与炎症密切相关的靶点蛋白(受体),采用软件AutoDockVina将Sargentol和紫丁香苷与这26个蛋白进行分子对接,根据结合能预测二者的抗炎作用靶点。结果:Sargentol... 目的:发现红藤中Sargentol及其类似物紫丁香苷的抗炎作用靶点。方法:选取26个与炎症密切相关的靶点蛋白(受体),采用软件AutoDockVina将Sargentol和紫丁香苷与这26个蛋白进行分子对接,根据结合能预测二者的抗炎作用靶点。结果:Sargentol与4NF5、6EQ9、2Y37、5D3I、2R59等5种蛋白具有较强的结合能力,紫丁香苷与6EQ9、2Y37、2R59、3L8P、3KGC等5种蛋白具有较强的结合能力。Sargentol及紫丁香苷均与c-Jun氨基末端激酶-3(JNK-3,PDB ID:6EQ9)表现出较强的结合能,分别为-7.9和-8.3 kcal/mol,提示JNK-3可能是Sargentol和紫丁香苷抗炎的关键靶点。二者对诱导性一氧化氮合酶(iNOS,PDB ID:2Y37)亦有较强的结合能,前者还可能通过调节N甲基-D-天冬氨酸受体-2A(NR2A)等谷氨酸受体发挥抗炎作用。结论:初步确定Sargentol和紫丁香苷抗炎作用的关键靶点,这将为进一步研究Sargentol类化合物的抗炎作用机制提供依据。 展开更多
关键词 Sargentol 紫丁香苷 抗炎 分子对接
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红藤化学成分中端粒酶TERT基因激动剂的虚拟筛选
3
作者 汤建 徐滢滢 +3 位作者 黄淑慧 刘梦 曹裕旻 闻崇炜 《中国野生植物资源》 CSCD 2021年第9期1-4,共4页
目的:为了发现红藤中能够激活端粒酶逆转录酶(TERT)的化学成分。方法:检索文献和数据库,确定红藤中的小分子化合物(配体);使用AutodockVina软件与受体TERT(PDBID:5CQG)进行分子对接,根据结合能(打分值)确定潜在的激活TERT的化合物。结果... 目的:为了发现红藤中能够激活端粒酶逆转录酶(TERT)的化学成分。方法:检索文献和数据库,确定红藤中的小分子化合物(配体);使用AutodockVina软件与受体TERT(PDBID:5CQG)进行分子对接,根据结合能(打分值)确定潜在的激活TERT的化合物。结果:红藤中126种化合物与5CQG的结合能与化合物的结构类型具有明显的关系:黄酮类化合物(2R)-maesopsin-6-O-β-D-glucoside(111)和大黄素类化合物(113-117)与靶点蛋白5CQG的结合力最强,结合能绝对值均大于9 kcal/mol。其中大黄酚(114)的结合能最强,为-9.5 kcal/mol。苯丙酸类化合物和木脂素成分的结合能分值相对集中,处于-8.8~-6.5 kcal/mol范围内。所有化合物的结合能均弱于原配体BI⁃BR153(-10.9 kcal/mol)。结论:初步筛选出激活TERT的化合物,这将为进一步研究红藤成分的端粒酶调节作用和相关机制提供依据。 展开更多
关键词 红藤 端粒酶 端粒酶逆转录酶 分子对接 虚拟筛选
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