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大豆株高QTL定位及候选基因挖掘
被引量：
3
1
作者
郑海洋
侯立龙
+4 位作者
曹
富
斌
魏茹茹
谢建国
蒋洪蔚
陈庆山
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期283-292,共10页
大豆株高(plant height,PH)对理想株型和产量有重要影响,为筛选株高相关候选基因,以包含208个株系的染色体片段代换系(chromosome segment substitution lines,CSSL)群体为材料,对大豆株高性状进行QTL定位。共检测到12个与大豆株高相关...
大豆株高(plant height,PH)对理想株型和产量有重要影响,为筛选株高相关候选基因,以包含208个株系的染色体片段代换系(chromosome segment substitution lines,CSSL)群体为材料,对大豆株高性状进行QTL定位。共检测到12个与大豆株高相关的QTL位点,其中qPH7-1、qPH12-1和qPH16-1在不同年份被重复检测到。对3个QTL区间进行基因注释得到35个基因。根据基因注释、双亲序列比对和qRT-PCR,最终预测Glyma.16G198800和Glyma.16G199000为调控大豆株高的候选基因。单倍型分析结果显示Glyma.16G198800中SNP-4034在双亲间的差异可能是导致株高产生差异的原因。
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关键词
大豆
染色体片段代换系(CSSL)
株高
QTL
候选基因
下载PDF
职称材料
大豆三粒荚数相关QTL的分子标记开发与验证
2
作者
侯立龙
蒋洪蔚
+7 位作者
熊心
郑海洋
曹
富
斌
魏茹茹
张一超
赵雨轩
郭梦瑶
陈庆山
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1239-1248,共10页
本研究基于大豆三粒荚数相关QTL开发InDel标记,并利用自然群体和育种群体分别对InDel标记进行多态性的筛选和应用效果的验证,以期实现分子标记辅助选择,最后利用大豆三粒荚数相关QTL内的候选基因表达情况验证QTL的有效性。经过4个育种...
本研究基于大豆三粒荚数相关QTL开发InDel标记,并利用自然群体和育种群体分别对InDel标记进行多态性的筛选和应用效果的验证,以期实现分子标记辅助选择,最后利用大豆三粒荚数相关QTL内的候选基因表达情况验证QTL的有效性。经过4个育种群体验证,引物INDEL_(3-311497)、INDEL_(17-440117)和INDEL_(17-462053)可用于加拿大蛋白豆与吉育4512杂交群体的验证,INDEL_(13-24003)1可用于齐农7号与辛大粒杂交群体中的验证,INDEL_(3-250092)、IN⁃DEL_(3-311497)和INDEL_(13-254396)可用于东富豆8号与通试豆4杂交群体中的验证,INDEL_(3-240669)和INDEL_(13-246066)可用于吉育441与合丰55杂交群体中的验证。表达量分析结果表明,Glyma.03G029800和Glyma.17G062600两个候选基因促进大豆三粒荚形成及发育;Glyma.17G062000和Glyma.13G063700两个候选基因抑制大豆三粒荚形成及发育。说明本实验室前期获得的四个QTL位点可能与大豆三粒荚形成有关,该结果也与InDel标记对育种群体选择的有效性相印证。
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关键词
大豆
三粒荚数
分子标记
标记辅助选择
下载PDF
职称材料
题名
大豆株高QTL定位及候选基因挖掘
被引量：
3
1
作者
郑海洋
侯立龙
曹
富
斌
魏茹茹
谢建国
蒋洪蔚
陈庆山
机构
东北农业大学/教育部大豆生物学重点实验室/大豆遗传改良团队
吉林省农业科学院/大豆研究所
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第2期283-292,共10页
基金
国家自然科学基金(U20A2027,31771882)
财政部和农业农村部:国家现代农业产业技术体系(CARS-04-PS07,CARS-04-PS11)
吉林省科研院所引进高层次科研创新人才资助计划(0413502)。
文摘
大豆株高(plant height,PH)对理想株型和产量有重要影响,为筛选株高相关候选基因,以包含208个株系的染色体片段代换系(chromosome segment substitution lines,CSSL)群体为材料,对大豆株高性状进行QTL定位。共检测到12个与大豆株高相关的QTL位点,其中qPH7-1、qPH12-1和qPH16-1在不同年份被重复检测到。对3个QTL区间进行基因注释得到35个基因。根据基因注释、双亲序列比对和qRT-PCR,最终预测Glyma.16G198800和Glyma.16G199000为调控大豆株高的候选基因。单倍型分析结果显示Glyma.16G198800中SNP-4034在双亲间的差异可能是导致株高产生差异的原因。
关键词
大豆
染色体片段代换系(CSSL)
株高
QTL
候选基因
Keywords
soybean
chromosome segment substitution lines(CSSLs)
plant height
QTLs
candidate genes
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
大豆三粒荚数相关QTL的分子标记开发与验证
2
作者
侯立龙
蒋洪蔚
熊心
郑海洋
曹
富
斌
魏茹茹
张一超
赵雨轩
郭梦瑶
陈庆山
机构
东北农业大学
吉林省农业科学院
出处
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第6期1239-1248,共10页
基金
国家自然科学基金区域联合重点项目(U20A2027)
国家自然科学基金(31771882)
2019年吉林省科研院所引进高层次科研创新人才资助计划。
文摘
本研究基于大豆三粒荚数相关QTL开发InDel标记,并利用自然群体和育种群体分别对InDel标记进行多态性的筛选和应用效果的验证,以期实现分子标记辅助选择,最后利用大豆三粒荚数相关QTL内的候选基因表达情况验证QTL的有效性。经过4个育种群体验证,引物INDEL_(3-311497)、INDEL_(17-440117)和INDEL_(17-462053)可用于加拿大蛋白豆与吉育4512杂交群体的验证,INDEL_(13-24003)1可用于齐农7号与辛大粒杂交群体中的验证,INDEL_(3-250092)、IN⁃DEL_(3-311497)和INDEL_(13-254396)可用于东富豆8号与通试豆4杂交群体中的验证,INDEL_(3-240669)和INDEL_(13-246066)可用于吉育441与合丰55杂交群体中的验证。表达量分析结果表明,Glyma.03G029800和Glyma.17G062600两个候选基因促进大豆三粒荚形成及发育;Glyma.17G062000和Glyma.13G063700两个候选基因抑制大豆三粒荚形成及发育。说明本实验室前期获得的四个QTL位点可能与大豆三粒荚形成有关,该结果也与InDel标记对育种群体选择的有效性相印证。
关键词
大豆
三粒荚数
分子标记
标记辅助选择
Keywords
soybean
number of three-seeded pods
molecular marker
marker-assisted selection
分类号
S565.1 [农业科学—作物学]
下载PDF
职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
大豆株高QTL定位及候选基因挖掘
郑海洋
侯立龙
曹
富
斌
魏茹茹
谢建国
蒋洪蔚
陈庆山
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2023
3
下载PDF
职称材料
2
大豆三粒荚数相关QTL的分子标记开发与验证
侯立龙
蒋洪蔚
熊心
郑海洋
曹
富
斌
魏茹茹
张一超
赵雨轩
郭梦瑶
陈庆山
《中国油料作物学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
下载PDF
职称材料
已选择
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