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题名野生二粒小麦AP2家族基因鉴定与表达模式分析
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作者
刘涛
曹启彬
卫科旭
张艳
聂小军
童维
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机构
西北农林科技大学农学院
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出处
《麦类作物学报》
CAS
北大核心
2025年第1期24-36,共13页
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基金
陕西省科技攻关项目。
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文摘
AP2转录因子在植物信号转导、生长发育和胁迫响应方面发挥着重要作用。为探索AP2转录因子在野生二粒小麦中的分子特征,基于野生二粒小麦基因组信息,采用Blast和Hmmer进行AP2家族成员鉴定,对鉴定到的成员进行蛋白质理化性质、亚细胞定位、系统进化树、保守结构域、基因扩增、顺式作用元件、密码子偏好性、表达模式和遗传多样性分析。结果表明,在野生二粒小麦中共鉴定到265个AP2基因,主要定位在细胞核和叶绿体中。根据系统进化树将其分为3个亚族,各亚族之间的保守结构域和基因结构存在保守性与多样性。AP2含有多个与生长发育和非生物胁迫相关的顺式作用元件。AP2基因的密码子偏好性可能受到压力选择作用。从AP2基因的表达模式看,该家族成员可能发生了亚功能化,且对盐胁迫响应有重要作用。通过对不同小麦群体中核酸多样性和分化指数分析,AP2基因部分成员在野生二粒小麦中具有较高的遗传多样性。
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关键词
野生二粒小麦
AP2基因
进化分析
表达模式
遗传多样性
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Keywords
Wild emmer wheat
AP2 gene
Evolutionary analysis
Expression pattern
Genetic diversity
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分类号
S512.1
[农业科学—作物学]
S330
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