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人NFE2基因上游增强子lncRNA调控NFE2基因转录和K562细胞增殖
1
作者
卢燕飞
曲
颂
雅
+4 位作者
朱晶晶
刘超
王建
韩兵社
张俊芳
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期190-201,共12页
目的转录因子NFE2的异常表达在许多骨髓增殖性肿瘤患者中被观察到,然而造成这种异常的转录调控机制尚不明确,本研究旨在探究参与NFE2转录调控的元件和分子机制。方法首先通过公共数据库中Ch IP-seq数据和ATAC-seq数据预测NFE2基因的潜...
目的转录因子NFE2的异常表达在许多骨髓增殖性肿瘤患者中被观察到,然而造成这种异常的转录调控机制尚不明确,本研究旨在探究参与NFE2转录调控的元件和分子机制。方法首先通过公共数据库中Ch IP-seq数据和ATAC-seq数据预测NFE2基因的潜在增强子元件,并通过双荧光素酶报告实验进行体外验证。随后,通过PRO-seq和GRO-seq数据结合RACE技术克隆这些增强子RNA转录本,经在线编码潜能预测工具分析认为其为lnc RNA,通过RT-q PCR检测该lnc RNA在不同白血病细胞系中和这些细胞诱导分化前后的表达变化及其亚细胞定位。最后,通过慢病毒系统在K562细胞中过表达和敲降该lnc RNA以探究其功能。结果鉴定出调控NFE2转录的3个增强子元件,分别位于NFE2转录起始位点-3.6k,-6.2k和+6.3k区域,这些元件插入NFE2启动子上游均能增强下游萤火虫荧光素酶的表达。克隆出-3.6k增强子负链方向的转录本,将其鉴定为-3.6k-lnc RNA。本研究发现,该lnc RNA在K562、U937和HL-60这3种白血病细胞系中均有一定程度的表达,且均定位于细胞核内。当该lnc RNA在K562细胞中过表达,NFE2水平随之提高,细胞增殖和细胞迁移能力受到抑制;当其被敲降时,NFE2水平相应降低而K562细胞增殖能力随之升高。结论本文鉴定了调控人NFE2基因转录的3个增强子元件和一条增强子lnc RNA转录本,并验证了该lnc RNA对NFE2转录的正调控作用以及对K562细胞增殖能力具有抑制作用。
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关键词
NFE2基因
增强子
长链非编码RNA
细胞增殖
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职称材料
组蛋白去乙酰化酶11的免疫调控功能及其在免疫相关疾病中的作用研究进展
2
作者
曲
颂
雅
韩兵社
张俊芳
《生命科学》
CSCD
北大核心
2023年第6期704-713,共10页
组蛋白乙酰化是一种重要的表观遗传修饰,受到组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶的动态调节。组蛋白去乙酰化酶11 (histone deacetylases 11, HDAC11)是IV类HDAC的唯一成员,能够催化组蛋白和非组蛋白赖氨酸残基去乙酰化并具有去脂酰化...
组蛋白乙酰化是一种重要的表观遗传修饰,受到组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶的动态调节。组蛋白去乙酰化酶11 (histone deacetylases 11, HDAC11)是IV类HDAC的唯一成员,能够催化组蛋白和非组蛋白赖氨酸残基去乙酰化并具有去脂酰化活性。HDAC11与免疫细胞的成熟、分化和功能密切相关,多数研究显示HDAC11通过负调控IL-10和上调促炎细胞因子发挥免疫激活作用,但HDAC11也负调控中性粒细胞和T细胞的功能,发挥免疫抑制作用。最近报道HDAC11在炎症反应、肿瘤免疫、移植免疫、自身免疫疾病中发挥重要作用,是免疫治疗的重要靶点。该文就HDAC11的生物学特性、免疫调控功能、在免疫相关性疾病中的作用及其抑制剂开发的最新研究进展作一综述。
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关键词
组蛋白去乙酰化
组蛋白去乙酰化酶11
免疫
原文传递
题名
人NFE2基因上游增强子lncRNA调控NFE2基因转录和K562细胞增殖
1
作者
卢燕飞
曲
颂
雅
朱晶晶
刘超
王建
韩兵社
张俊芳
机构
上海海洋大学
上海海洋大学
临港新片区海洋生物医药科技创新型平台
出处
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024年第1期190-201,共12页
基金
国家自然科学基金(81770165),临港新片区海洋生物医药科技创新型平台科创基金和上海市教委水产一流学科建设项目资助。
文摘
目的转录因子NFE2的异常表达在许多骨髓增殖性肿瘤患者中被观察到,然而造成这种异常的转录调控机制尚不明确,本研究旨在探究参与NFE2转录调控的元件和分子机制。方法首先通过公共数据库中Ch IP-seq数据和ATAC-seq数据预测NFE2基因的潜在增强子元件,并通过双荧光素酶报告实验进行体外验证。随后,通过PRO-seq和GRO-seq数据结合RACE技术克隆这些增强子RNA转录本,经在线编码潜能预测工具分析认为其为lnc RNA,通过RT-q PCR检测该lnc RNA在不同白血病细胞系中和这些细胞诱导分化前后的表达变化及其亚细胞定位。最后,通过慢病毒系统在K562细胞中过表达和敲降该lnc RNA以探究其功能。结果鉴定出调控NFE2转录的3个增强子元件,分别位于NFE2转录起始位点-3.6k,-6.2k和+6.3k区域,这些元件插入NFE2启动子上游均能增强下游萤火虫荧光素酶的表达。克隆出-3.6k增强子负链方向的转录本,将其鉴定为-3.6k-lnc RNA。本研究发现,该lnc RNA在K562、U937和HL-60这3种白血病细胞系中均有一定程度的表达,且均定位于细胞核内。当该lnc RNA在K562细胞中过表达,NFE2水平随之提高,细胞增殖和细胞迁移能力受到抑制;当其被敲降时,NFE2水平相应降低而K562细胞增殖能力随之升高。结论本文鉴定了调控人NFE2基因转录的3个增强子元件和一条增强子lnc RNA转录本,并验证了该lnc RNA对NFE2转录的正调控作用以及对K562细胞增殖能力具有抑制作用。
关键词
NFE2基因
增强子
长链非编码RNA
细胞增殖
Keywords
NFE2
enhancer
lncRNA
cellular proliferation
分类号
Q291 [生物学—细胞生物学]
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职称材料
题名
组蛋白去乙酰化酶11的免疫调控功能及其在免疫相关疾病中的作用研究进展
2
作者
曲
颂
雅
韩兵社
张俊芳
机构
上海海洋大学水产种质资源发掘与利用教育部重点实验室
上海海洋大学水产科学国家级实验教学示范中心
上海海洋大学科技部海洋生物科学国际联合研究中心
临港新片区海洋生物医药科技创新型平台
出处
《生命科学》
CSCD
北大核心
2023年第6期704-713,共10页
基金
国家自然科学基金项目(81770165)。
文摘
组蛋白乙酰化是一种重要的表观遗传修饰,受到组蛋白乙酰转移酶和组蛋白去乙酰化酶的动态调节。组蛋白去乙酰化酶11 (histone deacetylases 11, HDAC11)是IV类HDAC的唯一成员,能够催化组蛋白和非组蛋白赖氨酸残基去乙酰化并具有去脂酰化活性。HDAC11与免疫细胞的成熟、分化和功能密切相关,多数研究显示HDAC11通过负调控IL-10和上调促炎细胞因子发挥免疫激活作用,但HDAC11也负调控中性粒细胞和T细胞的功能,发挥免疫抑制作用。最近报道HDAC11在炎症反应、肿瘤免疫、移植免疫、自身免疫疾病中发挥重要作用,是免疫治疗的重要靶点。该文就HDAC11的生物学特性、免疫调控功能、在免疫相关性疾病中的作用及其抑制剂开发的最新研究进展作一综述。
关键词
组蛋白去乙酰化
组蛋白去乙酰化酶11
免疫
Keywords
histone deacetylation
HDACll
immunity
分类号
Q342 [生物学—遗传学]
R392.1 [医药卫生—免疫学]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
人NFE2基因上游增强子lncRNA调控NFE2基因转录和K562细胞增殖
卢燕飞
曲
颂
雅
朱晶晶
刘超
王建
韩兵社
张俊芳
《生物化学与生物物理进展》
SCIE
CAS
CSCD
北大核心
2024
0
下载PDF
职称材料
2
组蛋白去乙酰化酶11的免疫调控功能及其在免疫相关疾病中的作用研究进展
曲
颂
雅
韩兵社
张俊芳
《生命科学》
CSCD
北大核心
2023
0
原文传递
已选择
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