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不同DNA条形码在微口线虫属形态相近物种分类上的应用
1
作者 周仁桂 郭玉清 +1 位作者 朱慧兰 施宜佳 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2024年第8期52-62,共11页
为建立和完善海洋线虫相近物种的DNA条形码鉴定方法,本研究以深圳福田红树林湿地自由生活的海洋线虫优势属微口线虫属(Terschellingia)为研究对象,在形态分类鉴定基础上,将DNA条形码技术引入海洋线虫形态相似物种的鉴定,研究线粒体细胞... 为建立和完善海洋线虫相近物种的DNA条形码鉴定方法,本研究以深圳福田红树林湿地自由生活的海洋线虫优势属微口线虫属(Terschellingia)为研究对象,在形态分类鉴定基础上,将DNA条形码技术引入海洋线虫形态相似物种的鉴定,研究线粒体细胞色素氧化酶第一亚基(COⅠ)基因、18S核糖体RNA基因(18S rDNA)和28S rDNA三种基因序列片段的物种分类效果。研究共鉴定出微口线虫属4个不同的形态学种,获得其中3个种的DNA序列。18S rDNA及28S rDNA两种条形码所构建的发育树支持将本属划分成6个类群;Kimura 2 parameter(K2P)种内和种间阈值分别为18S rDNA的0%~2.5%和0.4%~13.7%,28S rDNA的0%和20.5%~84.6%。18S rDNA的MN18F-Nem_18S_R引物对所扩增的序列最适合作为微口线虫属种类鉴定的DNA条形码,并可用于区分物种复合体。28S rDNA序列虽然能成功扩增,但扩增效率相对较低;COⅠ基因片段无法在所有物种中成功扩增,推测现有引物可能不适合用于本属序列的提取。研究结果表明,DNA条形码可以用于自由生活海洋线虫形态相似物种的识别,但不同的单基因片段对相同物种的鉴定结果有明显差异。 展开更多
关键词 海洋线虫 微口线虫属 DNA条形码 18S rDNA 28S rDNA
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金门岛红树林湿地海洋线虫群落结构的初步探究 被引量：1
2
作者 肖月平 郭玉清 施宜佳 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第3期402-408,共7页
本研究于2021年2月在金门岛红树林湿地设置2个断面4个采样站位进行沉积物样品采集,对小型底栖动物的类群组成,海洋线虫群落的优势属、优势种和摄食类型等方面进行研究。结果表明:共鉴定出10个小型底栖动物类群,包括海洋线虫、桡足类、... 本研究于2021年2月在金门岛红树林湿地设置2个断面4个采样站位进行沉积物样品采集,对小型底栖动物的类群组成,海洋线虫群落的优势属、优势种和摄食类型等方面进行研究。结果表明:共鉴定出10个小型底栖动物类群,包括海洋线虫、桡足类、寡毛类、多毛类、涡虫、有孔虫、腹足类、涟虫、双壳类和缓步类;其中海洋线虫为最优势类群,占小型底栖动物总数的93.93%。共鉴定出海洋线虫51种或分类实体,隶属于4目15科31属。建功屿断面JH站位鉴定出11属16种,其优势属(数量百分比≥5%)为Ptycholaimellus、Viscosia、Daptonema、Dorylaimopsis、Parasphaerolaimus、Anoplostoma,优势种为Ptycholaimellus sp.1、Viscosia sp.1、Daptonema ungula、Dorylaimopsis sp.1、Anoplostoma papaviviparum;JM站位鉴定出23属35种,其优势属为Metachromadora、Daptonema、Viscosia、Ptycholaimellus、Dorylaimopsis,优势种为Metachromadora sp.1、Viscosia sp.1、Dorylaimopsis sp.1、Daptonema baihaijiaoensis、Ptycholaimellus ocellatus;JL站位鉴定出18属30种,其优势属为Daptonema、Dorylaimopsis,优势种为Daptonema quattuor、Daptonema setihyalocella、Viscosia sp.1、Daptonema baihaijiaoensis、Ptycholaimellus sp.1、Spilophorella candida。古宁头断面GH站位鉴定出21属35种,其优势属为Daptonema、Parasphaerolaimus、Ptycholaimellus、Viscosia、Ptycholaimellus,优势种为Daptonema aquattuor、Daptonema setihyalocella、Viscosia sp.1、Daptonema baihaijiaoensis、Ptycholaimellus sp.1、Spilophorella candida。从群落结构来言,4个采样站位仅Daptonema为共有优势属,其他无共有优势种。从摄食类型来看,除建功屿断面中潮位的海洋线虫群落以2A型为主以外,在其他3个采样站位均以1B型为优势,故本研究海洋线虫以非选择性沉积食性者为主。 展开更多
关键词 海洋生物学 自由生活海洋线虫 群落结构 红树林湿地 金门岛
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厦门湾瘦枝珊瑚属空间分布及新记录种
3
作者 阳静 刘佳英 +1 位作者 王云沛 施宜佳 《应用海洋学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期604-612,共9页
厦门湾是一个集河口、红树林、浅海湿地等多种典型生态系统的海湾,生物多样性高,曾报道有28种八放珊瑚栖息,但未见瘦枝珊瑚属(Carijoa)的相关报道。为了解厦门湾内瘦枝珊瑚属资源现状,本研究于2014—2021年期间在厦门湾内的大佰屿、小... 厦门湾是一个集河口、红树林、浅海湿地等多种典型生态系统的海湾,生物多样性高,曾报道有28种八放珊瑚栖息,但未见瘦枝珊瑚属(Carijoa)的相关报道。为了解厦门湾内瘦枝珊瑚属资源现状,本研究于2014—2021年期间在厦门湾内的大佰屿、小佰屿、白哈礁、角屿、上屿、黄厝、鼓浪屿、火烧屿、青屿以及浯屿附近海域通过潜水调查采集珊瑚样本,其中有25株是瘦枝珊瑚属样本。对样本进行形态学鉴定及基因片段[细胞色素C氧化酶亚单位Ⅰ(COⅠ)、NADH脱氢酶第二亚基(ND2)]定序技术研究。结果显示,采集的25株瘦枝珊瑚属样本全部都是Carijoa riisei,这是该种在厦门湾的首次记录。C.riisei分布在厦门湾的小佰屿、白哈礁、上屿、角屿、鼓浪屿和火烧屿附近海域,而大佰屿、黄厝、青屿和浯屿站位未见该物种分布。本研究结果既丰富了厦门湾的珊瑚物种记录,也增加了C.riisei的世界地理分布信息,可为全球Carijoa属珊瑚生物地理信息研究提供数据支撑。 展开更多
关键词 海洋生物学 珊瑚 生物多样性 瘦枝珊瑚属 新记录种 厦门湾
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