目的:利用网络药理学方法,探讨二仙汤治疗乳腺癌的潜在作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集二仙汤药物的活性成分和其作...目的:利用网络药理学方法,探讨二仙汤治疗乳腺癌的潜在作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集二仙汤药物的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、OMIM及CTD数据库建立乳腺癌靶点数据库。提炼出二仙汤作用于乳腺癌的交集靶点,运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制“二仙汤活性成分-作用靶点-乳腺癌”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,最后运用分子对接验证活性成分与核心靶点的作用强度。结果:二仙汤共有93个活性成分,154个作用靶点,乳腺癌疾病靶点共有364个,中药成分靶点和乳腺癌交集靶点共有40个,具有重要作用的中药成分是槲皮素、山柰酚、异延胡索单酚碱和β-谷甾醇,关键核心靶点有TP53、IL-6和JUN。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析共筛选出1502条GO信号通路(P<0.05)和101条KEGG信号通路(P<0.05),主要涉及癌症途径和PI3K-AKT信号通路等。分子对接结果显示,化合物和作用靶点之间具有较好的结合力。结论:二仙汤治疗乳腺癌具有多成分、多靶点和多通路的特点,可为后续研究提供更多支持。展开更多
目的基于知识图谱探析乳腺癌微环境的研究现状,并预测未来研究热点。方法检索中国知网及Web of Science Core Collection数据库近20年乳腺癌微环境相关文献,并运用CiteSpace、VOSviewer等软件进行文献计量学分析。结果共检索到中文文献...目的基于知识图谱探析乳腺癌微环境的研究现状,并预测未来研究热点。方法检索中国知网及Web of Science Core Collection数据库近20年乳腺癌微环境相关文献,并运用CiteSpace、VOSviewer等软件进行文献计量学分析。结果共检索到中文文献825篇,英文文献16221篇。可视化分析显示科研人员的研究重点逐渐从细胞研究转向分子方向及药物创新层面,肿瘤干细胞、PD-1、PD-L1、免疫检查点抑制剂、纳米颗粒等是目前乳腺癌微环境研究的热点。美国乳腺癌微环境的相关研究最多,其次为中国、意大利。结论目前的研究热点主要集中在肿瘤细胞干性、免疫治疗、纳米递送等领域。随着对该领域研究的不断深入,通过靶向乳腺癌微环境预防肿瘤发展及转移,改善肿瘤预后成为新的研究趋势。展开更多
目的:基于网络药理学-分子对接技术,探讨山慈菇治疗乳腺癌的分子作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和UniProt数据库中收集...目的:基于网络药理学-分子对接技术,探讨山慈菇治疗乳腺癌的分子作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和UniProt数据库中收集山慈菇的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、人类孟德尔遗传综合数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)和毒性与基因比较数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)建立乳腺癌靶点数据库,获取山慈菇作用于乳腺癌的交集靶点。运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制“山慈菇-活性成分-作用靶点”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,运用分子对接技术验证活性成分与核心靶点的作用强度,最后运用细胞实验证明山慈菇水煎液对乳腺癌细胞增殖的抑制作用。结果:山慈菇共有3个活性成分,涉及70个作用靶点,乳腺癌作用靶点有364个。山慈菇作用靶点和乳腺癌疾病靶点共有14个交集靶点。其中,重要的中药成分有豆甾醇和β-谷甾醇;关键作用靶点为PTGS2、JUN、ESR1和NOS3。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果显示,共筛选出475条GO信号通路和23条KEGG信号通路,主要涉及癌症的途径和雌激素信号通路等。分子对接结果显示,化合物与靶点之间具有较好的结合能。细胞实验结果证实,山慈菇对乳腺癌具有较好的抑瘤作用。结论:山慈菇治疗乳腺癌具有多成分、多靶点和多通路的特点,可为临床应用提供更多参考。展开更多
文摘目的:利用网络药理学方法,探讨二仙汤治疗乳腺癌的潜在作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集二仙汤药物的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、OMIM及CTD数据库建立乳腺癌靶点数据库。提炼出二仙汤作用于乳腺癌的交集靶点,运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制“二仙汤活性成分-作用靶点-乳腺癌”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,最后运用分子对接验证活性成分与核心靶点的作用强度。结果:二仙汤共有93个活性成分,154个作用靶点,乳腺癌疾病靶点共有364个,中药成分靶点和乳腺癌交集靶点共有40个,具有重要作用的中药成分是槲皮素、山柰酚、异延胡索单酚碱和β-谷甾醇,关键核心靶点有TP53、IL-6和JUN。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析共筛选出1502条GO信号通路(P<0.05)和101条KEGG信号通路(P<0.05),主要涉及癌症途径和PI3K-AKT信号通路等。分子对接结果显示,化合物和作用靶点之间具有较好的结合力。结论:二仙汤治疗乳腺癌具有多成分、多靶点和多通路的特点,可为后续研究提供更多支持。
文摘目的基于知识图谱探析乳腺癌微环境的研究现状,并预测未来研究热点。方法检索中国知网及Web of Science Core Collection数据库近20年乳腺癌微环境相关文献,并运用CiteSpace、VOSviewer等软件进行文献计量学分析。结果共检索到中文文献825篇,英文文献16221篇。可视化分析显示科研人员的研究重点逐渐从细胞研究转向分子方向及药物创新层面,肿瘤干细胞、PD-1、PD-L1、免疫检查点抑制剂、纳米颗粒等是目前乳腺癌微环境研究的热点。美国乳腺癌微环境的相关研究最多,其次为中国、意大利。结论目前的研究热点主要集中在肿瘤细胞干性、免疫治疗、纳米递送等领域。随着对该领域研究的不断深入,通过靶向乳腺癌微环境预防肿瘤发展及转移,改善肿瘤预后成为新的研究趋势。
文摘目的:基于网络药理学-分子对接技术,探讨山慈菇治疗乳腺癌的分子作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和UniProt数据库中收集山慈菇的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、人类孟德尔遗传综合数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)和毒性与基因比较数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)建立乳腺癌靶点数据库,获取山慈菇作用于乳腺癌的交集靶点。运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制“山慈菇-活性成分-作用靶点”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,运用分子对接技术验证活性成分与核心靶点的作用强度,最后运用细胞实验证明山慈菇水煎液对乳腺癌细胞增殖的抑制作用。结果:山慈菇共有3个活性成分,涉及70个作用靶点,乳腺癌作用靶点有364个。山慈菇作用靶点和乳腺癌疾病靶点共有14个交集靶点。其中,重要的中药成分有豆甾醇和β-谷甾醇;关键作用靶点为PTGS2、JUN、ESR1和NOS3。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果显示,共筛选出475条GO信号通路和23条KEGG信号通路,主要涉及癌症的途径和雌激素信号通路等。分子对接结果显示,化合物与靶点之间具有较好的结合能。细胞实验结果证实,山慈菇对乳腺癌具有较好的抑瘤作用。结论:山慈菇治疗乳腺癌具有多成分、多靶点和多通路的特点,可为临床应用提供更多参考。
