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东南沿海地区汉坦病毒的遗传进化分析 被引量：4
1
作者 李婵 姚苹苹 +8 位作者 朱函坪 徐芳 杨章女 岳明 谢荣辉 孙一晟 徐致遥 王长军 张云 《中国媒介生物学及控制杂志》 CAS CSCD 2015年第3期275-278,共4页
目的对浙江、福建省及上海市东南沿海地区汉坦病毒的基因进行比较。方法收集浙江、福建省及上海市汉坦病毒部分M基因序列，应用Mega4．0和DNAStar软件包进行系统发生分析，以邻位相连法（NJ）构建系统发生树，分析东南沿海地区浙江、福... 目的对浙江、福建省及上海市东南沿海地区汉坦病毒的基因进行比较。方法收集浙江、福建省及上海市汉坦病毒部分M基因序列，应用Mega4．0和DNAStar软件包进行系统发生分析，以邻位相连法（NJ）构建系统发生树，分析东南沿海地区浙江、福建省及上海市汉坦病毒的基因差异，分析采用1000个多序列组。结果经对浙江、福建省及上海市若干株汉坦病毒基因的序列比较与系统进化分析，浙江省分离的同型别毒株的基因序列同源性高于福建省与上海市的分离毒株，而浙江省同地区分离株的核苷酸同源性更高，地区接近的分离株系统进化分支的分布也大部分更靠近。汉滩型病毒（HTNV）福建株的ZH53和汉城型病毒（SEOV）浙江建德株Gou3和ZJ5与本研究同型别的其他株及国际标准株的核苷酸同源性较低，分别为82．7％～86．3％和84．0％～85．3％，而且分别在HTNV和SEOV发生群中构成一独立分支。浙江省从田鼠中分离到SEOV，产生宿主“溢出”现象。结论浙江、福建省及上海市东南沿海地区汉坦病毒的基因差异和亲缘远近关系主要表现在地区性，显示出高度的地理聚集现象，浙江省建德地区和福建省分别存在SEOV和HTNV的特殊亚型病毒。 展开更多
关键词 汉坦病毒 序列分析 系统进化 地理聚集现象 特殊亚型
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汉坦病毒与宿主线粒体D-loop和cyt b基因共进化分析 被引量：1
2
作者 杨章女 姚苹苹 +7 位作者 朱函坪 徐芳 岳明 谢荣辉 孙一晟 徐致遥 王长军 张云 《中国公共卫生》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期205-207,共3页
目的比较汉坦病毒(HV)抗原阳性和阴性的宿主动物线粒体D环区(D-loop)和细胞色素b(Cyt b)基因序列变化及与HV共进化的关系。方法采用直接免疫荧光法检测715份宿主动物鼠肺HV感染情况,提取HV抗原阳性和阴性黑线姬鼠鼠肺组织总DNA,应用聚... 目的比较汉坦病毒(HV)抗原阳性和阴性的宿主动物线粒体D环区(D-loop)和细胞色素b(Cyt b)基因序列变化及与HV共进化的关系。方法采用直接免疫荧光法检测715份宿主动物鼠肺HV感染情况,提取HV抗原阳性和阴性黑线姬鼠鼠肺组织总DNA,应用聚合酶链反应(PCR)扩增宿主动物线粒体的D-loop和Cyt b基因,PCR产物纯化后测定序列,应用Clustal X生物学软件进行多重序列同源性分析,M ega软件绘制系统发生树进行分析比较。结果 HV抗原检测阳性和阴性鼠的遗传距离较小,阳性和阴性鼠的D-loop和Cyt b基因均有分布在同一个分支上。结论 HV感染与否与宿主线粒体基因无直接联系。 展开更多
关键词 汉坦病毒 线粒体 D环区 细胞色素B基因 共进化
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